Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.3 0.36 0.39 0.46 0.47 0.47 0.47 0.43 0.45 0.4 0.34 0.29 0.3 0.42 0.64 0.58 0.47 0.79 0.69 0.5 0.36 1.0 0.55 0.46 0.42 0.48
0.26 0.26 0.25 0.21 0.16 0.12 0.21 0.22 0.19 0.24 0.23 0.22 0.31 0.38 0.42 0.44 0.28 0.39 0.33 0.22 0.35 1.0 0.37 0.31 0.29 0.37
0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.03 0.06 0.07 0.06 0.08 0.07 0.05 0.06 0.1 0.09 0.56 0.04 0.15 0.18 0.08 0.2 1.0 0.1 0.1 0.05 0.13
0.04 0.16 0.13 0.21 0.2 0.17 0.14 0.15 0.12 0.13 0.12 0.11 0.04 0.36 0.57 0.34 0.21 0.72 0.5 0.19 0.23 1.0 0.34 0.22 0.3 0.35
0.01 0.04 0.07 0.12 0.25 0.3 0.31 0.24 0.28 0.26 0.21 0.13 0.01 0.18 0.17 0.16 0.17 0.2 0.17 0.17 0.05 1.0 0.43 0.24 0.26 0.22
0.1 0.15 0.15 0.3 0.26 0.27 0.45 0.34 0.42 0.47 0.48 0.39 0.15 0.44 0.32 0.43 0.29 0.38 0.3 0.17 0.27 1.0 0.72 0.34 0.53 0.43
0.04 0.11 0.16 0.2 0.33 0.47 0.33 0.35 0.31 0.2 0.26 0.27 0.06 0.28 0.21 0.21 0.13 0.25 0.2 0.15 0.04 1.0 0.43 0.23 0.3 0.21
0.23 0.31 0.28 0.35 0.26 0.16 0.2 0.3 0.29 0.28 0.34 0.28 0.34 0.61 0.51 0.84 0.19 0.66 0.35 0.08 0.19 1.0 0.35 0.36 0.46 0.28
0.06 0.16 0.21 0.24 0.26 0.26 0.21 0.21 0.28 0.25 0.29 0.28 0.03 0.12 0.19 0.15 0.17 0.36 0.28 0.22 0.11 1.0 0.42 0.32 0.28 0.24
0.21 0.19 0.18 0.26 0.29 0.23 0.29 0.28 0.34 0.39 0.42 0.37 0.25 0.62 0.59 0.66 0.37 0.59 0.38 0.27 0.31 1.0 0.4 0.51 0.41 0.41
0.38 0.45 0.53 0.48 0.49 0.45 0.45 0.44 0.36 0.37 0.31 0.31 0.39 0.62 0.82 0.73 0.53 0.68 0.67 0.5 0.41 1.0 0.49 0.49 0.41 0.74
0.01 0.02 0.02 0.09 0.12 0.15 0.22 0.13 0.18 0.16 0.19 0.11 0.02 0.06 0.05 0.09 0.15 0.07 0.04 0.05 0.08 1.0 0.22 0.33 0.24 0.17
0.05 0.11 0.18 0.26 0.3 0.25 0.34 0.33 0.42 0.45 0.46 0.38 0.07 0.44 0.3 0.42 0.33 0.3 0.27 0.27 0.41 1.0 0.67 0.63 0.49 0.4
0.11 0.18 0.26 0.31 0.38 0.29 0.55 0.44 0.54 0.56 0.37 0.41 0.11 0.9 0.68 1.0 0.68 0.79 0.6 0.77 0.24 0.96 0.53 0.68 0.4 0.55
0.23 0.29 0.31 0.25 0.14 0.08 0.16 0.21 0.2 0.28 0.25 0.21 0.33 0.41 0.58 0.55 0.38 0.62 0.54 0.28 0.64 1.0 0.63 0.4 0.49 0.49
0.34 0.16 0.14 0.21 0.2 0.16 0.3 0.31 0.33 0.35 0.41 0.36 0.38 0.39 0.26 0.25 0.23 0.28 0.19 0.16 0.25 1.0 0.38 0.33 0.48 0.33
0.12 0.14 0.15 0.14 0.16 0.17 0.21 0.18 0.15 0.17 0.13 0.12 0.1 0.31 0.37 0.3 0.27 0.46 0.45 0.28 0.26 1.0 0.16 0.22 0.22 0.38
0.23 0.24 0.27 0.38 0.44 0.36 0.45 0.39 0.39 0.38 0.35 0.3 0.22 0.52 0.31 0.46 0.25 0.17 0.19 0.2 0.05 1.0 0.39 0.28 0.33 0.33
0.21 0.22 0.25 0.29 0.35 0.28 0.4 0.32 0.3 0.36 0.3 0.2 0.19 0.64 0.39 0.55 0.31 0.22 0.24 0.24 0.07 1.0 0.41 0.27 0.41 0.38
0.17 0.17 0.15 0.24 0.31 0.23 0.29 0.28 0.24 0.25 0.26 0.21 0.15 0.36 0.15 0.34 0.14 0.13 0.12 0.11 0.06 1.0 0.44 0.25 0.33 0.34
0.09 0.1 0.12 0.14 0.17 0.16 0.17 0.15 0.15 0.15 0.11 0.11 0.08 0.31 0.25 0.56 0.13 0.28 0.24 0.16 0.19 1.0 0.2 0.27 0.26 0.39
0.07 0.05 0.05 0.12 0.32 0.34 0.32 0.25 0.25 0.2 0.18 0.16 0.1 0.09 0.08 0.1 0.05 0.1 0.07 0.05 0.07 1.0 0.29 0.06 0.15 0.09
0.36 0.37 0.35 0.4 0.38 0.31 0.25 0.22 0.23 0.26 0.21 0.21 0.27 0.49 0.6 0.52 0.4 0.71 0.56 0.35 0.25 1.0 0.37 0.36 0.49 0.43
0.15 0.22 0.28 0.28 0.27 0.3 0.32 0.26 0.33 0.26 0.22 0.2 0.16 0.57 0.44 0.58 0.36 0.66 0.5 0.39 0.24 1.0 0.31 0.29 0.55 0.38
0.48 0.48 0.61 0.51 0.39 0.36 0.49 0.5 0.48 0.41 0.39 0.33 0.44 0.72 0.84 0.89 0.71 0.82 0.73 0.58 0.58 1.0 0.6 0.51 0.53 0.66
0.12 0.12 0.13 0.22 0.27 0.18 0.22 0.25 0.28 0.27 0.29 0.23 0.14 0.32 0.24 0.31 0.22 0.23 0.19 0.16 0.2 1.0 0.45 0.24 0.29 0.27
0.25 0.25 0.25 0.25 0.29 0.29 0.36 0.34 0.32 0.32 0.27 0.26 0.23 0.49 0.45 0.51 0.39 0.63 0.46 0.38 0.2 1.0 0.31 0.31 0.32 0.36
0.17 0.16 0.17 0.18 0.17 0.13 0.2 0.19 0.19 0.18 0.19 0.16 0.18 0.27 0.41 0.27 0.4 0.48 0.32 0.21 0.44 1.0 0.46 0.36 0.57 0.35
0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.25 0.36 0.28 0.33 0.35 0.4 0.29 0.0 0.1 0.08 0.07 0.1 0.15 0.07 0.09 0.05 1.0 0.28 0.26 0.41 0.27
0.03 0.06 0.09 0.14 0.16 0.2 0.17 0.14 0.17 0.14 0.13 0.1 0.02 0.05 0.05 0.11 0.02 0.04 0.05 0.06 0.13 1.0 0.29 0.09 0.19 0.17
0.01 0.09 0.15 0.19 0.29 0.32 0.27 0.23 0.28 0.23 0.21 0.17 0.01 0.3 0.18 0.27 0.2 0.21 0.25 0.2 0.11 1.0 0.32 0.3 0.19 0.33
0.02 0.15 0.35 0.44 0.59 0.77 0.62 0.45 0.55 0.42 0.3 0.26 0.02 0.79 0.67 0.76 0.55 0.64 0.47 0.48 0.19 1.0 0.39 0.41 0.52 0.62
0.42 0.34 0.38 0.4 0.36 0.26 0.34 0.38 0.29 0.35 0.33 0.32 0.41 0.55 0.65 0.61 0.45 0.73 0.6 0.39 0.53 1.0 0.5 0.41 0.42 0.49
0.21 0.16 0.18 0.19 0.29 0.33 0.38 0.3 0.4 0.39 0.39 0.34 0.23 0.3 0.27 0.25 0.33 0.33 0.29 0.32 0.05 1.0 0.52 0.25 0.33 0.34
0.03 0.02 0.03 0.1 0.16 0.26 0.3 0.26 0.48 0.46 0.49 0.35 0.02 0.36 0.35 0.37 0.34 0.34 0.16 0.22 0.45 1.0 0.66 0.45 0.53 0.46
0.2 0.18 0.21 0.31 0.37 0.38 0.57 0.5 0.54 0.5 0.45 0.36 0.24 0.33 0.29 0.41 0.39 0.35 0.3 0.28 0.36 1.0 0.57 0.35 0.64 0.43
0.16 0.21 0.19 0.24 0.22 0.23 0.27 0.26 0.24 0.2 0.16 0.14 0.13 0.21 0.36 0.27 0.21 0.37 0.42 0.18 0.28 1.0 0.32 0.35 0.28 0.23
0.21 0.2 0.25 0.29 0.28 0.22 0.26 0.25 0.19 0.21 0.19 0.2 0.26 0.46 0.51 0.6 0.37 0.43 0.46 0.27 0.34 1.0 0.46 0.33 0.31 0.37
0.01 0.0 0.02 0.08 0.11 0.2 0.18 0.16 0.21 0.24 0.23 0.22 0.01 0.17 0.08 0.14 0.09 0.15 0.15 0.09 0.09 1.0 0.42 0.19 0.26 0.27
0.41 0.19 0.11 0.1 0.12 0.15 0.26 0.26 0.18 0.15 0.13 0.12 0.37 0.3 0.36 0.3 0.2 0.5 0.43 0.14 0.46 1.0 0.32 0.23 0.34 0.26
0.11 0.2 0.13 0.16 0.2 0.17 0.17 0.18 0.19 0.17 0.15 0.11 0.11 0.23 0.28 0.36 0.13 0.46 0.31 0.12 0.36 1.0 0.24 0.2 0.2 0.26
0.08 0.17 0.2 0.29 0.3 0.25 0.36 0.37 0.43 0.44 0.48 0.4 0.07 0.4 0.27 0.35 0.34 0.32 0.29 0.3 0.33 1.0 0.54 0.49 0.33 0.29
0.22 0.17 0.16 0.2 0.27 0.24 0.29 0.25 0.32 0.31 0.36 0.24 0.18 0.34 0.32 0.3 0.18 0.27 0.2 0.22 0.03 1.0 0.47 0.31 0.34 0.28
0.21 0.17 0.15 0.2 0.23 0.21 0.26 0.25 0.25 0.27 0.28 0.26 0.26 0.42 0.26 0.42 0.14 0.21 0.17 0.14 0.03 1.0 0.21 0.21 0.31 0.21
0.17 0.24 0.3 0.33 0.47 0.64 0.6 0.48 0.57 0.5 0.37 0.32 0.17 0.73 0.65 0.73 0.59 0.75 0.64 0.55 0.19 1.0 0.53 0.49 0.45 0.39
0.32 0.28 0.21 0.27 0.26 0.21 0.29 0.33 0.28 0.33 0.31 0.34 0.26 0.42 0.57 0.38 0.25 0.49 0.28 0.24 0.3 1.0 0.33 0.33 0.43 0.34
0.01 0.01 0.02 0.06 0.11 0.16 0.18 0.13 0.24 0.18 0.16 0.09 0.01 0.08 0.1 0.11 0.11 0.09 0.08 0.08 0.09 1.0 0.37 0.23 0.25 0.16
0.01 0.01 0.03 0.07 0.13 0.19 0.25 0.18 0.28 0.21 0.22 0.11 0.01 0.1 0.08 0.13 0.14 0.12 0.08 0.09 0.1 1.0 0.43 0.25 0.27 0.19
0.06 0.1 0.18 0.3 0.35 0.34 0.36 0.36 0.54 0.46 0.54 0.45 0.1 0.39 0.31 0.28 0.29 0.31 0.33 0.25 0.38 1.0 0.64 0.49 0.5 0.41
0.18 0.24 0.26 0.27 0.33 0.27 0.26 0.24 0.24 0.27 0.23 0.23 0.24 0.42 0.66 0.53 0.3 0.51 0.51 0.32 0.11 1.0 0.2 0.25 0.22 0.36
0.0 0.0 0.04 0.1 0.18 0.22 0.17 0.12 0.17 0.16 0.14 0.13 0.0 0.14 0.11 0.13 0.09 0.07 0.06 0.07 0.12 1.0 0.33 0.21 0.28 0.17
0.04 0.14 0.26 0.25 0.33 0.31 0.43 0.37 0.44 0.46 0.31 0.25 0.06 0.79 0.84 0.92 0.61 0.87 0.69 0.58 0.23 1.0 0.44 0.42 0.38 0.38
0.0 0.0 0.01 0.03 0.1 0.24 0.28 0.17 0.19 0.13 0.1 0.04 0.0 0.09 0.05 0.05 0.06 0.05 0.03 0.03 0.07 1.0 0.59 0.11 0.16 0.12
0.1 0.15 0.2 0.25 0.26 0.23 0.31 0.19 0.26 0.15 0.27 0.17 0.12 0.24 0.33 0.23 0.16 0.46 0.38 0.13 0.32 1.0 0.17 0.39 0.51 0.25
0.05 0.13 0.16 0.14 0.1 0.07 0.14 0.19 0.18 0.22 0.23 0.24 0.08 0.39 0.5 0.54 0.3 0.52 0.39 0.19 0.47 1.0 0.59 0.3 0.36 0.27
0.16 0.1 0.1 0.23 0.34 0.3 0.27 0.24 0.16 0.18 0.23 0.2 0.14 0.11 0.08 0.38 0.04 0.07 0.07 0.06 0.08 1.0 0.47 0.12 0.29 0.25
0.0 0.01 0.06 0.12 0.25 0.37 0.34 0.23 0.25 0.18 0.16 0.12 0.0 0.13 0.13 0.13 0.1 0.09 0.06 0.08 0.09 1.0 0.37 0.14 0.19 0.18
0.26 0.17 0.19 0.26 0.23 0.19 0.31 0.33 0.33 0.35 0.39 0.4 0.31 0.38 0.22 0.42 0.27 0.26 0.17 0.19 0.22 1.0 0.28 0.31 0.36 0.29
0.12 0.26 0.34 0.36 0.53 0.68 0.67 0.48 0.48 0.35 0.25 0.24 0.11 0.79 0.73 0.97 0.55 0.8 0.6 0.55 0.16 1.0 0.46 0.43 0.45 0.47
0.0 0.02 0.05 0.25 0.4 0.26 0.23 0.23 0.2 0.18 0.15 0.1 0.0 0.1 0.12 0.06 0.06 0.09 0.05 0.09 0.21 1.0 0.45 0.15 0.19 0.18
0.06 0.06 0.09 0.17 0.19 0.16 0.17 0.14 0.18 0.16 0.15 0.12 0.06 0.14 0.11 0.12 0.09 0.11 0.08 0.09 0.18 1.0 0.4 0.23 0.22 0.21
0.09 0.15 0.18 0.18 0.2 0.22 0.31 0.26 0.32 0.34 0.23 0.21 0.08 0.66 0.58 0.99 0.51 0.58 0.59 0.41 0.26 1.0 0.3 0.4 0.28 0.34
0.19 0.21 0.3 0.34 0.4 0.41 0.53 0.49 0.64 0.56 0.58 0.55 0.24 0.54 0.39 0.52 0.37 0.51 0.35 0.26 0.36 1.0 0.76 0.62 0.5 0.41
0.0 0.0 0.01 0.03 0.11 0.2 0.13 0.08 0.05 0.02 0.03 0.01 0.0 0.11 0.26 0.1 0.01 0.03 0.02 0.01 0.05 1.0 0.4 0.11 0.18 0.12
0.33 0.11 0.11 0.15 0.17 0.23 0.28 0.23 0.16 0.17 0.22 0.22 0.34 0.33 0.18 0.31 0.14 0.24 0.13 0.11 0.15 1.0 0.3 0.28 0.32 0.27
0.48 0.58 0.59 0.55 0.53 0.48 0.49 0.52 0.48 0.47 0.43 0.42 0.46 0.53 0.86 0.66 0.48 0.77 0.77 0.47 0.41 1.0 0.49 0.51 0.6 0.51
0.11 0.13 0.17 0.18 0.22 0.21 0.21 0.19 0.2 0.23 0.18 0.18 0.14 0.28 0.44 0.32 0.35 0.59 0.45 0.34 0.1 1.0 0.23 0.25 0.23 0.26
0.15 0.12 0.15 0.16 0.23 0.26 0.27 0.25 0.17 0.13 0.14 0.1 0.1 0.25 0.28 0.35 0.22 0.29 0.35 0.17 0.36 1.0 0.3 0.27 0.33 0.32
0.1 0.11 0.12 0.17 0.26 0.31 0.37 0.32 0.34 0.37 0.38 0.32 0.12 0.43 0.18 0.41 0.18 0.17 0.14 0.15 0.17 1.0 0.34 0.34 0.28 0.24
0.05 0.02 0.02 0.08 0.1 0.08 0.08 0.11 0.13 0.15 0.15 0.1 0.03 0.08 0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.02 0.13 1.0 0.26 0.38 0.3 0.17
0.08 0.13 0.21 0.28 0.32 0.44 0.47 0.4 0.44 0.29 0.21 0.15 0.06 0.52 0.46 0.66 0.43 0.58 0.48 0.35 0.25 1.0 0.42 0.29 0.37 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)