Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G009900.1 (SUVR3)	0.2	0.39	0.56	0.25	0.47	0.38	0.33	0.3	1.0	0.84	0.27	0.41	0.5	0.05	0.46	0.36	0.4	0.13	0.33	0.42	0.53	0.41	0.54	0.29	0.39	0.54
Ceric.01G021100.1 (Ceric.01G021100)	0.29	0.47	0.6	0.36	0.5	0.58	0.49	0.38	1.0	0.93	0.63	0.46	0.44	0.1	0.5	0.36	0.56	0.1	0.44	0.43	0.81	0.73	0.46	0.56	0.58	0.72
Ceric.02G005400.1 (Ceric.02G005400)	0.32	0.58	0.59	0.68	0.61	0.65	0.68	0.45	0.99	1.0	0.34	0.54	0.47	0.09	0.45	0.35	0.59	0.24	0.45	0.54	0.64	0.47	0.43	0.48	0.46	0.87
Ceric.02G025700.1 (Ceric.02G025700)	0.18	0.44	0.61	0.19	0.72	0.46	0.54	0.45	0.93	1.0	0.35	0.33	0.29	0.1	0.51	0.47	0.66	0.13	0.52	0.48	0.56	0.57	0.49	0.6	0.52	0.69
Ceric.02G062100.1 (AHP1)	0.21	0.4	0.6	0.22	0.55	0.34	0.42	0.34	1.0	0.99	0.25	0.23	0.23	0.07	0.45	0.31	0.54	0.12	0.35	0.45	0.67	0.8	0.53	0.44	0.45	0.53
Ceric.03G044600.1 (Ceric.03G044600)	0.05	0.22	0.5	0.09	0.36	0.26	0.26	0.18	0.89	1.0	0.19	0.11	0.13	0.02	0.32	0.32	0.37	0.04	0.27	0.16	0.21	0.3	0.3	0.19	0.32	0.45
Ceric.03G100900.1 (HOL3)	0.27	0.72	0.73	0.35	0.3	0.25	0.27	0.27	1.0	0.98	0.23	0.13	0.14	0.05	0.4	0.34	0.34	0.15	0.23	0.35	0.48	0.36	0.38	0.29	0.42	0.55
Ceric.04G019000.1 (Ceric.04G019000)	0.12	0.4	0.61	0.23	0.4	0.44	0.47	0.4	1.0	0.98	0.21	0.2	0.19	0.04	0.37	0.5	0.4	0.05	0.32	0.26	0.37	0.38	0.39	0.33	0.46	0.53
Ceric.04G062000.1 (Ceric.04G062000)	0.16	0.29	0.63	0.22	0.46	0.34	0.28	0.31	0.94	1.0	0.1	0.17	0.15	0.05	0.37	0.34	0.43	0.05	0.22	0.28	0.36	0.39	0.57	0.26	0.48	0.47
Ceric.05G099400.1 (Ceric.05G099400)	0.14	0.36	0.66	0.21	0.41	0.3	0.37	0.32	0.87	0.82	0.1	0.27	0.23	0.13	0.65	0.3	0.43	0.12	0.28	0.37	1.0	0.51	0.62	0.26	0.56	0.72
Ceric.06G050000.1 (Ceric.06G050000)	0.28	0.55	0.79	0.37	0.67	0.63	0.63	0.41	0.96	1.0	0.35	0.14	0.15	0.04	0.33	0.52	0.67	0.06	0.39	0.36	0.4	0.3	0.27	0.55	0.31	0.43
Ceric.06G055100.1 (Ceric.06G055100)	0.0	0.48	0.48	0.01	0.18	0.3	0.26	0.21	0.64	0.68	0.14	0.08	0.11	0.07	0.39	0.25	0.19	0.14	0.37	0.08	0.38	0.38	0.37	0.13	1.0	0.48
Ceric.06G058700.1 (Ceric.06G058700)	0.32	0.4	0.57	0.27	0.29	0.2	0.19	0.13	0.99	1.0	0.28	0.24	0.26	0.07	0.53	0.22	0.27	0.21	0.21	0.32	0.42	0.38	0.41	0.24	0.47	0.33
Ceric.07G050100.1 (Ceric.07G050100)	0.47	0.61	0.52	0.54	0.5	0.45	0.5	0.32	1.0	0.88	0.38	0.23	0.23	0.08	0.49	0.34	0.5	0.11	0.17	0.42	0.52	0.53	0.47	0.36	0.44	0.41
Ceric.07G067700.1 (NPQ7)	0.28	0.33	0.53	0.1	0.36	0.32	0.27	0.17	0.88	1.0	0.34	0.19	0.23	0.05	0.35	0.21	0.43	0.02	0.1	0.23	0.24	0.36	0.36	0.32	0.29	0.43
Ceric.09G003700.1 (Ceric.09G003700)	0.21	0.32	0.47	0.37	0.56	0.7	0.7	0.68	0.7	0.71	0.2	0.24	0.2	0.09	0.51	0.72	0.56	0.1	0.28	0.34	0.51	0.9	0.68	0.4	1.0	0.86
Ceric.09G004300.1 (OEP16)	0.33	0.64	0.5	0.48	0.6	0.57	0.51	0.48	1.0	0.98	0.57	0.49	0.4	0.19	0.54	0.42	0.59	0.25	0.64	0.63	0.82	0.7	0.45	0.52	0.76	0.74
Ceric.09G083900.1 (Ceric.09G083900)	0.33	0.56	0.77	0.44	0.57	0.51	0.53	0.52	1.0	0.99	0.49	0.35	0.39	0.09	0.55	0.58	0.53	0.1	0.41	0.46	0.58	0.53	0.55	0.44	0.54	0.74
Ceric.10G058300.1 (Ceric.10G058300)	0.31	0.43	0.63	0.5	0.44	0.41	0.45	0.35	0.87	1.0	0.18	0.2	0.16	0.08	0.43	0.28	0.47	0.07	0.3	0.41	0.53	0.41	0.39	0.54	0.48	0.34
Ceric.12G026400.1 (Ceric.12G026400)	0.28	0.65	0.56	0.14	0.47	0.61	0.55	0.45	0.94	1.0	0.34	0.79	0.74	0.15	0.56	0.41	0.47	0.33	0.58	0.5	0.85	0.42	0.54	0.48	0.88	0.6
Ceric.13G062900.1 (Ceric.13G062900)	0.19	0.37	0.92	0.29	0.6	0.33	0.35	0.27	0.94	1.0	0.33	0.34	0.3	0.1	0.46	0.36	0.58	0.16	0.31	0.39	0.73	0.75	0.6	0.45	0.66	0.6
Ceric.14G092900.1 (Ceric.14G092900)	0.26	0.39	0.57	0.16	0.19	0.21	0.22	0.19	0.89	1.0	0.35	0.12	0.12	0.07	0.39	0.25	0.21	0.16	0.29	0.39	0.65	0.28	0.43	0.22	0.36	0.53
Ceric.15G071800.1 (Ceric.15G071800)	0.25	0.37	0.61	0.43	0.6	0.41	0.45	0.3	0.87	1.0	0.18	0.18	0.22	0.05	0.27	0.32	0.57	0.07	0.19	0.27	0.35	0.38	0.36	0.36	0.35	0.34
Ceric.16G012400.1 (SKP5)	0.14	0.35	0.56	0.14	0.27	0.36	0.38	0.16	0.94	1.0	0.42	0.18	0.28	0.07	0.38	0.39	0.3	0.12	0.27	0.33	0.5	0.33	0.53	0.31	0.35	0.52
Ceric.17G014000.1 (PAP16)	0.16	0.22	0.51	0.16	0.41	0.53	0.59	0.48	0.92	1.0	0.26	0.28	0.23	0.05	0.45	0.69	0.42	0.07	0.34	0.3	0.31	0.39	0.5	0.43	0.39	0.4
Ceric.17G019900.1 (AL2)	0.26	0.57	0.65	0.43	0.76	0.75	0.79	0.67	0.99	1.0	0.37	0.29	0.27	0.1	0.62	0.63	0.69	0.2	0.73	0.54	0.7	0.63	0.56	0.59	0.58	0.85
Ceric.17G036300.1 (TGD2)	0.3	0.55	0.7	0.58	0.66	0.63	0.65	0.56	1.0	0.99	0.19	0.25	0.25	0.07	0.4	0.59	0.67	0.14	0.43	0.41	0.52	0.46	0.38	0.46	0.36	0.42
Ceric.19G007300.1 (Ceric.19G007300)	0.19	0.59	0.53	0.41	0.36	0.33	0.35	0.29	0.99	1.0	0.23	0.2	0.17	0.08	0.36	0.37	0.37	0.09	0.42	0.34	0.48	0.28	0.29	0.31	0.35	0.56
Ceric.19G028500.1 (CUM1)	0.29	0.67	0.6	0.47	0.52	0.34	0.31	0.31	0.86	0.86	0.32	0.25	0.24	0.19	0.54	0.4	0.5	0.5	0.51	0.57	0.85	1.0	0.44	0.48	0.73	0.55
Ceric.1Z089800.1 (GLS2)	0.22	0.82	0.68	0.56	0.63	0.17	0.21	0.15	0.95	1.0	0.57	0.17	0.17	0.06	0.44	0.29	0.58	0.1	0.2	0.24	0.24	0.6	0.36	0.57	0.66	0.41
Ceric.1Z142500.1 (Ceric.1Z142500)	0.3	0.63	0.64	0.92	0.69	0.37	0.32	0.25	1.0	0.85	0.35	0.22	0.15	0.14	0.36	0.36	0.7	0.13	0.2	0.42	0.27	0.88	0.41	0.59	0.65	0.51
Ceric.1Z323800.1 (SIZ1)	0.11	0.32	0.43	0.02	0.29	0.32	0.23	0.22	1.0	0.94	0.17	0.29	0.33	0.03	0.45	0.3	0.29	0.11	0.34	0.15	0.46	0.41	0.28	0.32	0.32	0.37
Ceric.20G052500.1 (Ceric.20G052500)	0.23	0.39	0.66	0.27	0.47	0.33	0.34	0.39	0.91	1.0	0.39	0.35	0.44	0.11	0.5	0.4	0.54	0.12	0.32	0.51	0.57	0.75	0.44	0.51	0.42	0.48
Ceric.20G078600.1 (HINT4)	0.32	0.46	0.66	0.38	0.6	0.54	0.59	0.63	1.0	0.87	0.45	0.32	0.3	0.09	0.45	0.52	0.59	0.22	0.57	0.43	0.48	0.33	0.24	0.58	0.49	0.4
Ceric.21G034700.1 (Ceric.21G034700)	0.1	0.49	0.5	0.1	0.24	0.28	0.27	0.37	0.95	0.93	0.42	0.26	0.27	0.12	0.55	0.43	0.25	0.37	0.73	0.6	1.0	0.53	0.33	0.3	0.58	0.87
Ceric.21G072000.1 (Ceric.21G072000)	0.2	0.32	0.62	0.44	0.48	0.5	0.6	0.48	0.84	0.86	0.3	0.26	0.3	0.09	0.4	0.56	0.49	0.32	0.41	0.53	0.68	1.0	0.5	0.54	0.65	0.45
Ceric.23G022800.1 (Ceric.23G022800)	0.5	0.63	0.49	1.0	0.59	0.59	0.63	0.42	0.91	0.93	0.42	0.28	0.34	0.07	0.48	0.48	0.55	0.12	0.42	0.48	0.74	0.45	0.5	0.5	0.47	0.62
Ceric.26G050700.1 (Ceric.26G050700)	0.23	0.47	0.69	0.34	0.52	0.53	0.48	0.46	0.99	1.0	0.43	0.33	0.34	0.11	0.52	0.52	0.5	0.12	0.45	0.51	0.63	0.53	0.57	0.48	0.5	0.61
Ceric.27G033000.1 (hda14)	0.2	0.6	0.6	0.43	0.69	0.41	0.42	0.35	0.97	1.0	0.27	0.19	0.19	0.07	0.4	0.45	0.68	0.1	0.35	0.35	0.44	0.42	0.38	0.46	0.51	0.44
Ceric.28G012800.1 (Ceric.28G012800)	0.29	0.55	0.64	0.5	0.57	0.62	0.59	0.47	0.93	1.0	0.26	0.16	0.12	0.06	0.4	0.77	0.51	0.1	0.35	0.27	0.32	0.47	0.42	0.41	0.51	0.44
Ceric.31G016200.1 (Ceric.31G016200)	0.21	0.64	0.64	0.49	0.49	0.4	0.39	0.3	0.99	1.0	0.22	0.33	0.33	0.09	0.45	0.48	0.48	0.2	0.36	0.4	0.61	0.47	0.59	0.36	0.57	0.6
Ceric.31G032100.1 (SAR2)	0.31	0.44	0.54	0.36	0.48	0.39	0.38	0.32	0.95	1.0	0.37	0.37	0.25	0.08	0.59	0.33	0.41	0.18	0.45	0.43	0.72	0.83	0.45	0.42	0.64	0.59
Ceric.31G034800.1 (Ceric.31G034800)	0.23	0.37	0.42	0.23	0.6	0.34	0.38	0.33	1.0	0.95	0.4	0.36	0.27	0.07	0.48	0.42	0.61	0.16	0.33	0.49	0.46	0.54	0.37	0.58	0.35	0.37
Ceric.31G062300.1 (Ceric.31G062300)	0.09	0.3	0.57	0.19	0.55	0.46	0.46	0.4	1.0	0.94	0.29	0.19	0.16	0.06	0.34	0.54	0.55	0.05	0.31	0.3	0.26	0.29	0.32	0.44	0.32	0.53
Ceric.32G067200.1 (PYL9)	0.39	0.48	0.29	0.44	0.37	0.19	0.2	0.22	0.96	1.0	0.35	0.31	0.36	0.08	0.44	0.34	0.36	0.18	0.28	0.35	0.53	0.5	0.26	0.35	0.55	0.37
Ceric.34G043800.1 (Ceric.34G043800)	0.14	0.42	0.64	0.18	0.62	0.46	0.5	0.43	1.0	0.98	0.29	0.4	0.35	0.1	0.46	0.54	0.62	0.13	0.41	0.43	0.52	0.46	0.48	0.34	0.55	0.55
Ceric.35G007900.1 (Ceric.35G007900)	0.33	0.83	0.61	0.39	0.63	0.47	0.41	0.33	1.0	0.97	0.35	0.46	0.48	0.15	0.5	0.36	0.54	0.22	0.42	0.52	0.85	0.64	0.53	0.38	0.53	0.64
Ceric.35G010100.1 (Ceric.35G010100)	0.09	0.48	0.93	0.14	0.43	0.39	0.36	0.4	0.82	0.9	0.34	0.4	0.41	0.14	0.73	0.53	0.4	0.19	0.61	0.39	1.0	0.58	0.51	0.4	0.38	0.88
Ceric.35G032000.1 (Ceric.35G032000)	0.28	0.32	0.41	0.29	0.45	0.46	0.54	0.51	0.95	1.0	0.32	0.12	0.13	0.06	0.38	0.68	0.46	0.08	0.18	0.3	0.34	0.43	0.51	0.37	0.46	0.56
Ceric.36G034700.1 (Ceric.36G034700)	0.09	0.4	0.45	0.11	0.25	0.11	0.11	0.09	0.83	1.0	0.32	0.57	0.59	0.16	0.52	0.18	0.27	0.12	0.22	0.26	0.57	0.44	0.3	0.26	0.69	0.36
Ceric.37G006500.1 (Ceric.37G006500)	0.23	0.53	0.68	0.48	0.97	0.34	0.43	0.31	0.99	1.0	0.46	0.29	0.29	0.14	0.53	0.31	0.96	0.13	0.3	0.5	0.4	0.47	0.38	0.6	0.36	0.56
Ceric.37G036200.1 (Ceric.37G036200)	0.2	0.45	0.56	0.13	0.36	0.25	0.23	0.24	1.0	0.89	0.33	0.13	0.17	0.07	0.5	0.31	0.34	0.11	0.41	0.35	0.69	0.45	0.41	0.33	0.55	0.45
Ceric.37G044900.1 (Ceric.37G044900)	0.14	0.2	0.37	0.32	0.46	0.13	0.17	0.3	1.0	0.9	0.36	0.26	0.25	0.01	0.44	0.09	0.38	0.02	0.16	0.28	0.27	0.36	0.24	0.25	0.22	0.39
Ceric.39G015400.1 (ABP)	0.31	0.57	0.94	0.19	0.35	0.39	0.33	0.3	0.85	0.87	0.56	0.48	0.48	0.17	0.68	0.46	0.36	0.19	0.47	0.61	0.97	1.0	0.62	0.4	0.78	0.78
Ceric.39G059900.1 (Ceric.39G059900)	0.25	0.4	0.7	0.32	0.53	0.47	0.45	0.41	0.93	1.0	0.29	0.22	0.23	0.1	0.49	0.73	0.56	0.16	0.38	0.38	0.42	0.38	0.54	0.47	0.5	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)