Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00462 (LAC17)	0.01	0.0	0.0	0.21	0.09	0.06	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.32	0.3	0.92	0.13	1.0
Gb_01040	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	1.0
Gb_01187	0.0	0.0	0.0	0.1	0.29	0.23	0.21	0.1	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.48	0.92
Gb_01480	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.21	0.17	0.06	0.0	0.01	0.14	0.13	0.02	0.01	0.01	0.0	0.04	0.12
Gb_02282	0.21	0.81	0.23	0.13	0.21	0.18	0.15	0.09	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.35	0.28	1.0	0.27	0.3
Gb_02480	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.56	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92
Gb_02536	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02956 (PUP1)	0.03	0.0	0.0	0.72	0.97	0.95	0.01	0.08	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.07	0.08	1.0	0.8	0.39
Gb_03366	0.36	0.0	0.06	0.0	0.21	0.04	0.04	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.78
Gb_03367	0.13	1.0	0.1	0.23	0.07	0.05	0.05	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.1	0.25	0.52
Gb_04112	0.0	0.0	0.0	0.06	0.17	1.0	0.01	0.08	0.14	0.18	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.85	0.46	0.52	0.01	0.48
Gb_04173	0.09	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	1.0
Gb_08833	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09065	1.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.14	0.56	0.62	0.11	0.0	0.16	0.17	0.56	0.0	0.0	0.0	0.54	0.5	0.18
Gb_10011	0.65	0.28	0.69	0.67	0.76	0.3	0.04	0.06	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.17	0.25	1.0	0.29	0.51
Gb_10187	0.0	0.0	0.0	0.14	0.14	0.17	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.1	0.18	1.0	0.31	0.47
Gb_10720	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.29
Gb_12030 (CYP76G1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.0	0.02	0.13	0.12	1.0
Gb_14415	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.31	0.0	1.0
Gb_14937	0.02	0.0	0.0	0.11	0.0	0.12	1.0	0.81	0.04	0.02	0.14	0.01	0.2	0.22	0.06	0.0	0.05	0.03	0.09	0.17
Gb_16661	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.17	0.36
Gb_17506 (FT)	0.02	0.02	0.08	0.03	1.0	0.03	0.0	0.39	0.6	0.61	0.15	0.25	0.4	0.35	0.26	0.31	0.28	0.32	0.28	0.04
Gb_17512	0.01	0.0	0.2	0.11	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.0	1.0
Gb_17655 (GLP7)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.15	0.05	0.06	0.02	0.04	0.06	0.07	0.02	0.22	1.0	0.55	0.13	0.7
Gb_17657 (GLP7)	0.07	0.01	0.04	0.07	0.11	0.83	0.15	1.0	0.33	0.47	0.25	0.2	0.46	0.22	0.26	0.17	0.52	0.77	0.74	0.83
Gb_18368 (RLP32)	0.05	0.16	0.04	0.58	0.18	1.0	0.02	0.34	0.06	0.02	0.07	0.25	0.01	0.04	0.16	0.1	0.33	0.42	0.06	0.06
Gb_18804	0.19	0.12	0.15	0.54	0.5	0.34	0.02	0.23	0.27	0.33	0.23	0.52	0.09	0.11	0.2	0.35	0.71	1.0	0.36	0.49
Gb_19463	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.02	0.03	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_19630 (PRF5)	0.03	0.0	0.0	0.35	0.23	0.15	0.09	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.05	0.12	0.66	0.19	1.0
Gb_19858	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20108	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0
Gb_20590	0.02	0.0	0.01	0.48	0.21	0.17	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.11	1.0	0.32	0.31
Gb_21140	0.05	0.23	0.21	0.0	0.23	0.0	0.13	0.06	0.13	0.06	0.3	0.05	0.04	0.08	0.19	0.29	0.0	0.19	1.0	0.0
Gb_21874	0.02	0.0	0.01	0.03	0.23	0.02	0.02	0.17	0.09	0.2	0.0	0.11	0.48	0.26	0.03	0.47	0.2	1.0	0.0	0.71
Gb_24045	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.33	1.0
Gb_26403	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	1.0	0.04	0.78
Gb_28799 (EXO70A2)	0.04	0.04	0.12	0.13	0.2	0.33	0.16	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.5	0.46	0.72	1.0
Gb_28909 (MAN6)	0.03	0.06	0.03	0.38	0.32	0.26	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.31	0.44	0.79	0.15	1.0
Gb_29323 (EXPL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.02	0.09	0.13	0.09	0.07	0.1	0.23	0.2	0.12	0.08	0.02	0.04	0.01	1.0
Gb_29324 (EXPL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.01	0.08	0.12	0.14	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.29	0.19	0.19	0.03	1.0
Gb_29495	0.09	0.07	0.06	0.12	0.14	0.01	0.02	0.3	0.44	0.52	0.35	0.21	0.13	0.09	0.15	0.36	0.22	0.82	0.06	1.0
Gb_31336 (PRR1)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.21	0.01	0.0	1.0	0.59	0.52
Gb_31337 (PRR2)	0.02	0.0	0.0	0.05	0.08	0.04	0.01	0.02	0.14	0.01	0.08	0.04	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.37	0.6
Gb_32299 (PEPR1)	0.23	0.18	0.13	0.2	0.43	0.3	0.14	0.13	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.2	0.2	0.65	0.16	1.0
Gb_33001	0.3	0.07	0.22	0.18	0.44	0.08	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	1.0	0.5	0.26
Gb_33424 (RHS19)	0.0	0.05	0.0	0.01	0.07	0.05	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.1	0.49
Gb_34018 (OMT1)	0.01	0.02	0.04	0.05	0.41	0.33	0.28	0.06	0.05	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.2	0.19	0.27	0.41	1.0
Gb_34157 (TBL1)	0.14	0.08	0.12	0.34	0.3	0.27	0.0	0.21	0.31	0.12	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.15	0.3	0.58	0.21	1.0
Gb_35265 (FAH1)	0.0	0.95	0.0	0.0	0.09	0.06	0.34	0.04	0.07	0.04	0.13	0.01	0.01	0.0	0.46	0.0	0.0	0.09	1.0	0.67
Gb_35535	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.01	0.15	0.05	0.02	0.08	0.09	0.06	0.11	0.01	0.0	0.04	0.7	0.11	1.0
Gb_36232	0.13	0.0	0.14	0.23	0.35	0.06	0.01	0.04	0.04	0.01	0.0	0.11	0.08	0.13	0.01	0.03	0.15	0.29	0.09	1.0
Gb_36451 (LPR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0
Gb_37476	0.32	0.35	0.24	0.15	0.36	0.24	0.39	0.28	0.25	0.24	0.26	0.26	0.22	0.24	0.28	0.65	0.55	0.42	0.43	1.0
Gb_37886	0.6	0.26	0.4	0.28	0.65	0.25	0.03	0.16	0.13	0.15	0.1	0.11	0.06	0.08	0.14	0.29	0.45	1.0	0.43	0.66
Gb_39268	0.01	0.0	0.01	0.03	0.18	0.46	0.01	0.23	0.14	0.19	0.07	0.27	0.23	0.18	0.1	0.21	0.77	0.94	0.68	1.0
Gb_39276	0.0	0.0	0.0	0.22	0.17	0.45	0.02	0.09	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.22	0.82	0.0	1.0
Gb_39854	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.01	0.31	0.16	0.21	0.3	0.33	0.52	0.37	0.2	0.08	0.29	0.29	0.4	0.03
Gb_40010	0.05	0.08	0.04	0.03	0.13	0.1	0.0	0.6	0.76	0.7	0.26	0.17	1.0	0.62	0.35	0.04	0.04	0.09	0.98	0.17
Gb_40387	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.19	0.0	0.05	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.75	0.04	1.0
Gb_40468	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.0	0.04	0.07	0.01	0.0	0.05	0.1	0.0	0.0	0.07	0.01	0.02	0.78	0.22	1.0
Gb_40469	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.05	1.0
Gb_41169 (OXI1)	0.61	0.44	0.61	0.82	0.73	0.14	0.14	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.08	0.12	0.8	0.12	1.0
Gb_41660 (PSAB)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)