1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.38 0.15 0.04 1.0 0.02 0.0 0.04 0.23 0.16 0.06 0.15 0.01 0.11 0.16 0.29 0.87 0.23 0.05 0.69 0.22
0.11 0.0 0.0 1.0 0.03 0.1 0.14 0.06 0.03 0.13 0.04 0.01 0.06 0.02 0.17 0.44 0.03 0.06 0.58 0.03
0.24 0.0 0.02 1.0 0.03 0.06 0.14 0.25 0.07 0.05 0.09 0.0 0.02 0.05 0.06 0.45 0.14 0.06 0.45 0.05
0.22 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.05 0.02 0.09 0.02 0.08 0.09 0.0 0.0 0.6 0.12
Gb_02240 (ORF111A)
 0.1 0.0 0.06 0.96 0.19 0.0 0.25 0.21 0.04 0.09 0.0 0.0 0.09 0.08 0.11 0.31 0.0 0.08 1.0 0.1
Gb_02478 (PNP)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.18 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.95 0.0 0.0 0.98 0.48
0.29 0.33 0.21 1.0 0.08 0.05 0.13 0.23 0.12 0.05 0.17 0.01 0.3 0.22 0.27 0.88 0.3 0.04 0.37 0.04
0.15 0.0 0.09 0.61 0.0 0.08 0.31 0.37 0.11 0.0 0.33 0.04 0.51 0.15 0.06 0.27 0.36 0.15 1.0 0.15
0.08 0.0 0.35 1.0 0.05 0.0 0.07 0.15 0.21 0.11 0.05 0.0 0.03 0.06 0.13 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0
0.33 0.35 0.12 0.88 0.05 0.08 0.13 0.26 0.14 0.13 0.22 0.02 0.2 0.17 0.36 1.0 0.21 0.06 0.75 0.21
0.12 0.0 0.0 0.5 0.18 0.07 0.02 0.09 0.0 0.06 0.09 0.0 0.02 0.02 0.1 0.3 0.12 0.0 1.0 0.05
0.66 0.3 0.05 0.58 0.09 0.0 0.05 0.39 0.2 0.2 0.34 0.01 0.09 0.0 0.39 0.99 0.11 0.07 1.0 0.16
0.41 0.75 0.39 0.75 0.39 0.0 0.08 0.41 0.21 0.19 0.64 0.02 0.63 0.49 0.19 1.0 0.89 0.19 0.87 0.07
0.31 0.12 0.04 0.85 0.12 0.07 0.16 0.24 0.15 0.14 0.34 0.02 0.09 0.1 0.37 0.43 0.26 0.15 1.0 0.2
0.25 0.1 0.22 0.44 0.11 0.11 0.03 0.29 0.18 0.15 0.08 0.0 0.28 0.17 0.25 1.0 0.21 0.13 0.78 0.24
0.13 0.36 0.0 1.0 0.13 0.0 0.05 0.09 0.07 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.35 0.44 0.06
0.35 0.3 0.13 0.74 0.03 0.0 0.19 0.28 0.17 0.25 0.03 0.02 0.19 0.1 0.28 0.54 0.19 0.17 1.0 0.3
0.06 0.16 0.05 1.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.06 0.08 0.0 0.03 0.48 0.0
Gb_08736 (ORF170)
 0.13 0.1 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.04 0.25 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0
0.17 0.0 0.18 0.37 0.06 0.0 0.29 0.18 0.1 0.13 0.29 0.0 0.11 0.13 0.34 0.9 0.28 0.0 1.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.12 0.08 0.05 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.1 0.0 1.0 0.09
0.34 0.46 0.13 0.53 0.05 0.0 0.1 0.32 0.06 0.12 0.51 0.0 0.07 0.11 0.4 1.0 0.09 0.04 0.63 0.1
0.31 0.0 0.11 1.0 0.08 0.02 0.11 0.17 0.12 0.1 0.22 0.01 0.14 0.15 0.16 0.69 0.13 0.03 0.23 0.23
0.23 0.22 0.13 0.91 0.08 0.0 0.09 0.22 0.12 0.13 0.15 0.0 0.05 0.06 0.22 0.61 0.09 0.04 1.0 0.13
Gb_12432 (ORF240B)
 0.39 0.88 0.13 0.24 0.14 0.16 0.08 0.14 0.21 0.26 0.31 0.12 0.11 0.02 0.05 0.7 0.12 0.09 1.0 0.32
0.19 0.13 0.05 1.0 0.09 0.05 0.05 0.13 0.04 0.05 0.14 0.0 0.08 0.05 0.15 0.19 0.04 0.01 0.84 0.08
0.29 0.16 0.0 1.0 0.2 0.0 0.08 0.26 0.16 0.1 0.38 0.02 0.2 0.21 0.14 0.64 0.34 0.03 0.5 0.09
0.3 0.13 0.1 0.94 0.1 0.04 0.18 0.21 0.17 0.19 0.34 0.03 0.06 0.04 0.35 0.63 0.22 0.09 1.0 0.26
Gb_13854 (CRK8)
 0.15 0.0 0.0 0.31 0.09 0.0 0.11 0.1 0.07 0.03 0.34 0.04 0.04 0.06 0.14 0.31 0.12 0.04 1.0 0.04
Gb_13936 (ORF240B)
 0.16 0.1 0.04 1.0 0.0 0.05 0.16 0.18 0.09 0.06 0.13 0.0 0.14 0.07 0.33 0.39 0.0 0.04 0.63 0.12
0.28 0.29 0.1 1.0 0.07 0.08 0.12 0.29 0.17 0.15 0.33 0.02 0.22 0.29 0.27 0.91 0.11 0.03 0.66 0.0
Gb_14369 (CRK8)
 0.08 0.21 0.05 0.56 0.2 0.0 0.14 0.23 0.1 0.1 0.31 0.02 0.01 0.04 0.25 0.64 0.16 0.07 1.0 0.09
0.21 0.0 0.0 0.94 0.21 0.0 0.1 0.27 0.12 0.0 0.34 0.05 0.08 0.05 0.08 0.99 0.25 0.0 1.0 0.08
0.37 0.44 0.15 1.0 0.23 0.08 0.23 0.3 0.2 0.13 0.32 0.02 0.12 0.09 0.45 0.75 0.37 0.12 0.97 0.31
0.56 0.14 0.09 1.0 0.23 0.08 0.07 0.21 0.1 0.13 0.12 0.02 0.19 0.12 0.18 0.73 0.21 0.1 0.64 0.11
0.1 0.15 0.0 0.89 0.07 0.0 0.0 0.28 0.09 0.04 0.13 0.02 0.06 0.09 0.0 0.41 0.58 0.06 1.0 0.31
0.41 0.18 0.12 0.87 0.26 0.13 0.25 0.3 0.27 0.27 0.65 0.06 0.09 0.05 0.59 0.73 0.27 0.16 1.0 0.25
0.68 0.86 0.79 0.82 0.0 0.0 0.05 0.51 0.26 0.24 0.47 0.07 0.29 0.32 0.68 0.52 0.92 0.49 1.0 0.13
0.7 0.15 0.23 0.82 0.41 0.05 0.21 0.44 0.45 0.36 0.5 0.1 0.35 0.17 0.55 0.94 0.49 0.23 1.0 0.3
0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.31 0.32 0.0 0.56 0.0
0.13 0.24 0.04 0.84 0.18 0.13 0.09 0.24 0.26 0.09 0.12 0.05 0.19 0.15 0.26 0.3 0.11 0.18 1.0 0.16
0.55 0.29 0.1 1.0 0.27 0.03 0.15 0.27 0.11 0.15 0.13 0.01 0.49 0.31 0.54 0.79 0.45 0.19 0.62 0.21
0.28 0.16 0.07 0.64 0.11 0.04 0.4 0.2 0.16 0.13 0.51 0.04 0.07 0.04 0.42 1.0 0.27 0.24 0.58 0.25
0.17 0.03 0.09 0.86 0.09 0.04 0.04 0.19 0.12 0.15 0.4 0.02 0.04 0.04 0.35 0.69 0.15 0.04 1.0 0.08
0.45 0.11 0.08 1.0 0.2 0.0 0.06 0.23 0.18 0.08 0.18 0.01 0.25 0.06 0.37 0.98 0.05 0.0 0.65 0.13
0.22 0.1 0.04 0.5 0.05 0.05 0.03 0.21 0.01 0.0 0.39 0.01 0.1 0.13 0.38 1.0 0.06 0.24 0.99 0.0
Gb_17834 (ORF170)
 0.18 0.0 0.15 0.34 0.0 0.0 0.09 0.12 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.08 0.0 1.0 0.06
0.4 0.26 0.12 0.86 0.14 0.13 0.16 0.3 0.27 0.24 0.36 0.03 0.11 0.14 0.47 0.62 0.25 0.16 1.0 0.27
0.4 0.0 0.07 0.98 0.2 0.0 0.04 0.18 0.15 0.05 0.1 0.03 0.27 0.35 0.25 1.0 0.37 0.28 0.57 0.03
0.12 0.07 0.03 0.73 0.04 0.08 0.06 0.16 0.08 0.05 0.21 0.0 0.02 0.02 0.23 0.11 0.05 0.15 1.0 0.12
0.29 0.12 0.04 0.48 0.07 0.01 0.08 0.2 0.11 0.11 0.21 0.01 0.17 0.13 0.2 1.0 0.19 0.06 0.46 0.08
0.0 0.0 0.0 0.45 0.08 0.08 0.0 0.12 0.02 0.04 0.07 0.04 0.06 0.0 0.13 0.18 0.1 0.0 1.0 0.12
Gb_19243 (CRK8)
 0.5 0.0 0.18 0.68 0.1 0.0 0.12 0.17 0.09 0.08 0.32 0.0 0.0 0.05 0.1 1.0 0.4 0.0 0.74 0.51
0.39 0.0 0.38 0.0 0.0 0.22 0.0 0.24 0.18 0.43 0.0 0.0 0.09 0.35 0.36 0.87 0.27 0.17 1.0 0.32
Gb_20038 (ORF158)
 0.76 0.26 0.23 1.0 0.28 0.05 0.14 0.22 0.06 0.17 0.28 0.08 0.03 0.16 0.16 0.59 0.16 0.18 0.57 0.04
0.67 0.0 0.0 1.0 0.2 0.08 0.12 0.38 0.22 0.11 0.18 0.0 0.24 0.07 0.48 0.8 0.35 0.0 0.8 0.05
0.16 0.0 0.0 0.76 0.19 0.0 0.06 0.27 0.17 0.02 0.19 0.04 0.14 0.11 0.24 0.48 0.31 0.12 1.0 0.15
Gb_20925 (STI)
 0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.09 0.14 0.12 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.28 0.13
0.36 0.21 0.1 0.64 0.38 0.21 0.25 0.3 0.27 0.2 0.34 0.04 0.19 0.19 0.22 0.51 0.19 0.37 1.0 0.3
0.11 0.16 0.0 1.0 0.07 0.04 0.2 0.09 0.01 0.13 0.18 0.01 0.2 0.01 0.03 0.17 0.13 0.03 0.55 0.0
0.69 0.32 0.19 0.76 0.07 0.04 0.11 0.32 0.3 0.22 0.3 0.05 0.19 0.21 0.3 0.31 0.12 0.25 1.0 0.48
0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.11 0.19 0.0 1.0 0.22 0.0 0.1 0.24 0.07 0.22 0.12 0.09 0.14 0.07 0.23 0.61 0.22 0.13 0.89 0.04
0.05 0.17 0.0 1.0 0.05 0.0 0.04 0.09 0.06 0.13 0.08 0.0 0.02 0.02 0.06 0.26 0.04 0.0 0.32 0.13
0.11 0.22 0.0 1.0 0.0 0.0 0.12 0.19 0.03 0.0 0.0 0.02 0.16 0.07 0.09 0.66 0.34 0.09 0.79 0.18
Gb_27820 (ORF240B)
 0.08 0.14 0.09 0.8 0.21 0.06 0.08 0.25 0.13 0.2 0.23 0.09 0.16 0.05 0.37 0.12 0.0 0.0 1.0 0.34
0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.07 0.57 0.0 0.03 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.46 0.07
0.13 0.38 0.09 0.55 0.16 0.0 0.04 0.17 0.05 0.1 0.2 0.05 0.01 0.0 0.03 0.49 0.0 0.08 1.0 0.07
0.27 0.49 0.17 1.0 0.06 0.25 0.1 0.25 0.21 0.03 0.0 0.0 0.22 0.1 0.0 0.58 0.08 0.15 0.57 0.0
0.35 0.21 0.12 1.0 0.12 0.18 0.04 0.23 0.11 0.08 0.11 0.03 0.19 0.11 0.16 0.99 0.45 0.03 0.71 0.03
0.21 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.28 0.14 0.03 0.41 0.0 0.0 0.04 0.12 0.08 0.02 0.03 0.0 0.03 0.01 0.08 1.0 0.26 0.0 0.39 0.35
0.29 0.21 0.13 1.0 0.18 0.02 0.23 0.21 0.09 0.05 0.21 0.04 0.05 0.03 0.21 0.39 0.26 0.06 0.76 0.21
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.26 0.09 0.17 0.0 0.04 0.24 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.0
Gb_34623 (CRK8)
 0.06 0.03 0.05 1.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.02 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.21 0.0 0.0 0.13 0.0
0.3 0.1 0.0 1.0 0.05 0.0 0.09 0.16 0.17 0.06 0.22 0.0 0.02 0.09 0.19 0.23 0.05 0.1 0.84 0.04
0.2 0.3 0.07 0.94 0.04 0.0 0.05 0.24 0.13 0.12 0.12 0.0 0.19 0.11 0.21 1.0 0.3 0.04 0.6 0.12
0.29 0.16 0.12 0.64 0.03 0.0 0.08 0.18 0.11 0.17 0.07 0.0 0.12 0.06 0.24 1.0 0.13 0.05 0.38 0.09
0.18 0.0 0.11 0.9 0.08 0.0 0.16 0.21 0.09 0.11 0.44 0.0 0.18 0.13 0.24 1.0 0.26 0.14 0.72 0.03
0.25 0.17 0.02 0.93 0.04 0.0 0.16 0.15 0.15 0.08 0.16 0.02 0.12 0.12 0.1 1.0 0.15 0.0 0.37 0.05
0.41 0.0 0.0 0.91 0.23 0.0 0.0 0.23 0.13 0.03 0.12 0.0 0.26 0.02 0.16 1.0 0.0 0.0 0.64 0.0
Gb_37844 (ORF240B)
 0.58 0.0 0.16 0.0 0.12 0.0 0.0 0.22 0.17 0.35 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 1.0 0.3
0.35 0.1 0.05 0.68 0.05 0.04 0.14 0.24 0.16 0.12 0.19 0.02 0.19 0.1 0.25 1.0 0.32 0.03 0.65 0.15
0.3 0.06 0.07 1.0 0.12 0.05 0.06 0.19 0.09 0.07 0.19 0.01 0.13 0.1 0.2 0.62 0.26 0.0 0.46 0.11
0.27 0.15 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.14 0.53 0.13 0.0 0.5 0.62
0.08 0.19 0.05 0.75 0.16 0.0 0.14 0.26 0.07 0.0 0.21 0.01 0.02 0.15 0.06 0.59 0.39 0.07 1.0 0.04
0.13 0.09 0.0 1.0 0.0 0.13 0.07 0.18 0.07 0.13 0.08 0.01 0.07 0.08 0.04 0.24 0.07 0.11 0.88 0.08
0.59 0.24 0.0 0.66 0.12 0.0 0.09 0.34 0.23 0.24 0.21 0.0 0.17 0.06 0.42 1.0 0.27 0.72 0.99 0.09
Gb_39862 (ORF240B)
 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.28 0.23 0.0 0.67 0.03
0.42 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.35 0.84 0.0 0.0 0.56 0.0
0.25 0.0 0.2 1.0 0.17 0.09 0.07 0.24 0.09 0.13 0.21 0.02 0.22 0.15 0.13 0.23 0.12 0.17 0.68 0.23
0.38 0.19 0.12 0.73 0.07 0.12 0.1 0.24 0.13 0.16 0.19 0.02 0.19 0.14 0.19 1.0 0.19 0.04 0.5 0.07
0.31 0.13 0.12 1.0 0.12 0.23 0.11 0.25 0.13 0.1 0.05 0.03 0.36 0.24 0.31 0.85 0.34 0.05 0.74 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)