Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
3.35 1.63 1.82 4.18 2.12 1.76 2.55 1.75 2.98 2.37 4.1 5.06 1.74 2.34 0.94 2.57 1.34 1.48 1.73 0.78 4.11 3.2 17.61 15.09 4.37 4.49
0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.72 0.2 0.15 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.1 0.04 0.02 0.58 0.29 0.14 0.11 1.05 0.12 8.05 2.49 0.25 1.2
0.14 0.05 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.22 0.05 0.0 0.07 0.04 0.0 0.82 0.14 0.21 0.35 0.56 0.15 7.61 1.42 0.19 0.58
0.02 0.0 0.08 0.0 0.07 0.33 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.14 0.0 0.03 0.02 0.02 0.31 0.18 0.02 0.02 1.15 1.16 8.44 3.12 0.35 1.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.02 0.28 0.0 0.05 0.04
0.07 0.18 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
2.49 3.6 5.04 4.21 6.59 6.63 5.01 4.35 4.55 5.42 5.1 3.85 1.23 4.71 6.25 6.8 4.68 14.16 12.34 4.1 8.63 4.83 26.99 5.89 3.37 6.43
0.88 1.35 1.63 1.63 1.92 1.08 1.38 1.81 1.37 2.21 1.48 1.4 0.8 1.81 1.68 2.13 1.41 6.63 4.8 1.9 5.97 1.32 16.82 1.98 1.21 2.11
0.63 0.7 0.6 0.58 0.67 0.5 0.93 0.9 1.2 1.55 1.65 1.61 0.71 0.64 0.81 0.87 0.61 1.23 1.03 0.78 0.68 1.53 3.35 1.54 1.09 1.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.12 0.13 0.41 0.61 0.45 0.47 0.54 0.63 0.12 0.53 0.14 0.12 0.33 0.64 0.43 0.26 0.38 0.94 0.5 0.68 0.21 2.63 0.24 0.79 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.46 4.05 0.0 0.96 0.04
1.09 0.62 0.48 1.03 0.54 0.75 0.64 0.67 0.62 0.84 1.17 1.1 0.67 0.28 0.33 0.08 0.35 0.44 0.52 0.17 0.36 2.5 4.38 1.26 0.4 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.86 0.28 0.48 0.16 0.13 0.47 1.3 0.36 0.62 0.46 0.19 0.16 0.28 0.28 0.65 0.94 0.28 0.7 1.22 0.54 3.1 1.35 8.01 1.21 2.91 1.86
0.74 0.53 0.3 0.84 0.7 0.65 0.63 0.57 0.94 0.46 0.79 0.65 0.59 0.38 0.62 0.58 0.48 1.02 0.61 0.37 1.07 1.02 3.23 1.76 0.94 0.81
0.02 0.0 0.19 0.27 0.1 0.03 0.06 0.14 0.43 0.14 0.41 0.3 0.05 0.0 0.08 0.0 0.07 0.21 0.51 0.4 0.56 0.15 5.1 4.99 3.37 3.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0
0.08 0.05 0.0 0.05 0.25 0.04 0.04 0.08 0.0 0.0 0.36 0.33 0.22 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.14 0.0 1.19 0.04 0.32 0.27
0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.14 0.08 0.09 0.12 0.13 0.05 0.05 0.2 0.14 0.37 0.03 0.48 0.4 0.19 0.76 0.27 1.26 0.1 0.14 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.11 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.84 3.22 3.29 3.37 4.81 3.38 3.97 3.17 3.19 4.65 3.51 2.61 1.64 5.45 4.31 4.37 4.07 8.55 5.22 3.8 11.2 7.93 18.2 5.16 4.11 7.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.1 0.04 0.09 0.16 0.0 0.34 0.07 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.82 0.36 0.42 0.59 0.55 1.18 1.19 0.86 1.29 1.89 1.59 1.5 0.94 1.15 1.65 1.04 0.53 1.74 1.17 1.21 0.66 1.01 5.31 1.88 0.53 2.19
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.07
0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.36 0.0 0.57 0.0 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.95 0.24 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.05 0.48 0.33 0.17 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.18 0.0 0.03 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)