1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.77 0.18 0.25 1.06 0.61 0.37 0.59 0.38 0.13 0.23 0.43 0.01 0.53 0.51 0.25 0.51 0.15 0.64 0.99 0.29
0.24 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.2 0.27 0.15 0.15 0.01 0.32 0.19 0.19 1.39 0.23 0.09 0.18 0.14
0.13 0.03 0.01 0.09 0.0 0.02 0.01 0.1 0.08 0.05 0.03 0.01 0.05 0.11 0.09 0.22 0.05 0.03 0.19 0.02
0.7 0.08 0.0 0.6 0.27 0.14 0.22 0.19 0.18 0.15 0.11 0.01 0.23 0.12 0.07 0.24 0.08 0.13 0.42 0.06
0.55 0.0 0.0 0.93 0.26 0.1 0.03 0.22 0.12 0.09 0.16 0.01 0.27 0.26 0.11 0.12 0.04 0.08 0.52 0.0
0.52 0.0 0.0 0.35 0.16 0.0 0.1 0.12 0.11 0.06 0.0 0.03 0.07 0.1 0.18 0.37 0.12 0.05 0.32 0.0
0.22 0.0 0.07 0.96 0.07 0.04 0.04 0.2 0.14 0.04 0.16 0.01 0.29 0.17 0.15 0.23 0.0 0.06 0.36 0.0
0.33 0.13 0.01 0.46 0.06 0.03 0.09 0.23 0.12 0.21 0.19 0.01 0.27 0.27 0.16 0.7 0.31 0.05 0.34 0.14
0.21 0.04 0.0 0.12 0.08 0.0 0.02 0.07 0.1 0.02 0.21 0.0 0.01 0.03 0.08 0.29 0.16 0.0 0.16 0.05
0.69 0.17 0.04 0.51 0.26 0.02 0.15 0.34 0.33 0.23 0.49 0.02 0.3 0.12 0.76 0.35 0.22 0.18 0.32 0.46
3.3 1.25 0.98 3.48 1.51 0.36 1.21 1.0 1.11 0.91 0.97 0.12 0.87 0.65 0.83 1.44 0.27 0.93 3.12 0.77
2.56 0.5 0.45 4.92 0.63 0.06 0.65 0.88 0.76 0.91 1.29 0.14 0.64 0.65 1.52 0.56 0.41 0.85 1.67 0.71
1.69 0.44 0.04 2.58 0.76 0.05 0.24 0.59 0.69 0.56 0.61 0.1 0.48 0.54 0.8 1.43 0.57 0.67 0.87 0.65
6.25 1.04 1.42 6.03 1.83 1.1 1.25 2.18 1.74 2.0 1.32 0.15 0.89 0.9 2.02 3.01 1.15 3.81 3.52 0.95
0.6 0.06 0.12 0.43 0.16 0.05 0.12 0.25 0.19 0.19 0.24 0.01 0.27 0.19 0.36 0.13 0.09 0.16 0.32 0.28
0.55 0.4 0.12 1.15 0.44 0.15 0.18 0.71 0.53 0.57 0.57 0.0 0.82 0.8 0.52 1.46 0.51 0.17 1.11 0.11
0.31 0.27 0.12 0.91 0.17 0.05 0.1 0.29 0.19 0.07 0.08 0.0 0.22 0.11 0.4 0.52 0.43 0.08 0.43 0.14
0.55 0.1 0.05 0.44 0.05 0.11 0.2 0.35 0.24 0.13 0.17 0.01 0.61 0.86 0.23 0.73 0.19 0.09 0.68 0.0
Gb_12967 (HOT1)
 0.56 0.05 0.08 0.23 0.03 0.19 0.06 0.33 0.14 0.19 0.42 0.04 0.56 0.27 0.36 0.58 0.13 0.21 0.59 0.15
0.22 0.11 0.12 0.24 0.0 0.0 0.05 0.19 0.18 0.3 0.31 0.0 0.14 0.05 0.41 0.79 0.45 0.07 0.42 0.16
0.41 0.0 0.29 0.61 0.3 0.11 0.19 0.5 0.47 0.78 0.99 0.0 0.57 0.48 1.16 0.71 0.78 0.05 1.06 0.17
0.37 0.15 0.04 0.78 0.04 0.0 0.02 0.16 0.16 0.18 0.13 0.02 0.23 0.16 0.29 0.55 0.25 0.0 0.25 0.03
Gb_14803 (NFYA5)
 1.34 0.38 0.27 1.54 0.66 0.1 0.44 0.3 0.31 0.3 0.4 0.08 0.16 0.16 0.53 0.17 0.13 0.29 0.97 0.15
2.16 0.44 0.37 1.61 0.66 0.04 0.24 0.68 0.7 0.35 0.19 0.04 0.72 1.85 0.03 0.29 0.04 0.3 1.83 0.86
0.32 0.17 0.19 0.38 0.04 0.0 0.05 0.22 0.17 0.16 0.15 0.02 0.16 0.13 0.21 0.78 0.3 0.22 0.41 0.42
0.5 0.14 0.28 0.1 0.15 0.04 0.02 0.25 0.17 0.12 0.26 0.01 0.54 0.19 0.1 0.4 0.22 0.17 0.37 0.05
0.26 0.1 0.11 0.05 0.02 0.02 0.03 0.18 0.22 0.16 0.43 0.02 0.28 0.22 0.3 0.31 0.22 0.03 0.24 0.28
1.63 1.11 0.38 0.84 1.42 0.43 1.14 1.11 1.14 0.96 1.26 0.2 0.51 0.59 0.86 0.67 0.43 0.66 2.14 0.49
0.35 0.0 0.0 0.97 0.2 0.13 0.05 0.52 0.19 0.4 1.53 0.08 0.85 0.62 0.98 0.96 0.21 0.0 1.33 0.35
0.55 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.08 0.18 0.12 0.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.26 0.29 0.11
0.78 0.27 0.32 0.9 0.54 0.0 0.07 0.4 0.31 0.25 0.27 0.05 0.2 0.15 0.32 0.48 0.26 0.18 0.96 0.14
1.05 0.96 0.17 1.71 0.59 0.24 0.16 0.55 0.47 0.6 0.53 0.09 1.02 0.85 0.62 1.35 0.78 0.55 0.71 0.44
0.72 0.3 0.12 0.63 0.27 0.21 0.29 0.39 0.37 0.24 0.41 0.04 0.82 0.55 0.28 0.32 0.3 0.27 0.8 0.31
0.67 0.0 0.2 0.65 0.0 0.0 0.06 0.39 0.26 0.06 0.39 0.03 0.41 0.43 0.26 0.64 0.21 0.0 0.42 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.08 0.01 0.07 0.06 0.0 0.13 0.14 0.05 0.3 0.06 0.03 0.06 0.01
0.53 0.85 0.28 1.08 0.46 0.0 0.28 0.58 0.65 0.62 0.95 0.1 0.62 0.38 0.81 1.02 0.29 0.35 1.44 0.09
1.66 0.24 0.11 1.05 0.46 0.13 0.07 0.51 0.15 0.16 0.35 0.0 0.24 0.11 0.7 0.38 0.31 0.38 0.89 0.37
1.47 0.07 0.1 1.01 0.23 0.14 0.04 0.29 0.14 0.13 0.42 0.05 0.31 0.2 0.2 0.52 0.49 0.34 0.64 0.31
3.72 0.98 0.11 2.72 0.61 0.09 0.47 1.33 1.14 1.59 0.84 0.11 0.68 0.76 0.57 3.0 0.84 0.9 2.58 0.09
13.08 5.93 1.15 14.03 5.45 0.53 1.46 3.72 4.99 6.06 2.24 0.62 1.55 1.47 2.03 6.24 1.26 3.87 8.36 0.09
0.88 0.25 0.13 0.69 0.6 0.03 0.21 0.33 0.25 0.21 0.14 0.05 0.41 0.54 0.11 0.22 0.16 0.37 0.65 0.13
0.45 0.16 0.24 0.71 0.24 0.18 0.23 0.26 0.33 0.21 0.14 0.02 0.03 0.06 0.32 0.53 0.0 0.14 0.33 0.37
0.32 0.0 0.03 0.35 0.09 0.06 0.06 0.13 0.09 0.12 0.05 0.03 0.17 0.19 0.03 0.48 0.12 0.03 0.15 0.1
3.85 2.61 0.8 3.16 0.94 0.48 1.39 1.0 0.77 0.89 0.75 0.36 1.23 0.25 0.77 0.43 0.27 2.01 4.63 1.39
3.1 0.54 1.47 1.96 1.35 0.36 0.94 0.67 0.59 0.58 0.8 0.12 0.25 0.23 1.02 0.49 0.66 0.25 1.35 0.53
1.1 0.14 0.13 0.41 0.34 0.34 0.53 0.67 0.81 0.49 1.17 0.08 0.32 0.18 1.22 0.75 0.47 0.41 1.5 0.39
6.81 0.51 1.17 9.79 4.61 1.85 1.82 3.9 1.47 1.04 3.19 0.47 6.25 4.48 2.3 1.44 0.9 1.78 7.47 0.61
0.76 0.33 0.39 0.48 0.34 0.21 0.34 0.36 0.4 0.38 0.49 0.04 0.69 0.53 0.28 0.13 0.2 0.32 0.98 0.16
0.11 0.0 0.05 0.26 0.05 0.0 0.03 0.08 0.04 0.09 0.18 0.01 0.11 0.03 0.02 0.28 0.13 0.0 0.07 0.06
Gb_37055 (CRK8)
 0.12 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.08 0.12 0.1 0.09 0.18 0.0 0.09 0.02 0.11 0.1 0.23 0.0 0.35 0.0
0.09 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.0 0.07 0.0 0.1 0.04 0.0 0.2 0.1 0.0 0.07 0.0
0.71 0.0 0.0 1.1 0.11 0.0 0.0 0.18 0.25 0.32 0.0 0.0 0.26 0.29 0.29 0.37 0.0 0.11 0.25 0.0
0.57 0.28 0.13 1.01 0.13 0.04 0.06 0.14 0.08 0.05 0.06 0.02 0.13 0.03 0.22 0.16 0.03 0.03 0.46 0.05
1.04 0.1 0.1 1.21 0.19 0.05 0.21 0.34 0.24 0.24 0.09 0.0 0.19 0.19 0.21 0.55 0.0 0.26 0.57 0.08
15.45 28.55 8.82 18.39 24.22 10.83 10.72 13.34 12.85 13.25 3.17 5.2 3.25 2.76 3.65 7.97 1.52 18.51 24.32 4.79

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)