1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.3 0.09 0.3 0.04 0.57 0.9 31.0
0.2 0.05 0.0 0.0 0.24 0.39 6.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.37 12.49
18.95 7.77 6.76 5.04 6.32 6.9 104.64
1.43 4.08 1.14 8.7 1.81 18.29 884.14
Msp_g17135 (PIP2)
 24.28 5.14 12.88 3.72 0.51 2.44 292.25
5.03 1.03 2.17 1.37 1.19 0.93 62.96
0.03 1.59 0.23 2.64 0.08 21.4 4585.74
0.0 1.09 0.04 0.77 0.09 0.91 24.09
0.22 0.08 0.11 0.26 0.0 0.13 5.98
3.19 0.67 1.78 1.65 0.47 1.23 35.07
1.3 1.71 1.27 2.75 1.0 1.55 70.29
2.12 1.05 1.46 0.36 0.39 0.89 151.3
0.0 0.03 0.0 0.14 0.0 47.58 15608.0
0.0 0.0 0.08 0.16 0.0 83.17 26595.43
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 44.53 11149.74
Msp_g28940 (CCD4)
 0.0 0.0 0.0 0.09 0.57 0.41 15.85
0.06 0.0 0.03 0.0 0.05 0.28 13.7
0.05 0.15 0.27 0.33 0.54 65.79 5373.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 37.04
0.12 0.07 0.0 0.05 0.1 0.78 35.86
Msp_g29360 (ADH2)
 1.74 0.42 0.93 0.16 0.3 2.19 66.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 201.76
0.04 3.08 0.78 4.89 0.3 3.15 143.09
0.0 0.86 0.62 0.89 0.1 1.9 42.07
Msp_g30299 (PDLP6)
 0.0 0.29 0.17 0.3 0.01 1.26 242.65
0.11 0.0 0.05 0.0 0.17 1.08 292.99
0.0 0.05 0.0 0.1 0.0 31.22 7300.07
1.11 0.63 0.03 0.33 0.0 11.32 297.7
0.31 0.03 0.03 0.07 0.29 0.52 15.07
0.04 0.13 0.02 0.15 0.42 1.19 22.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 631.83
Msp_g32668 (PCK1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 7.09
2.0 11.28 14.45 9.05 0.04 11.46 2475.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.56
0.41 0.12 0.08 0.04 0.08 0.22 10.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 2.58
Msp_g33070 (PA2)
 0.0 0.02 0.04 0.07 0.01 0.17 22.67
0.05 0.0 0.04 0.0 0.12 1.1 42.43
0.1 0.0 0.03 0.02 0.0 0.15 14.66
0.47 0.21 0.32 0.13 0.06 0.36 5.11
1.7 0.97 1.21 0.87 1.11 1.48 54.48
0.15 0.16 0.47 0.0 0.06 0.18 7.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.59
0.62 0.07 0.28 0.01 0.03 0.14 10.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.33
0.36 0.91 0.16 0.95 0.0 0.0 24.28
Msp_g33336 (SHR)
 0.02 0.06 0.01 0.05 0.0 0.0 2.57
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 5.61
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 4.15
0.0 0.16 0.7 0.24 0.99 1.5 21.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.06
Msp_g33482 (RD19)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 10.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 15.46
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 4.87
Msp_g33673 (KAO2)
 0.07 0.0 0.0 0.1 0.03 0.03 24.41
Msp_g33748 (UBQ11)
 0.03 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 2.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.93
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 3.34 1366.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 10.49
4.82 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 41.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 25.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.0
3.05 0.1 0.4 0.62 0.0 0.0 53.13
0.02 0.0 0.01 0.0 0.17 0.08 6.89
2.08 0.12 1.02 0.24 0.06 0.26 18.9
0.32 0.0 0.0 0.09 0.1 0.75 85.15
Msp_g34322 (HCT)
 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 2.97
Msp_g34379 (CYP707A3)
 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 6.16
2.09 0.55 0.76 0.25 1.15 2.36 41.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29.96
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.36 6.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 3.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 5.4
Msp_g34977 (RABA1e)
 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 2.73
1.18 0.06 0.36 0.13 0.0 0.0 6.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.76
0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 1.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.75
Msp_g35382 (PA2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 82.44
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 6.68
1.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 11.7
0.17 0.0 0.02 0.0 0.02 0.1 10.36
Msp_g35612 (RAP2.11)
 0.38 0.03 0.04 0.01 0.02 0.25 17.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 3.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.98
Msp_g35745 (OMT1)
 0.01 0.02 0.0 0.02 0.2 2.53 88.59
0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.28 4.83
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 78.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 29.47
0.35 0.01 0.04 0.0 0.02 0.11 8.84
0.11 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 3.72
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 31.42
0.0 0.13 0.2 0.0 0.0 0.0 7.39
Msp_g36052 (CYP704B1)
 0.02 0.02 0.13 0.0 0.01 0.03 13.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 34.31 10333.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.34
Msp_g36329 (GRP4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.44
Msp_g36352 (HSP70)
 0.06 0.02 0.02 0.03 0.01 0.0 4.91
0.45 1.09 0.5 1.3 0.62 1.41 16.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.3
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 4.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.18
0.09 0.15 0.2 0.0 0.24 0.24 79.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 13.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 5.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.61
12.02 16.97 6.89 15.47 3.35 5.36 216.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.54
0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.83 87.7
0.42 0.24 0.37 0.38 0.56 1.04 44.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 32.94
0.09 0.0 0.06 0.01 0.02 0.03 5.99
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.69
0.0 0.05 0.01 0.04 0.02 0.38 4.41
Msp_g37017 (EXPA4)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 4.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.47
Msp_g37029 (RPL18)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.57
Msp_g37030 (RPS15)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.18
0.02 0.12 0.05 0.23 0.03 0.06 4.54
0.07 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 2.52
0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.29 7.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.55
0.0 0.0 0.0 0.09 0.31 4.18 71.22
0.05 0.03 0.08 0.06 0.04 0.89 57.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.38
0.0 0.1 0.04 0.19 0.0 0.65 249.84
Msp_g37426 (SCR)
 0.03 0.05 0.05 0.06 0.1 0.17 11.16
Msp_g37450 (CLC-C)
 0.2 0.13 0.02 0.12 0.0 0.16 6.43
Msp_g37520 (LAC1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.33
0.07 0.0 0.12 0.02 0.01 0.01 4.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 7.09
0.0 0.03 0.02 0.13 0.05 47.22 17128.43
0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 5.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.25
0.43 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 64.29
Msp_g37798 (SYP123)
 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 5.3
0.0 0.09 0.02 0.12 0.64 0.26 15.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 11.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.27
0.2 0.0 0.08 0.23 0.08 0.95 25.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 34.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.27
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 5.2
Msp_g38615 (RSL2)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.09 3.16
Msp_g38618 (PMA)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.29
0.44 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 6.97
0.0 0.04 0.05 0.05 0.11 0.0 10.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.83
Msp_g39216 (CYP704B1)
 0.04 0.0 0.14 0.0 0.03 0.03 18.71
Msp_g39217 (CYP704B1)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 4.8
1.08 1.04 0.23 2.59 0.85 1.51 58.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.86
1.58 0.76 0.84 2.0 0.78 0.48 52.2
Msp_g39347 (TUB8)
 0.04 0.35 0.2 0.36 0.0 0.0 6.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.37 5.19
Msp_g39559 (GAI)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 3.25
1.42 0.0 0.09 0.09 0.0 0.14 21.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 142.72
2.48 0.17 1.01 0.08 12.49 42.65 1362.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.43
1.39 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 16.38
Msp_g44952 (ILR3)
 0.23 0.03 0.13 0.01 0.09 0.21 16.32
1.45 0.02 0.24 0.05 0.0 0.2 32.69

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)