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Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.57 0.47 0.27 0.55 0.32 0.01 0.19 0.4 0.07 -0.3 -0.36 -0.35 0.26 -0.75 -0.8 -0.82 -0.69 0.07 -0.26 -0.1 -3.17 0.46 -1.67 -0.78 1.01 0.64
-0.09 0.14 0.26 0.45 0.41 -0.17 0.09 -0.08 -0.19 -0.4 -0.66 -0.74 -0.45 -0.76 -0.65 -0.48 -0.39 0.09 -0.62 0.07 -1.04 0.71 0.37 0.05 1.0 0.71
-0.41 0.11 0.46 0.54 0.23 -0.27 0.02 -0.12 -0.61 -0.54 -0.43 -0.89 -0.98 -0.91 -0.51 -0.5 -0.4 0.16 -0.2 0.0 -2.19 1.2 -0.59 -0.23 1.19 1.18
0.49 0.48 0.37 0.34 0.62 0.12 -0.24 -0.13 -0.43 -0.7 -0.52 -0.42 0.18 0.36 0.12 -0.05 0.09 -0.42 -0.44 -0.32 -5.07 -0.33 -0.4 -0.49 0.92 0.53
0.28 0.36 0.41 0.21 0.01 -0.12 -0.22 0.03 -0.06 -0.24 -0.02 -0.05 -0.05 -0.36 -0.4 -0.17 -0.22 -0.08 -0.18 0.3 -0.62 0.31 -0.63 0.04 0.32 0.4
0.31 0.3 0.4 0.32 0.09 0.04 -0.0 0.21 0.24 -0.13 -0.06 0.03 0.13 -0.38 -0.49 -0.06 -0.36 -0.07 -0.21 0.21 -1.42 0.4 -0.79 -0.15 0.06 0.18
0.46 0.22 0.34 0.56 0.28 -0.21 -0.19 0.28 0.03 -0.55 -0.26 -0.36 0.14 -0.79 -0.92 -0.69 -0.78 -0.34 -0.79 -0.21 -0.26 0.56 -0.14 -0.28 0.94 0.7
0.47 0.46 0.58 0.67 0.4 0.09 0.09 0.44 0.14 -0.36 -0.2 -0.16 0.39 -0.96 -0.82 -1.03 -0.86 -0.5 -0.95 -0.37 -0.77 0.6 -0.6 -0.8 0.61 0.49
0.52 0.55 0.57 0.61 0.23 -0.19 0.07 0.44 0.18 -0.39 -0.32 -0.16 0.3 -0.92 -0.89 -0.66 -0.67 -0.1 -0.59 -0.05 -1.35 0.56 -1.11 -0.27 0.61 0.33
0.37 0.63 0.26 0.35 0.18 0.07 0.35 0.5 0.03 -0.57 -0.75 -1.15 -0.09 -0.99 -0.92 -1.01 -0.4 0.3 -0.02 0.06 -3.28 0.74 -0.7 -1.01 1.21 0.47
0.56 0.57 0.64 0.55 0.37 0.24 0.1 0.3 -0.24 -1.04 -1.44 -1.45 0.53 -1.12 -0.6 -0.82 -0.36 -0.0 -0.23 -0.26 -2.1 -0.79 -0.45 -1.13 1.64 0.54
0.44 0.64 0.67 0.71 0.45 -0.01 -0.02 0.37 0.23 -0.48 -0.29 -0.07 0.38 -1.22 -1.14 -0.85 -0.74 -0.37 -0.7 -0.12 -1.34 0.48 -0.91 -0.34 0.61 0.34
0.15 0.56 0.44 0.67 0.59 0.37 -0.02 -0.23 -0.3 -0.6 -0.54 -0.55 -0.09 -0.42 -0.56 0.45 -0.59 0.29 -0.09 -0.38 -2.85 0.86 -1.2 -0.74 0.74 0.02
0.33 0.85 0.88 0.86 0.55 0.24 0.2 0.44 -0.02 -1.33 -1.44 -1.37 0.3 -1.22 -1.0 -0.91 -0.49 -0.12 -0.33 -0.09 -3.27 -0.87 -1.23 -2.29 1.69 0.5
0.69 0.55 0.55 0.4 0.14 0.08 -0.08 -0.01 -0.51 -0.57 -0.58 -0.48 0.35 0.04 -0.5 0.41 -0.28 -0.09 -0.47 -0.09 -2.16 0.02 -0.95 -0.67 0.67 0.63
0.16 0.49 0.57 0.71 0.27 -0.09 -0.3 0.06 -0.32 -0.71 -0.74 -0.66 -0.03 -1.26 -0.93 -1.15 -0.89 0.65 -0.09 0.02 -0.55 0.26 0.19 -0.28 0.83 0.71
0.56 0.84 0.98 0.77 0.23 -0.38 -0.3 0.09 -0.49 -1.19 -0.97 -0.89 0.42 -0.56 -0.36 -0.57 -0.21 0.03 0.04 0.05 -4.86 -1.36 -1.45 -1.26 1.42 0.8
0.45 0.67 0.44 0.42 -0.01 -0.52 -0.28 0.08 -0.21 -0.72 -0.49 -0.44 0.24 -0.33 -0.27 -0.15 0.09 -0.09 -0.06 -0.16 -4.47 0.36 -1.02 -0.47 1.29 0.37
0.34 0.41 0.23 0.25 0.63 0.47 0.7 0.72 0.03 -0.3 -0.48 -0.35 0.5 -0.47 -0.95 -0.73 -0.71 -0.33 -0.61 -0.68 -7.99 -0.81 -2.9 -2.73 1.89 -0.01
-1.37 0.69 0.8 0.76 0.69 0.32 -0.28 -0.54 -0.72 -0.64 -0.48 -0.81 -2.28 -0.03 0.0 -0.23 0.11 0.49 0.12 -0.05 -3.88 0.78 -0.51 0.04 0.48 0.24
0.48 0.57 0.52 0.44 -0.25 -0.81 -0.27 0.08 -0.23 -1.18 -1.05 -0.64 -0.11 -0.39 -0.55 -0.55 -0.25 -0.06 -0.21 -0.01 -2.62 0.86 -0.48 -0.49 1.39 0.9
0.27 0.27 0.39 0.35 0.23 -0.15 -0.14 0.11 -0.31 -0.6 -0.68 -0.69 0.09 -0.86 -0.63 -0.53 -0.41 0.42 -0.14 0.03 -0.5 0.7 -0.96 -0.59 1.06 0.72
-0.5 0.05 0.38 0.22 -0.08 -0.24 -0.16 -0.23 -0.39 -0.33 -0.22 -0.18 -0.11 -0.33 -0.53 0.08 -0.02 -0.11 0.06 0.17 -2.27 0.83 -0.83 -0.34 1.16 0.88
0.48 0.64 0.58 0.65 0.4 0.02 0.04 0.37 0.2 -0.42 -0.34 -0.22 0.32 -0.78 -0.77 -0.81 -0.63 -0.24 -0.51 -0.01 -0.43 0.28 -1.23 -0.67 0.41 0.36
0.71 0.77 0.94 0.7 0.45 0.05 -0.26 -0.04 -1.11 -0.84 -0.77 -0.54 0.72 -0.32 -0.8 -0.52 0.09 -0.58 -0.65 -0.13 -5.14 0.07 -1.83 -1.34 1.27 0.53
0.15 0.47 0.48 0.27 0.04 -0.12 0.0 0.1 0.09 -0.3 -0.48 -0.54 -0.11 -0.29 -0.13 -0.14 -0.01 -0.06 -0.09 0.46 -0.47 0.53 -1.04 -0.51 0.3 0.25
0.37 0.35 0.39 0.4 0.31 0.05 -0.04 0.26 -0.14 -0.43 -0.42 -0.38 0.12 -0.61 -0.11 -0.53 -0.7 0.28 -0.08 -0.16 -0.99 -0.08 -0.62 -0.33 0.64 0.76
-0.43 0.59 0.71 0.72 0.26 -0.39 -0.01 0.46 0.12 -0.07 -0.14 -0.35 -0.4 -1.12 -0.55 -0.58 0.16 0.36 0.23 0.19 -7.03 -1.94 -1.08 -1.52 1.45 0.37
0.44 0.54 0.36 0.47 0.28 0.09 -0.0 0.29 0.22 -0.38 -0.19 -0.2 0.33 -0.83 -0.71 -0.65 -0.72 -0.36 -0.39 -0.18 -0.69 0.46 -0.05 -0.4 0.34 0.35
0.42 0.46 0.49 0.44 0.25 -0.04 -0.22 0.1 0.14 -0.53 -0.35 -0.23 0.2 -0.48 -0.41 -0.2 -0.27 -0.02 -0.21 0.2 -0.8 0.48 -1.18 -0.49 0.34 0.37
-0.7 0.25 0.69 0.37 -0.31 -0.5 -0.17 -0.03 -0.85 -0.75 -0.92 -1.14 -1.16 -1.11 -0.91 -1.72 -1.17 -0.38 -0.35 -0.13 -0.72 1.73 0.36 -0.27 1.27 1.42
0.54 0.34 0.44 0.6 0.12 -0.01 0.01 0.25 -0.11 -0.42 -0.36 -0.26 0.43 -0.73 -0.62 -0.69 -0.87 0.1 -0.44 -0.34 -0.16 0.23 -0.25 -0.15 0.28 0.53
0.04 0.25 0.44 0.4 0.4 -0.02 -0.39 -0.1 -0.13 -0.38 -0.32 -0.36 -0.05 -0.73 -0.38 -0.73 -0.31 -0.53 -0.36 0.06 -0.88 0.44 0.67 0.42 0.56 0.36
-0.09 0.48 0.41 0.56 0.3 0.19 -0.09 0.18 0.16 -0.32 -0.52 -0.52 -0.15 -1.07 -0.68 -1.02 -0.84 0.57 -0.34 -0.25 -1.23 0.95 -0.78 -0.63 0.95 0.5
-0.25 0.57 0.44 0.6 0.37 -0.07 -0.09 0.3 -0.11 -0.42 -0.42 -0.66 -0.44 -0.99 -0.96 -0.78 -0.41 0.4 -0.18 -0.2 -2.9 0.07 -1.88 -0.36 1.95 0.09
0.29 0.43 0.59 0.6 0.35 0.21 0.05 0.31 0.14 -0.36 -0.36 -0.34 0.07 -0.87 -0.68 -0.74 -0.65 -0.07 -0.46 -0.03 -0.72 0.48 -0.34 -0.48 0.53 0.24
0.57 0.64 0.74 0.69 0.23 -0.08 -0.47 -0.01 -0.48 -0.8 -0.63 -0.56 -0.03 -0.6 -0.17 -0.99 -0.68 0.07 -0.18 -0.27 -0.8 0.61 -0.63 -0.47 0.77 0.72
0.21 0.43 0.46 0.57 0.37 0.18 0.14 0.3 -0.02 -0.06 -0.12 -0.12 0.07 -0.7 -0.48 -0.49 -0.03 -0.19 -0.32 -0.28 -3.42 0.01 -0.58 -1.38 1.18 0.13
0.22 0.39 0.25 0.36 0.23 0.05 0.02 0.2 0.21 -0.17 -0.14 -0.1 0.1 -0.47 -0.71 -0.01 -0.41 0.08 -0.2 -0.09 -0.53 0.22 -0.44 -0.07 0.26 0.03
-0.22 0.41 0.19 -0.02 0.21 0.02 -0.46 -0.33 -0.29 -0.62 -0.83 -0.71 -0.35 -0.48 -0.31 -0.49 -0.11 0.15 0.04 0.27 -1.11 1.36 -1.23 -0.23 1.11 0.65
-0.15 -0.02 -0.43 0.25 0.4 0.27 0.91 1.07 -0.57 -0.38 -0.31 -0.84 0.18 -0.09 -0.46 -0.13 -0.46 -0.24 -0.58 -0.45 -6.99 -0.83 -3.76 -4.22 2.07 0.34
0.84 1.02 0.64 0.31 0.07 -0.65 -0.15 -0.1 -0.73 -1.05 -0.68 -1.02 0.24 -1.67 -0.96 -1.4 -0.36 0.25 0.16 0.03 -3.16 -0.66 -0.82 -0.75 1.93 0.54
0.22 0.86 0.78 0.94 0.69 0.4 0.15 0.26 -0.33 -0.68 -0.81 -0.66 0.1 -0.98 -1.16 -0.73 -0.51 -0.1 -0.6 -0.45 -6.13 -0.2 -1.91 -2.57 1.8 0.12
1.12 0.85 1.06 0.76 0.43 0.22 -0.2 0.02 -1.03 -1.26 -1.16 -1.21 0.54 -0.9 -0.36 -1.02 -0.33 -0.26 -0.39 -0.07 -5.75 -1.83 -2.04 -0.74 1.36 0.82
0.05 0.31 0.33 0.54 0.5 0.41 0.75 0.71 -0.0 -0.43 -0.78 -0.7 -0.65 -0.49 -0.6 -0.26 -0.33 0.33 0.03 0.08 -6.03 -2.78 -2.13 -2.98 1.61 0.55
0.28 0.35 0.44 0.34 0.1 -0.0 -0.16 0.06 -0.05 -0.61 -0.48 -0.32 -0.04 -0.7 -0.58 -0.44 -0.59 -0.46 -0.67 -0.01 -0.41 0.73 0.52 0.12 0.56 0.4
0.14 0.5 0.58 0.63 0.4 0.24 -0.1 0.08 -0.33 -1.53 -1.75 -1.59 -0.04 -0.7 -0.69 -0.33 -0.61 0.49 0.24 0.06 -4.34 0.06 -3.06 -2.27 1.84 0.93
0.39 0.43 0.45 0.5 0.46 0.25 0.11 0.29 0.22 -0.25 -0.2 -0.39 0.06 -0.77 -0.57 -0.58 -0.64 -0.33 -0.36 -0.07 -0.76 0.05 -0.25 -0.7 0.66 0.31
-0.0 0.51 0.45 0.6 0.52 0.19 -0.12 -0.22 -0.57 -0.86 -1.04 -1.14 -0.16 -0.13 0.17 0.16 -0.08 0.38 -0.2 -0.37 -2.89 1.45 -1.34 -0.96 0.41 0.15
0.49 0.69 0.6 0.21 -0.16 -0.16 0.11 0.33 -0.15 -0.43 -0.59 -0.48 0.12 -0.77 -0.36 -0.68 -0.11 0.29 0.11 -0.0 -2.07 -0.68 -0.99 -1.16 1.4 0.49
0.74 0.76 0.69 0.23 -0.07 -0.55 0.21 0.61 -0.35 -0.31 0.05 0.03 0.18 -0.85 -0.31 -0.89 -0.51 -0.13 0.1 -0.33 -4.42 -3.3 -1.58 -0.66 1.58 0.35
0.68 0.48 0.27 0.12 0.18 0.17 0.07 0.01 -0.5 -0.3 -0.28 -0.14 0.51 -0.06 -0.52 0.74 -0.19 -0.36 -0.57 -0.16 -3.43 -0.66 -0.75 -0.44 0.75 0.52
-0.46 0.65 0.76 0.6 0.06 -0.12 -0.13 0.29 0.09 -0.11 0.03 0.08 -0.47 -2.13 -1.42 -2.26 -1.21 -0.34 -0.59 -0.59 -3.2 0.1 -1.03 0.02 2.09 0.37
-0.09 0.67 0.85 0.4 -0.23 -0.75 -0.23 -0.21 -0.69 -0.75 -0.76 -0.58 -0.43 -0.05 -0.84 -0.71 -0.59 0.13 -0.18 -0.38 -5.5 1.04 -1.5 -0.92 1.5 1.39
0.73 0.49 0.5 0.52 0.19 -0.17 -0.26 0.08 -0.13 -0.67 -0.38 -0.0 0.53 -1.08 -0.86 -0.84 -1.0 -0.37 -0.76 -0.19 -0.21 0.53 -0.07 -0.13 0.4 0.67
-0.45 0.21 0.62 0.55 0.23 -0.03 -0.32 -0.13 0.03 0.04 0.28 -0.73 -0.29 0.23 -0.47 -0.29 -1.16 0.07 -0.12 -0.37 -2.89 0.16 -0.58 -1.06 1.35 0.78
-0.35 0.22 0.4 0.3 0.21 0.12 -0.46 -0.64 -0.19 -0.38 -0.57 -0.44 -1.03 0.09 -0.09 0.22 0.23 -0.01 0.11 0.21 -4.9 0.84 -1.44 -0.69 1.16 0.8
0.05 0.52 0.6 0.83 0.78 0.2 -0.51 -0.7 -1.01 -0.78 -0.79 -0.75 -0.05 -0.53 -0.87 -0.62 0.26 0.18 -0.13 -0.18 -1.61 1.11 -0.55 -0.4 0.81 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.