Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
Ehy_g00557 (ADK)
0.24 -0.22 -0.06
Ehy_g00742 (COX6B)
0.27 -0.41 0.05
Ehy_g00830 (HSA32)
0.2 -0.33 0.08
0.18 -0.25 0.04
0.09 -0.38 0.23
0.37 -0.82 0.2
Ehy_g01214 (EB1B)
0.25 -0.72 0.27
Ehy_g01337 (ENOC)
0.19 -0.35 0.11
0.04 -0.24 0.16
Ehy_g01397 (VPS45)
0.13 -0.19 0.04
Ehy_g01413 (3BETAHSD/D2)
0.28 -0.49 0.1
0.18 -0.21 0.0
0.26 -0.64 0.22
0.38 -0.78 0.15
0.21 -0.32 0.06
0.25 -0.42 0.08
0.28 -0.61 0.18
0.23 -0.39 0.09
0.35 -0.93 0.27
0.25 -0.59 0.2
0.19 -0.3 0.07
Ehy_g02116 (CBL9)
0.38 -0.41 -0.08
0.47 -1.08 0.19
Ehy_g02387 (ATAIH)
0.12 -0.47 0.25
0.28 -0.42 0.06
0.28 -0.32 -0.02
Ehy_g02643 (IAA2)
0.49 -1.1 0.17
Ehy_g02784 (APP1)
0.11 -0.13 0.01
0.12 -0.32 0.15
0.2 -0.44 0.16
0.23 -0.44 0.12
0.52 -0.73 -0.06
Ehy_g03284 (CBL9)
0.43 -1.97 0.48
0.34 -1.24 0.39
0.14 -0.29 0.11
Ehy_g03477 (TRB1)
0.13 -0.29 0.12
0.24 -0.42 0.1
0.2 -0.27 0.03
Ehy_g03601 (NEV)
0.22 -0.3 0.04
0.12 -0.38 0.2
0.2 -0.57 0.24
0.23 -0.49 0.16
Ehy_g03976 (HSP91)
0.06 -0.27 0.17
0.16 -0.34 0.12
0.34 -0.79 0.21
0.11 -0.28 0.13
Ehy_g04516 (ARPC1)
0.27 -0.33 -0.0
0.09 -0.19 0.08
Ehy_g04595 (PTB2)
0.12 -0.26 0.1
0.16 -0.39 0.16
Ehy_g04638 (GRF12)
0.29 -1.21 0.43
Ehy_g04850 (LAX1)
0.27 -1.17 0.43
0.13 -0.28 0.11
0.14 -0.13 -0.03
0.14 -0.34 0.15
0.21 -0.51 0.19
0.08 -0.3 0.18
Ehy_g05410 (WLIM1)
0.22 -0.45 0.14
0.13 -0.21 0.06
Ehy_g05643 (GUT1)
0.57 -3.11 0.48
0.13 -0.41 0.2
Ehy_g05822 (RAD23D)
0.18 -0.39 0.14
Ehy_g05923 (TBL2)
0.65 -1.19 -0.01
Ehy_g05935 (MPK9)
0.26 -1.01 0.39
0.19 -0.36 0.12
Ehy_g06112 (VHA-A3)
0.18 -0.46 0.19
Ehy_g06203 (VPS54)
0.27 -0.44 0.08
Ehy_g06412 (ROD1)
0.36 -0.59 0.07
0.17 -0.17 -0.02
Ehy_g06732 (JAI3)
0.24 -0.74 0.29
Ehy_g06917 (SAY1)
0.13 -0.14 -0.01
Ehy_g07109 (UBDK GAMMA 7)
0.12 -0.42 0.22
0.28 -0.72 0.23
0.19 -0.56 0.24
0.18 -0.84 0.39
0.37 -0.92 0.24
0.3 -0.6 0.15
0.37 -1.15 0.33
0.27 -0.95 0.36
0.11 -0.34 0.18
0.42 -1.04 0.24
0.2 -0.58 0.25
Ehy_g08507 (PHS1)
0.11 -0.17 0.05
Ehy_g08508 (PDF1)
0.29 -0.37 0.01
Ehy_g08984 (COV1)
0.33 -0.7 0.17
0.13 -0.39 0.19
Ehy_g09119 (APM1)
0.12 -0.36 0.19
0.31 -0.78 0.24
0.21 -0.72 0.3
Ehy_g09708 (CKB1)
0.2 -0.27 0.03
0.22 -0.25 -0.01
0.18 -0.31 0.08
Ehy_g09919 (TMN7)
0.25 -0.21 -0.07
0.23 -0.26 -0.01
0.22 -0.75 0.31
Ehy_g09994 (VLN3)
0.17 -0.33 0.11
0.13 -0.6 0.32
0.18 -0.35 0.11
Ehy_g10201 (SEC8)
0.18 -0.24 0.03
Ehy_g10253 (UBC5)
0.32 -0.74 0.2
0.17 -0.56 0.26
0.29 -0.58 0.15
0.38 -0.86 0.2
0.17 -0.32 0.11
0.24 -0.49 0.15
Ehy_g11901 (GLP5)
0.32 -1.34 0.44
0.11 -0.45 0.25
0.36 -1.64 0.48
0.18 -0.43 0.17
0.15 -0.18 0.01
0.58 -1.48 0.19
Ehy_g12710 (TCX2)
0.25 -0.68 0.24
Ehy_g12760 (CPH)
0.42 -1.06 0.25
0.25 -0.6 0.2
0.43 -1.53 0.39
0.18 -0.57 0.25
0.39 -1.48 0.41
0.46 -0.76 0.04
0.17 -0.31 0.09
Ehy_g13841 (ANQ1)
0.12 -0.37 0.19
Ehy_g13925 (PDI8)
0.28 -0.51 0.12
0.44 -1.0 0.2
Ehy_g14276 (CSLC5)
0.51 -0.74 -0.03
0.45 -2.02 0.47
0.15 -0.38 0.17
0.15 -0.22 0.04
0.61 -1.84 0.26
0.31 -0.39 -0.01
0.09 -0.34 0.2
0.41 -1.44 0.38
0.2 -0.75 0.33
0.31 -0.82 0.25
0.14 -0.33 0.14
Ehy_g15873 (SYP32)
0.18 -0.47 0.19
0.59 -1.17 0.07
Ehy_g16457 (TOR2)
0.38 -2.13 0.55
0.21 -0.54 0.21
Ehy_g16702 (SEC10)
0.17 -0.35 0.13
0.11 -0.25 0.11
0.47 -1.34 0.28
0.33 -0.69 0.17
0.12 -0.28 0.12
Ehy_g17072 (IAA8)
0.37 -0.66 0.11
0.2 -0.18 -0.04
Ehy_g17237 (SYTB)
0.31 -1.27 0.43
Ehy_g17376 (VLN4)
0.2 -0.37 0.11
0.32 -1.17 0.39
Ehy_g17807 (CRR22)
0.24 -0.28 -0.01
Ehy_g17896 (BEN1)
0.23 -0.55 0.19
0.16 -0.31 0.11
Ehy_g17919 (STT3A)
0.15 -0.19 0.02
0.41 -1.11 0.27
0.5 -1.33 0.24
0.15 -0.41 0.19
0.35 -0.72 0.17
0.39 -1.09 0.29
0.23 -1.03 0.42
Ehy_g21108 (CPK34)
0.23 -0.58 0.21
0.22 -0.33 0.06
0.4 -1.14 0.3
Ehy_g21798 (ALA1)
0.22 -0.33 0.05
0.26 -0.74 0.27
0.13 -0.22 0.07
0.13 -0.24 0.08
0.27 -0.34 0.01
0.32 -0.35 -0.04
0.14 -0.39 0.19
0.22 -0.66 0.26
0.15 -0.29 0.1
Ehy_g25424 (PEN2)
0.25 -0.46 0.11
Ehy_g25574 (CYL1)
0.38 -0.55 0.02
0.31 -0.9 0.29
Ehy_g26246 (MAP65-1)
0.21 -0.45 0.15
Ehy_g26270 (ARA7)
0.24 -0.38 0.07
0.24 -0.51 0.16
0.38 -1.69 0.47
0.41 -2.25 0.55
0.22 -0.32 0.06
0.41 -0.88 0.18
0.39 -1.43 0.4
0.11 -0.22 0.09
0.16 -0.28 0.09
0.24 -0.29 0.0
0.39 -3.27 0.66
0.5 -1.84 0.39
0.26 -0.62 0.2
0.24 -0.4 0.09
Ehy_g31293 (GONST1)
0.15 -0.23 0.05
0.48 -1.73 0.38
0.49 -1.51 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.