Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.93 0.78 1.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.05 0.01 0.88 0.02 1.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.31 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.18 0.16 0.25 0.07 0.59 0.35 1.0 0.13 0.02 0.1 0.08 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.2 0.12 0.31 0.08 0.93 0.3 1.0 0.07 0.05 0.02 0.07 0.03 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.19 0.13 0.33 0.08 0.69 0.31 1.0 0.05 0.06 0.01 0.06 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.18 0.13 0.25 0.07 0.61 0.34 1.0 0.04 0.02 0.02 0.04 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.16 0.14 0.23 0.07 0.56 0.41 1.0 0.05 0.02 0.02 0.04 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 1.0 0.46 0.8 0.17 0.03 0.03 0.14 0.33 0.22
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.07 0.27 0.25 0.25 0.06 1.0 0.2 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.04 0.05 0.08 0.0 0.02 0.11 0.03 0.09 1.0 0.23 0.43 0.11 0.0 0.6 0.19 0.0 0.04
0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.06 0.02 0.05 0.08 0.05 0.03 0.02 0.08 0.05 0.07 1.0 0.32 0.57 0.27 0.04 0.66 0.46 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.09 0.09 0.1 0.2 0.12 0.05 0.03 0.13 0.12 0.21 0.12 0.05 0.02 0.01 0.66 0.05 1.0 0.37 1.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02
0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.88 1.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.14 0.0 0.13 1.0 0.01 0.07 0.32 0.01 0.34 0.07 0.03 0.07
0.0 0.0 0.09 0.12 0.12 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 1.0 0.08 0.06 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
0.15 0.33 0.3 0.33 0.3 0.38 0.56 0.68 0.62 0.67 0.54 0.48 0.16 0.24 0.45 0.28 0.85 0.9 0.84 0.77 0.27 0.35 0.38 0.52 1.0 0.82
0.06 0.04 0.04 0.06 0.1 0.13 0.14 0.11 0.09 0.17 0.16 0.14 0.08 0.62 0.16 0.25 0.61 0.36 0.37 1.0 0.09 0.05 0.16 0.25 0.17 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.33 0.62 0.04 0.01 0.93 0.95 1.0 0.05 0.0 0.04 0.2 0.02 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.11 0.24 0.23 0.15 1.0 0.05 0.04 0.01 0.18 0.05 0.05
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.67 0.0 0.31 0.23 0.37 0.15 1.0 0.13 0.0 0.0 0.22 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.04 0.06 0.04 0.05 0.06 0.15 0.27 0.26 0.36 0.32 0.19 0.12 0.07 0.3 0.04 0.68 0.74 1.0 0.64 0.01 0.11 0.2 0.17 0.71 0.47
0.16 0.04 0.23 0.05 0.02 0.07 0.23 0.53 0.35 0.55 0.59 0.35 0.24 0.05 0.46 0.05 1.0 0.78 0.79 0.71 0.0 0.11 0.25 0.4 1.0 0.51
0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.17 0.26 0.23 0.22 0.22 0.19 0.09 0.1 0.42 0.02 0.86 0.64 1.0 0.7 0.0 0.11 0.2 0.23 0.72 0.62
0.2 0.08 0.19 0.37 0.49 0.53 0.74 0.65 0.47 0.68 0.58 0.4 0.15 0.37 0.28 0.11 0.8 0.78 1.0 0.78 0.03 0.39 0.12 0.65 0.66 0.7
0.09 0.1 0.16 0.1 0.07 0.06 0.09 0.14 0.1 0.27 0.18 0.17 0.11 0.34 0.27 0.11 0.14 1.0 0.17 0.57 0.02 0.12 0.29 0.2 0.63 0.3
0.11 0.07 0.08 0.08 0.13 0.07 0.11 0.09 0.11 0.16 0.19 0.16 0.11 0.19 0.22 0.02 0.12 1.0 0.18 0.89 0.04 0.08 0.44 0.67 0.82 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.33 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.47 0.0 0.2 0.21 0.53 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.1 0.32 0.34 0.14 0.07 0.1 0.19 0.06 0.07 0.05 0.05 0.07 0.12 0.16 0.12 0.09 0.56 0.19 1.0 0.05 0.18 0.01 0.24 0.3 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85 0.0 0.0 0.36 0.37 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.02 0.05 0.06 0.09 0.07 0.04 0.03 0.09 0.06 0.07 0.01 0.07 0.02 0.02 0.02 0.23 0.03 1.0 0.08 0.03 0.51 0.26 0.18 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.39 0.1 0.0 0.45 0.08 0.07 1.0 0.07 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.15 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)