Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.04 0.0 0.09 0.06 0.15 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.29 0.09
Mp1g13460.1 (AXS1)
0.64 0.4 0.11 0.05 0.16 1.0 0.39 0.25 0.49 0.28 0.4 0.4 0.1 0.39 0.36 0.45 0.37 0.35 0.58 0.21 0.25 0.19
0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 1.0 0.1 0.06 0.29 0.05 0.13 0.14 0.08 0.63 0.09 0.3 0.05 0.07 0.51 0.06 0.05 0.1
Mp1g25890.1 (FRO7)
0.38 0.84 0.0 0.09 0.0 1.0 0.24 0.15 0.71 0.26 0.37 0.85 0.03 0.19 0.41 0.51 0.44 0.49 0.18 0.03 0.01 0.1
0.45 0.03 0.0 0.94 0.06 1.0 0.09 0.08 0.32 0.14 0.12 0.38 0.0 0.06 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.79
0.03 0.13 0.15 0.69 0.0 1.0 0.15 0.08 0.0 0.04 0.05 0.15 0.17 0.66 0.05 0.07 0.29 0.2 0.11 0.12 0.0 0.0
0.26 0.48 0.7 0.07 0.15 1.0 0.3 0.21 0.35 0.17 0.26 0.27 0.12 0.18 0.21 0.19 0.23 0.15 0.35 0.22 0.14 0.55
0.04 0.27 0.0 0.06 0.0 1.0 0.24 0.26 0.05 0.21 0.23 0.08 0.1 0.17 0.06 0.05 0.09 0.11 0.06 0.19 0.11 0.04
Mp2g22040.1 (EST3)
0.03 0.25 0.17 0.18 0.03 0.79 0.14 0.01 0.53 0.12 0.13 0.45 0.04 0.59 0.1 0.07 0.21 0.11 1.0 0.16 0.18 0.43
0.41 0.4 0.0 0.08 0.11 1.0 0.48 0.3 0.3 0.21 0.3 0.21 0.1 0.54 0.22 0.24 0.25 0.24 0.46 0.13 0.15 0.99
0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.77 0.14 0.2 1.0 0.19 0.47 0.61 0.06 0.03 0.03 0.01 0.03 0.03 0.05 0.03 0.01 0.02
0.36 0.16 0.02 0.07 0.0 1.0 0.1 0.24 0.36 0.05 0.1 0.31 0.02 0.14 0.19 0.32 0.19 0.18 0.37 0.07 0.03 0.06
0.1 0.15 0.0 0.12 0.21 1.0 0.02 0.08 0.15 0.1 0.0 0.0 0.02 0.11 0.07 0.02 0.07 0.05 0.05 0.08 0.33 0.15
0.07 0.0 0.04 0.62 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.07 0.08 0.0 0.04 0.0 1.0 0.11 0.17 0.44 0.07 0.19 0.18 0.06 0.2 0.22 0.15 0.18 0.2 0.53 0.03 0.04 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.11 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.1 0.48 0.11 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.27 0.05 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.28 0.09 0.59 0.06 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.03 0.23 0.02 0.03 0.78 0.01 0.0 0.0
0.12 0.05 0.0 0.02 0.0 1.0 0.27 0.51 0.83 0.23 0.48 0.6 0.08 0.14 0.03 0.03 0.06 0.02 0.03 0.03 0.04 0.31
0.24 0.19 0.0 0.17 0.02 1.0 0.12 0.15 0.22 0.08 0.1 0.27 0.17 0.06 0.03 0.01 0.05 0.04 0.07 0.11 0.11 0.36
0.01 0.04 0.15 0.05 0.02 1.0 0.02 0.01 0.15 0.01 0.01 0.1 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.02
0.0 0.21 0.06 0.19 0.01 1.0 0.29 0.05 0.38 0.06 0.07 0.23 0.04 0.27 0.26 0.3 0.28 0.32 0.2 0.4 0.33 0.01
0.0 0.0 0.0 0.46 0.08 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.35
0.01 0.0 0.0 0.25 0.02 1.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.5 0.01 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
Mp5g21440.1 (RCI3)
0.01 0.03 0.0 0.51 0.02 1.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.36
0.02 0.01 0.0 0.33 0.0 1.0 0.12 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.11
0.02 0.01 0.0 0.5 0.0 1.0 0.08 0.04 0.06 0.06 0.02 0.06 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04
0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 1.0 0.14 0.17 0.21 0.11 0.17 0.1 0.01 0.14 0.03 0.02 0.03 0.02 0.06 0.0 0.01 0.58
Mp6g20230.1 (VIM1)
0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.69 0.07 0.09 0.06 0.1 0.13 0.06 0.08 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.09
0.03 0.0 0.08 0.48 0.01 1.0 0.05 0.28 0.54 0.08 0.45 0.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.79 0.45 0.02 0.11 0.01 1.0 0.35 0.21 0.61 0.49 0.29 0.7 0.04 0.17 0.14 0.28 0.3 0.19 0.02 0.02 0.05 0.16
Mp8g02700.1 (ACA4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Mp8g02710.1 (ACA4)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp8g02730.1 (ACA6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.23 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g02750.1 (ACA4)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.15 0.03 0.04 0.12 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.02 0.06 0.06 0.13 0.0 1.0 0.1 0.03 0.26 0.08 0.12 0.16 0.15 0.05 0.13 0.05 0.07 0.1 0.08 0.06 0.07 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)