Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.14 0.05 0.21 0.2 0.21 0.24 0.21 0.29 0.45 1.0 0.57 0.16 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.1 0.03 0.0 0.0 0.05 0.05 0.1 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.36 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.09 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.24
0.17 0.14 0.09 0.33 0.12 0.11 0.34 0.81 0.31 0.2 1.0 0.56 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.06 0.8 0.36 0.6 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.31 0.17 0.02 0.07 0.16 0.39 0.05 0.06 0.06 0.37 0.44 0.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 0.3 0.23 0.16 0.32 0.44 0.36 0.41 1.0 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.24 0.33 0.39 0.05
0.14 0.06 0.29 0.44 0.41 0.26 0.54 0.63 0.7 0.9 1.0 0.37 0.39 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.24 0.23 0.3 0.52 0.11 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.22 0.0 0.0 1.0
0.51 0.53 0.41 0.42 0.31 0.06 0.19 0.47 0.37 0.44 0.64 0.67 0.65 0.11 0.01 0.05 0.12 0.16 0.22 0.14 0.0 0.81 0.89 1.0 0.38 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.95 0.63 0.26 0.52 0.34 0.2 0.46 0.62 0.42 0.63 1.0 0.72 0.83 0.22 0.25 0.08 0.15 0.38 0.3 0.19 0.02 0.15 0.21 0.21 0.4 0.38
0.64 0.23 0.19 0.42 0.51 0.36 0.55 0.37 0.55 0.58 1.0 0.63 0.27 0.04 0.12 0.02 0.02 0.09 0.12 0.0 0.17 0.73 0.79 0.52 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.44 0.0 0.0 0.0 0.15 0.17 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.15 0.14 0.0 0.31 0.0 0.0 0.23 1.0
0.53 0.23 0.12 0.75 0.25 0.5 0.43 0.48 0.62 0.23 0.96 0.39 0.27 0.52 1.0 0.35 0.28 0.18 0.6 0.09 0.68 0.3 0.7 0.11 0.62 0.44
0.0 0.0 0.51 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.08 0.22 0.42 0.28 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.39 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.35 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.18 0.16 0.17 0.18 0.22 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.0 0.26 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.0 0.37 0.95 0.0 0.0 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.31 0.5 0.13 0.57 0.34 0.23 0.26 0.6 0.45 1.0 0.34 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.32 0.38 0.29 0.76 0.96 0.11 0.09 0.0 0.0 0.55 0.1 0.21 0.06 0.0 0.09 0.0 0.06 0.45 0.09 0.1 0.08 0.28 1.0 0.48 0.46
0.38 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.7 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.26 0.31 0.02 0.02 0.02 0.19 0.07 0.46 0.0 0.11 0.72 0.0 0.0 0.09 0.14 0.03 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.03 0.3 0.84 0.34 0.24 1.0 0.86 0.37 0.77 0.76 0.92 0.25 0.1 0.13 0.09 0.09 0.21 0.05 0.0 0.15 0.07 0.31 0.14 0.93 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.04 0.06 0.63 0.23 0.0 0.0 0.33 0.49 0.18 1.0 0.25 0.02 0.01 0.04 0.04 0.0 0.08 0.05 0.0 0.02 0.45 0.22 0.45 0.23 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.27 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)