Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
-1.07 -0.07 0.43 -0.74 0.18 -0.13 -0.31 -0.47 1.28 1.02 -0.62 0.0 0.28 -3.12 0.16 -0.2 -0.04 -1.71 -0.33 0.02 0.37 0.0 0.39 -0.51 -0.09 0.4
Ceric.01G021100.1 (Ceric.01G021100)
-0.82 -0.14 0.21 -0.53 -0.05 0.15 -0.09 -0.45 0.95 0.85 0.29 -0.18 -0.25 -2.37 -0.06 -0.52 0.1 -2.32 -0.25 -0.26 0.64 0.5 -0.16 0.1 0.15 0.48
Ceric.02G005400.1 (Ceric.02G005400)
-0.75 0.11 0.14 0.34 0.19 0.27 0.34 -0.25 0.88 0.9 -0.67 0.02 -0.19 -2.56 -0.25 -0.61 0.15 -1.18 -0.25 0.01 0.25 -0.2 -0.32 -0.16 -0.23 0.7
Ceric.02G025700.1 (Ceric.02G025700)
-1.48 -0.17 0.3 -1.37 0.55 -0.09 0.14 -0.14 0.92 1.02 -0.51 -0.59 -0.77 -2.23 0.04 -0.07 0.43 -1.93 0.07 -0.03 0.17 0.22 0.01 0.3 0.08 0.49
-1.09 -0.16 0.45 -1.01 0.3 -0.37 -0.09 -0.37 1.18 1.17 -0.85 -0.93 -0.92 -2.7 0.04 -0.51 0.28 -1.83 -0.34 0.03 0.59 0.86 0.25 0.01 0.02 0.27
Ceric.03G044600.1 (Ceric.03G044600)
-2.51 -0.42 0.78 -1.62 0.3 -0.15 -0.13 -0.65 1.62 1.79 -0.6 -1.38 -1.16 -4.0 0.15 0.14 0.36 -2.99 -0.08 -0.81 -0.44 0.03 0.04 -0.59 0.16 0.64
-0.52 0.91 0.93 -0.11 -0.36 -0.63 -0.51 -0.51 1.38 1.35 -0.73 -1.51 -1.5 -2.93 0.05 -0.18 -0.17 -1.37 -0.75 -0.13 0.32 -0.09 -0.01 -0.43 0.14 0.51
Ceric.04G019000.1 (Ceric.04G019000)
-1.67 0.06 0.65 -0.76 0.06 0.2 0.27 0.04 1.37 1.35 -0.88 -0.96 -1.0 -3.24 -0.06 0.38 0.05 -3.1 -0.27 -0.55 -0.07 -0.03 0.02 -0.22 0.24 0.45
Ceric.04G062000.1 (Ceric.04G062000)
-1.17 -0.32 0.81 -0.7 0.35 -0.07 -0.34 -0.21 1.38 1.48 -1.82 -1.11 -1.27 -2.78 0.06 -0.06 0.26 -2.74 -0.73 -0.35 0.01 0.12 0.67 -0.47 0.42 0.38
Ceric.05G099400.1 (Ceric.05G099400)
-1.61 -0.24 0.64 -1.02 -0.04 -0.5 -0.21 -0.39 1.04 0.94 -2.1 -0.66 -0.88 -1.69 0.62 -0.49 0.03 -1.87 -0.6 -0.2 1.24 0.28 0.56 -0.7 0.41 0.77
Ceric.06G050000.1 (Ceric.06G050000)
-0.66 0.31 0.82 -0.26 0.6 0.51 0.51 -0.1 1.1 1.17 -0.36 -1.67 -1.54 -3.38 -0.44 0.21 0.59 -2.95 -0.18 -0.3 -0.17 -0.57 -0.72 0.31 -0.53 -0.06
Ceric.06G055100.1 (Ceric.06G055100)
-5.97 0.67 0.66 -4.74 -0.71 0.0 -0.22 -0.54 1.11 1.17 -1.07 -1.9 -1.47 -2.15 0.37 -0.24 -0.65 -1.07 0.31 -1.96 0.34 0.35 0.3 -1.23 1.74 0.68
Ceric.06G058700.1 (Ceric.06G058700)
-0.16 0.19 0.67 -0.37 -0.29 -0.84 -0.92 -1.4 1.47 1.49 -0.36 -0.54 -0.43 -2.35 0.58 -0.66 -0.4 -0.74 -0.75 -0.17 0.24 0.1 0.22 -0.54 0.41 -0.1
Ceric.07G050100.1 (Ceric.07G050100)
0.1 0.48 0.25 0.29 0.18 0.02 0.18 -0.47 1.18 1.0 -0.21 -0.95 -0.95 -2.51 0.14 -0.39 0.19 -2.05 -1.36 -0.06 0.23 0.28 0.09 -0.29 -0.0 -0.11
-0.21 0.03 0.7 -1.75 0.18 -0.01 -0.27 -0.96 1.45 1.63 0.08 -0.76 -0.48 -2.58 0.13 -0.65 0.4 -3.92 -1.65 -0.5 -0.42 0.16 0.16 0.0 -0.15 0.41
Ceric.09G003700.1 (Ceric.09G003700)
-1.28 -0.63 -0.08 -0.44 0.17 0.48 0.48 0.43 0.49 0.5 -1.36 -1.08 -1.31 -2.41 0.04 0.53 0.15 -2.27 -0.82 -0.56 0.03 0.85 0.44 -0.31 1.0 0.77
-0.79 0.17 -0.18 -0.24 0.07 0.01 -0.16 -0.26 0.81 0.79 0.01 -0.21 -0.53 -1.62 -0.07 -0.43 0.04 -1.21 0.16 0.14 0.52 0.31 -0.33 -0.14 0.42 0.38
Ceric.09G083900.1 (Ceric.09G083900)
-0.68 0.1 0.57 -0.26 0.13 -0.02 0.04 -0.01 0.94 0.93 -0.09 -0.55 -0.43 -2.54 0.07 0.16 0.02 -2.44 -0.34 -0.19 0.16 0.02 0.08 -0.25 0.05 0.51
Ceric.10G058300.1 (Ceric.10G058300)
-0.39 0.08 0.61 0.28 0.11 0.01 0.13 -0.25 1.09 1.28 -1.2 -1.05 -1.32 -2.36 0.07 -0.55 0.2 -2.59 -0.45 -0.02 0.37 0.0 -0.08 0.41 0.24 -0.25
Ceric.12G026400.1 (Ceric.12G026400)
-0.96 0.23 0.02 -1.94 -0.22 0.15 0.01 -0.3 0.78 0.86 -0.69 0.53 0.43 -1.87 0.03 -0.41 -0.22 -0.76 0.07 -0.14 0.62 -0.39 -0.04 -0.18 0.68 0.13
Ceric.13G062900.1 (Ceric.13G062900)
-1.31 -0.36 0.95 -0.71 0.33 -0.53 -0.45 -0.8 0.98 1.07 -0.53 -0.51 -0.67 -2.22 -0.04 -0.4 0.29 -1.58 -0.63 -0.28 0.61 0.65 0.33 -0.07 0.47 0.33
Ceric.14G092900.1 (Ceric.14G092900)
-0.42 0.2 0.74 -1.1 -0.83 -0.72 -0.61 -0.87 1.38 1.55 0.02 -1.53 -1.54 -2.23 0.19 -0.44 -0.71 -1.13 -0.23 0.18 0.93 -0.28 0.31 -0.61 0.06 0.64
Ceric.15G071800.1 (Ceric.15G071800)
-0.59 -0.02 0.71 0.21 0.69 0.11 0.27 -0.34 1.21 1.41 -1.08 -1.06 -0.75 -3.01 -0.46 -0.25 0.59 -2.34 -1.0 -0.46 -0.09 0.01 -0.06 -0.07 -0.08 -0.13
-1.37 -0.07 0.6 -1.42 -0.44 -0.04 0.05 -1.22 1.35 1.43 0.2 -1.01 -0.38 -2.41 0.03 0.09 -0.31 -1.58 -0.43 -0.16 0.45 -0.17 0.51 -0.24 -0.06 0.5
-1.3 -0.9 0.34 -1.36 0.03 0.4 0.55 0.24 1.19 1.31 -0.61 -0.51 -0.79 -3.06 0.15 0.78 0.04 -2.55 -0.25 -0.42 -0.38 -0.05 0.31 0.08 -0.04 -0.02
-1.16 -0.04 0.15 -0.45 0.38 0.35 0.43 0.19 0.76 0.77 -0.68 -1.03 -1.12 -2.62 0.09 0.11 0.24 -1.54 0.32 -0.12 0.26 0.12 -0.06 0.01 -0.01 0.53
-0.68 0.19 0.53 0.26 0.44 0.38 0.42 0.21 1.04 1.02 -1.36 -0.94 -0.97 -2.76 -0.29 0.27 0.47 -1.76 -0.17 -0.23 0.09 -0.07 -0.37 -0.07 -0.43 -0.22
Ceric.19G007300.1 (Ceric.19G007300)
-1.02 0.63 0.46 0.1 -0.1 -0.19 -0.12 -0.39 1.38 1.39 -0.74 -0.94 -1.16 -2.26 -0.1 -0.04 -0.07 -2.12 0.14 -0.15 0.32 -0.45 -0.41 -0.31 -0.11 0.56
-0.8 0.38 0.24 -0.12 0.02 -0.57 -0.74 -0.71 0.75 0.75 -0.68 -1.04 -1.12 -1.43 0.08 -0.34 -0.05 -0.04 0.01 0.16 0.74 0.97 -0.23 -0.1 0.51 0.09
-0.97 0.94 0.68 0.41 0.56 -1.29 -1.04 -1.47 1.16 1.23 0.42 -1.32 -1.36 -2.82 0.04 -0.53 0.45 -2.04 -1.08 -0.8 -0.84 0.49 -0.24 0.42 0.64 -0.05
Ceric.1Z142500.1 (Ceric.1Z142500)
-0.67 0.41 0.44 0.95 0.54 -0.35 -0.57 -0.93 1.08 0.85 -0.43 -1.11 -1.7 -1.75 -0.39 -0.38 0.57 -1.86 -1.24 -0.19 -0.8 0.89 -0.19 0.31 0.47 0.1
-1.54 -0.02 0.38 -3.8 -0.18 -0.01 -0.49 -0.59 1.61 1.52 -0.93 -0.16 0.01 -3.54 0.47 -0.13 -0.17 -1.53 0.06 -1.13 0.48 0.33 -0.24 -0.04 -0.02 0.19
Ceric.20G052500.1 (Ceric.20G052500)
-0.97 -0.22 0.54 -0.74 0.06 -0.48 -0.43 -0.24 1.0 1.13 -0.23 -0.37 -0.04 -2.11 0.13 -0.2 0.24 -1.92 -0.52 0.15 0.32 0.72 -0.04 0.16 -0.11 0.08
-0.6 -0.06 0.45 -0.35 0.31 0.17 0.29 0.38 1.05 0.85 -0.09 -0.57 -0.67 -2.48 -0.09 0.12 0.28 -1.13 0.25 -0.18 -0.01 -0.53 -0.99 0.28 0.04 -0.26
Ceric.21G034700.1 (Ceric.21G034700)
-2.14 0.11 0.13 -2.21 -0.9 -0.69 -0.75 -0.28 1.06 1.02 -0.11 -0.82 -0.77 -1.93 0.26 -0.08 -0.89 -0.31 0.68 0.4 1.13 0.21 -0.46 -0.59 0.36 0.93
Ceric.21G072000.1 (Ceric.21G072000)
-1.32 -0.62 0.33 -0.16 -0.03 0.03 0.28 -0.03 0.77 0.79 -0.74 -0.93 -0.71 -2.46 -0.3 0.19 -0.01 -0.61 -0.29 0.11 0.46 1.02 0.02 0.13 0.4 -0.13
Ceric.23G022800.1 (Ceric.23G022800)
-0.06 0.27 -0.11 0.93 0.16 0.16 0.27 -0.31 0.8 0.83 -0.31 -0.88 -0.6 -2.96 -0.13 -0.12 0.06 -2.12 -0.31 -0.14 0.51 -0.21 -0.07 -0.07 -0.15 0.24
Ceric.26G050700.1 (Ceric.26G050700)
-1.11 -0.08 0.49 -0.54 0.07 0.1 -0.03 -0.09 1.0 1.02 -0.21 -0.59 -0.55 -2.2 0.07 0.07 0.03 -2.03 -0.14 0.03 0.34 0.1 0.21 -0.05 0.01 0.3
-1.13 0.46 0.45 -0.01 0.65 -0.1 -0.04 -0.3 1.14 1.19 -0.69 -1.22 -1.18 -2.55 -0.11 0.05 0.63 -2.18 -0.33 -0.34 0.01 -0.06 -0.21 0.07 0.23 0.0
Ceric.28G012800.1 (Ceric.28G012800)
-0.64 0.29 0.52 0.16 0.33 0.45 0.39 0.06 1.04 1.15 -0.79 -1.47 -1.96 -2.87 -0.19 0.78 0.17 -2.24 -0.38 -0.74 -0.5 0.05 -0.09 -0.13 0.18 -0.03
Ceric.31G016200.1 (Ceric.31G016200)
-1.18 0.47 0.46 0.06 0.07 -0.22 -0.24 -0.63 1.09 1.1 -1.06 -0.49 -0.48 -2.34 -0.05 0.05 0.03 -1.22 -0.38 -0.21 0.39 0.02 0.35 -0.36 0.28 0.37
-0.59 -0.1 0.19 -0.39 0.03 -0.3 -0.3 -0.56 1.01 1.08 -0.37 -0.34 -0.89 -2.49 0.33 -0.5 -0.22 -1.36 -0.08 -0.13 0.6 0.81 -0.06 -0.17 0.42 0.32
Ceric.31G034800.1 (Ceric.31G034800)
-0.89 -0.21 -0.01 -0.9 0.5 -0.34 -0.17 -0.39 1.22 1.15 -0.11 -0.24 -0.66 -2.57 0.18 -0.04 0.52 -1.43 -0.36 0.19 0.11 0.34 -0.2 0.45 -0.28 -0.21
Ceric.31G062300.1 (Ceric.31G062300)
-2.14 -0.35 0.57 -1.02 0.54 0.28 0.28 0.07 1.39 1.3 -0.38 -0.97 -1.25 -2.66 -0.15 0.51 0.53 -2.93 -0.31 -0.37 -0.57 -0.4 -0.25 0.2 -0.27 0.49
0.02 0.31 -0.45 0.17 -0.08 -1.03 -0.97 -0.84 1.29 1.36 -0.15 -0.34 -0.13 -2.26 0.17 -0.18 -0.11 -1.13 -0.46 -0.14 0.44 0.34 -0.56 -0.14 0.48 -0.1
Ceric.34G043800.1 (Ceric.34G043800)
-1.71 -0.13 0.48 -1.32 0.44 0.01 0.11 -0.1 1.11 1.09 -0.7 -0.22 -0.41 -2.25 -0.0 0.24 0.42 -1.85 -0.19 -0.12 0.16 0.01 0.06 -0.43 0.26 0.25
Ceric.35G007900.1 (Ceric.35G007900)
-0.65 0.66 0.24 -0.4 0.28 -0.14 -0.35 -0.66 0.94 0.9 -0.59 -0.17 -0.11 -1.76 -0.06 -0.53 0.06 -1.26 -0.33 0.0 0.7 0.28 0.03 -0.45 0.01 0.3
Ceric.35G010100.1 (Ceric.35G010100)
-2.38 -0.04 0.92 -1.85 -0.2 -0.34 -0.47 -0.31 0.74 0.88 -0.54 -0.31 -0.26 -1.86 0.56 0.1 -0.31 -1.34 0.3 -0.33 1.02 0.22 0.05 -0.3 -0.37 0.84
Ceric.35G032000.1 (Ceric.35G032000)
-0.52 -0.36 0.01 -0.49 0.13 0.16 0.41 0.33 1.22 1.29 -0.33 -1.71 -1.62 -2.84 -0.09 0.75 0.17 -2.3 -1.2 -0.46 -0.26 0.09 0.32 -0.15 0.18 0.45
Ceric.36G034700.1 (Ceric.36G034700)
-1.93 0.16 0.33 -1.72 -0.53 -1.7 -1.75 -1.94 1.22 1.49 -0.13 0.67 0.73 -1.2 0.55 -1.02 -0.4 -1.55 -0.69 -0.45 0.69 0.3 -0.26 -0.44 0.95 0.02
Ceric.37G006500.1 (Ceric.37G006500)
-1.05 0.12 0.48 -0.02 0.99 -0.52 -0.19 -0.64 1.02 1.04 -0.07 -0.76 -0.74 -1.82 0.13 -0.66 0.98 -1.86 -0.71 0.04 -0.27 -0.05 -0.36 0.3 -0.43 0.2
Ceric.37G036200.1 (Ceric.37G036200)
-0.95 0.25 0.55 -1.52 -0.08 -0.62 -0.71 -0.69 1.39 1.23 -0.21 -1.54 -1.15 -2.47 0.4 -0.29 -0.16 -1.79 0.12 -0.11 0.85 0.25 0.09 -0.23 0.54 0.23
Ceric.37G044900.1 (Ceric.37G044900)
-1.11 -0.62 0.27 0.04 0.58 -1.26 -0.84 -0.01 1.71 1.56 0.23 -0.23 -0.27 -5.14 0.51 -1.82 0.32 -3.63 -0.96 -0.12 -0.2 0.22 -0.35 -0.29 -0.46 0.34
-0.81 0.08 0.79 -1.52 -0.62 -0.48 -0.71 -0.87 0.65 0.68 0.04 -0.17 -0.17 -1.71 0.33 -0.24 -0.6 -1.51 -0.22 0.17 0.84 0.88 0.19 -0.44 0.52 0.52
Ceric.39G059900.1 (Ceric.39G059900)
-0.87 -0.2 0.6 -0.51 0.2 0.03 -0.03 -0.16 1.02 1.12 -0.67 -1.09 -1.02 -2.27 0.11 0.68 0.28 -1.55 -0.29 -0.26 -0.13 -0.29 0.23 0.04 0.12 0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.