Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Rhizome
Root
Dde_g00331 (GLY2)
0.67 0.73 0.72 0.7 0.68 1.0 0.48
0.53 0.54 0.7 0.64 0.77 1.0 0.35
Dde_g00494 (RAB)
0.19 0.32 0.45 0.6 0.41 1.0 0.0
Dde_g00702 (FPN1)
0.63 0.54 0.71 0.55 0.94 1.0 0.33
0.69 0.77 0.8 0.77 0.9 1.0 0.55
0.74 0.66 0.8 0.74 0.83 1.0 0.55
0.55 0.57 0.69 0.6 0.77 1.0 0.42
0.62 0.53 0.67 0.51 0.74 1.0 0.4
0.43 0.43 0.39 0.34 0.45 1.0 0.15
0.71 0.55 0.61 0.53 0.76 1.0 0.5
0.77 0.75 0.8 0.77 0.8 1.0 0.59
0.63 0.69 0.78 0.78 0.78 1.0 0.6
0.71 0.8 0.74 0.84 0.95 1.0 0.53
0.5 0.56 0.69 0.72 0.73 1.0 0.57
0.37 0.6 0.55 0.45 0.59 1.0 0.19
0.5 0.46 0.64 0.57 0.82 1.0 0.27
0.71 0.66 0.71 0.55 0.74 1.0 0.17
0.66 0.65 0.84 0.69 0.89 1.0 0.61
0.8 0.79 0.73 0.78 0.9 1.0 0.56
Dde_g02549 (NRPB7)
0.82 0.9 0.79 0.75 0.94 1.0 0.56
0.35 0.44 0.41 0.29 0.44 1.0 0.04
0.72 0.56 0.72 0.61 0.89 1.0 0.41
0.53 0.56 0.67 0.59 0.9 1.0 0.23
0.63 0.77 0.74 0.84 0.82 1.0 0.28
0.5 0.53 0.69 0.78 0.8 1.0 0.28
0.71 0.83 0.79 0.78 0.77 1.0 0.56
0.22 0.18 0.53 0.58 0.28 1.0 0.02
0.67 0.81 0.87 0.75 0.9 1.0 0.59
Dde_g03974 (SMD1)
0.74 0.86 0.87 0.78 0.91 1.0 0.57
0.61 0.68 0.67 0.53 0.72 1.0 0.45
0.71 0.57 0.72 0.63 0.81 1.0 0.45
Dde_g04274 (UGE2)
0.63 0.46 0.44 0.45 0.53 1.0 0.14
0.49 0.45 0.65 0.56 0.74 1.0 0.35
0.58 0.51 0.59 0.55 0.77 1.0 0.15
0.79 0.75 0.74 0.69 0.8 1.0 0.39
Dde_g04844 (SK13)
0.6 0.56 0.73 0.56 0.84 1.0 0.53
Dde_g04917 (PIN4)
0.26 0.36 0.56 0.56 0.49 1.0 0.11
0.73 0.82 0.76 0.66 0.85 1.0 0.5
0.7 0.73 0.68 0.64 0.8 1.0 0.48
0.46 0.63 0.69 0.71 0.88 1.0 0.15
0.68 0.57 0.67 0.6 0.89 1.0 0.17
Dde_g07147 (BEH4)
0.52 0.63 0.64 0.64 0.75 1.0 0.29
0.29 0.17 0.23 0.24 0.2 1.0 0.0
Dde_g07223 (HY4)
0.83 0.82 0.77 0.83 0.95 1.0 0.52
0.24 0.44 0.43 0.42 0.62 1.0 0.14
0.51 0.58 0.83 0.67 0.76 1.0 0.25
Dde_g07450 (FTSH11)
0.7 0.6 0.65 0.63 0.7 1.0 0.39
Dde_g07582 (CDKC;1)
0.78 0.83 0.86 0.84 0.87 1.0 0.68
0.59 0.63 0.75 0.73 0.71 1.0 0.38
0.68 0.76 0.74 0.76 0.88 1.0 0.58
Dde_g08665 (GALK)
0.45 0.51 0.57 0.59 0.54 1.0 0.22
Dde_g08705 (KU70)
0.66 0.54 0.66 0.5 0.77 1.0 0.45
0.76 0.57 0.73 0.57 0.9 1.0 0.32
Dde_g09332 (CPL4)
0.82 0.88 0.87 0.81 0.89 1.0 0.68
0.38 0.39 0.59 0.49 0.7 1.0 0.26
0.59 0.84 0.84 0.79 0.94 1.0 0.22
Dde_g10398 (SR45)
0.59 0.47 0.74 0.61 0.88 1.0 0.35
Dde_g10428 (AP2)
0.47 0.29 0.52 0.65 0.6 1.0 0.13
0.7 0.71 0.67 0.62 0.8 1.0 0.41
0.4 0.54 0.51 0.5 0.7 1.0 0.15
Dde_g10906 (ARC3)
0.6 0.46 0.62 0.61 0.8 1.0 0.43
0.68 0.74 0.72 0.66 0.89 1.0 0.43
0.77 0.68 0.7 0.74 0.79 1.0 0.44
Dde_g11240 (QQT1)
0.79 0.71 0.74 0.78 0.87 1.0 0.55
Dde_g11456 (RBP47B)
0.73 0.75 0.82 0.8 0.92 1.0 0.69
Dde_g11657 (ELP2)
0.71 0.58 0.73 0.6 0.83 1.0 0.58
0.57 0.5 0.69 0.59 0.82 1.0 0.34
Dde_g12994 (MIOX5)
0.72 0.66 0.71 0.58 0.82 1.0 0.2
Dde_g12999 (SK13)
0.66 0.68 0.66 0.65 0.73 1.0 0.44
0.55 0.63 0.63 0.66 1.0 0.96 0.28
0.37 0.35 0.37 0.57 0.66 1.0 0.0
0.57 0.43 0.61 0.52 0.76 1.0 0.35
0.7 0.59 0.7 0.6 0.86 1.0 0.35
0.32 0.25 0.67 0.62 0.54 1.0 0.3
0.61 0.65 0.64 0.71 0.69 1.0 0.18
Dde_g15997 (PDR6)
0.28 0.51 0.58 0.43 0.56 1.0 0.14
0.46 0.6 0.45 0.44 0.71 1.0 0.23
0.43 0.59 0.58 0.57 1.0 0.96 0.07
0.37 0.4 0.58 0.61 0.58 1.0 0.19
0.86 0.72 0.72 0.6 0.78 1.0 0.3
Dde_g18256 (SPL3)
0.2 0.23 0.68 0.7 0.48 1.0 0.18
Dde_g18756 (CRR22)
0.54 0.67 0.72 0.74 0.83 1.0 0.15
Dde_g18836 (U2A')
0.74 0.69 0.78 0.7 0.9 1.0 0.67
0.73 0.64 0.61 0.54 0.62 1.0 0.18
Dde_g19007 (DGK3)
0.51 0.59 0.62 0.76 0.63 1.0 0.24
0.18 0.42 0.43 0.35 0.4 1.0 0.01
0.49 0.66 0.63 0.71 1.0 0.87 0.11
0.58 0.59 0.37 0.37 0.62 1.0 0.32
0.7 0.61 0.67 0.56 0.87 1.0 0.27
Dde_g22347 (CDC20.2)
0.48 0.48 0.65 0.47 0.78 1.0 0.19
0.55 0.5 0.73 0.71 0.68 1.0 0.22
0.6 0.65 0.7 0.72 0.85 1.0 0.52
0.38 0.35 0.72 0.59 0.54 1.0 0.25
0.41 0.59 0.56 0.59 1.0 0.89 0.1
0.54 0.6 0.72 0.67 0.89 1.0 0.27
0.75 0.59 0.66 0.7 0.92 1.0 0.32
0.76 0.75 0.77 0.74 0.91 1.0 0.41
Dde_g24159 (HMR)
0.66 0.52 0.62 0.54 0.66 1.0 0.37
0.58 0.66 0.73 0.8 0.76 1.0 0.49
0.64 0.59 0.75 0.64 0.88 1.0 0.49
0.71 0.68 0.79 0.69 0.86 1.0 0.51
0.52 0.44 0.63 0.52 0.62 1.0 0.14
0.39 0.38 0.51 0.49 0.67 1.0 0.08
Dde_g25969 (MOD1)
0.68 0.76 0.75 0.71 0.79 1.0 0.47
Dde_g26282 (GATA5)
0.51 0.61 0.52 0.47 0.69 1.0 0.19
Dde_g26316 (BRN2)
0.1 0.29 0.52 0.54 0.53 1.0 0.09
Dde_g26782 (SUF4)
0.65 0.82 0.86 0.82 0.94 1.0 0.53
0.42 0.69 0.64 0.57 1.0 0.81 0.08
0.69 0.53 0.75 0.6 0.81 1.0 0.46
0.18 0.28 0.4 0.42 0.51 1.0 0.15
Dde_g28139 (TBL4)
0.56 0.47 0.48 0.44 0.6 1.0 0.15
0.39 0.39 0.34 0.45 0.39 1.0 0.06
0.58 0.71 0.7 0.68 0.81 1.0 0.43
0.54 0.46 0.58 0.68 0.8 1.0 0.25
Dde_g29255 (HSK)
0.45 0.51 0.64 0.58 0.88 1.0 0.34
0.37 0.64 0.46 0.49 0.74 1.0 0.09
0.56 0.36 0.67 0.48 0.65 1.0 0.2
0.57 0.53 0.58 0.51 0.75 1.0 0.32
0.63 0.67 0.67 0.62 0.78 1.0 0.26
Dde_g31084 (PYL4)
0.82 0.77 0.76 0.83 0.97 1.0 0.45
0.6 0.47 0.67 0.57 0.93 1.0 0.28
0.5 0.37 0.47 0.49 0.55 1.0 0.04
0.19 0.34 0.38 0.34 0.56 1.0 0.14
0.39 0.32 0.58 0.39 0.71 1.0 0.08
0.61 0.79 0.8 0.64 0.86 1.0 0.21
0.53 0.37 0.45 0.7 0.61 1.0 0.16
0.48 0.23 0.5 0.35 0.77 1.0 0.2
Dde_g39694 (SR34a)
0.81 0.71 0.72 0.72 0.88 1.0 0.52
0.6 0.5 0.7 0.57 0.74 1.0 0.44
0.61 0.69 0.71 0.68 0.84 1.0 0.48
0.65 0.51 0.68 0.57 0.86 1.0 0.38
0.61 0.61 0.6 0.62 0.58 1.0 0.22
0.64 0.8 0.87 0.88 0.82 1.0 0.13
Dde_g47262 (PAP10)
0.49 0.77 0.77 0.71 0.88 1.0 0.31
0.52 0.47 0.64 0.55 0.84 1.0 0.31
0.43 0.42 0.66 0.6 0.79 1.0 0.21
0.67 0.65 0.56 0.62 0.69 1.0 0.17
0.71 0.5 0.66 0.55 0.74 1.0 0.36
0.62 0.48 0.64 0.67 0.64 1.0 0.19
0.72 0.57 0.76 0.72 0.9 1.0 0.48
0.65 0.32 0.55 0.42 0.64 1.0 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)