Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Meristem	Rhizome	Crozier	Young Root	Mature Root
Dcu_g05921 (RPL14)	0.61	1.0	0.6	0.15	0.21	0.21	0.16	0.15	0.15	0.26	0.15
Dcu_g10440 (GSTL3)	0.46	0.16	1.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.14	0.0	0.0
Dcu_g12491	0.6	0.72	1.0	0.96	0.88	0.57	0.73	0.38	0.8	0.93	0.77
Dcu_g12751 (KT1)	0.23	0.18	1.0	0.03	0.02	0.03	0.27	0.02	0.27	0.01	0.04
Dcu_g12917 (NDHE)	0.68	0.71	1.0	0.02	0.05	0.08	0.05	0.03	0.07	0.05	0.06
Dcu_g13089 (RPL22)	0.63	1.0	0.47	0.14	0.43	0.32	0.22	0.3	0.4	0.28	0.22
Dcu_g13090	0.59	1.0	0.52	0.1	0.15	0.12	0.21	0.15	0.16	0.21	0.21
Dcu_g13091	0.62	1.0	0.85	0.13	0.18	0.17	0.13	0.07	0.15	0.17	0.15
Dcu_g13295 (SDH4)	0.69	0.82	0.82	0.63	0.22	0.39	0.25	0.33	0.36	1.0	0.37
Dcu_g13300	0.88	1.0	0.87	0.56	0.57	0.64	0.56	0.63	0.58	0.59	0.53
Dcu_g13397	0.72	1.0	0.81	0.17	0.29	0.07	0.18	0.29	0.27	0.37	0.21
Dcu_g13580	0.61	0.86	0.98	0.6	0.64	0.52	0.44	0.3	0.25	1.0	0.59
Dcu_g14654	0.55	0.69	1.0	0.1	0.16	0.52	0.2	0.23	0.18	0.16	0.36
Dcu_g15362	0.67	0.63	1.0	0.1	0.14	0.03	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01
Dcu_g15446	0.27	0.72	1.0	0.3	0.24	0.13	0.41	0.07	0.12	0.4	0.37
Dcu_g15605	0.43	0.13	1.0	0.04	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g17951	0.2	0.85	1.0	0.28	0.16	0.16	0.45	0.07	0.17	0.41	0.38
Dcu_g18367	0.69	0.42	1.0	0.29	0.18	0.26	0.34	0.02	0.1	0.19	0.1
Dcu_g18433	0.08	1.0	0.48	0.06	0.09	0.04	0.12	0.03	0.02	0.05	0.06
Dcu_g19275	0.5	1.0	0.65	0.31	0.45	0.18	0.25	0.21	0.24	0.24	0.16
Dcu_g20297	0.1	1.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.03	0.01
Dcu_g20604	1.0	0.83	0.88	0.12	0.09	0.0	0.06	0.05	0.05	0.08	0.21
Dcu_g20611	0.37	0.54	1.0	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.0	0.04	0.0
Dcu_g20888 (RPOA)	0.72	1.0	0.46	0.23	0.25	0.27	0.15	0.23	0.35	0.23	0.24
Dcu_g21066	0.56	0.43	1.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.01	0.03	0.05	0.05
Dcu_g21115	0.43	0.17	1.0	0.09	0.18	0.12	0.17	0.08	0.2	0.18	0.2
Dcu_g21129	0.48	0.66	1.0	0.01	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.16	0.09
Dcu_g21132	0.39	1.0	0.51	0.37	0.36	0.33	0.25	0.22	0.16	0.55	0.51
Dcu_g21229 (GLK2)	0.53	0.63	1.0	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0
Dcu_g21398	0.78	1.0	0.88	0.0	0.06	0.12	0.1	0.03	0.0	0.0	0.0
Dcu_g21402 (NDHA)	0.4	0.56	1.0	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04
Dcu_g22020	0.15	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Dcu_g22662 (BAT1)	0.69	0.49	1.0	0.17	0.14	0.1	0.21	0.11	0.19	0.11	0.11
Dcu_g22759	0.77	1.0	0.77	0.1	0.04	0.01	0.24	0.0	0.03	0.07	0.0
Dcu_g22801	0.6	1.0	0.53	0.24	0.3	0.23	0.19	0.21	0.1	0.3	0.69
Dcu_g22952	0.06	1.0	0.72	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g23029	0.41	1.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0
Dcu_g23091	0.42	0.48	1.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01
Dcu_g23092	0.57	0.75	1.0	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05
Dcu_g23283	0.61	0.71	1.0	0.04	0.12	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.02
Dcu_g23520 (ATP6-2)	0.52	1.0	0.55	0.61	0.5	0.3	0.4	0.2	0.13	0.56	0.61
Dcu_g25498	0.77	0.75	1.0	0.04	0.04	0.09	0.07	0.12	0.11	0.19	0.09
Dcu_g25661 (ATP1)	0.37	0.46	0.68	0.22	0.23	0.44	0.31	0.37	0.29	1.0	0.6
Dcu_g28718	0.63	0.86	1.0	0.25	0.39	0.57	0.35	0.18	0.42	0.21	0.3
Dcu_g30105	0.46	1.0	0.42	0.26	0.26	0.11	0.22	0.17	0.04	0.49	0.44
Dcu_g31509	0.49	1.0	0.66	0.24	0.21	0.22	0.17	0.32	0.3	0.29	0.2
Dcu_g36068	0.74	1.0	0.72	0.11	0.17	0.19	0.15	0.15	0.2	0.15	0.19
Dcu_g36245	0.52	0.7	0.89	0.47	0.4	0.36	0.85	0.22	0.23	1.0	0.56
Dcu_g36684	0.15	1.0	0.56	0.12	0.09	0.01	0.26	0.0	0.0	0.0	0.01
Dcu_g36769 (ORF25)	0.38	1.0	0.34	0.27	0.15	0.27	0.24	0.13	0.29	0.53	0.32
Dcu_g37275	0.63	0.83	1.0	0.03	0.06	0.06	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0
Dcu_g37301	0.63	0.38	1.0	0.14	0.09	0.37	0.36	0.41	0.05	0.02	0.07
Dcu_g37601	0.65	0.91	1.0	0.02	0.04	0.12	0.09	0.01	0.06	0.0	0.0
Dcu_g37905	0.14	0.48	1.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g39082	0.47	0.94	1.0	0.37	0.38	0.48	0.51	0.52	0.36	0.95	0.53
Dcu_g39431 (RPS11)	0.56	1.0	0.6	0.32	0.23	0.24	0.26	0.11	0.1	0.59	0.31
Dcu_g41240	0.54	0.56	1.0	0.16	0.09	0.02	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04
Dcu_g42213	0.96	1.0	0.58	0.16	0.28	0.14	0.12	0.28	0.35	0.26	0.07
Dcu_g42711	0.73	0.61	1.0	0.23	0.2	0.26	0.25	0.29	0.7	0.23	0.12
Dcu_g42712	0.05	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g42726	0.17	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g42824	0.66	0.22	1.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g43151	0.5	0.35	1.0	0.06	0.1	0.02	0.04	0.07	0.02	0.2	0.08
Dcu_g43162	0.52	0.38	1.0	0.02	0.01	0.02	0.08	0.03	0.04	0.01	0.02
Dcu_g43183 (CNGC15)	0.73	0.75	1.0	0.15	0.03	0.0	0.11	0.01	0.0	0.01	0.02
Dcu_g43551	0.64	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g43965	0.79	0.61	1.0	0.02	0.24	0.24	0.06	0.07	0.14	0.01	0.01
Dcu_g44063	0.48	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g44386	0.22	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dcu_g44779	0.7	0.44	1.0	0.08	0.03	0.14	0.16	0.1	0.2	0.13	0.18
Dcu_g44946	0.83	1.0	0.71	0.08	0.02	0.0	0.19	0.19	0.23	0.17	0.18
Dcu_g45649	0.69	1.0	0.93	0.27	0.33	0.27	0.21	0.12	0.21	0.35	0.25
Dcu_g46310	0.84	1.0	0.43	0.19	0.25	0.12	0.27	0.09	0.22	0.28	0.25
Dcu_g46636 (BAT1)	0.77	0.66	1.0	0.09	0.11	0.07	0.14	0.05	0.1	0.02	0.02
Dcu_g47283	0.55	1.0	0.82	0.49	0.33	0.25	0.33	0.15	0.28	0.2	0.22
Dcu_g47469 (NAD7)	0.43	1.0	0.53	0.36	0.25	0.2	0.19	0.13	0.13	0.43	0.27
Dcu_g47926 (COX1)	0.54	0.85	1.0	0.42	0.37	0.3	0.41	0.16	0.19	0.66	0.41
Dcu_g47986	0.3	0.5	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Dcu_g48315	0.99	0.6	1.0	0.36	0.37	0.77	0.64	0.57	0.38	0.4	0.36
Dcu_g48883	0.42	0.18	1.0	0.05	0.04	0.03	0.18	0.03	0.16	0.0	0.14
Dcu_g49123	0.8	1.0	0.97	0.05	0.18	0.14	0.27	0.03	0.28	0.11	0.04
Dcu_g49268	0.64	0.61	1.0	0.09	0.11	0.07	0.07	0.09	0.0	0.31	0.06
Dcu_g49424	0.61	1.0	0.82	0.67	0.63	0.36	0.33	0.32	0.31	0.77	0.36
Dcu_g49833 (RPL2.1)	0.82	1.0	0.78	0.61	0.53	0.36	0.41	0.45	0.47	0.45	0.42
Dcu_g51796	0.41	0.52	0.87	0.49	0.49	0.25	0.64	0.35	0.37	1.0	0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)