Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
Ehy_g00557 (ADK)
105.38 76.81 86.0
Ehy_g00742 (COX6B)
204.88 127.54 175.57
Ehy_g00830 (HSA32)
74.05 51.47 68.45
9.43 6.98 8.56
6.07 4.38 6.7
26.56 11.64 23.61
Ehy_g01214 (EB1B)
35.7 18.26 36.11
Ehy_g01337 (ENOC)
15.84 10.89 15.04
69.15 57.04 75.21
Ehy_g01397 (VPS45)
14.12 11.29 13.31
Ehy_g01413 (3BETAHSD/D2)
27.45 16.03 24.18
8.94 6.85 7.92
7.6 4.08 7.39
8.85 3.96 7.54
11.52 7.94 10.36
3.67 2.31 3.27
13.68 7.36 12.75
7.53 4.92 6.83
66.19 27.25 62.62
66.57 37.2 64.05
14.45 10.3 13.28
Ehy_g02116 (CBL9)
52.17 30.19 37.94
6.58 2.24 5.42
Ehy_g02387 (ATAIH)
25.65 17.06 28.12
21.84 13.45 18.81
9.22 6.08 7.53
Ehy_g02643 (IAA2)
13.15 4.37 10.53
Ehy_g02784 (APP1)
31.72 26.9 29.77
10.94 8.04 11.2
36.65 23.41 35.55
12.79 8.03 11.79
116.42 48.82 78.03
Ehy_g03284 (CBL9)
13.35 2.53 13.86
163.22 54.39 167.93
20.34 15.12 19.84
Ehy_g03477 (TRB1)
12.66 9.41 12.53
39.13 24.86 35.75
71.24 51.76 63.6
Ehy_g03601 (NEV)
19.72 13.77 17.42
15.92 11.2 16.74
17.59 10.31 18.15
6.17 3.75 5.91
Ehy_g03976 (HSP91)
49.69 39.58 53.53
3.0 2.12 2.92
20.76 9.46 18.88
35.9 27.39 36.39
Ehy_g04516 (ARPC1)
28.94 19.15 23.94
28.05 23.06 27.81
Ehy_g04595 (PTB2)
7.19 5.53 7.08
23.53 16.14 23.59
Ehy_g04638 (GRF12)
144.57 51.08 159.54
Ehy_g04850 (LAX1)
25.17 9.32 28.28
32.25 24.26 31.8
16.94 14.08 15.09
11.74 8.44 11.78
57.87 35.04 56.87
25.63 19.67 27.54
Ehy_g05410 (WLIM1)
99.54 62.59 94.59
26.16 20.6 24.82
Ehy_g05643 (GUT1)
2.08 0.16 1.95
3.37 2.32 3.55
Ehy_g05822 (RAD23D)
41.17 27.81 40.05
Ehy_g05923 (TBL2)
2.91 0.82 1.85
Ehy_g05935 (MPK9)
11.26 4.69 12.31
4.33 2.97 4.14
Ehy_g06112 (VHA-A3)
83.67 53.46 83.7
Ehy_g06203 (VPS54)
12.88 7.87 11.33
Ehy_g06412 (ROD1)
22.51 11.67 18.36
14.46 11.45 12.72
Ehy_g06732 (JAI3)
18.42 9.36 19.17
Ehy_g06917 (SAY1)
22.56 18.69 20.42
Ehy_g07109 (UBDK GAMMA 7)
8.04 5.51 8.6
11.68 5.84 11.28
114.15 68.02 117.92
12.83 6.32 14.87
20.75 8.5 18.91
14.27 7.61 12.83
9.27 3.25 9.07
21.08 9.06 22.45
8.85 6.48 9.27
10.39 3.78 9.16
6.43 3.75 6.65
Ehy_g08507 (PHS1)
3.49 2.87 3.35
Ehy_g08508 (PDF1)
45.74 28.95 37.88
Ehy_g08984 (COV1)
11.82 5.81 10.63
16.92 11.85 17.66
Ehy_g09119 (APM1)
3.93 2.82 4.14
11.69 5.49 11.13
34.72 18.24 36.92
Ehy_g09708 (CKB1)
26.4 19.0 23.32
50.34 36.34 43.02
79.26 56.58 74.1
Ehy_g09919 (TMN7)
47.94 34.89 38.49
18.59 13.27 15.71
113.72 58.03 121.35
Ehy_g09994 (VLN3)
21.98 15.48 21.04
15.66 9.44 17.94
37.13 25.75 35.26
Ehy_g10201 (SEC8)
14.45 10.75 12.99
Ehy_g10253 (UBC5)
60.34 28.84 55.42
9.8 5.88 10.38
9.78 5.34 8.83
6.87 2.89 6.05
37.17 26.47 35.63
46.9 28.46 44.15
Ehy_g11901 (GLP5)
6.11 1.93 6.63
2.42 1.64 2.66
96.15 24.1 104.69
13.95 9.13 13.86
9.2 7.31 8.35
3.72 0.89 2.84
Ehy_g12710 (TCX2)
2.21 1.16 2.19
Ehy_g12760 (CPH)
47.12 16.96 41.94
19.73 10.92 19.09
1.89 0.49 1.84
23.58 13.97 24.78
3.65 1.0 3.71
4.35 1.86 3.25
3.32 2.39 3.15
Ehy_g13841 (ANQ1)
12.93 9.2 13.53
Ehy_g13925 (PDI8)
8.71 5.06 7.82
2.55 0.94 2.16
Ehy_g14276 (CSLC5)
2.18 0.92 1.5
3.94 0.71 3.97
6.34 4.41 6.43
13.54 10.45 12.55
5.6 1.03 4.41
10.79 6.62 8.64
10.25 7.62 11.05
2.35 0.65 2.29
14.88 7.67 16.19
12.14 5.53 11.63
9.85 7.08 9.81
Ehy_g15873 (SYP32)
5.4 3.45 5.45
8.25 2.43 5.76
Ehy_g16457 (TOR2)
820.0 143.54 921.23
2.39 1.42 2.38
Ehy_g16702 (SEC10)
13.43 9.37 13.04
40.24 31.45 40.31
3.87 1.1 3.39
6.59 3.24 5.88
16.51 12.56 16.6
Ehy_g17072 (IAA8)
163.22 80.02 136.4
8.09 6.23 6.86
Ehy_g17237 (SYTB)
3.38 1.13 3.67
Ehy_g17376 (VLN4)
30.27 20.28 28.26
18.62 6.62 19.49
Ehy_g17807 (CRR22)
2.31 1.61 1.94
Ehy_g17896 (BEN1)
22.91 13.37 22.33
66.37 48.01 64.08
Ehy_g17919 (STT3A)
27.21 21.55 24.97
54.97 19.22 50.03
4.22 1.18 3.52
63.56 43.27 65.49
12.38 5.91 10.92
10.32 3.69 9.59
19.9 8.29 22.76
Ehy_g21108 (CPK34)
29.57 16.84 29.09
27.36 18.71 24.5
7.61 2.62 7.11
Ehy_g21798 (ALA1)
4.05 2.76 3.59
3.48 1.74 3.52
5.71 4.48 5.46
26.5 20.5 25.54
7.83 5.15 6.54
41.56 26.15 32.45
5.24 3.62 5.41
1.9 1.03 1.95
11.87 8.73 11.43
Ehy_g25424 (PEN2)
29.63 18.07 26.92
Ehy_g25574 (CYL1)
4.86 2.54 3.77
21.29 9.17 20.97
Ehy_g26246 (MAP65-1)
40.59 25.68 39.02
Ehy_g26270 (ARA7)
119.31 77.17 105.78
4.05 2.41 3.82
8.98 2.13 9.57
2.7 0.43 2.98
7.52 5.18 6.74
6.83 2.79 5.81
21.0 5.92 21.03
9.19 7.27 9.01
7.15 5.26 6.8
10.85 7.54 9.24
61.06 4.81 73.51
21.48 4.24 19.83
4.28 2.33 4.1
11.82 7.58 10.65
Ehy_g31293 (GONST1)
5.44 4.18 5.09
33.76 7.33 31.66
4.05 1.01 3.58

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)