Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Image
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.09 0.1 0.24 0.12 0.1 0.14 0.1 0.17 0.13 0.23 0.29 0.1 0.13 0.05 0.15 0.08 0.08 0.1 0.04 0.23 0.18 1.0 0.86 0.25 0.26
0.02 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 1.0 0.27 0.21 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.04 0.02 0.01 0.13 0.01 1.0 0.31 0.03 0.15
0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.02 0.03 0.05 0.07 0.02 1.0 0.19 0.03 0.08
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.14 0.14 1.0 0.37 0.04 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.14 0.06 1.0 0.0 0.2 0.16
0.12 0.33 0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.16 0.16 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.13 0.19 0.16 0.24 0.25 0.19 0.16 0.17 0.2 0.19 0.14 0.05 0.17 0.23 0.25 0.17 0.52 0.46 0.15 0.32 0.18 1.0 0.22 0.12 0.24
0.05 0.08 0.1 0.1 0.11 0.06 0.08 0.11 0.08 0.13 0.09 0.08 0.05 0.11 0.1 0.13 0.08 0.39 0.29 0.11 0.35 0.08 1.0 0.12 0.07 0.13
0.19 0.21 0.18 0.17 0.2 0.15 0.28 0.27 0.36 0.46 0.49 0.48 0.21 0.19 0.24 0.26 0.18 0.37 0.31 0.23 0.2 0.46 1.0 0.46 0.32 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.04 0.05 0.15 0.23 0.17 0.18 0.2 0.24 0.05 0.2 0.05 0.04 0.12 0.24 0.16 0.1 0.15 0.36 0.19 0.26 0.08 1.0 0.09 0.3 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.24 0.01
0.25 0.14 0.11 0.23 0.12 0.17 0.15 0.15 0.14 0.19 0.27 0.25 0.15 0.06 0.08 0.02 0.08 0.1 0.12 0.04 0.08 0.57 1.0 0.29 0.09 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.03 0.06 0.02 0.02 0.06 0.16 0.05 0.08 0.06 0.02 0.02 0.03 0.04 0.08 0.12 0.04 0.09 0.15 0.07 0.39 0.17 1.0 0.15 0.36 0.23
0.23 0.16 0.09 0.26 0.22 0.2 0.19 0.18 0.29 0.14 0.25 0.2 0.18 0.12 0.19 0.18 0.15 0.32 0.19 0.11 0.33 0.32 1.0 0.54 0.29 0.25
0.0 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.01 0.03 0.09 0.03 0.08 0.06 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.1 0.08 0.11 0.03 1.0 0.98 0.66 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0
0.07 0.04 0.0 0.04 0.21 0.03 0.04 0.07 0.0 0.0 0.3 0.28 0.18 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.12 0.0 1.0 0.03 0.27 0.22
0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.11 0.06 0.07 0.1 0.1 0.04 0.04 0.16 0.11 0.3 0.02 0.38 0.32 0.15 0.6 0.22 1.0 0.08 0.11 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.24 0.14 0.0 0.62 0.0 0.27 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.3 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.18 0.18 0.19 0.26 0.19 0.22 0.17 0.18 0.26 0.19 0.14 0.09 0.3 0.24 0.24 0.22 0.47 0.29 0.21 0.62 0.44 1.0 0.28 0.23 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.07 0.05 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.3 0.13 0.26 0.46 0.0 1.0 0.2 0.08 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.07 0.08 0.11 0.1 0.22 0.22 0.16 0.24 0.36 0.3 0.28 0.18 0.22 0.31 0.2 0.1 0.33 0.22 0.23 0.12 0.19 1.0 0.35 0.1 0.41
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.08
0.12 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.14 0.0 0.62 0.0 1.0 0.0 0.05 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.00.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.25 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.1 1.0 0.7 0.35 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 1.0 0.78 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.15 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)