1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
1.35 -0.37 -1.88 0.25 0.2 0.27 0.43 0.22 0.73 1.36 2.5 1.68 -0.19 - -2.45 -3.96 -3.74 -4.09 -0.8 -2.73 - - -1.82 -1.95 -0.86 -2.44
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 2.66 - - - 2.61 3.76 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.46 - 3.38 - - - - - - - 3.34 - - - - - - -
1.75 - - - - - - - - - 2.62 - - - 2.93 - - - - - - - 2.26 - 1.44 0.48
- - - - - - - - - - 3.8 - - - 3.59 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - 1.18 - - 3.72 0.31 2.91
- - - - - - 3.72 - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.34 - 3.19 - - - - - - - - - 1.13 - 1.11 1.29
-0.53 -0.86 -1.41 0.43 -1.03 -1.15 0.48 1.73 0.35 -0.3 2.03 1.19 -0.93 - - - - - - -2.6 -4.16 -1.98 1.71 0.55 1.29 -0.42
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.07 - - - - 3.24 - - 3.03 - - - - - - -
1.15 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 3.96
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
-4.24 -4.8 - -4.98 -3.05 -5.03 -3.69 -5.05 - -4.98 -4.93 - - 2.66 0.96 0.11 -2.77 -1.08 0.01 1.3 -1.7 -1.5 -1.47 1.23 1.48 2.58
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 4.02 - - 2.47 - - - - - - 2.07 - - - - -
0.33 - - 0.69 0.32 -0.23 0.77 1.24 0.95 1.14 2.42 0.32 -0.93 - - - - - - - -1.8 - 0.39 0.83 1.05 -1.86
-1.12 -2.24 -0.07 0.54 0.43 -0.22 0.85 1.05 1.21 1.58 1.73 0.28 0.36 - - - -1.62 -2.56 - - -0.33 -0.39 -0.03 0.79 -1.46 -0.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - - - - - - - 4.21
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.19 - 1.97 - - 4.13
0.45 0.51 0.13 0.17 -0.27 -2.53 -0.95 0.34 0.0 0.22 0.77 0.84 0.79 -1.83 -4.79 -2.98 -1.65 -1.27 -0.76 -1.45 - 1.12 1.26 1.42 0.04 -1.37
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
1.22 0.65 -0.64 0.37 -0.26 -1.03 0.2 0.62 0.06 0.65 1.31 0.83 1.05 -0.85 -0.68 -2.33 -1.46 -0.09 -0.45 -1.1 -4.27 -1.45 -0.96 -0.96 -0.03 -0.11
0.87 -0.62 -0.92 0.27 0.53 0.04 0.65 0.09 0.65 0.72 1.51 0.84 -0.36 -3.05 -1.59 -3.87 -4.04 -2.02 -1.51 - -1.04 1.05 1.17 0.56 -1.85 -1.75
- - - - - - - - - - 3.02 - - - - - - 3.87 - 1.68 - - - - - -
-0.02 1.86 - - - 0.3 0.49 - - - 0.25 - 0.18 - - - 0.49 - 0.28 0.2 - 1.36 - - 0.94 3.03
0.25 -0.99 -1.87 0.75 -0.82 0.15 -0.05 0.1 0.48 -0.95 1.1 -0.2 -0.7 0.21 1.16 -0.36 -0.66 -1.29 0.41 -2.25 0.59 -0.59 0.65 -1.97 0.46 -0.03
- - 1.97 - 1.67 - - - - - 2.93 - - 1.38 - - - 2.43 - - - 1.71 - - - -
-1.08 - -0.77 - -0.58 - -0.32 1.11 2.04 1.44 3.29 1.32 - - - - - -1.36 - - - - - -0.17 -0.12 -
- - 0.96 - - - -0.35 - - -0.47 - - - - - - -0.39 2.35 - - 1.9 - - - - 3.69
1.41 - 1.34 - - - 0.55 - 0.47 0.26 0.35 0.44 0.74 -0.24 - - - - - - - 0.09 -0.03 - 0.99 2.92
- - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97
- - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18
- - - - - 3.22 - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - 2.81
- 0.28 - - - 0.71 - 0.72 - 1.61 2.98 - - 3.06 0.44 - - - - - -0.24 - - - - -
0.96 0.55 1.24 -0.72 1.42 0.66 0.08 0.28 1.5 1.09 2.23 0.69 -0.57 - - - - - - -0.01 -2.72 - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - 3.52 - - - - - -
0.81 0.18 0.4 0.02 1.41 1.75 -1.39 -1.71 - - 0.95 -1.51 -0.43 -2.19 - -1.71 - -2.19 0.66 -1.68 -1.56 -1.85 -0.04 1.81 0.76 0.7
1.62 - 2.15 - - - - 1.81 - - - - - 1.34 - - - - - - 0.94 - - - 1.31 3.01
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 3.32 - - - - 2.35 - 2.8 - 1.99 - - - - - -
- -2.77 0.91 1.15 -3.12 -2.77 -2.81 0.47 -1.01 1.7 - -0.33 2.37 - - -0.68 0.02 -2.18 -1.02 -3.39 -3.46 - - -0.83 - 2.84
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - 4.35
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - 2.44 - - - - -
0.82 -3.52 -0.39 1.11 -0.2 -0.66 1.37 1.15 -0.05 0.99 0.96 1.24 -0.66 -1.94 -1.6 -2.07 -2.13 -0.92 -3.11 - -1.4 -2.49 -0.3 -1.49 1.26 0.28
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - - 2.37 4.07
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.61 - - - - 3.79 - - - - - - - - - -
0.4 -2.3 -1.77 1.56 0.14 - - 0.64 1.21 -0.21 2.23 0.24 -3.54 -4.02 -2.52 -2.46 - -1.34 -1.99 - -3.11 1.1 0.08 1.07 0.09 0.9
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.51 - - 2.09 4.0
- - - - 1.99 - - - - 3.3 - - - 1.21 - - - - - - 1.36 - - - - 2.88

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.