1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00462 (LAC17)
 0.24 0.0 0.01 4.47 1.91 1.21 0.03 0.67 0.05 0.03 0.02 0.38 0.15 0.31 0.02 6.78 6.4 19.48 2.71 21.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 4.28
0.0 0.03 0.0 0.77 2.28 1.78 1.66 0.8 0.04 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 7.88 3.79 7.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 37.85 1.39 8.03 6.61 2.19 0.16 0.22 5.15 4.87 0.91 0.41 0.49 0.15 1.59 4.68
2.38 9.15 2.64 1.49 2.37 2.01 1.65 1.04 0.07 0.09 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 3.91 3.2 11.3 3.06 3.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_02956 (PUP1)
 0.07 0.0 0.0 1.67 2.25 2.21 0.02 0.18 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.16 0.19 2.32 1.86 0.92
1.9 0.0 0.3 0.0 1.12 0.21 0.22 0.07 0.06 0.0 0.06 0.02 0.03 0.07 0.0 0.48 0.0 5.31 0.02 4.16
1.15 9.14 0.9 2.11 0.62 0.48 0.48 0.08 0.0 0.18 0.0 0.03 0.0 0.11 0.0 0.11 0.0 0.91 2.25 4.72
0.47 0.0 0.0 39.97 104.08 625.68 8.03 51.8 87.22 114.2 0.62 15.12 3.12 8.11 1.34 533.6 286.24 326.17 6.26 298.71
0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01
3.46 1.49 3.68 3.57 4.05 1.58 0.19 0.31 0.01 0.02 0.04 0.11 0.01 0.05 0.05 0.93 1.34 5.35 1.52 2.74
0.2 0.0 0.05 8.74 9.17 11.11 0.03 2.09 0.01 0.08 0.18 1.0 0.2 0.29 0.0 6.17 11.61 63.54 19.67 30.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 31.7 9.31
Gb_12030 (CYP76G1)
 0.11 0.19 0.2 0.04 0.4 0.19 0.89 0.57 0.49 0.66 1.34 0.88 0.34 0.44 1.32 0.17 1.09 6.19 5.76 46.7
1.27 0.0 0.13 3.0 7.05 20.15 0.52 37.71 0.27 0.15 0.0 1.79 0.05 0.09 0.0 23.49 19.65 750.33 11.29 2450.02
0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.1 0.85 0.68 0.03 0.02 0.12 0.01 0.17 0.19 0.05 0.0 0.04 0.03 0.08 0.14
0.18 0.05 0.04 0.0 0.0 9.56 0.0 0.11 0.09 0.04 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.07 0.34 1.64 3.4
Gb_17506 (FT)
 0.14 0.15 0.48 0.22 6.43 0.17 0.0 2.49 3.86 3.89 0.98 1.58 2.54 2.27 1.69 1.99 1.78 2.03 1.8 0.29
0.02 0.0 0.32 0.18 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 1.55
Gb_17655 (GLP7)
 0.24 0.41 0.61 0.3 3.23 6.74 0.19 5.1 1.58 1.93 0.77 1.46 1.96 2.35 0.74 7.61 34.56 19.11 4.35 24.1
Gb_17657 (GLP7)
 1.73 0.35 1.07 1.85 2.71 20.8 3.77 24.97 8.28 11.68 6.18 4.97 11.39 5.43 6.52 4.16 13.04 19.26 18.36 20.66
Gb_18368 (RLP32)
 0.04 0.12 0.03 0.44 0.14 0.77 0.02 0.26 0.05 0.02 0.05 0.19 0.01 0.03 0.12 0.08 0.25 0.33 0.05 0.05
4.8 3.02 3.77 13.82 12.97 8.77 0.44 5.98 6.95 8.64 5.83 13.53 2.21 2.89 5.12 8.98 18.34 25.82 9.2 12.73
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 13.68 1.51 2.35 2.22 1.15 0.05 0.01 0.0 0.76 0.0 0.17 0.16 0.0 74.71
Gb_19630 (PRF5)
 0.66 0.0 0.08 7.07 4.72 3.0 1.92 0.88 0.0 0.08 0.0 0.34 0.03 0.11 0.0 1.09 2.45 13.53 3.79 20.44
0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 2.53 0.09 27.9
0.42 0.06 0.18 8.8 3.87 3.06 0.2 0.89 0.03 0.03 0.01 0.14 0.01 0.02 0.0 1.1 2.03 18.31 5.86 5.74
0.01 0.04 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.03 0.01 0.06 0.01 0.01 0.02 0.04 0.06 0.0 0.04 0.19 0.0
0.47 0.0 0.26 0.86 5.92 0.5 0.39 4.26 2.22 5.12 0.12 2.77 12.33 6.73 0.81 12.18 5.16 25.66 0.0 18.3
0.07 0.04 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 1.21 3.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.01 0.11
Gb_28799 (EXO70A2)
 0.17 0.19 0.55 0.55 0.87 1.45 0.7 0.22 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.03 0.0 0.14 2.22 2.0 3.19 4.4
Gb_28909 (MAN6)
 0.77 1.5 0.7 9.75 8.22 6.52 0.02 0.88 0.03 0.04 0.0 0.32 0.07 0.17 0.01 8.02 11.29 20.11 3.72 25.47
Gb_29323 (EXPL1)
 0.0 0.0 0.0 0.15 0.19 38.27 1.93 8.67 11.86 8.47 6.16 9.49 20.97 18.57 11.59 7.04 1.82 3.84 0.7 93.05
Gb_29324 (EXPL1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 4.36 2.6 1.19 9.36 14.44 15.99 3.72 4.73 3.6 4.26 4.93 33.67 22.81 21.66 3.39 117.06
0.16 0.13 0.11 0.22 0.27 0.01 0.04 0.59 0.86 1.0 0.68 0.4 0.26 0.17 0.28 0.69 0.43 1.57 0.11 1.93
Gb_31336 (PRR1)
 0.02 0.0 0.0 0.1 0.03 0.07 0.19 0.14 0.57 0.09 0.4 0.02 0.0 0.0 1.59 0.05 0.0 7.57 4.49 3.97
Gb_31337 (PRR2)
 0.2 0.0 0.0 0.56 0.91 0.48 0.14 0.24 1.65 0.14 0.9 0.48 0.03 0.0 1.6 0.0 0.0 11.54 4.28 6.95
Gb_32299 (PEPR1)
 1.58 1.2 0.88 1.36 2.93 2.06 0.98 0.86 0.43 0.44 0.36 0.36 0.31 0.34 0.33 1.38 1.33 4.39 1.12 6.79
0.68 0.16 0.49 0.41 0.99 0.17 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.09 2.23 1.12 0.57
Gb_33424 (RHS19)
 0.01 0.36 0.02 0.07 0.49 0.37 6.82 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.7 3.31
Gb_34018 (OMT1)
 1.05 1.79 2.96 3.78 32.44 26.68 22.72 5.12 3.72 5.97 1.13 13.13 1.15 2.0 0.9 15.7 15.48 21.44 32.56 80.01
Gb_34157 (TBL1)
 1.81 1.04 1.45 4.23 3.74 3.41 0.03 2.63 3.88 1.53 0.47 0.44 0.48 0.32 0.49 1.84 3.84 7.36 2.69 12.61
Gb_35265 (FAH1)
 0.0 3.97 0.0 0.0 0.39 0.27 1.43 0.16 0.31 0.16 0.54 0.03 0.02 0.02 1.93 0.0 0.0 0.37 4.19 2.8
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.01 0.15 0.05 0.02 0.08 0.09 0.06 0.11 0.01 0.0 0.04 0.7 0.11 1.0
1.63 0.0 1.71 2.86 4.41 0.77 0.17 0.44 0.44 0.18 0.04 1.33 0.98 1.61 0.14 0.39 1.88 3.67 1.07 12.57
Gb_36451 (LPR1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 3.7
3.99 4.36 2.96 1.82 4.47 2.99 4.85 3.5 3.06 2.95 3.26 3.23 2.78 3.02 3.48 8.08 6.89 5.19 5.37 12.49
31.09 13.68 20.88 14.6 33.72 12.87 1.72 8.48 6.96 7.83 5.29 5.56 3.08 3.92 7.32 15.24 23.25 52.0 22.18 34.25
0.27 0.0 0.13 0.88 4.67 12.23 0.34 6.25 3.69 5.05 1.81 7.31 6.09 4.92 2.65 5.49 20.48 25.11 18.09 26.63
0.0 0.0 0.0 1.56 1.25 3.19 0.13 0.66 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 1.6 5.85 0.02 7.12
0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 8.72 0.07 2.67 1.38 1.82 2.61 2.9 4.53 3.26 1.78 0.66 2.57 2.55 3.51 0.24
0.07 0.12 0.06 0.05 0.19 0.14 0.01 0.86 1.09 1.0 0.37 0.25 1.43 0.89 0.5 0.05 0.06 0.13 1.39 0.25
0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.78 0.01 0.22 0.04 0.07 0.08 0.01 0.03 0.04 0.12 0.12 0.07 3.09 0.15 4.14
0.29 0.25 1.2 1.1 1.08 0.0 1.43 2.3 0.17 0.06 1.48 3.31 0.04 0.09 2.35 0.28 0.73 24.8 7.2 32.0
0.06 0.0 0.34 0.37 0.47 0.0 0.87 1.69 0.0 0.0 0.45 0.16 0.0 0.09 0.11 0.0 0.0 43.39 7.1 146.32
Gb_41169 (OXI1)
 6.62 4.79 6.58 8.85 7.83 1.46 1.51 0.42 0.0 0.06 0.09 0.12 0.02 0.03 0.13 0.84 1.29 8.62 1.26 10.78
Gb_41660 (PSAB)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)