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Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.99 0.81 0.73 0.5 -0.2 -0.26 0.27 0.87 0.52 0.53 0.38 0.24 0.51 -2.01 -0.86 -1.95 -0.44 0.16 0.12 0.37 -7.86 -3.05 -2.48 -1.48 -0.11 -0.37
1.02 0.27 -0.31 -0.83 -0.94 -0.27 0.55 0.75 0.94 1.18 0.81 0.59 0.27 -1.26 -1.64 -2.26 -0.36 0.51 0.08 0.35 - -3.74 -0.92 -0.39 -0.4 -0.65
-0.49 -1.2 -1.53 -1.3 -0.09 0.66 0.89 0.58 0.7 0.55 0.04 -0.45 -0.61 -0.5 -0.16 -0.71 0.31 0.98 0.9 0.52 -2.84 -1.4 0.03 -0.53 -0.11 -0.22
0.58 0.53 -1.13 -1.19 -0.4 0.23 0.85 0.86 0.74 0.51 0.21 -0.12 0.41 -0.31 -0.2 -0.84 0.29 0.32 0.17 0.26 -5.83 -0.69 -1.89 -0.88 0.23 -1.03
-1.16 -1.52 -0.75 -0.48 0.11 0.49 0.75 0.69 0.64 0.85 0.53 0.12 -1.05 1.08 -1.3 -0.05 -0.19 0.2 0.12 0.62 -5.89 -1.16 -0.94 -0.3 0.12 -0.46
0.71 -0.0 -0.53 0.31 0.6 0.08 0.52 0.47 0.42 0.46 0.45 0.06 -0.3 -0.27 -0.54 -0.68 -0.83 0.61 -0.12 -1.71 -6.86 -2.91 -0.31 -0.2 1.0 -0.27
1.12 0.52 -0.23 -0.48 0.09 0.46 0.76 0.72 0.32 0.22 -0.21 -0.63 0.83 -0.94 -0.07 -0.97 0.16 0.63 0.54 0.4 -4.49 -1.56 -2.0 -1.29 -0.88 -1.61
1.33 -1.01 -3.27 -3.06 -1.26 0.21 1.44 1.39 1.03 0.85 0.41 -0.51 0.86 -2.95 -2.53 -4.63 -1.03 0.53 0.26 -0.44 -5.1 -0.4 -0.17 -0.0 -0.17 -1.37
0.68 -0.31 -0.05 -0.17 -1.36 -1.06 0.43 1.28 0.71 0.81 0.64 0.44 0.13 -1.61 -1.72 -3.18 -1.17 1.25 0.48 0.5 -3.1 -0.49 -1.05 -0.3 -0.62 -0.89
0.53 -1.16 -3.42 -3.28 -1.12 0.44 1.38 1.05 0.78 0.52 -0.18 -0.82 0.37 -0.73 -1.37 -1.57 0.29 0.81 0.52 0.01 -3.87 -0.88 0.57 0.14 -0.01 -0.73
0.9 0.39 0.84 0.45 -0.23 -0.18 0.67 1.28 0.91 0.52 0.24 -0.29 0.2 -1.88 -1.17 -1.48 -0.64 0.35 0.26 0.62 -6.05 -2.5 -3.67 -3.0 -0.71 -0.47
0.98 0.51 0.25 -0.17 -0.14 0.17 0.57 0.68 0.61 0.47 0.54 0.68 0.89 -1.36 -1.0 -1.43 -0.66 0.19 0.16 -0.22 -5.17 -1.79 -1.08 -0.47 -0.57 -1.36
0.79 0.68 -0.05 -0.83 -0.72 -0.19 0.73 0.9 0.81 0.8 0.65 0.37 0.33 -2.45 -1.22 -1.86 -0.19 0.48 -0.18 0.36 -4.95 -2.06 -0.15 -0.3 -0.37 -1.2
0.77 0.76 0.03 -0.84 -0.48 0.21 0.71 0.86 0.84 0.85 0.66 0.34 0.24 -2.27 -0.98 -1.84 -0.11 0.36 0.16 0.53 -5.14 -2.93 -0.78 -0.53 -0.94 -1.48
0.81 0.28 -0.41 -0.51 0.02 0.54 0.79 0.73 0.49 0.4 0.09 -0.26 0.52 -1.22 -0.46 -1.54 -0.08 0.62 0.21 0.19 -3.22 -0.86 -0.47 -0.34 -0.38 -1.12
-0.46 -0.11 -0.39 -0.44 -0.17 0.15 -0.07 0.4 0.83 0.8 0.61 0.47 -1.32 -0.76 0.16 -0.7 0.02 0.68 0.57 0.28 -3.68 -3.7 0.14 0.38 -0.32 -0.43
0.39 0.27 0.07 -0.01 0.17 0.16 0.35 0.83 0.83 0.56 0.69 0.64 0.53 -0.09 -0.7 -0.86 -0.43 -0.2 0.09 0.04 -7.09 -1.44 -3.14 -1.28 -0.75 -0.06
0.91 1.44 0.51 -0.5 -1.1 -0.34 0.47 0.88 0.95 0.96 0.83 0.74 0.56 -3.91 -2.35 -4.73 -1.19 0.08 -0.5 -0.42 -5.05 -2.17 -0.59 -0.49 -0.41 -1.45
1.07 0.4 -0.38 -0.57 -0.05 0.14 0.82 0.6 0.12 0.12 -0.23 -0.62 0.56 -1.03 -0.19 -0.71 0.28 0.65 0.45 0.38 -4.22 -0.57 -1.25 -0.53 -0.4 -0.74
1.0 0.38 -0.82 -1.07 -0.21 0.51 0.82 0.72 0.42 0.23 -0.26 -0.76 0.7 -0.59 -0.32 -0.92 0.11 0.62 0.26 0.17 -3.85 -0.57 -0.61 -0.74 -0.36 -0.56
1.29 1.73 0.92 0.16 -0.45 -0.05 0.16 0.49 0.36 0.32 0.44 0.61 0.78 -2.51 -1.37 -2.92 -0.5 -0.07 -0.29 0.03 -7.41 -1.65 -2.4 -1.02 -1.23 -1.9
0.26 -0.3 -0.24 -0.16 -0.32 -0.51 0.12 0.34 0.24 0.46 0.51 0.56 0.42 -0.92 -0.51 -0.7 -0.2 0.6 0.01 0.34 -4.5 0.16 -0.46 0.13 0.2 -0.05
0.46 0.54 0.51 0.33 0.39 0.05 0.14 0.16 0.51 0.69 0.68 0.61 0.47 -0.02 -0.55 -0.67 -0.38 -0.32 -0.27 0.2 -5.34 -0.15 -3.74 -1.29 -0.97 -0.74
0.6 -0.26 -1.21 -1.22 -0.43 0.43 0.73 0.65 0.64 0.46 0.1 -0.24 0.28 -0.69 -1.02 -1.4 -0.09 0.75 0.18 -0.06 -4.07 0.23 -0.65 -0.01 0.58 -0.24
0.52 0.75 -0.08 -0.28 -0.07 -0.07 0.49 0.77 0.62 0.8 0.75 0.31 -0.69 -3.06 -1.65 -2.97 -0.35 0.83 -0.04 0.23 -4.04 -0.89 0.03 0.14 -0.38 -0.97
0.97 0.17 -0.09 -0.25 0.01 0.34 0.58 0.52 0.4 0.32 0.06 -0.08 0.85 -0.88 -0.32 -0.84 -0.23 0.25 0.16 -0.07 -4.52 -0.94 -0.22 -0.33 -0.42 -0.72
1.32 1.9 0.68 -0.72 -1.52 -0.76 0.27 0.68 0.84 0.77 0.66 0.56 0.81 -2.57 -1.19 -4.0 -0.48 -0.24 -0.34 0.08 -8.95 -3.38 -1.96 -1.46 -1.08 -1.98
0.99 -0.53 -1.43 -1.33 -0.55 0.08 0.83 0.71 0.37 0.34 0.28 0.0 0.76 -0.45 -0.5 -1.13 0.28 0.5 0.17 0.02 -2.73 -0.61 -0.16 -0.26 0.06 -0.51
0.31 -0.39 -1.15 -1.15 -0.29 0.4 0.95 0.89 0.54 0.47 0.03 -0.1 0.01 -1.39 -0.06 -0.89 0.15 0.98 0.84 0.32 -1.99 -1.52 0.14 -0.38 -1.02 -1.25
-0.02 -1.08 -2.38 -1.11 -0.46 0.48 1.05 1.04 1.24 0.81 0.13 -0.98 -0.18 0.48 -0.5 -1.0 0.34 0.16 0.87 -0.13 -5.76 -2.67 -0.59 -1.95 0.53 -0.35
0.14 -1.09 -1.44 -1.59 -1.05 0.32 1.15 0.9 0.98 0.69 0.38 -0.6 -0.17 0.53 -0.75 -0.86 0.2 1.07 0.82 0.25 -4.71 -1.78 -1.49 -2.54 0.21 -0.53
0.67 1.02 0.72 -0.03 -0.82 -1.64 -0.33 0.1 -0.05 0.14 0.33 0.4 0.31 -0.49 -0.96 -0.97 -0.2 0.57 -0.51 -0.24 -3.1 -0.32 -0.25 0.44 0.32 0.14
0.37 0.52 -0.45 -0.99 -0.43 0.28 0.84 0.82 0.66 0.51 -0.01 -0.55 -0.07 -1.76 -1.03 -2.11 -0.13 1.0 0.45 0.25 -3.08 -0.38 -0.81 -0.08 0.45 -0.7
1.37 -0.14 -2.51 - -1.91 0.81 1.7 1.83 1.3 0.9 0.03 -0.19 0.96 -1.43 -1.38 -1.99 -1.41 -0.37 -2.13 -0.59 -3.5 -2.42 -0.35 -2.1 -0.66 -1.43
-0.26 1.25 0.56 -0.3 -1.11 -2.01 -0.69 0.19 -0.29 0.72 0.55 0.68 0.48 -0.77 -0.75 -0.81 -0.37 0.62 0.24 -0.31 -5.6 -1.03 -0.39 0.0 0.96 -0.28
0.44 0.32 0.36 0.33 0.26 0.38 0.42 0.23 0.11 0.16 0.02 0.4 0.46 -0.59 -0.06 -0.18 -0.8 0.18 -0.31 -0.46 -1.73 -1.59 0.3 -0.34 -0.44 -0.31
0.91 1.53 0.61 -0.23 -0.5 -0.28 0.45 0.82 0.83 0.91 0.71 0.56 0.71 -1.83 -1.68 -2.49 -0.83 -0.7 -0.96 -0.08 -4.04 -2.45 -1.49 -1.34 -0.27 -0.82
-0.22 -0.73 -2.99 -3.1 -1.37 -0.07 0.87 0.68 1.27 1.3 0.75 0.48 -0.43 -1.77 -0.93 -1.34 0.08 0.64 0.91 0.59 -4.19 -3.33 0.19 -0.03 -0.15 -1.14
-0.38 -0.75 -2.18 -2.27 -1.44 -0.47 0.93 0.93 0.95 1.03 0.56 0.22 -0.88 -0.91 -0.26 -1.44 0.57 1.16 0.79 1.07 -4.64 -4.62 -0.06 -0.11 -1.05 -1.24
0.54 0.04 -0.18 -0.37 -0.5 -0.26 0.35 0.53 0.64 0.77 0.59 0.42 0.21 -0.7 -0.5 -0.95 -0.11 0.77 0.31 0.16 -3.78 -1.53 0.0 -0.16 -0.66 -0.81
0.7 -0.92 -2.57 -2.16 -0.71 0.33 1.18 0.96 0.72 0.38 -0.06 -0.54 0.53 -0.22 -0.63 -1.01 0.14 0.47 0.3 -0.04 -2.83 -0.35 -0.07 0.12 -0.08 -0.43
0.56 -0.38 -1.24 -1.17 -0.42 0.29 0.81 0.67 0.42 0.35 -0.12 -0.6 0.28 -0.91 -0.52 -0.74 0.34 0.66 0.42 0.42 -5.09 0.05 -0.32 -0.12 0.26 -0.26
-0.2 -0.26 -1.08 -1.15 -0.35 0.56 0.97 0.89 0.82 0.73 0.15 -0.45 -0.61 -1.79 -0.69 -1.95 0.28 0.96 0.69 0.71 -1.33 -1.49 -0.05 -0.46 -0.31 -0.86
-2.32 -1.58 -0.2 -0.24 -0.03 0.58 0.93 0.92 1.0 0.84 0.41 0.03 -1.66 1.12 -1.05 0.42 -0.17 0.19 -0.05 0.37 -8.89 -2.82 -2.94 -2.13 0.46 -0.21
0.93 -0.7 -2.59 -2.38 -0.9 0.24 1.11 0.91 0.47 0.22 -0.1 -0.82 0.68 -0.77 -1.42 -2.55 -0.03 0.71 0.64 -0.2 -1.38 -0.8 0.52 0.12 0.34 -0.32
0.62 -0.06 -1.21 -1.03 -0.19 0.63 0.96 0.9 0.75 0.54 0.02 -0.55 0.21 -0.93 -0.66 -1.12 -0.08 0.69 0.16 0.09 -3.6 -0.29 -0.55 -0.52 0.04 -0.52
0.84 -0.51 -1.67 -1.45 -0.21 0.7 0.99 1.09 0.91 0.53 0.24 -0.72 0.58 -0.67 -1.33 -1.95 -0.21 0.31 0.4 0.01 -5.15 -0.47 -0.69 -0.61 0.31 -0.65
0.03 -0.76 -1.29 -1.53 -0.33 0.39 0.98 0.66 0.67 0.46 0.02 -0.12 0.04 -1.63 -0.71 -1.26 0.2 0.85 0.76 0.48 -4.83 -1.89 0.08 0.67 -0.56 0.02
0.41 -0.7 -1.01 -0.92 -0.24 -0.0 0.58 0.62 0.78 0.63 0.65 0.2 0.12 -0.92 -0.91 -1.48 -0.01 0.54 0.16 0.17 -3.88 -0.58 -0.23 0.14 0.57 -0.32
1.13 0.75 0.3 0.28 0.31 0.47 0.69 0.9 0.34 0.38 0.2 0.1 0.95 -2.4 -1.21 -1.58 -0.56 0.14 0.03 0.04 -6.71 -1.96 -1.28 -1.2 -0.63 -1.64
1.17 0.94 -0.21 -1.28 -0.96 0.13 0.8 0.97 0.79 0.73 0.45 0.22 0.71 -1.69 -1.07 -2.51 -0.4 0.11 -0.09 -0.07 -4.89 -1.02 -0.63 -0.53 -0.46 -1.25
1.19 0.81 0.23 -0.45 -0.25 0.23 0.58 0.7 0.55 0.49 0.39 0.38 0.95 -2.59 -1.54 -2.41 -0.39 0.52 0.12 0.48 -5.38 -3.22 -1.11 -1.01 -0.67 -1.26
0.7 -0.27 -1.27 -0.67 -0.14 0.03 1.05 1.0 1.2 1.0 0.47 0.28 0.43 -1.91 -1.14 -3.52 -0.46 0.53 0.32 -0.71 -4.46 -1.7 -0.68 -1.17 0.47 -0.68
0.44 0.69 0.53 -0.26 -0.91 -0.58 0.34 0.72 0.77 1.02 0.88 0.85 0.44 -1.55 -0.75 -1.2 -0.42 0.31 0.02 0.17 -5.18 -2.03 -1.2 -1.4 -0.45 -0.75
0.05 0.36 -0.34 -0.74 -0.51 -0.23 0.69 0.82 0.68 0.69 0.35 -0.13 -0.14 -0.82 -0.44 -1.16 0.29 0.38 -0.36 0.17 -4.37 -0.24 -0.5 -0.36 0.56 0.03
0.19 0.46 -0.22 -0.62 -0.37 0.26 0.78 0.87 0.83 0.73 0.43 0.04 0.08 -0.96 -0.4 -1.16 0.22 -0.17 -0.24 0.13 -4.62 -0.42 -1.1 -0.75 0.26 -0.27
0.83 -0.22 -2.44 -2.86 -1.58 0.07 0.98 0.86 0.55 0.24 0.0 -0.37 0.64 -1.37 -0.69 -2.59 0.02 0.62 0.79 -0.18 -2.64 -0.34 0.77 0.48 -0.01 -0.97
0.17 -0.09 -0.46 -0.59 -0.38 -0.25 0.16 0.02 0.17 0.51 0.53 0.68 0.15 -0.45 -0.23 -0.46 -0.1 0.3 -0.02 -0.09 -2.94 0.5 -0.32 0.3 -0.07 0.23
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1.69 0.41 -0.77 -0.95 0.04 0.76 1.3 1.19 0.55 0.28 -0.3 -1.2 1.3 -1.77 -1.26 -3.19 -0.35 0.34 0.07 0.09 -6.45 -2.65 -2.44 -2.17 -0.48 -2.17
0.42 -0.5 -1.46 -1.41 -0.41 0.32 0.77 0.57 0.44 0.38 -0.13 -0.72 0.21 -0.38 -0.35 -0.89 0.41 0.97 0.54 0.55 -5.01 -0.14 -0.49 -0.12 0.14 -0.47
0.99 0.39 -0.28 -0.52 0.02 0.32 0.84 0.58 0.15 0.06 -0.66 -1.16 0.56 -1.22 -0.45 -1.29 0.11 1.18 0.79 0.54 -5.64 -0.66 -0.82 -1.1 -0.52 -1.18
0.48 -0.38 -0.29 0.11 0.65 0.95 0.89 0.84 0.29 0.42 0.38 0.18 0.46 -0.93 -1.25 -1.27 -0.52 -0.45 -0.48 -0.67 -3.25 0.01 -1.58 0.07 0.19 -0.63
0.84 -0.8 -2.5 -2.73 -1.1 0.15 1.2 1.04 0.63 0.53 -0.04 -0.8 0.58 0.19 -0.96 -0.64 0.09 0.89 0.58 0.34 -3.47 -0.51 -0.68 -0.67 -0.39 -0.85
-0.36 -0.2 -0.26 -0.35 -0.03 0.39 0.87 0.9 0.96 0.86 0.59 0.28 -0.31 0.34 -1.41 -0.26 -0.31 0.33 0.06 0.47 -5.93 -1.62 -1.48 -1.38 -0.33 -0.7
0.32 0.27 -0.65 -1.08 -0.56 -0.0 0.67 0.72 0.61 0.66 0.37 0.03 0.19 -0.71 -0.34 -0.96 0.18 0.59 0.11 0.06 -1.89 -1.09 0.16 -0.0 -0.15 -0.89
-0.77 -0.41 -0.48 -0.39 0.17 0.51 0.84 0.58 0.63 0.22 -0.05 -0.63 -0.72 0.06 -0.02 -0.3 0.24 0.89 0.7 0.26 -2.01 -2.19 -0.44 -0.75 -0.27 0.11
0.53 -0.56 -0.57 -0.59 -0.33 0.17 0.72 0.71 0.56 0.92 0.53 0.1 0.44 0.38 -0.89 0.28 0.13 0.49 0.11 0.46 -7.45 -3.77 -3.68 -2.83 0.18 -0.62
0.63 0.72 -0.06 -0.74 -0.58 0.13 0.66 0.85 0.69 0.72 0.51 0.14 -0.09 -2.65 -1.74 -2.67 -0.29 0.96 0.26 0.44 -3.01 -2.19 0.23 -0.59 -0.3 -1.12
0.03 -0.81 -0.64 -0.46 -0.25 -0.09 0.48 0.44 0.55 1.0 0.67 0.25 0.16 0.51 -0.74 0.37 0.13 0.61 0.22 0.27 -7.3 -3.45 -3.27 -2.98 0.49 0.12
0.94 0.84 -0.23 -1.06 -1.06 -0.47 0.38 0.61 0.53 0.57 0.57 0.48 0.6 -1.41 -1.3 -1.48 -0.18 0.25 -0.17 0.09 -1.12 -1.57 -0.09 0.16 -0.08 -0.7
-4.86 -1.15 -0.28 0.29 0.79 0.83 0.74 0.66 1.16 0.91 0.38 -0.01 -3.8 -1.73 -1.34 -1.13 -0.23 1.08 0.34 -0.03 -1.4 -1.16 -0.02 0.08 -0.99 -1.01
0.32 0.12 -0.09 0.3 -0.21 -0.1 0.65 0.25 -0.12 0.26 0.69 0.67 -0.36 -0.45 -1.07 -0.23 -1.21 1.09 0.45 0.33 -3.14 -0.27 -1.0 -1.1 -0.91 0.2
0.42 0.88 0.46 -0.06 -0.2 0.19 0.77 1.0 0.7 0.07 -0.5 -0.89 0.07 0.89 -0.86 -0.2 -0.38 -0.16 -0.37 -0.06 -5.47 -2.61 -1.34 -2.05 0.45 -0.08
-0.22 0.49 0.7 0.19 -0.02 -0.31 0.05 0.33 0.49 0.34 0.49 0.03 -0.22 -0.44 -0.08 -0.39 0.09 0.91 0.57 0.21 -3.96 -1.59 -0.71 -0.97 -0.6 -0.48
0.95 -0.69 -1.83 -2.0 -0.77 0.57 1.32 1.32 1.03 0.71 0.25 -0.43 1.05 -0.97 -0.56 -2.2 -0.11 0.43 0.14 0.0 -6.98 -0.76 -1.08 -1.41 -0.73 -1.47
0.28 -0.24 -0.52 0.08 0.18 -0.17 0.61 0.55 0.63 0.55 0.4 0.19 0.23 -0.61 -0.6 -0.84 0.05 0.37 0.17 -0.3 -2.19 -1.44 -0.07 0.11 0.21 -0.65
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1.08 0.34 -0.07 -0.31 0.18 0.67 0.99 0.95 0.49 0.39 0.03 -0.49 0.8 -1.31 -0.55 -1.51 0.11 0.43 0.18 0.37 -7.07 -1.27 -2.49 -1.9 -1.02 -1.42
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1.02 0.5 0.03 -0.15 0.03 0.35 0.74 0.8 0.49 0.27 0.17 0.02 0.76 -0.39 -0.63 -0.3 -0.25 0.0 -0.15 -0.38 -3.5 -1.27 -0.93 -0.83 -0.6 -1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.