Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
1.0 0.92 0.91 1.0 0.07 0.19 0.65
Msp_g01206 (PUB17)
0.88 0.59 0.84 1.0 0.05 0.05 0.56
0.59 0.33 1.0 0.54 0.13 0.07 0.65
0.84 0.83 1.0 0.9 0.16 0.35 0.94
0.88 0.73 1.0 0.95 0.5 0.65 0.93
0.54 0.56 1.0 0.71 0.15 0.23 0.72
0.87 0.87 0.8 1.0 0.36 0.36 0.76
Msp_g05278 (PAO5)
0.92 0.43 1.0 0.74 0.12 0.19 0.89
0.16 0.33 1.0 0.47 0.08 0.26 0.97
0.58 0.56 1.0 0.75 0.03 0.06 0.64
Msp_g05912 (FER3)
0.65 0.78 0.82 0.97 0.48 0.72 1.0
0.76 0.68 1.0 0.79 0.42 0.4 0.6
0.51 0.48 0.93 0.62 0.08 0.19 1.0
0.63 0.44 1.0 0.62 0.1 0.15 0.7
0.71 0.52 1.0 0.58 0.13 0.29 0.66
0.96 0.86 0.88 1.0 0.55 0.57 0.89
0.47 0.58 0.73 0.59 0.31 0.33 1.0
0.74 0.59 0.95 1.0 0.25 0.38 0.74
Msp_g09444 (ECA2)
0.54 0.58 0.85 0.89 0.07 0.18 1.0
0.73 0.72 1.0 0.82 0.13 0.31 0.98
0.77 0.58 1.0 0.85 0.09 0.08 0.59
Msp_g10836 (ERF7)
0.76 0.71 0.92 1.0 0.17 0.22 0.6
Msp_g11189 (JAZ2)
0.88 0.49 1.0 0.7 0.33 0.49 0.64
Msp_g11303 (XT2)
0.67 0.75 0.94 1.0 0.33 0.47 0.91
Msp_g11653 (ELF4)
0.92 0.81 0.9 0.76 0.57 0.5 1.0
0.87 0.42 1.0 0.7 0.19 0.21 0.73
0.65 0.61 0.76 0.77 0.43 0.36 1.0
0.76 0.49 1.0 0.49 0.25 0.3 0.66
0.71 0.88 0.97 1.0 0.45 0.68 0.84
Msp_g14138 (ERF-1)
0.88 0.72 0.83 1.0 0.16 0.29 0.63
0.83 0.55 1.0 0.69 0.33 0.52 0.92
0.69 0.65 1.0 0.69 0.47 0.41 0.72
0.73 0.8 1.0 0.77 0.49 0.52 0.77
Msp_g14818 (ACA8)
0.66 0.64 0.98 1.0 0.1 0.13 0.59
Msp_g15446 (PUB44)
0.45 0.35 0.74 0.43 0.53 0.44 1.0
Msp_g15691 (GLT1)
0.49 0.76 1.0 0.78 0.49 0.45 0.78
0.75 0.85 0.83 1.0 0.13 0.23 0.72
0.65 0.59 1.0 0.96 0.24 0.2 0.68
0.97 0.9 0.86 1.0 0.07 0.15 0.72
0.68 0.8 1.0 0.93 0.44 0.73 0.85
0.3 0.42 0.8 1.0 0.05 0.05 0.6
0.34 0.6 1.0 0.59 0.01 0.01 0.15
0.67 0.74 0.97 1.0 0.19 0.32 0.77
0.32 0.53 1.0 0.66 0.02 0.04 0.1
0.42 0.7 0.85 0.56 0.29 0.37 1.0
0.52 0.6 1.0 0.56 0.09 0.27 0.59
0.53 0.47 1.0 0.67 0.38 0.3 0.56
0.74 0.63 1.0 0.68 0.0 0.01 0.41
0.92 0.64 0.85 1.0 0.27 0.27 0.53
0.52 0.76 0.84 0.91 0.29 0.19 1.0
0.4 1.0 0.98 0.61 0.35 0.44 0.4
0.38 0.42 1.0 0.81 0.06 0.04 0.57
Msp_g18169 (ATOEP16-S)
0.92 0.74 0.62 0.83 0.04 0.19 1.0
0.48 0.41 0.46 1.0 0.41 0.3 0.47
Msp_g19113 (GSL5)
0.66 0.69 1.0 0.84 0.39 0.45 0.59
Msp_g19708 (WRKY71)
0.69 0.78 1.0 0.99 0.13 0.21 0.56
0.54 0.53 1.0 0.65 0.13 0.18 0.84
Msp_g20856 (RKF3)
0.23 0.97 1.0 0.91 0.26 0.82 0.9
0.53 0.78 1.0 0.63 0.06 0.08 0.77
0.32 0.78 0.88 0.51 0.21 0.21 1.0
0.6 0.42 1.0 0.54 0.18 0.22 0.46
0.21 0.47 0.74 0.49 0.03 0.06 1.0
0.56 0.51 1.0 0.56 0.24 0.21 0.61
0.21 0.48 1.0 0.59 0.15 0.07 0.48
0.55 0.5 0.72 0.63 0.58 0.51 1.0
Msp_g22927 (ACR4)
0.61 0.73 0.78 1.0 0.12 0.21 0.66
Msp_g22999 (ACA9)
0.24 0.33 1.0 0.76 0.13 0.21 0.84
0.1 1.0 0.92 0.66 0.01 0.13 0.48
0.99 0.64 1.0 0.87 0.43 0.44 0.67
0.22 1.0 0.82 0.66 0.08 0.2 0.53
0.52 0.46 1.0 0.63 0.19 0.24 0.7
0.06 0.2 1.0 0.33 0.1 0.15 0.53
0.47 0.95 0.91 1.0 0.45 0.32 0.89
Msp_g24344 (ERD7)
0.72 0.55 1.0 0.73 0.22 0.31 0.66
Msp_g24437 (UGT85A1)
0.48 0.74 0.94 0.71 0.51 0.47 1.0
0.51 0.81 1.0 0.74 0.24 0.18 0.49
Msp_g25344 (ZHD4)
0.8 0.74 1.0 0.77 0.76 0.67 0.81
Msp_g25401 (CLC-C)
0.15 0.45 1.0 0.59 0.08 0.17 0.75
Msp_g25869 (CYP707A3)
0.51 0.44 1.0 0.54 0.1 0.11 0.69
0.91 0.83 0.9 1.0 0.31 0.37 0.84
0.87 0.76 0.85 1.0 0.32 0.37 0.88
0.44 0.81 0.94 1.0 0.18 0.13 0.77
Msp_g26846 (EXO)
0.78 0.74 0.98 1.0 0.37 0.5 0.92
0.58 0.47 1.0 0.61 0.24 0.32 0.45
0.83 0.56 1.0 0.7 0.19 0.37 0.67
0.59 0.39 1.0 0.41 0.2 0.17 0.27
0.83 0.8 0.91 1.0 0.11 0.19 0.63
0.59 0.42 1.0 0.43 0.19 0.25 0.24
0.46 0.49 0.71 1.0 0.43 0.53 0.61
0.2 0.97 1.0 0.65 0.0 0.17 0.61
0.03 0.73 1.0 0.73 0.18 0.14 0.56
0.24 0.99 1.0 0.7 0.22 0.46 0.96
0.51 0.44 1.0 0.55 0.04 0.07 0.49
0.5 0.77 1.0 0.9 0.48 0.72 0.89
0.68 0.6 1.0 0.71 0.14 0.42 0.56
0.73 0.65 0.84 0.82 0.56 0.49 1.0
0.85 0.51 1.0 0.8 0.25 0.26 0.7
0.81 0.36 1.0 0.41 0.0 0.01 1.0
0.33 0.47 1.0 0.39 0.03 0.12 0.82
0.98 0.62 1.0 0.7 0.08 0.32 0.94
0.25 0.62 0.79 0.68 0.18 0.35 1.0
0.45 0.55 1.0 0.69 0.53 0.29 0.58
0.51 0.65 0.88 0.5 0.23 0.4 1.0
0.22 0.19 1.0 0.44 0.26 0.0 1.0
0.73 0.85 0.71 0.9 0.39 0.33 1.0
0.43 0.68 1.0 0.82 0.17 0.18 0.35
0.35 0.36 1.0 0.25 0.0 0.04 0.8
0.53 0.5 1.0 0.62 0.35 0.49 0.8
0.7 0.66 0.79 1.0 0.18 0.16 0.68
0.51 0.56 1.0 0.78 0.01 0.03 0.26
0.38 0.67 1.0 0.82 0.15 0.23 0.36
0.54 0.7 1.0 0.77 0.05 0.37 0.44
0.58 0.53 1.0 0.74 0.41 0.55 0.84
Msp_g41693 (ANN5)
1.0 0.17 0.92 0.1 0.09 0.13 0.71
0.63 0.39 1.0 0.29 0.04 0.16 0.64
0.35 0.3 1.0 0.65 0.06 0.07 0.59
0.48 0.45 1.0 0.43 0.2 0.21 0.88
0.81 0.75 0.9 1.0 0.11 0.15 0.48
0.4 0.6 1.0 0.65 0.3 0.52 0.76
0.13 0.61 1.0 0.7 0.27 0.16 0.32
0.73 0.07 1.0 0.22 0.05 0.07 0.94
0.39 1.0 0.91 0.73 0.28 0.31 0.78
0.87 0.53 1.0 0.75 0.23 0.45 0.88
Msp_g46895 (CRK8)
0.17 0.42 0.97 1.0 0.18 0.39 0.03
0.92 0.7 1.0 0.95 0.49 0.52 0.92
0.64 0.66 1.0 1.0 0.13 0.29 0.72
0.64 0.71 0.89 0.77 0.09 0.14 1.0
0.84 0.58 0.81 1.0 0.27 0.24 0.5
0.64 0.68 1.0 0.57 0.27 0.21 0.61
0.96 0.84 0.97 1.0 0.35 0.42 0.82
0.63 0.75 1.0 0.76 0.16 0.2 0.79
0.71 0.58 1.0 0.7 0.23 0.32 0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)