Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.1 0.14 0.6 0.34 0.21 0.33 0.21 0.07 0.13 0.24 0.01 0.3 0.29 0.14 0.29 0.08 0.36 0.56 0.16
0.17 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.15 0.2 0.11 0.11 0.01 0.23 0.14 0.14 1.0 0.16 0.07 0.13 0.1
0.62 0.15 0.07 0.43 0.0 0.08 0.04 0.48 0.39 0.23 0.13 0.03 0.25 0.5 0.4 1.0 0.24 0.13 0.87 0.11
1.0 0.12 0.0 0.86 0.39 0.2 0.32 0.28 0.25 0.21 0.15 0.01 0.33 0.17 0.09 0.34 0.11 0.19 0.6 0.09
0.59 0.0 0.0 1.0 0.28 0.11 0.03 0.24 0.13 0.1 0.17 0.01 0.29 0.28 0.12 0.12 0.05 0.08 0.56 0.0
1.0 0.0 0.0 0.66 0.31 0.0 0.2 0.23 0.22 0.12 0.0 0.05 0.13 0.19 0.35 0.7 0.22 0.09 0.61 0.0
0.23 0.0 0.07 1.0 0.07 0.04 0.04 0.21 0.14 0.04 0.16 0.01 0.3 0.17 0.15 0.24 0.0 0.06 0.38 0.0
0.47 0.18 0.02 0.66 0.08 0.05 0.12 0.33 0.17 0.3 0.27 0.02 0.39 0.38 0.23 1.0 0.45 0.08 0.49 0.21
0.74 0.14 0.0 0.41 0.28 0.0 0.07 0.26 0.35 0.07 0.73 0.02 0.05 0.12 0.29 1.0 0.56 0.0 0.55 0.17
0.91 0.23 0.05 0.67 0.34 0.03 0.2 0.44 0.43 0.31 0.64 0.02 0.39 0.16 1.0 0.46 0.29 0.24 0.42 0.6
0.95 0.36 0.28 1.0 0.44 0.1 0.35 0.29 0.32 0.26 0.28 0.04 0.25 0.19 0.24 0.41 0.08 0.27 0.9 0.22
0.52 0.1 0.09 1.0 0.13 0.01 0.13 0.18 0.16 0.19 0.26 0.03 0.13 0.13 0.31 0.11 0.08 0.17 0.34 0.14
0.65 0.17 0.02 1.0 0.29 0.02 0.09 0.23 0.27 0.22 0.24 0.04 0.18 0.21 0.31 0.55 0.22 0.26 0.34 0.25
1.0 0.17 0.23 0.96 0.29 0.18 0.2 0.35 0.28 0.32 0.21 0.02 0.14 0.14 0.32 0.48 0.18 0.61 0.56 0.15
1.0 0.1 0.2 0.71 0.26 0.08 0.19 0.42 0.32 0.31 0.4 0.02 0.45 0.32 0.6 0.21 0.15 0.27 0.54 0.47
0.38 0.27 0.08 0.79 0.3 0.1 0.12 0.49 0.36 0.39 0.39 0.0 0.56 0.55 0.36 1.0 0.35 0.11 0.76 0.08
0.34 0.29 0.14 1.0 0.18 0.06 0.11 0.32 0.21 0.07 0.09 0.0 0.25 0.12 0.44 0.57 0.47 0.08 0.47 0.15
0.64 0.12 0.06 0.51 0.06 0.13 0.23 0.4 0.28 0.15 0.2 0.01 0.72 1.0 0.27 0.85 0.23 0.1 0.79 0.0
Gb_12967 (HOT1)
0.94 0.09 0.13 0.39 0.04 0.32 0.1 0.55 0.24 0.32 0.7 0.06 0.94 0.45 0.61 0.98 0.21 0.36 1.0 0.25
0.27 0.14 0.16 0.3 0.0 0.0 0.06 0.24 0.23 0.37 0.39 0.0 0.18 0.06 0.51 1.0 0.57 0.09 0.52 0.2
0.35 0.0 0.25 0.53 0.26 0.1 0.17 0.44 0.41 0.67 0.86 0.0 0.49 0.41 1.0 0.61 0.68 0.04 0.92 0.14
0.48 0.2 0.05 1.0 0.05 0.0 0.03 0.21 0.2 0.23 0.17 0.02 0.3 0.21 0.38 0.71 0.33 0.0 0.32 0.04
Gb_14803 (NFYA5)
0.87 0.25 0.18 1.0 0.43 0.07 0.28 0.19 0.2 0.19 0.26 0.05 0.1 0.1 0.35 0.11 0.09 0.19 0.63 0.1
1.0 0.2 0.17 0.75 0.31 0.02 0.11 0.32 0.32 0.16 0.09 0.02 0.34 0.86 0.01 0.14 0.02 0.14 0.85 0.4
0.41 0.22 0.25 0.49 0.06 0.0 0.07 0.28 0.21 0.2 0.19 0.03 0.2 0.17 0.27 1.0 0.38 0.29 0.53 0.54
0.93 0.25 0.53 0.18 0.28 0.07 0.04 0.47 0.31 0.23 0.49 0.01 1.0 0.35 0.19 0.74 0.4 0.32 0.69 0.1
0.61 0.24 0.25 0.12 0.04 0.04 0.06 0.42 0.52 0.37 1.0 0.06 0.66 0.5 0.71 0.72 0.52 0.07 0.56 0.65
0.76 0.52 0.18 0.39 0.66 0.2 0.53 0.52 0.53 0.45 0.59 0.09 0.24 0.27 0.4 0.31 0.2 0.31 1.0 0.23
0.23 0.0 0.0 0.63 0.13 0.08 0.04 0.34 0.13 0.26 1.0 0.05 0.55 0.41 0.64 0.63 0.14 0.0 0.87 0.23
0.92 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.14 0.3 0.19 0.0 0.42 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.43 0.47 0.19
0.82 0.28 0.33 0.94 0.56 0.0 0.08 0.41 0.32 0.26 0.28 0.05 0.2 0.15 0.33 0.5 0.27 0.19 1.0 0.15
0.62 0.56 0.1 1.0 0.35 0.14 0.09 0.33 0.27 0.35 0.31 0.05 0.6 0.5 0.36 0.79 0.46 0.32 0.42 0.26
0.87 0.37 0.15 0.77 0.33 0.25 0.35 0.48 0.46 0.29 0.5 0.04 1.0 0.67 0.34 0.39 0.37 0.33 0.97 0.38
1.0 0.0 0.29 0.96 0.0 0.0 0.1 0.58 0.39 0.09 0.57 0.04 0.62 0.64 0.38 0.96 0.32 0.0 0.62 0.0
0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.19 0.0 0.27 0.03 0.22 0.19 0.0 0.44 0.46 0.17 1.0 0.21 0.1 0.21 0.04
0.37 0.59 0.2 0.75 0.32 0.0 0.19 0.4 0.45 0.43 0.66 0.07 0.43 0.26 0.56 0.71 0.2 0.24 1.0 0.06
1.0 0.14 0.06 0.63 0.28 0.08 0.04 0.31 0.09 0.1 0.21 0.0 0.15 0.06 0.42 0.23 0.18 0.23 0.54 0.22
1.0 0.05 0.07 0.69 0.16 0.1 0.03 0.2 0.1 0.09 0.29 0.03 0.21 0.14 0.13 0.35 0.33 0.23 0.44 0.21
1.0 0.26 0.03 0.73 0.16 0.02 0.13 0.36 0.31 0.43 0.23 0.03 0.18 0.2 0.15 0.81 0.23 0.24 0.69 0.03
0.93 0.42 0.08 1.0 0.39 0.04 0.1 0.27 0.36 0.43 0.16 0.04 0.11 0.1 0.14 0.44 0.09 0.28 0.6 0.01
1.0 0.28 0.15 0.79 0.69 0.03 0.24 0.37 0.29 0.24 0.16 0.05 0.47 0.61 0.12 0.25 0.19 0.42 0.74 0.15
0.63 0.23 0.34 1.0 0.34 0.26 0.32 0.36 0.47 0.29 0.2 0.03 0.05 0.08 0.45 0.75 0.0 0.2 0.46 0.53
0.66 0.0 0.06 0.73 0.18 0.13 0.13 0.28 0.19 0.25 0.11 0.06 0.36 0.39 0.05 1.0 0.26 0.05 0.31 0.21
0.83 0.56 0.17 0.68 0.2 0.1 0.3 0.22 0.17 0.19 0.16 0.08 0.27 0.05 0.17 0.09 0.06 0.43 1.0 0.3
1.0 0.17 0.47 0.63 0.44 0.12 0.3 0.22 0.19 0.19 0.26 0.04 0.08 0.07 0.33 0.16 0.21 0.08 0.44 0.17
0.73 0.1 0.09 0.28 0.23 0.22 0.35 0.45 0.54 0.32 0.78 0.05 0.21 0.12 0.82 0.5 0.31 0.27 1.0 0.26
0.7 0.05 0.12 1.0 0.47 0.19 0.19 0.4 0.15 0.11 0.33 0.05 0.64 0.46 0.23 0.15 0.09 0.18 0.76 0.06
0.78 0.33 0.4 0.49 0.35 0.22 0.35 0.37 0.41 0.39 0.49 0.04 0.7 0.54 0.29 0.13 0.21 0.33 1.0 0.17
0.41 0.0 0.18 0.94 0.19 0.0 0.1 0.3 0.15 0.31 0.63 0.03 0.4 0.1 0.06 1.0 0.47 0.0 0.27 0.21
Gb_37055 (CRK8)
0.33 0.0 0.0 0.56 0.1 0.0 0.23 0.35 0.28 0.27 0.51 0.0 0.25 0.05 0.32 0.28 0.67 0.0 1.0 0.0
0.2 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.14 0.11 0.12 0.0 0.15 0.0 0.22 0.09 0.0 0.44 0.22 0.0 0.16 0.0
0.64 0.0 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.16 0.23 0.29 0.0 0.0 0.23 0.26 0.26 0.33 0.0 0.1 0.22 0.0
0.57 0.27 0.13 1.0 0.13 0.04 0.06 0.14 0.08 0.05 0.06 0.02 0.13 0.03 0.22 0.16 0.03 0.03 0.45 0.05
0.85 0.09 0.08 1.0 0.16 0.04 0.18 0.28 0.2 0.2 0.07 0.0 0.16 0.16 0.17 0.45 0.0 0.21 0.47 0.06
0.54 1.0 0.31 0.64 0.85 0.38 0.38 0.47 0.45 0.46 0.11 0.18 0.11 0.1 0.13 0.28 0.05 0.65 0.85 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)