1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.22 0.05 3.75 0.1 4.24 0.15 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.0 8.47 0.34 27.26 0.0 0.0 0.06 0.07 0.03 0.24
0.72 0.44 0.22 0.35 0.38 0.56 1.27 0.4 1.63 4.63 3.66 2.52 0.44 34.38 30.71 49.14 13.91 115.6 68.33 194.38 25.86 4.18 18.74 16.01 8.56 9.38
0.19 0.14 0.02 0.42 0.05 0.02 0.27 0.06 0.52 0.89 0.58 0.37 0.0 8.62 5.4 13.4 3.56 40.37 13.14 43.34 3.07 2.35 0.99 3.11 1.48 2.19
0.25 0.02 0.14 0.23 0.06 0.03 0.06 0.08 0.24 0.84 0.4 0.0 0.0 9.95 6.83 17.4 4.33 36.71 16.71 53.42 2.75 3.08 0.7 3.2 3.89 2.62
0.44 0.2 0.44 0.51 0.3 0.25 0.56 0.35 1.0 3.23 1.62 1.0 0.18 27.07 20.25 38.28 10.67 93.96 51.43 153.43 5.84 3.39 3.46 5.82 2.09 5.8
0.62 0.42 0.44 0.35 1.24 1.15 1.22 0.34 1.15 2.81 1.17 0.67 0.11 23.96 20.66 34.24 9.98 82.94 60.7 148.07 7.04 2.93 2.69 6.19 7.98 9.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.15 1.06 0.49 0.85 0.18 0.03 0.03 0.15 0.35 0.23
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.08 0.3 0.28 0.28 0.07 1.11 0.23 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.04 0.03 0.02 0.02 0.0 0.04 0.06 0.04 0.0 0.04 0.06 0.09 0.0 0.02 0.13 0.04 0.11 1.21 0.27 0.51 0.14 0.0 0.73 0.23 0.0 0.05
0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.1 0.04 0.08 0.15 0.09 0.06 0.04 0.14 0.08 0.14 1.83 0.58 1.04 0.5 0.07 1.21 0.84 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.13 0.13 0.13 0.27 0.16 0.07 0.04 0.18 0.17 0.3 0.16 0.07 0.03 0.02 0.91 0.08 1.4 0.52 1.39 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.45 0.51 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.18 0.0 0.17 1.27 0.02 0.09 0.4 0.02 0.43 0.09 0.04 0.09
0.0 0.0 0.09 0.13 0.13 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05 1.1 0.08 0.07 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
3.84 8.65 8.02 8.8 7.94 9.99 14.64 18.01 16.31 17.71 14.28 12.73 4.2 6.35 11.76 7.28 22.42 23.68 22.22 20.23 7.1 9.32 10.08 13.76 26.38 21.58
7.96 4.6 5.56 7.46 12.86 16.53 17.48 14.19 11.75 21.34 20.92 17.25 9.68 78.91 20.57 31.27 77.45 45.39 47.01 126.85 11.13 6.61 20.24 32.0 21.29 18.5
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 1.21 2.25 0.13 0.05 3.38 3.45 3.65 0.18 0.0 0.15 0.73 0.07 0.33
0.14 0.29 0.31 0.07 0.59 0.31 0.44 0.08 0.04 0.18 0.49 0.19 0.15 27.24 7.36 11.4 24.81 23.24 15.37 101.47 5.26 4.24 0.97 18.21 4.63 5.03
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.89 0.0 0.41 0.3 0.49 0.2 1.32 0.17 0.0 0.0 0.3 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.12 0.6 0.85 0.66 0.79 0.85 2.28 4.08 3.9 5.47 4.8 2.85 1.84 1.11 4.51 0.59 10.29 11.11 15.08 9.62 0.08 1.72 3.01 2.59 10.65 7.1
0.68 0.19 1.0 0.22 0.09 0.29 0.98 2.27 1.5 2.38 2.55 1.52 1.03 0.22 1.98 0.2 4.33 3.39 3.4 3.09 0.0 0.46 1.07 1.75 4.33 2.2
0.11 0.15 0.15 0.09 0.21 0.21 0.83 1.26 1.15 1.07 1.1 0.91 0.43 0.5 2.05 0.1 4.23 3.14 4.9 3.44 0.0 0.54 0.96 1.14 3.53 3.02
1.51 0.65 1.5 2.85 3.79 4.06 5.76 4.99 3.63 5.29 4.46 3.06 1.15 2.89 2.15 0.87 6.16 6.0 7.73 6.06 0.19 2.99 0.91 5.04 5.13 5.39
0.21 0.25 0.38 0.24 0.16 0.14 0.21 0.35 0.25 0.65 0.43 0.4 0.26 0.82 0.65 0.28 0.34 2.4 0.4 1.36 0.05 0.28 0.69 0.47 1.5 0.72
0.23 0.14 0.16 0.16 0.26 0.14 0.23 0.18 0.23 0.33 0.39 0.33 0.22 0.39 0.45 0.05 0.24 2.04 0.37 1.83 0.09 0.17 0.89 1.37 1.68 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.35 3.51 11.02 11.62 4.89 2.26 3.47 6.57 2.14 2.22 1.8 1.65 2.45 4.17 5.46 4.03 3.19 19.03 6.51 34.04 1.58 6.11 0.46 8.28 10.04 13.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.18 0.16 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0
0.02 0.15 0.16 0.5 0.6 0.95 0.67 0.44 0.33 0.91 0.6 0.7 0.11 0.71 0.16 0.23 0.24 2.32 0.34 10.1 0.77 0.27 5.11 2.61 1.78 3.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.08 0.02 0.0 0.09 0.02 0.01 0.2 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.3 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)