Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Rhizome
Root
Dde_g00331 (GLY2)
101.3 110.94 108.73 105.28 102.11 151.01 72.57
14.67 14.72 19.18 17.51 21.1 27.52 9.71
Dde_g00494 (RAB)
2.46 4.12 5.9 7.81 5.35 12.97 0.04
Dde_g00702 (FPN1)
15.68 13.54 17.92 13.88 23.61 25.06 8.24
6.59 7.39 7.68 7.43 8.69 9.62 5.32
38.4 34.29 41.52 38.49 43.07 52.19 28.96
9.34 9.73 11.76 10.2 13.16 17.07 7.2
2.95 2.52 3.2 2.43 3.57 4.8 1.93
3.97 3.95 3.59 3.17 4.19 9.26 1.4
59.02 45.24 50.19 43.96 63.12 82.93 41.65
178.46 175.01 185.08 178.91 185.83 232.64 136.55
15.93 17.59 19.78 19.79 19.75 25.39 15.14
16.27 18.18 16.92 19.09 21.63 22.78 12.01
7.95 9.0 11.03 11.45 11.65 15.98 9.14
5.64 9.11 8.31 6.88 8.98 15.16 2.95
108.72 100.14 138.8 124.08 178.85 218.35 59.45
33.88 31.53 34.18 26.5 35.64 48.04 8.05
9.93 9.83 12.6 10.35 13.45 15.07 9.19
149.73 147.58 137.04 145.78 168.62 187.88 104.33
Dde_g02549 (NRPB7)
50.26 55.14 48.07 45.82 57.23 61.02 34.25
20.59 25.5 23.79 17.17 25.8 58.36 2.44
31.81 24.66 31.7 26.78 39.21 43.9 18.18
4.52 4.79 5.77 5.1 7.71 8.59 1.98
52.61 64.72 62.16 70.3 69.06 83.87 23.17
21.56 22.65 29.36 33.24 34.18 42.71 12.01
5.42 6.35 5.98 5.96 5.85 7.61 4.24
2.35 1.84 5.53 6.02 2.97 10.47 0.21
15.42 18.65 20.01 17.17 20.66 22.99 13.65
Dde_g03974 (SMD1)
3.74 4.36 4.41 3.94 4.64 5.07 2.91
10.19 11.37 11.05 8.78 11.96 16.62 7.51
15.29 12.37 15.6 13.61 17.56 21.54 9.64
Dde_g04274 (UGE2)
65.08 47.52 45.18 46.72 54.84 103.35 14.03
54.85 50.28 73.25 62.99 82.64 112.17 39.25
38.53 33.76 39.3 36.36 51.23 66.11 9.83
10.24 9.62 9.52 8.86 10.29 12.91 5.06
Dde_g04844 (SK13)
15.33 14.26 18.64 14.17 21.37 25.52 13.55
Dde_g04917 (PIN4)
2.55 3.55 5.54 5.55 4.89 9.93 1.05
38.79 43.44 40.34 34.72 45.01 52.98 26.62
14.7 15.29 14.2 13.46 16.81 20.96 10.07
31.86 43.44 48.04 48.93 61.02 69.38 10.52
28.71 24.02 28.27 25.33 37.31 41.97 7.12
Dde_g07147 (BEH4)
3.92 4.75 4.9 4.89 5.68 7.61 2.17
0.95 0.54 0.77 0.77 0.67 3.27 0.0
Dde_g07223 (HY4)
22.21 21.96 20.44 22.07 25.29 26.65 13.75
0.99 1.85 1.8 1.75 2.61 4.19 0.6
14.54 16.36 23.48 19.07 21.58 28.25 7.13
Dde_g07450 (FTSH11)
33.76 28.91 31.45 30.52 34.1 48.49 19.09
Dde_g07582 (CDKC;1)
39.53 42.17 43.94 42.71 44.47 50.92 34.39
40.7 43.24 51.83 49.99 49.04 68.68 26.31
44.16 49.8 47.92 49.44 57.62 65.19 37.58
Dde_g08665 (GALK)
19.53 22.32 24.55 25.81 23.4 43.42 9.43
Dde_g08705 (KU70)
8.55 6.98 8.53 6.44 9.98 12.95 5.87
44.38 33.36 42.46 32.96 52.47 58.25 18.44
Dde_g09332 (CPL4)
4.06 4.35 4.29 3.98 4.37 4.93 3.36
168.98 176.63 264.75 218.29 313.07 449.55 118.29
1.9 2.68 2.69 2.53 3.03 3.21 0.72
Dde_g10398 (SR45)
34.92 27.56 43.51 35.78 51.83 59.12 20.54
Dde_g10428 (AP2)
14.25 8.97 15.94 19.8 18.18 30.54 3.93
12.61 12.91 12.05 11.17 14.41 18.1 7.46
2.47 3.32 3.16 3.11 4.33 6.19 0.91
Dde_g10906 (ARC3)
4.81 3.72 4.99 4.85 6.41 8.0 3.47
4.28 4.67 4.54 4.16 5.64 6.34 2.7
32.12 28.46 29.2 30.94 32.82 41.57 18.21
Dde_g11240 (QQT1)
27.06 24.26 25.23 26.62 29.68 34.11 18.67
Dde_g11456 (RBP47B)
82.2 84.11 91.93 89.5 103.27 112.37 77.02
Dde_g11657 (ELP2)
3.86 3.12 3.93 3.24 4.48 5.4 3.13
26.44 23.44 32.16 27.62 38.0 46.57 15.73
Dde_g12994 (MIOX5)
34.82 31.95 34.2 27.89 39.33 48.09 9.45
Dde_g12999 (SK13)
143.52 147.16 142.87 141.54 157.08 216.26 94.58
1.27 1.46 1.47 1.53 2.32 2.24 0.66
1.08 1.02 1.07 1.66 1.92 2.89 0.0
45.75 34.19 48.82 41.45 60.46 80.03 27.61
17.36 14.55 17.27 14.75 21.26 24.71 8.62
35.01 27.42 72.75 66.77 58.52 108.07 32.39
3.84 4.11 4.05 4.49 4.38 6.3 1.12
Dde_g15997 (PDR6)
1.14 2.09 2.38 1.76 2.3 4.11 0.6
14.71 19.29 14.31 14.14 22.63 31.98 7.49
17.08 23.61 23.23 22.68 39.98 38.22 2.93
312.15 333.2 490.82 508.68 488.04 840.36 160.85
8.47 7.06 7.1 5.88 7.73 9.85 2.99
Dde_g18256 (SPL3)
2.88 3.29 9.72 10.12 6.91 14.38 2.66
Dde_g18756 (CRR22)
1.3 1.59 1.71 1.76 1.99 2.39 0.35
Dde_g18836 (U2A')
42.03 39.41 44.38 39.45 50.93 56.77 38.12
3.63 3.17 3.03 2.69 3.08 4.95 0.88
Dde_g19007 (DGK3)
21.61 25.2 26.58 32.62 27.03 42.76 10.17
1.44 3.28 3.43 2.73 3.16 7.88 0.05
16.13 21.46 20.72 23.08 32.73 28.39 3.61
1.74 1.79 1.13 1.12 1.88 3.02 0.98
10.19 8.88 9.85 8.21 12.64 14.6 3.91
Dde_g22347 (CDC20.2)
1.79 1.75 2.41 1.75 2.88 3.69 0.7
52.5 47.64 69.07 67.3 64.44 95.23 20.81
6.37 6.87 7.38 7.56 9.0 10.55 5.52
5.95 5.55 11.39 9.34 8.52 15.84 3.9
17.01 24.39 23.14 24.4 41.22 36.56 4.19
9.52 10.69 12.83 11.83 15.86 17.73 4.74
35.23 27.85 30.81 32.66 42.87 46.82 14.75
31.15 30.75 31.29 30.07 37.16 40.75 16.72
Dde_g24159 (HMR)
17.96 14.12 16.64 14.55 17.89 27.02 10.0
28.67 32.25 35.66 39.33 37.55 49.16 24.16
62.8 57.42 73.65 62.94 86.66 98.04 48.43
5.93 5.68 6.55 5.76 7.19 8.34 4.29
12.2 10.21 14.54 12.08 14.53 23.25 3.37
3.97 3.84 5.19 5.01 6.87 10.18 0.84
Dde_g25969 (MOD1)
65.93 73.16 72.26 68.73 76.02 96.78 45.32
Dde_g26282 (GATA5)
17.38 20.6 17.56 16.1 23.57 34.0 6.61
Dde_g26316 (BRN2)
0.59 1.67 2.96 3.06 3.03 5.7 0.53
Dde_g26782 (SUF4)
32.58 40.78 43.14 40.82 47.05 50.02 26.69
13.56 22.62 20.73 18.65 32.59 26.25 2.58
23.81 18.3 25.7 20.78 27.95 34.36 15.9
9.52 14.63 20.7 21.48 26.44 51.72 7.58
Dde_g28139 (TBL4)
17.21 14.45 14.54 13.41 18.21 30.55 4.71
1.78 1.8 1.58 2.07 1.79 4.6 0.28
11.94 14.58 14.38 13.93 16.61 20.61 8.82
4.5 3.9 4.84 5.75 6.73 8.41 2.13
Dde_g29255 (HSK)
3.48 3.91 4.87 4.43 6.74 7.67 2.62
2.31 4.02 2.9 3.1 4.65 6.27 0.57
5.44 3.47 6.42 4.61 6.24 9.65 1.9
7.6 7.15 7.83 6.82 10.03 13.42 4.3
8.31 8.79 8.74 8.17 10.19 13.11 3.41
Dde_g31084 (PYL4)
70.6 66.27 65.91 72.17 83.75 86.58 38.92
3.02 2.34 3.36 2.83 4.63 5.0 1.38
3.49 2.61 3.32 3.44 3.89 7.05 0.32
2.25 4.09 4.51 4.07 6.72 11.9 1.72
18.42 15.0 27.66 18.67 33.67 47.37 3.62
19.35 25.31 25.6 20.33 27.38 31.87 6.7
18.93 13.43 16.29 25.05 22.03 35.82 5.67
10.24 4.85 10.68 7.39 16.4 21.17 4.24
Dde_g39694 (SR34a)
18.22 15.96 16.2 16.06 19.71 22.38 11.64
9.77 8.03 11.29 9.21 11.98 16.21 7.11
20.22 23.12 23.73 22.71 28.03 33.34 16.02
7.21 5.65 7.49 6.27 9.49 11.08 4.17
86.95 86.45 85.58 88.5 81.72 141.97 31.72
5.28 6.62 7.15 7.3 6.76 8.25 1.06
Dde_g47262 (PAP10)
3.62 5.68 5.66 5.24 6.51 7.37 2.28
35.15 32.01 43.38 37.52 57.22 68.22 20.93
21.3 20.54 32.12 29.61 38.67 49.02 10.37
32.49 31.67 27.23 30.12 33.28 48.51 8.26
7.9 5.54 7.31 6.11 8.24 11.08 3.98
44.09 33.9 45.55 47.82 45.81 71.28 13.27
64.23 50.58 67.74 63.99 80.13 89.04 42.66
4.49 2.24 3.8 2.9 4.44 6.94 1.38

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)