1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.15 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.17 0.07 0.03 0.06 0.03 0.19 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.1 0.16 0.3 0.29 0.14 1.0 0.08
0.09 0.0 0.13 0.13 0.11 0.34 0.24 0.14 0.27 0.18 0.18 0.14 0.0 0.29 0.5 0.23 0.08 0.23 0.32 0.11 0.1 0.0 0.25 0.25 1.0 0.11
0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.27 0.0 1.0 0.0
0.09 0.05 0.0 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.1 0.14 0.12 0.02 0.01 0.05 0.02 0.04 0.05 0.0 0.12 0.1 0.41 0.16 1.0 0.03
0.0 0.0 0.03 0.24 0.36 0.06 0.1 0.26 0.14 0.39 0.17 0.09 0.0 0.02 0.03 0.03 0.09 0.15 0.1 0.04 0.01 0.22 0.08 0.18 1.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.03 0.05 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.22 0.04 0.01 0.17 0.02 0.24 1.0 0.07
0.57 0.5 0.33 0.23 0.14 0.19 0.25 0.27 0.16 0.15 0.14 0.22 0.4 0.12 0.16 0.25 0.18 0.38 0.35 0.1 0.27 0.24 0.66 0.32 1.0 0.14
0.39 0.11 0.14 0.14 0.12 0.1 0.16 0.17 0.14 0.09 0.15 0.18 0.38 0.08 0.07 0.26 0.16 0.21 0.29 0.19 0.48 0.13 0.44 0.33 1.0 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.0 0.25 0.22 0.17 0.0 0.24 0.41 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.59 0.0 0.38 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.2 0.21 0.17 0.11 0.19 0.08 0.02 0.13 0.1 0.24 0.23 0.2 0.07 0.03 0.0 0.06 0.1 0.05 0.08 0.04 0.15 0.01 0.15 1.0 0.03
0.03 0.06 0.07 0.01 0.1 0.3 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.07 0.13 0.13 0.07 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 1.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.14 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.0 0.0 0.04 0.37 0.0 0.46 0.05 0.05 0.09 1.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.14 0.03 0.11 0.09 0.1 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.25 0.04 0.14 0.12 0.22 0.09 0.25 0.31 0.14 0.26 0.37 0.1 0.23 0.01 0.02 0.01 0.09 0.03 0.08 0.09 0.02 0.55 0.1 0.11 1.0 0.45
0.04 0.09 0.16 0.25 0.01 0.03 0.25 0.08 0.03 0.0 0.01 0.06 0.16 0.13 0.08 0.0 0.05 0.04 0.1 0.09 0.09 0.1 0.05 0.2 1.0 0.22
0.05 0.19 0.28 0.17 0.21 0.06 0.06 0.54 0.05 0.31 0.37 0.05 0.13 0.19 0.09 0.08 0.17 0.06 0.14 0.01 0.07 0.06 0.14 0.08 1.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.08 0.4 0.11 0.13 0.7 1.0 0.07
0.05 0.02 0.11 0.11 0.22 0.17 0.12 0.11 0.08 0.02 0.1 0.3 0.2 0.02 0.12 0.17 0.02 0.26 0.13 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.1
0.26 0.1 0.1 0.1 0.16 0.12 0.1 0.34 0.36 0.22 0.24 0.14 0.05 0.1 0.07 0.04 0.06 0.11 0.23 0.06 0.0 0.09 0.19 0.24 1.0 0.05
0.05 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.13 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19
0.06 0.04 0.09 0.06 0.08 0.03 0.04 0.02 0.03 0.07 0.0 0.08 0.02 0.06 0.05 0.03 0.03 0.03 0.14 0.08 0.05 0.2 0.08 0.05 1.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0
0.0 0.04 0.19 0.2 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.35 0.07 0.08 0.34 0.22 0.0 0.07 0.19 0.13 0.0 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.1 0.0 1.0 0.31
0.06 0.15 0.34 0.14 0.45 0.16 0.24 0.22 0.1 0.17 0.1 0.16 0.12 0.25 0.23 0.16 0.02 0.17 0.19 0.05 0.23 0.06 0.27 0.11 1.0 0.07
0.38 0.21 0.22 0.38 0.27 0.09 0.09 0.5 0.34 0.28 0.59 0.32 0.2 0.0 0.13 0.0 0.04 0.2 0.03 0.04 0.0 0.03 0.08 0.15 1.0 0.08
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.1 0.17 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.04 0.4 0.0 0.03 0.13 1.0 0.18
0.12 0.17 0.09 0.11 0.15 0.16 0.04 0.06 0.32 0.11 0.18 0.23 0.04 0.17 0.0 0.09 0.04 0.14 0.01 0.01 0.1 0.21 0.33 0.04 1.0 0.15
0.21 0.09 0.07 0.15 0.05 0.0 0.03 0.14 0.15 0.03 0.06 0.03 0.18 0.33 0.16 0.18 0.12 0.15 0.14 0.17 0.02 0.02 0.33 0.28 1.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.09 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.15
0.05 0.15 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 1.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.07 0.04 0.07 0.29 0.42 0.4 0.36 0.18 0.0 0.07 0.08 0.29 0.79 0.16 0.58 0.11 0.42 0.17 0.03 0.06 0.25 0.02 0.0 1.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.47 0.21 0.08 0.16 0.0 0.0 0.11 0.04 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0
0.08 0.01 0.02 0.05 0.07 0.04 0.0 0.12 0.15 0.11 0.2 0.13 0.04 0.0 0.05 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.12 0.08 0.51 0.03 1.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.05 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.03 0.29 0.53 0.11 1.0 0.11
0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.08 0.03 0.1 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.1 0.11 0.12 1.0 0.05
0.0 0.17 0.46 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.0 0.0 0.31 0.14 0.0 0.0 0.1 0.14 0.25 0.15 0.11 0.0 0.0 1.0 0.2
0.42 0.23 0.07 0.23 0.06 0.37 0.15 0.22 0.36 0.15 0.16 0.21 0.03 0.15 0.21 0.09 0.1 0.13 0.06 0.02 0.07 0.3 0.18 0.03 1.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.19
0.11 0.34 0.2 0.1 0.29 0.49 0.25 0.18 0.21 0.28 0.17 0.23 0.1 0.27 0.28 0.36 0.18 0.21 0.36 0.26 0.03 0.02 0.05 0.22 1.0 0.26
0.17 0.08 0.19 0.11 0.3 0.11 0.04 0.08 0.04 0.09 0.03 0.04 0.19 0.1 0.15 0.0 0.04 0.03 0.07 0.0 0.03 0.07 0.03 0.06 1.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.1 0.06 0.03 0.07 0.0 0.18 0.06 0.03 0.0 0.06 0.03 0.09 0.32 0.31 0.07 0.25 1.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.17 0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.17 0.2 0.07 0.1 0.11 0.15 0.25 0.15 0.2 0.13 0.24 0.49 0.37 0.04 0.04 0.08 0.03 0.16 0.02 0.04 0.02 0.27 0.11 0.02 1.0 0.25
0.2 0.02 0.03 0.1 0.11 0.02 0.01 0.13 0.11 0.19 0.14 0.15 0.04 0.03 0.03 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.05 0.1 1.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.1 0.0 0.0 0.08 0.0 0.42 0.0 0.18 0.08 0.0 0.19 0.12 0.36 0.5 0.58 0.31 0.49 0.68 0.74 0.04 0.0 0.06 0.66 1.0 0.0
0.62 0.19 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.15 0.29 0.21 0.62 0.04 0.03 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.32 0.01 0.02 0.05 1.0 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)