Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g00130.1	0.05	0.0	0.15	0.5	0.1	0.02	0.01	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp1g02520.1	0.23	0.05	0.0	0.32	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.19	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	1.0
Mp1g08540.1	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp2g04350.1	0.14	0.0	0.0	0.22	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp2g05180.1	0.21	0.01	0.0	0.01	0.03	0.19	0.06	0.16	0.16	0.07	0.15	0.25	0.05	0.08	0.07	0.03	0.06	0.05	0.14	0.16	0.23	1.0
Mp2g06650.1	0.02	0.01	0.0	0.1	0.01	0.01	0.0	0.03	0.41	0.01	0.03	0.24	0.01	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.11	0.07	1.0
Mp2g14480.1 (MPL1)	0.0	0.01	0.01	0.21	0.0	0.01	0.01	0.01	0.26	0.01	0.03	0.18	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.01	0.06	1.0
Mp2g18160.1	0.03	0.01	0.0	0.15	0.01	0.02	0.1	0.03	0.13	0.08	0.05	0.12	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp3g04630.1	0.01	0.01	0.0	0.11	0.01	0.03	0.02	0.1	0.14	0.08	0.23	0.04	0.05	0.16	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	1.0
Mp3g09670.1 (GLP10)	0.06	0.0	0.0	0.18	0.0	0.05	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp3g09680.1 (GLP10)	0.06	0.0	0.0	0.18	0.0	0.05	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp3g12960.1	0.0	0.0	0.13	0.54	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp3g19060.1 (PCK1)	0.07	0.04	0.05	0.02	0.09	0.03	0.06	0.16	0.04	0.2	0.15	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	1.0
Mp3g21190.1	0.02	0.01	0.0	0.0	0.09	0.04	0.08	0.09	0.05	0.09	0.08	0.06	0.01	0.16	0.03	0.03	0.03	0.03	0.11	0.05	0.04	1.0
Mp3g22440.1	0.19	0.03	0.0	0.74	0.02	0.1	0.16	0.22	0.17	0.15	0.07	0.08	0.04	0.21	0.11	0.05	0.02	0.03	0.06	0.26	0.52	1.0
Mp4g00520.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.06	0.02	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0
Mp4g00530.1 (SCPL45)	0.15	0.01	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp4g03700.1	0.0	0.0	0.0	0.16	0.01	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.06	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp4g08520.1	0.07	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.01	0.05	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp4g17360.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.05	0.03	0.1	0.05	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Mp4g17370.1	0.03	0.0	0.0	0.19	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp4g17380.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.02	0.09	0.07	0.15	0.09	0.1	0.01	0.04	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.03	1.0
Mp4g20010.1	0.07	0.04	0.01	0.02	0.03	0.12	0.08	0.07	0.13	0.08	0.09	0.14	0.05	0.06	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.03	1.0
Mp5g08030.1	0.1	0.0	0.07	0.21	0.01	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp5g10680.1 (TAF1)	0.29	0.06	0.0	0.42	0.0	0.0	0.03	0.09	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp5g23420.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp5g23470.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp5g23510.1 (GLP5)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp6g12120.1	0.19	0.05	0.0	0.01	0.02	0.13	0.08	0.2	0.09	0.13	0.1	0.1	0.12	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.08	0.09	1.0
Mp6g14000.1	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.11	0.05	0.03	0.05	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	1.0
Mp6g15360.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.09	1.0
Mp6g16410.1	0.1	0.04	0.0	0.07	0.04	0.03	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp6g19190.1	0.01	0.0	0.01	0.1	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0
Mp6g20650.1	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp6g20660.1 (GLP5)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.04	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp7g08050.1 (TT7)	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.12	0.05	0.0	0.04	0.06	0.01	0.01	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp7g15010.1 (RCI3)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mp7g17870.1	0.05	0.03	0.0	0.06	0.02	0.1	0.04	0.03	0.0	0.09	0.08	0.09	0.06	0.04	0.03	0.09	0.05	0.05	0.04	0.02	0.0	1.0
Mp8g05000.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.12	0.07	1.0
Mp8g12470.1 (GL22)	0.01	0.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.13	0.0	0.04	0.08	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.02	1.0
Mp8g12530.1	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.03	0.01	0.04	1.0
Mp8g15110.1	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.09	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	1.0
Mpzg00210.1	0.02	0.01	0.44	0.35	0.04	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Mpzg00810.1	0.02	0.01	0.44	0.35	0.04	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)