Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00277	0.25	0.01	0.03	0.38	0.16	0.02	0.0	0.16	0.15	0.02	0.0	0.24	0.01	0.0	0.05	0.17	0.07	0.13	0.03	1.0
Gb_00363 (SIP1)	0.8	0.07	0.15	0.09	0.08	0.09	0.08	0.68	1.0	0.13	0.07	0.07	0.54	0.88	0.04	0.01	0.07	0.11	0.07	0.29
Gb_00467	0.27	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.07	0.05	1.0	0.64	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00893	0.05	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	1.0	0.77	0.51	0.83	0.27	0.15	0.06	0.75	0.35	0.54	0.0	0.0	0.0
Gb_01042	0.63	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.71	0.36	0.11	0.0	0.6	0.17	0.36	0.0	0.26	0.87	0.43	0.0	0.32	0.29
Gb_01415 (ORF158)	1.0	0.0	0.29	0.0	0.23	0.0	0.26	0.41	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.73	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_02134	0.03	0.01	0.01	0.06	0.04	0.14	0.05	0.39	0.05	0.05	1.0	0.09	0.26	0.23	0.8	0.24	0.15	0.04	0.06	0.02
Gb_02404	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02992	0.0	0.0	0.14	1.0	0.14	0.0	0.0	0.58	0.05	0.09	0.0	0.04	0.18	0.0	0.13	0.41	0.92	0.13	0.05	0.0
Gb_03381 (FAD4)	0.04	0.01	0.01	0.18	0.01	0.29	0.0	0.51	0.37	0.21	0.25	0.16	0.13	0.12	0.17	1.0	0.92	0.16	0.0	0.0
Gb_03954	0.03	0.01	0.01	0.22	0.04	0.15	0.03	0.47	0.09	0.1	1.0	0.07	0.3	0.27	0.81	0.52	0.33	0.04	0.1	0.03
Gb_03982	0.02	0.01	0.01	0.12	0.03	0.07	0.03	0.42	0.07	0.08	1.0	0.06	0.12	0.13	0.68	0.16	0.16	0.03	0.02	0.02
Gb_05879	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.38	0.0	0.0	0.0
Gb_05897	0.26	0.0	0.18	0.27	0.09	0.21	0.1	0.4	1.0	0.69	0.04	0.14	0.04	0.05	0.15	0.34	0.24	0.15	0.57	0.26
Gb_06116 (ELIP)	0.25	0.0	0.04	0.06	0.11	0.18	0.0	0.39	0.2	0.18	0.05	0.31	0.07	0.07	0.05	0.63	1.0	0.16	0.0	0.0
Gb_06813	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06825 (PSBD)	0.24	0.35	0.31	0.51	0.0	0.2	0.19	0.45	0.0	0.0	0.91	0.0	0.2	0.06	1.0	0.0	0.0	0.14	0.05	0.0
Gb_06913 (CYP86B1)	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.04	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_07151	0.16	0.01	0.01	0.23	0.14	0.14	0.39	0.37	0.57	0.97	1.0	0.43	0.23	0.26	0.85	0.04	0.56	0.1	0.79	0.63
Gb_07339	0.1	0.69	0.19	0.0	0.3	1.0	0.26	0.34	0.38	0.39	0.01	0.09	0.0	0.01	0.0	0.53	0.29	0.3	0.08	0.05
Gb_08042	0.05	0.23	0.03	0.21	0.33	0.0	0.0	0.59	1.0	0.75	0.01	0.1	0.05	0.01	0.01	0.58	0.64	0.01	0.0	0.0
Gb_08334	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.5	0.04	0.04	1.0	0.04	0.29	0.26	0.82	0.28	0.12	0.04	0.04	0.02
Gb_09036	0.03	0.02	0.02	0.08	0.05	0.22	0.07	0.31	0.06	0.07	1.0	0.13	0.26	0.23	0.79	0.44	0.16	0.05	0.12	0.03
Gb_09046	0.04	0.01	0.01	0.14	0.03	0.09	0.02	0.59	0.07	0.08	1.0	0.06	0.26	0.29	0.76	0.21	0.19	0.03	0.03	0.02
Gb_09260 (NLM4)	0.13	0.02	0.07	0.68	1.0	0.91	0.0	0.4	0.37	0.09	0.03	0.15	0.12	0.15	0.03	0.07	0.24	0.17	0.01	0.0
Gb_09841	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_10121	0.21	0.79	0.42	0.48	0.25	0.17	0.18	0.33	0.34	0.37	0.07	0.43	0.07	0.06	0.01	0.65	1.0	0.26	0.4	0.09
Gb_11161	0.0	0.0	0.04	1.0	0.04	0.0	0.14	0.09	0.01	0.0	0.34	0.0	0.03	0.0	0.11	0.11	0.0	0.04	0.06	0.03
Gb_11368	0.05	0.02	0.02	0.25	0.09	0.59	0.1	0.39	0.06	0.03	0.43	0.06	0.08	0.06	0.39	1.0	0.16	0.02	0.2	0.07
Gb_11369	0.03	0.0	0.12	0.0	0.18	0.35	0.07	0.66	0.23	0.23	0.73	0.1	0.48	0.55	0.52	1.0	0.34	0.11	0.16	0.0
Gb_11951	0.01	0.0	0.0	0.09	0.02	0.06	0.01	0.26	0.03	0.04	1.0	0.03	0.23	0.22	0.77	0.17	0.12	0.02	0.03	0.01
Gb_12115	0.08	0.02	0.03	0.09	0.09	0.07	0.82	0.29	0.18	0.4	0.99	0.14	0.18	0.16	1.0	0.83	0.23	0.09	0.33	0.41
Gb_14450	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14645	0.0	0.0	0.42	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.11
Gb_14851	0.0	0.56	0.0	0.0	0.28	0.29	0.6	0.38	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.41	0.0	0.24	1.0	0.0
Gb_15454	0.19	0.97	1.0	0.26	0.22	0.29	0.13	0.51	0.39	0.52	0.8	0.32	0.35	0.34	0.71	0.34	0.81	0.52	0.61	0.19
Gb_15455	0.15	1.0	0.59	0.19	0.15	0.1	0.05	0.3	0.15	0.26	0.32	0.16	0.18	0.12	0.34	0.1	0.34	0.12	0.24	0.07
Gb_15570 (PSBC)	0.02	0.0	0.0	0.08	0.03	0.07	0.02	0.42	0.05	0.05	1.0	0.04	0.22	0.22	0.76	0.17	0.12	0.03	0.03	0.02
Gb_15706	0.04	1.0	0.15	0.08	0.07	0.38	0.0	0.33	0.18	0.42	0.13	0.32	0.18	0.21	0.12	0.39	0.55	0.0	0.0	0.0
Gb_16289	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.09	1.0	0.76	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.74	0.46
Gb_16405	0.09	0.01	0.01	0.04	0.09	0.08	0.25	0.29	0.33	0.52	1.0	0.16	0.21	0.19	0.9	0.04	0.32	0.07	0.34	0.44
Gb_17142	0.7	1.0	0.7	0.13	0.06	0.28	0.05	0.23	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.05	0.01	0.0
Gb_17835	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17953	0.06	0.24	0.04	0.0	0.0	0.04	0.02	0.21	0.43	0.24	0.21	1.0	0.3	0.67	0.09	0.46	0.2	0.0	0.0	0.0
Gb_17982 (NDHJ)	0.05	0.02	0.02	0.13	0.05	0.18	0.04	0.62	0.14	0.15	1.0	0.12	0.28	0.28	0.8	0.75	0.38	0.06	0.09	0.03
Gb_18620 (RBCL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.32	0.05	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.18	0.0	0.06	0.0
Gb_18643	0.02	0.0	0.32	0.0	0.49	0.5	0.01	0.11	0.19	1.0	0.02	0.23	0.0	0.0	0.58	0.0	0.42	0.0	0.0	0.03
Gb_18882	1.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.28	0.0	0.46	0.29	0.12	0.0
Gb_19302	0.11	0.06	0.17	0.03	0.23	0.03	0.07	0.27	0.86	1.0	0.2	0.35	0.0	0.1	0.2	0.0	0.11	0.74	0.04	0.66
Gb_19368	0.1	0.02	0.02	0.19	0.12	0.26	0.24	0.15	0.05	0.05	1.0	0.06	0.09	0.11	0.54	0.52	0.18	0.07	0.17	0.02
Gb_20073	0.1	0.32	0.16	0.09	0.11	0.21	0.08	0.56	0.63	0.81	1.0	0.41	0.04	0.02	0.68	0.43	0.79	0.3	0.44	0.12
Gb_20096	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	1.0	0.62	0.0	0.0	0.49	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20490	0.04	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.08	0.21	0.03	0.04	0.98	0.03	0.45	0.35	1.0	0.08	0.1	0.17	0.2	0.53
Gb_20540 (GA3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20885 (RCD3)	0.65	0.54	0.42	0.78	0.41	0.37	0.45	1.0	0.66	0.42	0.32	0.45	0.4	0.22	0.24	0.33	0.22	0.78	0.7	0.47
Gb_21235	0.13	0.0	0.12	0.0	0.14	0.02	0.5	0.7	1.0	0.8	0.37	0.22	0.22	0.13	0.21	0.38	0.72	0.17	0.01	0.41
Gb_21369	0.47	0.42	0.5	0.09	0.16	0.28	0.07	0.43	0.61	0.31	0.3	0.38	0.11	0.09	0.37	1.0	0.9	0.33	0.0	0.03
Gb_21737	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0
Gb_22156 (ATF1)	0.19	0.44	0.45	0.57	0.65	0.27	0.02	0.51	0.97	1.0	0.24	0.41	0.02	0.03	0.46	0.22	0.68	0.18	0.22	0.33
Gb_23168	0.01	1.0	0.17	0.24	0.09	0.22	0.0	0.36	0.13	0.24	0.12	0.09	0.23	0.28	0.09	0.17	0.19	0.0	0.0	0.0
Gb_23528	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.03	1.0	0.03	0.17	0.13	0.88	0.07	0.06	0.03	0.01	0.04
Gb_23557	0.12	0.1	0.15	0.3	0.24	0.11	1.0	0.62	0.45	0.5	0.22	0.14	0.12	0.12	0.74	0.15	0.12	0.04	0.29	0.12
Gb_23640	0.12	0.01	0.01	0.05	0.08	0.11	0.26	0.27	0.37	0.57	1.0	0.23	0.18	0.18	0.85	0.06	0.46	0.11	0.46	0.42
Gb_23851 (CXE17)	0.04	0.11	0.02	0.16	0.01	0.33	0.02	0.15	0.02	0.02	0.19	0.55	0.03	0.09	0.22	0.55	0.55	1.0	0.0	0.0
Gb_23853 (AMK2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24000	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.09	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.24
Gb_24954 (ELIP)	0.23	0.0	0.04	0.18	0.17	0.16	0.0	0.35	0.13	0.11	0.06	0.21	0.02	0.04	0.05	0.68	1.0	0.2	0.0	0.01
Gb_25931	0.02	0.06	0.05	0.56	0.08	0.14	0.05	0.59	0.06	0.08	0.82	0.08	0.17	0.16	0.59	1.0	0.25	0.07	0.41	0.06
Gb_27109	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27250	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_27367 (WAKL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.83	1.0	0.25	0.0	0.25	0.81	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28974	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29133 (NYC1)	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0
Gb_29148	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29212	0.01	0.08	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.29	0.04	0.04	1.0	0.03	0.26	0.23	0.77	0.11	0.07	0.02	0.02	0.01
Gb_29216	0.03	0.09	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.43	0.09	0.09	1.0	0.11	0.13	0.14	0.64	0.22	0.23	0.04	0.02	0.04
Gb_29217	0.02	0.1	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.31	0.05	0.06	1.0	0.05	0.2	0.18	0.69	0.13	0.11	0.03	0.03	0.04
Gb_29776	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_29899	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.44	0.89	0.63	1.0	0.29	0.4	0.19	0.28	0.5	0.63	0.0	0.0	0.0
Gb_30209 (ARA12)	1.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.12	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49
Gb_30289	0.05	0.08	0.13	0.04	0.08	0.07	0.01	0.31	0.03	0.04	0.99	0.05	0.44	0.4	1.0	0.33	0.06	0.1	0.28	0.28
Gb_31594	0.04	0.01	0.01	0.03	0.09	0.09	0.1	0.23	0.03	0.04	1.0	0.03	0.29	0.26	0.86	0.06	0.08	0.11	0.48	0.32
Gb_32444	0.03	0.01	0.01	0.13	0.04	0.09	0.05	0.42	0.09	0.11	1.0	0.09	0.23	0.22	0.74	0.24	0.23	0.05	0.03	0.03
Gb_32479	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32958	0.01	0.0	0.09	0.71	0.14	0.07	0.01	0.27	0.03	0.0	1.0	0.05	0.05	0.08	0.6	0.18	0.08	0.04	0.23	0.0
Gb_34317 (LACS9)	0.38	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.23	0.0
Gb_34787	0.04	0.36	0.41	0.0	0.03	0.04	0.54	0.2	0.05	0.09	0.32	0.03	0.08	0.59	0.13	1.0	0.0	0.09	0.6	0.16
Gb_34813	0.01	0.0	0.33	0.72	0.44	0.73	1.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.52
Gb_34972	0.04	0.01	0.01	0.04	0.05	0.12	0.05	0.36	0.07	0.08	1.0	0.12	0.19	0.15	0.85	0.34	0.17	0.05	0.05	0.05
Gb_35560	0.2	0.33	0.26	0.16	0.05	0.88	0.09	0.68	0.73	0.91	1.0	0.55	0.14	0.28	0.71	0.76	0.26	0.05	0.21	0.19
Gb_35922 (CAX9)	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.55	0.0	0.24	0.31	0.44	0.0	0.08	0.0	0.0	0.07	0.0	0.3	0.0	0.13	0.02
Gb_36090 (PXY)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_37275	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.18
Gb_37381	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38466	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	1.0	0.01	0.01	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39012	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.13	0.1	0.05	0.01	0.03	0.05	0.2	0.89	0.23	1.0	0.12	0.0
Gb_39906 (PPa4)	0.21	0.0	0.11	1.0	0.2	0.0	0.13	0.19	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.09	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40087	0.02	0.01	0.01	0.13	0.03	0.06	0.05	0.27	0.06	0.07	1.0	0.09	0.27	0.24	0.86	0.23	0.1	0.03	0.16	0.03
Gb_40306	0.5	0.51	0.48	0.33	0.5	0.3	0.25	0.4	0.52	0.42	0.15	0.28	0.24	0.29	0.27	1.0	0.59	0.74	0.56	0.2
Gb_40310	0.03	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.02	0.06	0.06	0.03	0.02	0.03	0.11	0.0	0.0	0.33	0.03
Gb_40557	0.03	0.01	0.01	0.11	0.03	0.08	0.02	0.26	0.06	0.07	1.0	0.08	0.16	0.16	0.68	0.4	0.23	0.03	0.04	0.02
Gb_40558	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.06	0.03	0.17	0.03	0.02	0.35	0.03	0.07	0.07	0.24	1.0	0.09	0.03	0.02	0.01
Gb_40564	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.57	0.04	0.04	1.0	0.04	0.21	0.2	0.75	0.27	0.14	0.02	0.04	0.01
Gb_40595 (TZ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)