1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.66 -0.43 -0.32 -0.06 -0.05 -0.02 -0.02 -0.17 -0.1 -0.28 -0.5 -0.72 -0.68 -0.2 0.41 0.28 -0.03 0.71 0.52 0.06 -0.4 1.06 0.19 -0.06 -0.19 -0.0
-0.23 -0.27 -0.28 -0.57 -0.99 -1.42 -0.54 -0.5 -0.67 -0.38 -0.42 -0.5 -0.01 0.31 0.44 0.52 -0.12 0.33 0.08 -0.52 0.2 1.7 0.28 0.01 -0.08 0.25
-1.03 -1.21 -1.14 -1.19 -1.11 -1.98 -1.1 -0.94 -1.22 -0.82 -0.97 -1.43 -1.32 -0.5 -0.6 2.04 -1.79 0.12 0.4 -0.78 0.51 2.86 -0.5 -0.41 -1.48 -0.09
-2.69 -0.78 -1.1 -0.37 -0.43 -0.68 -0.97 -0.84 -1.15 -1.05 -1.21 -1.25 -2.69 0.39 1.08 0.32 -0.39 1.42 0.88 -0.53 -0.23 1.88 0.34 -0.31 0.13 0.37
-4.25 -2.3 -1.67 -0.82 0.18 0.49 0.51 0.14 0.39 0.26 -0.08 -0.73 -5.01 -0.27 -0.34 -0.48 -0.35 -0.09 -0.38 -0.38 -2.19 2.2 0.99 0.12 0.25 0.03
-1.87 -1.32 -1.27 -0.27 -0.49 -0.42 0.28 -0.1 0.2 0.34 0.38 0.09 -1.3 0.27 -0.22 0.21 -0.35 0.06 -0.31 -1.08 -0.43 1.44 0.97 -0.1 0.52 0.22
-2.74 -1.19 -0.66 -0.41 0.35 0.84 0.37 0.44 0.27 -0.4 0.0 0.04 -2.0 0.13 -0.34 -0.28 -1.05 -0.04 -0.35 -0.8 -2.64 1.95 0.72 -0.15 0.21 -0.29
-0.64 -0.23 -0.39 -0.05 -0.49 -1.24 -0.84 -0.28 -0.32 -0.37 -0.09 -0.4 -0.11 0.74 0.47 1.2 -0.92 0.86 -0.07 -2.17 -0.96 1.45 -0.05 -0.03 0.31 -0.38
-2.18 -0.69 -0.29 -0.1 0.05 0.03 -0.26 -0.25 0.16 -0.03 0.21 0.13 -2.9 -1.08 -0.44 -0.72 -0.56 0.48 0.16 -0.18 -1.22 1.98 0.71 0.33 0.15 -0.1
-0.9 -1.07 -1.1 -0.59 -0.46 -0.75 -0.45 -0.48 -0.19 -0.02 0.11 -0.09 -0.65 0.66 0.59 0.75 -0.08 0.59 -0.06 -0.56 -0.35 1.35 0.03 0.37 0.06 0.05
-0.44 -0.21 0.02 -0.12 -0.09 -0.21 -0.2 -0.23 -0.54 -0.47 -0.74 -0.73 -0.42 0.25 0.67 0.5 0.03 0.39 0.37 -0.05 -0.36 0.95 -0.08 -0.1 -0.33 0.51
-4.21 -3.26 -2.7 -0.79 -0.31 -0.03 0.52 -0.24 0.23 0.05 0.31 -0.48 -3.05 -1.32 -1.75 -0.82 0.02 -1.21 -1.81 -1.74 -0.85 2.72 0.54 1.11 0.68 0.15
-2.94 -1.73 -1.01 -0.49 -0.31 -0.55 -0.12 -0.16 0.2 0.3 0.34 0.04 -2.45 0.26 -0.31 0.2 -0.14 -0.29 -0.43 -0.45 0.15 1.45 0.88 0.78 0.42 0.14
-2.24 -1.47 -0.95 -0.72 -0.44 -0.8 0.1 -0.22 0.07 0.13 -0.45 -0.33 -2.26 0.82 0.42 0.97 0.41 0.64 0.22 0.58 -1.11 0.91 0.05 0.42 -0.37 0.11
-0.76 -0.41 -0.3 -0.6 -1.47 -2.22 -1.23 -0.87 -0.94 -0.46 -0.63 -0.85 -0.23 0.1 0.59 0.53 -0.01 0.7 0.5 -0.45 0.74 1.39 0.73 0.06 0.35 0.35
0.1 -0.96 -1.18 -0.56 -0.64 -0.97 -0.09 -0.03 0.05 0.16 0.38 0.18 0.27 0.32 -0.26 -0.3 -0.46 -0.18 -0.73 -0.96 -0.34 1.67 0.27 0.07 0.6 0.09
-1.14 -0.81 -0.75 -0.87 -0.72 -0.62 -0.29 -0.52 -0.79 -0.57 -0.92 -1.06 -1.29 0.28 0.55 0.24 0.06 0.86 0.81 0.16 0.05 1.97 -0.64 -0.24 -0.23 0.57
-0.55 -0.51 -0.36 0.16 0.37 0.08 0.39 0.2 0.19 0.15 0.04 -0.2 -0.65 0.62 -0.14 0.42 -0.48 -0.99 -0.81 -0.76 -2.64 1.55 0.18 -0.29 -0.07 -0.03
-0.7 -0.6 -0.45 -0.23 0.05 -0.28 0.23 -0.06 -0.18 0.09 -0.16 -0.76 -0.84 0.92 0.22 0.69 -0.13 -0.61 -0.5 -0.49 -2.33 1.57 0.27 -0.32 0.26 0.18
-0.63 -0.64 -0.75 -0.13 0.26 -0.17 0.14 0.11 -0.08 -0.03 0.01 -0.3 -0.76 0.47 -0.82 0.38 -0.91 -1.0 -1.07 -1.2 -2.09 1.95 0.78 -0.05 0.37 0.41
-1.39 -1.17 -0.9 -0.73 -0.45 -0.55 -0.41 -0.62 -0.59 -0.59 -1.03 -1.07 -1.57 0.45 0.14 1.29 -0.78 0.31 0.06 -0.53 -0.25 2.13 -0.18 0.23 0.17 0.78
-1.36 -1.82 -1.83 -0.51 0.83 0.93 0.87 0.49 0.48 0.18 0.05 -0.16 -0.89 -1.01 -1.23 -0.83 -1.86 -0.82 -1.43 -1.82 -1.25 2.5 0.71 -1.45 -0.25 -0.93
-0.13 -0.1 -0.17 0.01 -0.08 -0.34 -0.66 -0.86 -0.82 -0.62 -0.9 -0.96 -0.55 0.29 0.6 0.4 -0.0 0.83 0.49 -0.18 -0.7 1.33 -0.09 -0.17 0.31 0.1
-1.32 -0.74 -0.38 -0.38 -0.46 -0.27 -0.18 -0.49 -0.16 -0.47 -0.76 -0.84 -1.22 0.63 0.27 0.67 -0.02 0.84 0.46 0.1 -0.6 1.45 -0.25 -0.35 0.59 0.06
-0.27 -0.28 0.07 -0.17 -0.57 -0.69 -0.24 -0.21 -0.26 -0.49 -0.58 -0.82 -0.4 0.31 0.54 0.62 0.31 0.51 0.34 0.02 -0.0 0.79 0.05 -0.18 -0.13 0.2
-1.09 -1.13 -0.98 -0.23 0.02 -0.52 -0.25 -0.08 0.11 0.03 0.13 -0.19 -0.88 0.26 -0.16 0.24 -0.28 -0.2 -0.46 -0.7 -0.4 1.93 0.77 -0.15 0.15 0.01
-0.57 -0.57 -0.55 -0.53 -0.35 -0.31 -0.02 -0.12 -0.17 -0.19 -0.43 -0.5 -0.64 0.42 0.3 0.48 0.09 0.78 0.34 0.05 -0.83 1.45 -0.22 -0.23 -0.17 -0.04
-0.87 -0.88 -0.8 -0.71 -0.79 -1.18 -0.59 -0.67 -0.67 -0.71 -0.67 -0.92 -0.7 -0.17 0.44 -0.16 0.4 0.69 0.09 -0.54 0.55 1.73 0.62 0.26 0.91 0.24
-6.9 -6.05 -5.42 -3.84 -1.65 0.32 0.83 0.47 0.7 0.77 0.97 0.52 -5.63 -0.97 -1.42 -1.48 -0.96 -0.49 -1.56 -1.14 -2.07 2.3 0.47 0.37 1.0 0.4
-2.39 -1.29 -0.72 -0.05 0.09 0.43 0.24 -0.03 0.2 -0.09 -0.17 -0.58 -2.88 -1.46 -1.47 -0.45 -2.66 -1.88 -1.64 -1.38 -0.12 2.78 0.97 -0.66 0.4 0.26
-4.52 -1.51 -0.72 -0.37 0.24 0.42 0.17 -0.07 0.2 -0.05 -0.23 -0.56 -4.5 0.32 -0.46 0.16 -0.27 -0.21 0.05 -0.28 -1.08 2.04 0.4 0.31 -0.36 0.46
-4.86 -1.64 -0.46 -0.14 0.31 0.7 0.37 -0.07 0.2 -0.18 -0.66 -0.86 -4.38 0.72 0.49 0.67 0.2 0.41 -0.04 -0.01 -1.36 1.06 -0.3 -0.21 0.13 0.37
-0.14 -0.42 -0.27 -0.2 -0.36 -0.8 -0.41 -0.27 -0.64 -0.4 -0.48 -0.52 -0.14 0.26 0.51 0.4 -0.02 0.67 0.4 -0.23 0.21 1.13 0.13 -0.16 -0.13 0.09
-0.58 -1.02 -0.88 -0.76 -0.16 0.04 0.25 -0.11 0.3 0.29 0.26 0.06 -0.47 -0.09 -0.24 -0.36 0.01 0.05 -0.13 -0.02 -2.63 1.63 0.7 -0.37 0.04 0.08
-3.38 -4.24 -3.31 -1.74 -1.03 -0.37 -0.15 -0.35 0.54 0.48 0.54 0.07 -4.04 0.12 0.09 0.14 0.04 0.03 -1.08 -0.6 0.43 1.59 0.99 0.42 0.67 0.47
-1.03 -1.16 -0.95 -0.4 -0.14 -0.08 0.5 0.3 0.41 0.32 0.14 -0.16 -0.77 -0.27 -0.5 0.02 -0.05 -0.19 -0.43 -0.54 -0.15 1.31 0.5 -0.22 0.66 0.09
-0.78 -0.41 -0.55 -0.21 -0.31 -0.23 -0.0 -0.1 -0.18 -0.47 -0.8 -0.98 -1.07 -0.36 0.38 -0.0 -0.37 0.43 0.61 -0.57 0.05 1.87 0.21 0.37 0.02 -0.28
-0.7 -0.79 -0.46 -0.25 -0.3 -0.65 -0.42 -0.45 -0.82 -0.69 -0.85 -0.77 -0.38 0.41 0.57 0.81 0.12 0.32 0.43 -0.33 -0.03 1.54 0.43 -0.06 -0.16 0.11
-4.13 - -3.24 -1.15 -0.71 0.08 -0.01 -0.17 0.18 0.36 0.33 0.25 -4.02 -0.13 -1.12 -0.37 -1.1 -0.25 -0.3 -1.01 -1.04 2.44 1.18 0.08 0.49 0.58
0.54 -0.55 -1.36 -1.48 -1.25 -0.88 -0.13 -0.14 -0.66 -0.93 -1.13 -1.26 0.36 0.05 0.36 0.08 -0.48 0.81 0.6 -0.99 0.7 1.81 0.15 -0.32 0.26 -0.14
-1.18 -0.24 -0.88 -0.58 -0.25 -0.5 -0.5 -0.37 -0.32 -0.47 -0.7 -1.08 -1.08 -0.07 0.24 0.6 -0.84 0.94 0.38 -1.04 0.59 2.06 -0.02 -0.22 -0.25 0.14
-2.22 -1.04 -0.81 -0.26 -0.24 -0.5 0.06 0.09 0.28 0.33 0.46 0.2 -2.3 0.2 -0.36 0.02 -0.06 -0.12 -0.27 -0.24 -0.1 1.52 0.63 0.49 -0.08 -0.25
-0.4 -0.73 -0.81 -0.51 -0.09 -0.24 0.03 -0.18 0.15 0.09 0.33 -0.23 -0.68 0.24 0.16 0.04 -0.64 -0.11 -0.5 -0.37 -3.15 1.8 0.71 0.08 0.23 -0.07
-0.33 -0.61 -0.78 -0.34 -0.14 -0.29 0.03 -0.04 -0.05 0.04 0.13 0.03 -0.02 0.68 0.01 0.69 -0.86 -0.31 -0.64 -0.92 -2.98 1.95 -0.33 -0.33 0.27 -0.32
-1.56 -1.04 -0.71 -0.6 -0.09 0.38 0.29 -0.03 0.19 0.01 -0.4 -0.61 -1.55 0.57 0.4 0.57 0.25 0.6 0.36 0.15 -1.4 1.02 0.09 -0.0 -0.13 -0.34
-0.13 -0.33 -0.75 -0.35 -0.44 -0.72 -0.27 -0.09 -0.31 -0.06 -0.16 -0.01 -0.41 0.27 0.7 0.13 -0.45 0.5 -0.33 -0.55 -0.23 1.52 -0.09 -0.07 0.32 -0.05
-4.36 -4.5 -2.88 -1.49 -0.48 0.05 0.23 -0.23 0.6 0.17 0.0 -0.83 -4.2 -1.02 -0.69 -0.49 -0.58 -0.75 -1.0 -1.04 -0.75 2.67 1.23 0.52 0.64 0.02
-4.38 -3.94 -2.83 -1.29 -0.42 0.11 0.47 0.01 0.63 0.22 0.27 -0.74 -4.5 -0.88 -1.12 -0.44 -0.39 -0.58 -1.11 -1.06 -0.87 2.48 1.25 0.47 0.59 0.09
-2.52 -1.91 -1.07 -0.33 -0.09 -0.15 -0.06 -0.07 0.53 0.31 0.54 0.27 -1.9 0.07 -0.28 -0.39 -0.39 -0.25 -0.18 -0.58 0.01 1.42 0.77 0.38 0.44 0.12
-0.86 -0.47 -0.38 -0.32 -0.01 -0.32 -0.37 -0.45 -0.46 -0.3 -0.53 -0.55 -0.45 0.33 0.98 0.66 -0.15 0.62 0.62 -0.04 -1.56 1.59 -0.72 -0.41 -0.59 0.11
-5.45 -5.11 -1.98 -0.66 0.14 0.45 0.05 -0.39 0.1 -0.06 -0.18 -0.38 -5.13 -0.25 -0.52 -0.3 -0.89 -1.2 -1.47 -1.28 -0.4 2.62 1.03 0.37 0.78 0.02
-3.47 -1.66 -0.82 -0.85 -0.45 -0.55 -0.07 -0.3 -0.06 0.03 -0.57 -0.89 -3.01 0.81 0.89 1.02 0.43 0.94 0.61 0.36 -0.96 1.14 -0.05 -0.1 -0.28 -0.27
-4.99 -4.96 -4.06 -2.2 -0.49 0.76 0.96 0.26 0.38 -0.17 -0.56 -1.78 -5.56 -0.69 -1.38 -1.4 -1.26 -1.66 -2.05 -2.17 -0.95 2.8 2.05 -0.43 0.19 -0.3
-1.44 -0.94 -0.47 -0.17 -0.13 -0.26 0.17 -0.58 -0.08 -0.88 -0.02 -0.69 -1.17 -0.19 0.23 -0.28 -0.78 0.72 0.46 -1.1 0.21 1.84 -0.75 0.49 0.87 -0.15
-2.47 -1.15 -0.94 -1.13 -1.54 -2.07 -1.12 -0.67 -0.73 -0.41 -0.39 -0.34 -1.91 0.38 0.76 0.85 0.03 0.8 0.38 -0.65 0.65 1.75 0.98 0.03 0.28 -0.15
-0.49 -1.1 -1.06 0.06 0.66 0.48 0.31 0.11 -0.45 -0.29 0.09 -0.11 -0.62 -0.99 -1.54 0.79 -2.46 -1.62 -1.56 -1.75 -1.46 2.2 1.11 -0.89 0.39 0.19
-6.7 -4.06 -1.61 -0.58 0.44 1.0 0.88 0.32 0.45 -0.05 -0.2 -0.61 -5.61 -0.49 -0.52 -0.46 -0.92 -0.97 -1.56 -1.16 -1.04 2.44 0.99 -0.43 0.03 -0.01
-0.27 -0.88 -0.71 -0.26 -0.46 -0.73 -0.03 0.07 0.1 0.18 0.32 0.37 0.02 0.3 -0.53 0.43 -0.18 -0.27 -0.86 -0.69 -0.52 1.69 -0.15 -0.01 0.22 -0.09
-2.07 -0.93 -0.54 -0.44 0.09 0.47 0.44 -0.03 -0.03 -0.5 -1.0 -1.05 -2.13 0.68 0.57 0.98 0.16 0.69 0.28 0.15 -1.66 1.02 -0.09 -0.21 -0.14 -0.08
-5.96 -3.31 -1.91 0.45 1.12 0.48 0.3 0.3 0.1 -0.02 -0.3 -0.85 -5.38 -0.95 -0.69 -1.57 -1.61 -1.04 -1.85 -1.12 0.17 2.43 1.27 -0.33 0.05 -0.02
-1.58 -1.62 -1.07 -0.13 0.09 -0.15 -0.1 -0.33 0.02 -0.2 -0.24 -0.54 -1.53 -0.39 -0.67 -0.65 -1.01 -0.67 -1.19 -1.0 -0.01 2.47 1.15 0.35 0.26 0.24
-2.08 -1.28 -1.08 -1.01 -0.92 -0.76 -0.26 -0.52 -0.22 -0.14 -0.69 -0.84 -2.25 0.83 0.64 1.41 0.46 0.64 0.68 0.16 -0.54 1.43 -0.32 0.1 -0.39 -0.12
-1.26 -1.11 -0.61 -0.46 -0.21 -0.17 0.2 0.07 0.46 0.28 0.31 0.25 -0.97 0.22 -0.23 0.16 -0.34 0.14 -0.4 -0.81 -0.35 1.11 0.71 0.43 0.12 -0.18
-7.69 -5.01 -3.93 -1.9 -0.17 0.77 0.1 -0.63 -1.22 -2.56 -1.9 -3.19 -5.7 -0.05 1.15 -0.27 -4.04 -1.84 -2.79 -3.07 -1.33 3.08 1.77 -0.07 0.57 0.03
0.39 -1.12 -1.2 -0.71 -0.54 -0.09 0.18 -0.1 -0.64 -0.56 -0.18 -0.19 0.46 0.39 -0.46 0.31 -0.8 -0.07 -0.99 -1.13 -0.69 2.0 0.25 0.18 0.34 0.09
-0.21 0.06 0.08 -0.02 -0.07 -0.23 -0.19 -0.12 -0.23 -0.26 -0.39 -0.4 -0.28 -0.08 0.62 0.24 -0.23 0.47 0.46 -0.25 -0.45 0.84 -0.2 -0.13 0.1 -0.12
-1.34 -1.11 -0.69 -0.65 -0.31 -0.41 -0.39 -0.58 -0.47 -0.28 -0.61 -0.6 -1.0 0.04 0.65 0.22 0.35 1.1 0.7 0.28 -1.41 1.85 -0.24 -0.18 -0.24 -0.08
-0.75 -1.06 -0.83 -0.68 -0.18 -0.02 0.06 -0.02 -0.62 -1.0 -0.92 -1.37 -1.32 -0.05 0.13 0.42 -0.26 0.19 0.45 -0.63 0.48 1.95 0.21 0.07 0.36 0.32
-1.53 -1.35 -1.2 -0.73 -0.13 0.14 0.39 0.16 0.29 0.38 0.45 0.2 -1.22 0.61 -0.65 0.54 -0.67 -0.7 -0.96 -0.92 -0.71 1.82 0.28 0.28 -0.01 -0.25
-1.46 -2.79 -2.85 -0.8 -0.43 -0.77 -0.86 -0.36 -0.11 0.06 0.06 -0.47 -2.04 -0.76 -1.77 -1.36 -2.19 -1.77 -2.69 -2.69 -0.12 2.84 0.91 1.46 1.11 0.25
-2.3 -1.51 -0.82 -0.41 -0.21 0.25 0.33 0.1 0.25 -0.38 -0.8 -1.3 -2.54 0.47 0.31 0.82 0.2 0.64 0.37 -0.1 -0.58 1.43 0.18 -0.38 -0.0 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.