Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Len_g00665 (SIG5)
1.0 1.0 0.28 0.23 0.05 0.04
1.0 0.89 0.22 0.32 0.14 0.14
Len_g02270 (TBL26)
1.0 1.0 0.16 0.31 0.04 0.17
1.0 0.83 0.26 0.19 0.21 0.27
1.0 0.8 0.08 0.28 0.04 0.0
1.0 0.88 0.3 0.12 0.17 0.32
1.0 0.91 0.48 0.5 0.23 0.35
Len_g04035 (J20)
0.79 1.0 0.23 0.13 0.22 0.41
1.0 0.96 0.26 0.13 0.01 0.02
1.0 0.92 0.28 0.15 0.24 0.11
1.0 0.95 0.38 0.19 0.09 0.1
0.77 1.0 0.18 0.08 0.0 0.0
1.0 0.79 0.14 0.08 0.08 0.07
0.95 1.0 0.17 0.13 0.01 0.01
1.0 0.82 0.24 0.41 0.13 0.21
1.0 0.94 0.32 0.29 0.16 0.16
1.0 0.96 0.2 0.45 0.18 0.29
1.0 0.92 0.42 0.44 0.18 0.03
1.0 0.92 0.29 0.59 0.29 0.34
1.0 0.95 0.29 0.31 0.15 0.42
0.93 1.0 0.36 0.4 0.3 0.33
0.65 1.0 0.02 0.27 0.0 0.0
0.68 1.0 0.15 0.3 0.21 0.09
1.0 0.9 0.34 0.41 0.27 0.27
0.83 1.0 0.1 0.42 0.07 0.08
0.65 1.0 0.17 0.21 0.1 0.02
0.98 1.0 0.43 0.54 0.3 0.53
Len_g13767 (PHT3;3)
1.0 0.97 0.39 0.31 0.11 0.09
0.97 1.0 0.24 0.53 0.21 0.25
Len_g14484 (EGY2)
0.9 1.0 0.36 0.39 0.32 0.22
0.68 1.0 0.12 0.06 0.01 0.01
1.0 0.91 0.3 0.52 0.19 0.18
Len_g15207 (TIC55-II)
0.9 1.0 0.17 0.19 0.1 0.13
Len_g16095 (MPK7)
1.0 0.76 0.28 0.48 0.27 0.35
1.0 0.86 0.29 0.37 0.29 0.34
0.73 1.0 0.36 0.43 0.14 0.19
1.0 0.8 0.18 0.1 0.01 0.03
1.0 0.95 0.53 0.36 0.11 0.14
1.0 0.72 0.09 0.06 0.05 0.03
Len_g17115 (COL1)
0.78 1.0 0.4 0.27 0.15 0.19
0.9 1.0 0.15 0.24 0.06 0.03
1.0 0.98 0.51 0.37 0.03 0.03
0.94 1.0 0.23 0.1 0.22 0.09
0.68 1.0 0.19 0.27 0.16 0.07
0.74 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.89 0.46 0.2 0.18 0.07
1.0 1.0 0.25 0.32 0.2 0.29
1.0 0.9 0.1 0.02 0.05 0.02
1.0 0.84 0.37 0.43 0.1 0.13
0.84 1.0 0.26 0.31 0.06 0.08
1.0 0.87 0.28 0.34 0.21 0.06
1.0 0.98 0.55 0.7 0.44 0.52
1.0 0.92 0.4 0.6 0.43 0.48
1.0 0.97 0.56 0.63 0.42 0.41
0.86 1.0 0.36 0.28 0.28 0.31
1.0 0.97 0.43 0.55 0.24 0.16
0.87 1.0 0.32 0.44 0.13 0.14
1.0 0.85 0.0 0.46 0.04 0.05
Len_g20143 (NF-YA7)
1.0 0.85 0.33 0.17 0.21 0.15
1.0 0.63 0.29 0.32 0.32 0.3
0.6 1.0 0.0 0.07 0.01 0.01
Len_g20888 (COBL1)
1.0 1.0 0.44 0.52 0.24 0.32
0.9 1.0 0.55 0.59 0.53 0.48
Len_g21279 (STI)
1.0 0.77 0.37 0.33 0.18 0.08
0.8 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.91 1.0 0.09 0.38 0.02 0.0
0.97 1.0 0.25 0.31 0.19 0.21
1.0 0.86 0.47 0.52 0.42 0.25
Len_g22912 (DND1)
0.99 1.0 0.4 0.43 0.3 0.16
Len_g23576 (FAH1)
1.0 0.78 0.13 0.1 0.15 0.05
0.87 1.0 0.26 0.5 0.14 0.14
Len_g23860 (HB5)
1.0 0.75 0.21 0.43 0.05 0.07
1.0 0.79 0.58 0.27 0.18 0.1
0.85 1.0 0.06 0.1 0.1 0.03
1.0 0.84 0.2 0.42 0.08 0.05
1.0 0.78 0.22 0.28 0.17 0.13
0.75 1.0 0.32 0.23 0.07 0.12
1.0 0.89 0.52 0.39 0.42 0.37
0.35 1.0 0.04 0.02 0.01 0.0
0.9 1.0 0.28 0.39 0.17 0.16
Len_g30040 (CDF2)
0.84 1.0 0.48 0.39 0.32 0.52
0.93 1.0 0.18 0.09 0.01 0.0
0.9 1.0 0.51 0.48 0.34 0.32
1.0 0.91 0.5 0.52 0.39 0.24
Len_g30681 (PSBY)
0.9 1.0 0.22 0.33 0.05 0.02
1.0 0.98 0.41 0.52 0.26 0.3
0.89 1.0 0.38 0.52 0.19 0.38
0.89 1.0 0.13 0.14 0.01 0.0
1.0 0.76 0.16 0.39 0.02 0.0
1.0 0.82 0.04 0.06 0.04 0.04
0.72 1.0 0.28 0.31 0.18 0.13
0.92 1.0 0.31 0.43 0.2 0.16
0.85 1.0 0.13 0.15 0.07 0.05
0.94 1.0 0.33 0.49 0.29 0.32
1.0 0.89 0.44 0.67 0.45 0.52
0.93 1.0 0.4 0.4 0.1 0.13
0.98 1.0 0.51 0.48 0.14 0.23
0.91 1.0 0.29 0.5 0.09 0.17
Len_g48330 (PRK)
0.98 1.0 0.19 0.3 0.04 0.03
0.91 1.0 0.27 0.53 0.12 0.3
1.0 1.0 0.35 0.36 0.3 0.1
Len_g49429 (RSH2)
1.0 1.0 0.46 0.49 0.37 0.53
1.0 0.85 0.16 0.15 0.17 0.16
0.93 1.0 0.09 0.28 0.0 0.0
0.75 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.96 1.0 0.1 0.08 0.0 0.04
0.99 1.0 0.43 0.58 0.18 0.19
0.74 1.0 0.05 0.26 0.28 0.04
1.0 0.89 0.46 0.47 0.12 0.1
1.0 0.94 0.11 0.33 0.09 0.02
1.0 0.76 0.42 0.46 0.4 0.41
Len_g54803 (FdC1)
0.84 1.0 0.28 0.41 0.21 0.08
1.0 0.72 0.31 0.3 0.1 0.1
1.0 0.89 0.48 0.6 0.46 0.47
Len_g55702 (OTP86)
1.0 0.85 0.44 0.5 0.43 0.35
0.79 1.0 0.02 0.08 0.0 0.0
0.86 1.0 0.21 0.11 0.01 0.0
0.43 1.0 0.02 0.06 0.08 0.11
1.0 0.99 0.0 0.15 0.0 0.0
Len_g58514 (GAPB)
0.41 1.0 0.12 0.14 0.03 0.0
0.95 1.0 0.11 0.22 0.04 0.03
0.95 1.0 0.03 0.53 0.08 0.03
0.87 1.0 0.2 0.3 0.0 0.07
0.78 1.0 0.22 0.53 0.22 0.09
0.98 1.0 0.22 0.74 0.21 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)