1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
63.15 57.88 57.6 63.12 4.48 11.9 40.82
Msp_g01206 (PUB17)
 54.76 36.35 52.34 62.12 3.21 3.2 34.93
11.98 6.69 20.21 10.95 2.55 1.34 13.18
52.27 51.55 62.23 56.02 10.15 21.8 58.24
13.51 11.11 15.32 14.51 7.62 9.91 14.25
24.04 25.07 44.81 32.03 6.8 10.29 32.44
27.01 27.25 25.01 31.19 11.17 11.37 23.72
Msp_g05278 (PAO5)
 10.17 4.74 11.11 8.27 1.33 2.14 9.91
0.96 1.94 5.96 2.8 0.5 1.53 5.77
88.69 84.61 152.1 113.4 4.11 8.81 97.6
Msp_g05912 (FER3)
 21.27 25.67 26.94 31.88 15.62 23.48 32.72
73.87 66.25 96.74 75.99 40.92 38.81 58.17
4.93 4.57 8.96 5.99 0.78 1.85 9.61
22.02 15.44 34.85 21.48 3.41 5.09 24.47
20.13 14.79 28.39 16.47 3.8 8.12 18.63
62.63 56.33 57.71 65.47 35.73 37.48 58.31
1.56 1.92 2.43 1.96 1.02 1.08 3.32
2.87 2.31 3.7 3.89 0.99 1.49 2.9
Msp_g09444 (ECA2)
 1.92 2.07 3.0 3.16 0.26 0.65 3.54
12.66 12.57 17.41 14.23 2.18 5.48 17.09
16.64 12.49 21.66 18.43 2.03 1.67 12.75
Msp_g10836 (ERF7)
 232.13 217.64 283.4 307.22 51.99 66.15 183.08
Msp_g11189 (JAZ2)
 34.01 18.96 38.5 27.03 12.61 18.73 24.71
Msp_g11303 (XT2)
 27.24 30.68 38.29 40.7 13.29 18.99 36.95
Msp_g11653 (ELF4)
 249.13 218.05 244.35 204.64 153.33 135.65 270.5
5.84 2.86 6.74 4.74 1.31 1.4 4.95
5.2 4.89 6.05 6.18 3.43 2.85 8.01
4.28 2.78 5.66 2.75 1.43 1.72 3.72
3.56 4.42 4.86 5.02 2.26 3.44 4.22
Msp_g14138 (ERF-1)
 15.39 12.56 14.44 17.49 2.87 5.0 11.03
13.29 8.8 16.07 11.11 5.28 8.3 14.77
11.59 10.88 16.79 11.64 7.97 6.95 12.06
3.26 3.57 4.48 3.45 2.18 2.35 3.47
Msp_g14818 (ACA8)
 23.4 22.66 34.77 35.41 3.71 4.64 20.91
Msp_g15446 (PUB44)
 2.15 1.63 3.51 2.03 2.5 2.07 4.73
Msp_g15691 (GLT1)
 21.93 33.85 44.66 34.73 21.86 20.25 35.06
69.67 78.4 76.73 92.72 11.81 21.45 67.04
18.88 17.04 28.97 27.77 6.92 5.75 19.67
48.38 45.14 43.05 50.11 3.42 7.7 36.31
4.97 5.87 7.32 6.82 3.22 5.35 6.19
7.11 10.03 18.9 23.62 1.22 1.28 14.28
4.24 7.35 12.35 7.27 0.07 0.17 1.91
5.13 5.71 7.44 7.69 1.48 2.49 5.89
1.77 2.94 5.5 3.64 0.13 0.22 0.57
3.4 5.6 6.81 4.53 2.34 3.0 8.02
4.22 4.84 8.07 4.52 0.72 2.2 4.77
4.86 4.32 9.11 6.08 3.44 2.77 5.11
2.43 2.07 3.31 2.24 0.0 0.05 1.35
14.95 10.49 13.91 16.34 4.34 4.49 8.7
23.92 34.96 38.38 41.94 13.4 8.9 45.96
2.44 6.07 5.93 3.69 2.14 2.67 2.42
5.87 6.55 15.5 12.51 0.92 0.65 8.84
Msp_g18169 (ATOEP16-S)
 19.03 15.33 12.66 17.03 0.84 3.98 20.57
1.14 0.98 1.1 2.39 0.98 0.72 1.13
Msp_g19113 (GSL5)
 11.69 12.26 17.76 14.99 6.99 7.98 10.44
Msp_g19708 (WRKY71)
 17.86 20.26 25.82 25.64 3.32 5.34 14.37
33.28 32.63 61.25 39.69 8.24 11.21 51.74
Msp_g20856 (RKF3)
 1.31 5.46 5.61 5.09 1.45 4.61 5.07
6.22 9.2 11.8 7.42 0.7 0.97 9.09
1.63 4.02 4.53 2.6 1.1 1.08 5.13
2.89 2.0 4.81 2.57 0.87 1.06 2.23
0.71 1.62 2.54 1.68 0.1 0.2 3.43
1.99 1.8 3.54 1.97 0.84 0.74 2.17
0.81 1.85 3.89 2.3 0.57 0.26 1.86
5.11 4.6 6.73 5.82 5.35 4.69 9.28
Msp_g22927 (ACR4)
 15.42 18.44 19.74 25.3 3.01 5.38 16.59
Msp_g22999 (ACA9)
 2.15 2.91 8.89 6.8 1.19 1.86 7.46
0.94 9.24 8.52 6.09 0.13 1.18 4.44
6.8 4.35 6.84 5.97 2.98 3.03 4.61
1.91 8.63 7.07 5.72 0.67 1.77 4.54
20.73 18.61 40.13 25.46 7.58 9.72 28.08
1.13 3.68 18.52 6.15 1.8 2.75 9.83
5.18 10.47 10.02 11.02 4.98 3.56 9.86
Msp_g24344 (ERD7)
 17.61 13.55 24.57 17.94 5.4 7.53 16.2
Msp_g24437 (UGT85A1)
 5.03 7.77 9.79 7.45 5.28 4.93 10.45
2.87 4.54 5.59 4.15 1.33 0.98 2.76
Msp_g25344 (ZHD4)
 5.96 5.5 7.48 5.76 5.66 5.04 6.06
Msp_g25401 (CLC-C)
 0.99 2.85 6.39 3.76 0.52 1.08 4.79
Msp_g25869 (CYP707A3)
 15.75 13.57 30.58 16.5 2.98 3.52 21.14
136.26 124.42 134.05 149.73 46.53 55.28 126.33
151.08 131.83 148.29 174.2 55.96 65.05 152.58
11.5 21.05 24.48 26.0 4.66 3.29 20.03
Msp_g26846 (EXO)
 60.03 56.84 75.28 76.87 28.59 38.05 70.96
3.62 2.95 6.26 3.79 1.49 2.0 2.83
9.07 6.13 10.87 7.62 2.07 3.98 7.3
31.61 20.85 53.2 21.68 10.77 9.12 14.31
137.55 131.93 149.48 164.81 18.05 31.98 103.96
21.74 15.49 36.66 15.9 7.01 9.04 8.92
1.72 1.84 2.66 3.77 1.63 2.01 2.29
1.21 5.73 5.91 3.81 0.0 1.0 3.62
0.16 3.66 5.0 3.67 0.9 0.71 2.81
5.73 23.68 23.94 16.71 5.26 10.9 23.08
5.49 4.74 10.66 5.91 0.43 0.79 5.25
9.38 14.27 18.6 16.74 8.99 13.42 16.49
6.03 5.34 8.83 6.23 1.22 3.71 4.99
21.48 19.21 24.74 24.18 16.59 14.6 29.56
146.46 88.17 172.3 138.44 42.68 45.52 120.8
2.0 0.88 2.45 1.01 0.0 0.02 2.45
4.29 6.17 13.1 5.06 0.39 1.57 10.73
4.61 2.93 4.71 3.28 0.36 1.49 4.44
0.74 1.82 2.29 2.0 0.53 1.03 2.92
5.53 6.87 12.41 8.57 6.54 3.64 7.17
2.32 2.97 4.03 2.31 1.06 1.83 4.57
0.43 0.37 1.95 0.85 0.5 0.0 1.94
9.95 11.63 9.67 12.35 5.36 4.51 13.7
4.98 7.9 11.67 9.6 2.04 2.12 4.09
6.06 6.32 17.32 4.37 0.08 0.76 13.92
1.6 1.51 3.04 1.88 1.05 1.5 2.44
18.17 17.13 20.43 25.78 4.61 4.13 17.47
2.38 2.6 4.63 3.61 0.05 0.12 1.2
3.5 6.14 9.23 7.54 1.37 2.17 3.3
5.61 7.32 10.48 8.03 0.53 3.83 4.56
4.23 3.92 7.34 5.44 2.99 4.03 6.18
Msp_g41693 (ANN5)
 2.59 0.45 2.37 0.26 0.24 0.34 1.85
3.76 2.34 5.96 1.71 0.22 0.97 3.81
6.96 6.03 20.07 13.12 1.29 1.38 11.92
6.59 6.2 13.81 5.96 2.81 2.92 12.21
41.75 38.68 46.6 51.66 5.83 7.97 24.87
2.03 3.04 5.08 3.32 1.54 2.66 3.85
0.38 1.78 2.93 2.06 0.79 0.47 0.93
2.56 0.23 3.49 0.76 0.19 0.26 3.29
1.21 3.06 2.77 2.24 0.85 0.94 2.39
5.57 3.39 6.39 4.82 1.49 2.9 5.59
Msp_g46895 (CRK8)
 0.37 0.94 2.19 2.25 0.4 0.88 0.08
20.09 15.21 21.75 20.59 10.56 11.26 19.97
25.0 25.76 39.24 39.27 4.92 11.52 28.1
4.69 5.15 6.51 5.64 0.67 1.0 7.29
7.46 5.17 7.22 8.88 2.39 2.17 4.48
1.77 1.87 2.76 1.58 0.75 0.58 1.68
11.09 9.71 11.27 11.61 4.09 4.93 9.51
14.56 17.28 23.17 17.54 3.74 4.6 18.23
4.68 3.79 6.59 4.62 1.54 2.13 4.22

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)