Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Msp_g08592	-3.98	-5.76	-3.97	-6.8	-3.06	-2.4	2.71
Msp_g08693	-2.42	-4.55	-	-	-2.18	-1.47	2.63
Msp_g09843	-	-	-	-	-3.43	-2.32	2.75
Msp_g12005	-0.24	-1.52	-1.72	-2.15	-1.82	-1.69	2.23
Msp_g12638	-6.52	-5.01	-6.85	-3.92	-6.18	-2.84	2.75
Msp_g17135 (PIP2)	-1.01	-3.25	-1.92	-3.71	-6.58	-4.32	2.58
Msp_g17896	-1.08	-3.37	-2.3	-2.96	-3.17	-3.52	2.56
Msp_g17901	-14.42	-8.7	-11.46	-7.96	-13.1	-4.94	2.8
Msp_g18129	-	-1.82	-6.56	-2.32	-5.5	-2.09	2.64
Msp_g19149	-2.12	-3.63	-3.14	-1.89	-	-2.87	2.63
Msp_g19227	-0.98	-3.24	-1.82	-1.93	-3.73	-2.35	2.48
Msp_g19848	-3.13	-2.74	-3.17	-2.05	-3.52	-2.88	2.62
Msp_g20457	-3.41	-4.42	-3.95	-5.95	-5.85	-4.67	2.75
Msp_g27733	-	-16.2	-	-13.94	-	-5.55	2.8
Msp_g28043	-	-	-15.5	-14.52	-	-5.52	2.8
Msp_g28928	-	-	-	-14.74	-	-5.17	2.8
Msp_g28940 (CCD4)	-	-	-	-4.79	-2.09	-2.55	2.71
Msp_g28954	-5.13	-	-5.86	-	-5.44	-2.84	2.76
Msp_g29018	-13.96	-12.34	-11.51	-11.22	-10.5	-3.56	2.79
Msp_g29107	-	-	-	-	-	-4.15	2.8
Msp_g29336	-5.41	-6.23	-	-6.69	-5.8	-2.76	2.76
Msp_g29360 (ADH2)	-2.57	-4.63	-3.48	-6.02	-5.11	-2.25	2.69
Msp_g29494	-	-	-	-	-	-5.28	2.8
Msp_g29725	-9.09	-2.85	-4.83	-2.18	-6.21	-2.82	2.69
Msp_g29749	-	-2.95	-3.43	-2.9	-6.05	-1.8	2.66
Msp_g30299 (PDLP6)	-	-6.93	-7.69	-6.84	-11.31	-4.79	2.8
Msp_g30451	-8.63	-	-9.71	-	-7.96	-5.29	2.8
Msp_g30546	-	-14.28	-	-13.34	-	-5.07	2.8
Msp_g30699	-5.33	-6.14	-10.31	-7.08	-	-1.97	2.74
Msp_g30946	-2.91	-6.07	-6.11	-5.0	-3.03	-2.16	2.69
Msp_g31057	-6.35	-4.75	-7.46	-4.59	-3.06	-1.56	2.69
Msp_g31754	-	-	-	-	-	-7.35	2.81
Msp_g32668 (PCK1)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32688	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32741	-	-4.25	-	-	-4.17	-	2.78
Msp_g32746	-7.49	-5.0	-4.64	-5.32	-13.07	-4.98	2.78
Msp_g32872	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32881	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32892	-1.94	-3.72	-4.37	-5.33	-4.29	-2.81	2.68
Msp_g32913	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33062	-4.99	-3.58	-	-	-	-4.07	2.77
Msp_g33070 (PA2)	-	-7.11	-6.25	-5.53	-8.55	-4.28	2.79
Msp_g33073	-7.04	-	-7.25	-	-5.66	-2.51	2.76
Msp_g33076	-4.39	-	-6.16	-6.9	-	-3.85	2.78
Msp_g33079	-1.03	-2.15	-1.56	-2.91	-3.95	-1.39	2.42
Msp_g33147	-2.38	-3.19	-2.86	-3.35	-3.0	-2.58	2.63
Msp_g33171	-3.03	-2.9	-1.35	-	-4.23	-2.75	2.62
Msp_g33172	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33185	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33195	-1.48	-4.61	-2.62	-7.2	-5.85	-3.66	2.66
Msp_g33202	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33269	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33330	-3.41	-2.06	-4.55	-2.01	-	-	2.67
Msp_g33336 (SHR)	-4.02	-2.66	-5.04	-2.85	-	-	2.72
Msp_g33350	-	-	-	-3.08	-	-	2.78
Msp_g33362	-	-	-	-3.14	-	-	2.78
Msp_g33395	-	-4.46	-2.36	-3.93	-1.86	-1.26	2.59
Msp_g33476	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33482 (RD19)	-	-	-	-	-	-5.18	2.8
Msp_g33522	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33611	-	-	-	-	-	-5.22	2.8
Msp_g33637	-3.63	-	-	-	-	-2.65	2.76
Msp_g33673 (KAO2)	-5.67	-	-	-5.18	-6.78	-7.12	2.79
Msp_g33748 (UBQ11)	-3.87	-	-	-2.19	-	-	2.75
Msp_g33779	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33807	-12.77	-	-	-	-	-5.87	2.8
Msp_g33812	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33952	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33953	-	-	-	-	-	-0.92	2.69
Msp_g34014	-0.46	-	-6.44	-	-	-	2.65
Msp_g34084	-	-	-	-	-	-1.81	2.75
Msp_g34086	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34118	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34162	-1.43	-6.35	-4.37	-3.71	-	-	2.7
Msp_g34186	-5.71	-	-6.1	-	-2.57	-3.77	2.75
Msp_g34211	-0.64	-4.8	-1.66	-3.76	-5.87	-3.63	2.54
Msp_g34273	-5.26	-	-	-7.16	-6.93	-4.03	2.79
Msp_g34322 (HCT)	-	-2.88	-	-	-	-	2.78
Msp_g34379 (CYP707A3)	-	-	-3.7	-4.57	-	-4.61	2.77
Msp_g34382	-1.73	-3.67	-3.18	-4.79	-2.59	-1.56	2.58
Msp_g34428	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34456	-5.58	-	-	-	-5.54	-1.52	2.72
Msp_g34589	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34638	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34694	-	-4.93	-	-	-	-	2.8
Msp_g34698	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34755	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34922	-	-	-	-	-	-3.81	2.79
Msp_g34977 (RABA1e)	-	-	-2.51	-	-	-	2.77
Msp_g35030	-0.04	-4.42	-1.77	-3.22	-	-	2.48
Msp_g35079	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35173	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35179	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35257	-	-3.38	-5.22	-4.11	-	-4.49	2.76
Msp_g35277	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35350	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35382 (PA2)	-	-	-	-	-	-6.43	2.8
Msp_g35391	-	-4.43	-	-4.62	-	-	2.79
Msp_g35592	-0.82	-	-	-	-	-3.69	2.67
Msp_g35607	-3.17	-	-6.12	-	-6.04	-3.99	2.76
Msp_g35612 (RAP2.11)	-2.77	-6.23	-6.13	-7.81	-7.31	-3.4	2.75
Msp_g35653	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35666	-	-	-	-	-	-3.79	2.79
Msp_g35697	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35745 (OMT1)	-10.5	-9.07	-	-9.5	-6.03	-2.37	2.76
Msp_g35747	-5.18	-	-5.99	-	-4.55	-1.4	2.71
Msp_g35750	-5.87	-	-	-	-	-3.9	2.79
Msp_g35751	-	-	-	-	-	-4.53	2.8
Msp_g35768	-1.94	-7.36	-5.16	-8.18	-6.3	-3.55	2.72
Msp_g35772	-2.41	-	-	-	-2.71	-3.44	2.72
Msp_g35996	-8.23	-	-	-	-	-6.55	2.8
Msp_g36026	-	-3.07	-2.46	-	-	-	2.74
Msp_g36052 (CYP704B1)	-6.3	-6.4	-3.89	-	-7.23	-6.17	2.78
Msp_g36137	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36258	-	-	-	-14.03	-	-5.43	2.8
Msp_g36261	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36301	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36329 (GRP4)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36352 (HSP70)	-3.62	-5.23	-5.19	-4.47	-6.44	-7.46	2.77
Msp_g36353	-2.76	-1.49	-2.62	-1.24	-2.29	-1.12	2.39
Msp_g36383	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36390	-	-4.33	-	-	-	-	2.8
Msp_g36406	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36421	-7.06	-6.29	-5.85	-	-5.58	-5.6	2.79
Msp_g36463	-	-	-	-	-	-1.09	2.71
Msp_g36500	-	-	-	-	-	-5.01	2.8
Msp_g36662	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36771	-1.72	-1.22	-2.52	-1.36	-3.56	-2.88	2.45
Msp_g36803	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36811	-9.15	-9.33	-9.26	-9.48	-	-3.92	2.79
Msp_g36877	-4.03	-4.84	-4.2	-4.16	-3.6	-2.72	2.71
Msp_g36878	-	-	-	-	-	-3.44	2.79
Msp_g36941	-3.32	-	-3.82	-6.31	-5.28	-4.87	2.76
Msp_g36950	-7.02	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36953	-	-3.69	-6.47	-4.02	-4.85	-0.89	2.65
Msp_g37017 (EXPA4)	-5.38	-	-	-	-	-3.12	2.78
Msp_g37024	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37029 (RPL18)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37030 (RPS15)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37058	-5.15	-2.64	-3.89	-1.63	-4.83	-3.58	2.66
Msp_g37107	-2.48	-2.75	-	-	-3.59	-	2.72
Msp_g37135	-5.98	-	-	-	-4.17	-1.88	2.73
Msp_g37244	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37253	-	-	-	-6.99	-5.12	-1.37	2.72
Msp_g37254	-7.26	-8.02	-6.79	-7.1	-7.73	-3.23	2.78
Msp_g37281	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37311	-	-8.45	-9.64	-7.55	-	-5.79	2.8
Msp_g37426 (SCR)	-5.84	-5.07	-5.05	-4.68	-4.07	-3.26	2.75
Msp_g37450 (CLC-C)	-2.36	-3.0	-5.6	-3.06	-	-2.7	2.67
Msp_g37520 (LAC1)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37591	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37598	-3.33	-	-2.52	-5.35	-6.98	-5.92	2.74
Msp_g37630	-	-	-	-	-	-3.12	2.78
Msp_g37680	-	-16.1	-17.06	-14.22	-15.7	-5.7	2.8
Msp_g37763	-5.13	-6.81	-5.96	-	-	-	2.8
Msp_g37775	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37776	-4.44	-	-8.9	-	-	-7.27	2.8
Msp_g37798 (SYP123)	-5.34	-	-	-4.78	-	-3.16	2.77
Msp_g37857	-	-4.66	-7.17	-4.22	-1.86	-3.15	2.7
Msp_g37968	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38020	-	-	-	-	-	-4.82	2.8
Msp_g38053	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38140	-4.26	-	-5.64	-4.06	-5.57	-2.05	2.72
Msp_g38149	-	-	-	-	-	-5.57	2.8
Msp_g38336	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38355	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38356	-2.41	-	-	-	-	-	2.77
Msp_g38490	-	-	-	-	-	-2.68	2.77
Msp_g38615 (RSL2)	-	-5.25	-	-5.02	-4.11	-2.32	2.74
Msp_g38618 (PMA)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38650	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38678	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38745	-1.27	-	-3.48	-	-	-	2.7
Msp_g39013	-	-5.09	-5.03	-4.89	-3.76	-	2.77
Msp_g39086	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39216 (CYP704B1)	-5.96	-	-4.32	-	-6.53	-6.34	2.79
Msp_g39217 (CYP704B1)	-	-	-3.58	-	-	-	2.79
Msp_g39223	-3.11	-3.16	-5.36	-1.85	-3.46	-2.63	2.64
Msp_g39238	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39276	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39321	-2.41	-3.46	-3.31	-2.07	-3.42	-4.12	2.64
Msp_g39347 (TUB8)	-4.8	-1.6	-2.42	-1.56	-	-	2.61
Msp_g39417	-	-	-	-	-6.72	-1.12	2.71
Msp_g39559 (GAI)	-	-	-	-5.46	-7.39	-4.77	2.79
Msp_g39615	-1.23	-	-5.29	-5.15	-	-4.6	2.7
Msp_g39675	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39753	-	-	-	-	-	-5.28	2.8
Msp_g39796	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39849	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39905	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39911	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39915	-	-	-	-	-	-4.86	2.8
Msp_g39942	-6.35	-10.24	-7.65	-11.24	-4.02	-2.25	2.75
Msp_g39953	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39965	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g41515	-0.87	-7.85	-7.81	-	-	-5.42	2.68
Msp_g44952 (ILR3)	-3.39	-6.32	-4.22	-7.48	-4.73	-3.51	2.75
Msp_g46973	-1.77	-8.18	-4.39	-6.77	-	-4.63	2.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.