Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.1 0.0 0.26 0.17 0.42 2.77 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.18 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.35 0.81 0.24
Mp1g13460.1 (AXS1)
10.17 6.37 1.68 0.79 2.58 15.82 6.24 3.99 7.78 4.51 6.39 6.27 1.5 6.13 5.67 7.04 5.93 5.54 9.1 3.36 3.97 2.99
0.5 1.12 0.11 0.38 0.32 48.95 5.11 3.01 14.27 2.6 6.39 6.79 3.93 30.78 4.55 14.82 2.24 3.47 24.98 2.86 2.31 5.12
Mp1g25890.1 (FRO7)
3.58 7.94 0.02 0.84 0.02 9.45 2.24 1.38 6.71 2.46 3.47 8.01 0.27 1.83 3.91 4.83 4.16 4.66 1.71 0.27 0.06 0.94
0.76 0.05 0.0 1.59 0.09 1.68 0.15 0.14 0.54 0.23 0.19 0.65 0.0 0.1 0.09 0.08 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 1.32
0.03 0.13 0.14 0.67 0.0 0.97 0.15 0.08 0.0 0.03 0.05 0.14 0.17 0.64 0.05 0.06 0.28 0.2 0.11 0.12 0.0 0.0
2.83 5.32 7.71 0.78 1.61 11.07 3.32 2.28 3.85 1.88 2.83 2.97 1.35 1.96 2.38 2.06 2.52 1.68 3.84 2.46 1.53 6.11
0.42 3.03 0.0 0.7 0.01 11.29 2.67 2.9 0.62 2.38 2.59 0.93 1.1 1.89 0.7 0.62 1.03 1.29 0.64 2.13 1.19 0.46
Mp2g22040.1 (EST3)
0.06 0.61 0.43 0.44 0.08 1.98 0.35 0.04 1.33 0.3 0.33 1.13 0.1 1.47 0.24 0.18 0.51 0.26 2.49 0.4 0.44 1.08
2.22 2.19 0.03 0.41 0.59 5.44 2.6 1.61 1.61 1.12 1.63 1.16 0.57 2.96 1.21 1.32 1.35 1.3 2.51 0.7 0.82 5.36
3.43 0.54 0.0 0.01 0.08 44.6 8.11 11.81 57.65 11.19 27.04 34.91 3.18 1.91 1.6 0.65 1.62 1.53 2.84 1.69 0.75 1.36
8.35 3.63 0.38 1.54 0.0 22.95 2.34 5.49 8.17 1.1 2.2 7.08 0.38 3.31 4.36 7.24 4.45 4.07 8.44 1.59 0.72 1.27
0.25 0.36 0.0 0.3 0.51 2.42 0.05 0.19 0.36 0.23 0.0 0.0 0.04 0.27 0.18 0.05 0.18 0.12 0.13 0.21 0.79 0.37
0.08 0.0 0.05 0.66 0.0 1.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.74 0.81 0.02 0.42 0.0 10.07 1.07 1.7 4.45 0.7 1.93 1.86 0.62 2.04 2.19 1.49 1.8 2.0 5.37 0.26 0.35 3.09
0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 1347.25 1.88 0.71 0.0 2.44 1.57 0.0 2.25 9.92 9.4 63.44 11.4 4.89 10.32 0.23 1.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 1246.03 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.03 8.1 13.13 87.74 15.64 13.58 5.99 1.49 1.88 0.0
0.09 0.0 0.0 0.42 0.01 1002.18 1.07 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 12.32 12.54 16.42 105.97 26.19 22.82 7.17 2.09 3.26 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1234.63 0.0 0.24 1.85 0.23 0.0 0.0 17.15 7.36 19.63 115.98 32.85 27.12 3.39 5.8 8.37 0.0
0.09 0.0 0.0 0.17 0.0 479.11 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.84 1.76 11.24 65.47 12.05 13.59 1.29 1.44 1.71 0.0
0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 302.87 5.58 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 12.8 7.25 28.97 144.27 33.26 27.95 0.57 6.01 6.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 96.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.64 6.05 25.62 4.65 2.99 0.0 0.48 0.69 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 481.56 3.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 7.18 1.69 11.25 69.23 12.29 14.77 1.31 3.14 1.21 0.0
0.09 0.0 0.0 0.64 0.01 3209.17 5.59 0.0 1.4 0.29 0.44 0.0 17.24 25.84 25.17 176.74 37.02 31.54 10.32 8.69 6.96 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 368.81 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.88 5.3 29.51 3.93 2.87 0.44 0.52 0.78 0.0
0.17 0.0 0.0 0.06 0.0 522.57 2.24 2.26 1.23 5.15 2.92 1.23 0.88 170.27 52.91 359.25 38.77 75.03 605.71 2.43 2.9 3.0
0.14 0.0 0.0 0.2 0.13 587.45 2.78 0.72 0.34 1.08 0.94 0.33 0.23 365.02 18.27 134.42 12.48 19.78 455.68 3.05 1.99 0.0
2.74 1.05 0.06 0.54 0.0 23.08 6.23 11.81 19.12 5.37 11.15 13.77 1.94 3.16 0.59 0.8 1.4 0.46 0.64 0.71 1.04 7.08
0.95 0.74 0.0 0.68 0.08 3.92 0.48 0.57 0.87 0.32 0.38 1.06 0.67 0.24 0.11 0.05 0.21 0.15 0.29 0.43 0.42 1.39
0.23 0.92 3.4 1.05 0.56 22.75 0.43 0.12 3.4 0.21 0.28 2.18 0.15 0.31 0.23 0.42 0.43 0.36 0.33 0.88 0.6 0.47
0.01 0.52 0.13 0.46 0.02 2.44 0.71 0.13 0.93 0.13 0.18 0.57 0.09 0.66 0.64 0.74 0.69 0.79 0.5 0.97 0.82 0.02
0.0 0.0 0.0 0.52 0.1 1.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.4
0.01 0.0 0.0 0.51 0.03 2.03 0.04 0.0 0.0 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61
0.01 0.0 0.0 1.15 0.03 2.29 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07
Mp5g21440.1 (RCI3)
0.04 0.09 0.0 1.39 0.04 2.71 0.19 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.98
0.16 0.11 0.0 2.81 0.0 8.39 0.98 0.18 0.34 0.0 0.07 0.0 0.08 0.66 0.05 0.05 0.35 0.06 0.0 0.13 0.0 0.91
0.11 0.04 0.0 2.29 0.0 4.54 0.39 0.2 0.26 0.29 0.08 0.25 0.0 0.38 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.2
1.17 0.56 0.06 0.5 0.24 21.75 3.08 3.77 4.62 2.32 3.68 2.19 0.3 3.01 0.62 0.35 0.62 0.43 1.26 0.06 0.14 12.67
Mp6g20230.1 (VIM1)
0.03 0.0 0.0 0.84 0.0 0.58 0.06 0.08 0.05 0.09 0.11 0.05 0.07 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.08
0.05 0.0 0.13 0.75 0.01 1.56 0.08 0.44 0.84 0.13 0.69 0.54 0.0 0.02 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
2.3 1.33 0.05 0.33 0.02 2.92 1.03 0.62 1.79 1.43 0.84 2.04 0.1 0.51 0.39 0.82 0.87 0.56 0.05 0.06 0.14 0.46
Mp8g02700.1 (ACA4)
0.01 0.0 0.0 0.43 1.72 149.74 0.31 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 1.28 0.52 0.41 0.59 0.49 0.46 2.55 0.05 0.11 0.0
Mp8g02710.1 (ACA4)
0.0 0.04 0.0 0.4 6.33 66.3 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.08 0.0 0.05 0.0 0.05 0.71 0.0 0.0 0.0
Mp8g02730.1 (ACA6)
0.0 0.0 0.0 0.36 2.65 153.01 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.26 0.08 0.03 0.0 0.11 0.33 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.42 0.58 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g02750.1 (ACA4)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 97.51 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.31 0.31 0.08 0.36 0.07 0.05 0.23 0.0 0.0 0.0
7.66 0.63 0.32 0.81 0.0 176.61 46.89 25.65 5.81 7.93 20.99 2.5 0.0 2.1 0.32 2.34 0.35 0.0 0.0 0.11 0.0 51.57
0.18 0.59 0.61 1.34 0.02 10.2 1.06 0.27 2.69 0.83 1.18 1.66 1.56 0.52 1.38 0.47 0.71 1.04 0.86 0.56 0.7 0.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)