Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.1 0.0 0.3 1.01 0.19 0.03 0.02 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.03
0.59 0.12 0.01 0.8 0.0 0.03 0.01 0.16 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.47 0.05 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 2.5
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
1.16 0.0 0.0 1.85 0.1 0.03 0.04 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.24
60.18 2.16 0.0 1.65 9.79 55.43 17.32 45.56 47.5 18.84 42.13 71.86 14.12 24.27 20.23 8.61 18.47 13.02 40.06 47.67 66.04 289.25
0.04 0.02 0.0 0.27 0.03 0.04 0.0 0.08 1.17 0.02 0.1 0.69 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.32 0.2 2.87
Mp2g14480.1 (MPL1)
0.0 0.06 0.03 1.38 0.03 0.09 0.09 0.09 1.73 0.09 0.2 1.21 0.0 0.59 0.0 0.0 0.02 0.0 0.44 0.08 0.37 6.63
0.11 0.03 0.0 0.49 0.04 0.07 0.3 0.1 0.41 0.26 0.17 0.39 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 3.17
0.02 0.02 0.0 0.33 0.02 0.08 0.05 0.3 0.4 0.25 0.68 0.11 0.15 0.47 0.1 0.02 0.04 0.13 0.04 0.18 0.1 2.96
Mp3g09670.1 (GLP10)
0.08 0.0 0.0 0.25 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41
Mp3g09680.1 (GLP10)
0.08 0.0 0.0 0.25 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41
0.0 0.0 0.16 0.65 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22
Mp3g19060.1 (PCK1)
59.83 40.35 47.37 21.41 86.41 30.78 56.62 149.48 40.83 183.77 136.41 50.0 8.39 59.65 18.01 17.34 24.68 15.69 17.79 21.49 23.99 913.45
38.46 14.27 4.84 0.9 153.02 79.22 142.55 153.67 86.19 167.35 150.65 98.49 21.49 277.42 61.13 50.3 56.31 57.45 199.62 87.92 77.85 1777.79
0.29 0.04 0.0 1.11 0.02 0.15 0.24 0.33 0.25 0.23 0.11 0.12 0.06 0.32 0.16 0.07 0.04 0.04 0.09 0.4 0.78 1.51
2.98 1.24 0.0 1.16 10.28 17.71 67.49 89.5 17.9 69.81 81.23 21.1 5.36 123.77 1.62 2.19 2.27 2.13 10.19 8.63 12.43 1260.35
Mp4g00530.1 (SCPL45)
0.45 0.04 0.0 0.71 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.09
0.0 0.0 0.0 0.63 0.03 0.03 0.19 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.22 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.89
0.26 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.14 0.09 0.0 0.0 0.04 0.17 0.02 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.68
1.39 0.39 0.04 0.89 7.85 19.27 0.78 18.7 10.91 37.64 19.85 23.43 0.36 3.95 0.04 0.12 0.35 0.12 0.47 5.67 3.12 381.33
0.17 0.0 0.0 1.17 0.02 0.58 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.28
34.18 1.88 2.24 1.13 16.69 27.63 11.13 64.67 51.09 108.71 59.97 73.19 3.95 27.12 3.54 2.94 3.92 2.86 2.21 21.63 23.13 703.17
3.9 1.94 0.51 1.24 1.74 6.62 4.4 3.91 6.94 4.34 5.02 7.59 2.87 3.49 1.61 1.25 1.41 0.9 2.56 2.12 1.67 54.12
0.17 0.0 0.12 0.34 0.02 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.61
Mp5g10680.1 (TAF1)
0.2 0.04 0.0 0.29 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
0.07 0.0 0.0 0.28 0.0 2.22 4.02 3.84 2.11 1.6 5.96 0.65 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 348.23
0.02 0.0 0.0 0.17 0.01 0.16 1.29 2.46 3.63 1.15 3.51 1.46 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 99.55
Mp5g23510.1 (GLP5)
0.03 0.0 0.07 0.54 0.0 0.01 0.17 0.11 0.0 0.07 0.49 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 55.67
9.11 2.36 0.0 0.6 1.08 6.36 3.66 9.75 4.56 6.15 4.84 4.94 5.74 1.59 0.76 1.27 0.76 1.64 2.94 4.02 4.54 48.6
1.35 0.88 0.0 0.9 1.4 4.36 10.61 5.19 3.36 5.18 14.3 1.29 0.6 2.19 1.6 1.89 1.91 3.4 0.5 0.53 0.59 96.71
0.41 0.0 0.0 0.0 0.39 1.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.85 8.94
1.47 0.66 0.0 1.06 0.62 0.47 0.0 0.0 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.3
0.05 0.0 0.08 0.7 0.04 0.0 0.05 0.08 0.0 0.13 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 6.7
0.32 0.0 0.0 1.01 0.24 0.65 1.08 0.94 0.0 1.05 0.98 0.0 0.02 0.65 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 54.87
Mp6g20660.1 (GLP5)
0.03 0.0 0.0 0.34 0.0 0.32 1.53 1.41 0.0 0.96 1.88 0.0 0.09 0.17 0.17 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35.82
0.16 0.0 0.0 0.38 0.01 0.12 2.33 0.97 0.05 0.71 1.28 0.14 0.17 3.18 0.04 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 19.85
Mp7g15010.1 (RCI3)
0.11 0.0 0.0 0.4 0.12 0.14 0.41 1.34 0.35 0.68 1.69 0.25 0.19 0.37 0.0 0.09 0.05 0.05 0.0 0.14 0.08 41.24
0.31 0.2 0.0 0.39 0.15 0.62 0.28 0.16 0.0 0.56 0.51 0.6 0.35 0.27 0.2 0.58 0.31 0.3 0.23 0.12 0.0 6.31
0.24 0.0 0.0 0.26 0.62 1.3 0.38 2.64 6.44 1.94 2.47 7.12 0.4 9.12 0.07 0.04 0.03 0.07 7.58 12.48 6.81 100.11
Mp8g12470.1 (GL22)
0.33 0.1 0.92 0.54 0.27 0.22 0.07 4.3 0.0 1.38 2.5 0.28 0.0 2.07 0.09 0.0 0.0 0.0 1.72 0.39 0.51 32.17
0.26 0.2 0.0 0.91 0.0 0.79 0.14 0.29 0.0 0.24 0.47 0.0 0.0 0.23 0.0 0.55 0.0 0.19 0.84 0.23 1.01 26.08
0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 1.51 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 0.0 0.0 0.0 0.0 3.28 0.0 0.0 16.68
0.46 0.29 9.38 7.57 0.75 0.4 2.64 0.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 21.5
0.46 0.29 9.38 7.57 0.75 0.4 2.64 0.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 21.5

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)