Heatmap: Cluster_103 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00007	0.64	0.24	0.49	0.24	0.13	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.02	0.03
Gb_00595	0.06	0.67	0.59	0.09	0.01	0.14	0.32	0.34	0.17	0.26	0.11	0.21	0.29	1.0	0.03	0.01	0.09	0.03	0.0	0.1
Gb_01708	1.0	0.07	0.34	0.02	0.04	0.02	0.0	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.29	0.0	0.07
Gb_02625 (WRKY75)	0.25	0.78	0.45	0.0	0.07	0.75	0.0	0.31	0.19	0.18	0.18	0.02	0.24	0.25	0.29	0.04	0.01	0.01	0.4	1.0
Gb_02857	0.28	0.03	0.04	0.0	0.04	0.37	0.3	0.08	0.05	0.07	0.06	0.11	0.02	0.03	0.03	0.09	0.11	0.18	0.01	1.0
Gb_02952	1.0	0.06	0.19	0.0	0.0	0.54	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.87	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.87
Gb_03768 (FAH1)	0.68	0.23	0.12	0.25	0.05	0.12	0.41	0.34	0.17	0.07	0.08	0.15	0.53	0.54	0.12	0.0	0.0	0.2	0.03	1.0
Gb_03772 (CYP76G1)	0.77	0.18	0.08	0.03	0.06	0.14	0.5	0.29	0.12	0.12	0.2	0.07	0.25	0.21	0.02	0.0	0.01	0.02	0.04	1.0
Gb_03783 (ERF-1)	0.29	0.0	0.01	0.0	0.14	1.0	0.0	0.08	0.06	0.05	0.02	0.14	0.01	0.01	0.0	0.02	0.12	0.11	0.3	0.23
Gb_04369	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_04549 (PA2)	0.1	0.02	0.06	0.07	0.05	1.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.07	0.04	0.0
Gb_04550 (PA2)	0.05	0.02	0.0	0.03	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05110	0.34	0.04	0.01	0.0	0.02	0.97	0.01	0.21	0.0	0.0	0.01	0.14	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_05452	0.09	0.68	0.24	0.0	0.0	0.15	0.36	0.58	0.11	0.27	1.0	0.85	0.0	0.09	0.21	0.0	0.07	0.05	0.06	0.0
Gb_05780 (MES3)	0.1	0.08	0.04	0.06	0.0	0.5	0.09	0.84	0.04	0.02	0.18	0.23	1.0	0.85	0.12	0.0	0.0	0.04	0.0	0.49
Gb_06639	0.23	1.0	0.2	0.05	0.01	0.33	0.19	0.05	0.06	0.07	0.02	0.94	0.02	0.08	0.01	0.04	0.03	0.01	0.0	0.01
Gb_06817	0.21	0.18	0.02	0.0	0.11	0.46	0.01	1.0	0.01	0.01	0.18	0.44	0.37	0.36	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0	0.4
Gb_07690	0.25	0.62	0.07	0.0	0.15	0.16	0.04	0.26	0.39	0.2	0.99	0.02	0.11	0.18	1.0	0.48	0.17	0.34	0.34	0.92
Gb_09310	1.0	0.37	0.98	0.26	0.26	0.12	0.18	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.11	0.01	0.75
Gb_10702 (EXPR)	0.51	0.11	0.01	0.0	0.04	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_10703 (EXPR)	0.49	0.04	0.0	0.0	0.01	0.42	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04
Gb_11148	1.0	0.33	0.48	0.14	0.15	0.45	0.33	0.14	0.05	0.04	0.03	0.23	0.07	0.08	0.02	0.11	0.07	0.48	0.2	0.44
Gb_11232 (MYB3)	0.52	0.28	0.1	0.0	0.17	0.33	0.12	1.0	0.29	0.22	0.72	0.42	0.73	0.32	0.24	0.0	0.0	0.0	0.03	0.76
Gb_13355	0.64	0.24	0.49	0.24	0.13	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.02	0.03
Gb_15631 (C4H)	0.81	0.13	0.14	0.07	0.17	0.71	0.02	0.36	0.17	0.2	0.07	1.0	0.02	0.1	0.0	0.05	0.46	0.02	0.0	0.5
Gb_15962	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.11	0.03	0.07	0.29	0.05	0.07	0.09	0.11	0.04	0.02	0.0	0.0	1.0
Gb_15969	0.08	0.09	0.01	0.0	0.0	0.25	0.01	0.13	0.02	0.04	0.31	0.08	0.1	0.09	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_15970	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.0	0.1	0.03	0.06	0.26	0.06	0.07	0.09	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0
Gb_16261	0.05	0.15	0.36	0.12	0.08	0.06	0.07	0.71	0.1	0.08	0.53	0.67	0.7	0.39	0.34	0.0	0.05	0.01	0.0	1.0
Gb_16530	1.0	0.0	0.64	0.06	0.39	0.26	0.0	0.1	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.2	0.08	0.33
Gb_16609	1.0	0.2	0.29	0.0	0.35	0.74	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.32	0.06	0.53
Gb_16883 (C4H)	1.0	0.15	0.06	0.17	0.02	0.23	0.05	0.11	0.09	0.07	0.01	0.66	0.0	0.01	0.0	0.01	0.06	0.03	0.0	0.39
Gb_17183	0.07	0.26	0.01	0.0	0.0	0.0	0.28	0.07	0.02	0.01	0.02	1.0	0.63	0.23	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.45
Gb_18125	0.17	1.0	0.1	0.05	0.07	0.04	0.21	0.08	0.01	0.0	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.34
Gb_18338	0.38	0.03	0.03	0.07	0.12	0.6	0.0	0.45	0.22	0.24	0.25	0.27	0.18	0.13	0.19	0.09	0.07	1.0	0.0	0.22
Gb_19502 (PUB23)	0.35	0.13	0.13	0.26	0.06	0.64	0.0	0.38	0.17	0.14	0.02	0.03	0.01	0.06	0.0	0.02	0.5	0.48	0.04	1.0
Gb_20200	0.15	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.09	0.01	0.02	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.27
Gb_20201	0.86	0.16	0.06	0.0	0.04	0.41	0.0	0.22	0.03	0.05	0.0	0.07	0.02	0.08	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.43
Gb_21003	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.03	0.04	0.0	0.05	0.18	0.09	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	1.0
Gb_21184	0.08	1.0	0.48	0.05	0.11	0.2	0.84	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.33
Gb_21185	0.11	0.08	0.02	0.0	0.19	1.0	0.03	0.03	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.6
Gb_21186	0.55	0.0	0.3	1.0	0.83	0.92	0.17	0.14	0.0	0.0	0.0	0.29	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.77
Gb_22639	1.0	0.09	0.1	0.0	0.0	0.24	0.09	0.04	0.0	0.02	0.0	0.17	0.0	0.19	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.83
Gb_23220 (CCoAOMT1)	0.32	0.19	0.02	0.04	0.04	1.0	0.38	0.2	0.01	0.04	0.06	0.26	0.08	0.29	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.65
Gb_23321 (ERF-1)	0.1	0.33	0.13	0.05	0.0	0.84	0.54	0.19	0.11	0.09	0.3	0.44	0.13	0.22	0.29	0.07	0.11	0.07	0.23	1.0
Gb_23443	0.38	1.0	0.64	0.0	0.09	0.16	0.26	0.19	0.07	0.07	0.11	0.16	0.25	0.25	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12
Gb_24132	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.79	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.11	1.0
Gb_24262	0.12	0.17	0.13	0.09	0.01	0.0	0.21	0.84	0.76	0.52	0.0	1.0	0.02	0.04	0.0	0.02	0.66	0.02	0.07	0.0
Gb_25265	0.32	0.76	1.0	0.44	0.08	0.35	0.11	0.04	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14
Gb_25722 (TLP-3)	0.14	0.15	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.36	0.2	0.13	0.0	1.0	0.07	0.21	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0
Gb_26771	0.64	0.24	0.49	0.24	0.13	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.02	0.03
Gb_26836	1.0	1.0	0.2	0.62	0.06	0.9	0.22	0.22	0.0	0.15	0.19	0.16	0.68	0.5	0.11	0.0	0.0	0.06	0.0	0.38
Gb_27541	0.56	0.28	0.46	0.21	0.11	0.26	0.08	1.0	0.15	0.18	0.29	0.52	0.71	0.58	0.14	0.02	0.14	0.11	0.04	0.08
Gb_29820	0.05	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.36	0.02	0.0	0.0	0.28	0.01	0.02	0.05	0.54	0.0	0.0	0.03	0.04	0.81
Gb_29829	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30263	0.17	0.15	0.0	0.0	0.07	0.23	0.0	0.02	0.11	0.04	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0
Gb_31149 (UGT85A2)	1.0	0.05	0.01	0.08	0.01	0.16	0.14	0.02	0.02	0.01	0.04	0.07	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.2
Gb_32307	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.05	0.12	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.05	0.08	0.0
Gb_32395	0.09	0.33	0.02	0.01	0.07	0.75	0.1	0.14	0.14	0.26	0.07	1.0	0.05	0.1	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.06
Gb_32396	0.09	0.33	0.02	0.01	0.07	0.75	0.1	0.14	0.14	0.26	0.07	1.0	0.05	0.1	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.06
Gb_32469 (CHS)	0.1	1.0	0.16	0.02	0.02	0.01	0.0	0.12	0.06	0.05	0.0	0.02	0.46	0.16	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_33152	0.06	1.0	0.19	0.06	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
Gb_33950	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09	0.17	0.02	0.02	0.23	0.01	0.2	0.01	0.12	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Gb_33954	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46
Gb_34041 (FLS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38
Gb_34703	1.0	0.17	0.28	0.13	0.12	0.41	0.25	0.65	0.16	0.23	0.46	0.4	0.3	0.18	0.16	0.03	0.07	0.1	0.24	0.43
Gb_34945	0.08	0.51	0.02	0.01	0.08	1.0	0.08	0.07	0.11	0.18	0.03	0.61	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05
Gb_34946	0.04	0.08	0.0	0.08	0.22	1.0	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.25	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_35191	0.07	0.51	0.04	0.0	0.02	1.0	0.19	0.24	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13
Gb_35192	0.06	0.65	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.74	0.0	0.05	0.2	0.85	0.02	0.03	0.0	0.0	0.09	0.04	0.0	0.0
Gb_35679	0.4	0.17	0.28	0.03	0.03	0.14	0.05	0.35	0.19	0.2	0.16	0.23	0.34	0.24	0.06	0.01	0.09	0.07	0.04	1.0
Gb_35796	0.17	0.53	0.2	0.02	0.03	0.14	0.17	0.51	0.17	0.13	0.31	0.24	1.0	0.95	0.16	0.0	0.01	0.03	0.0	0.21
Gb_36961	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37172	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.83	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0
Gb_37495 (GST8)	0.06	0.14	0.15	0.02	0.0	0.09	0.12	0.29	0.11	0.23	0.47	1.0	0.31	0.29	0.18	0.03	0.23	0.0	0.0	0.47
Gb_37499 (GSTU28)	0.15	0.08	0.19	0.02	0.01	0.11	0.1	0.46	0.19	0.35	0.82	1.0	0.61	0.46	0.3	0.04	0.57	0.01	0.01	0.59
Gb_38539	1.0	0.17	0.05	0.0	0.04	0.25	0.0	0.27	0.02	0.07	0.06	0.15	0.02	0.11	0.0	0.0	0.04	0.24	0.0	0.24
Gb_38571 (ACS7)	0.17	0.11	0.04	0.03	0.01	0.11	0.01	0.18	0.15	0.15	0.1	0.1	0.28	0.18	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_38676	0.31	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.3	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.25
Gb_39181	1.0	0.17	0.4	0.03	0.04	0.05	0.18	0.14	0.07	0.07	0.09	0.11	0.18	0.18	0.06	0.02	0.02	0.17	0.13	0.49
Gb_40346	1.0	0.16	0.32	0.11	0.07	0.13	0.02	0.19	0.05	0.05	0.16	0.12	0.3	0.28	0.07	0.09	0.09	0.18	0.03	0.56
Gb_40683 (TA1)	0.04	0.15	0.03	0.07	0.06	0.21	0.02	0.22	0.27	0.12	0.04	1.0	0.07	0.37	0.0	0.02	0.07	0.01	0.22	0.07
Gb_41836 (ERF-1)	0.86	0.17	0.0	0.0	0.53	0.18	0.0	0.34	0.32	0.44	0.0	0.26	0.03	0.05	0.0	0.12	0.0	0.0	0.12	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)