Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.46 0.31 0.0 0.0 0.28 0.0 0.1 0.51 0.19 0.08 0.17 0.09 0.56 0.08 0.0 0.0 0.0 0.38 0.24 0.31 0.48 0.89 0.85 0.42 2.99 0.25
0.24 0.0 0.34 0.34 0.28 0.86 0.61 0.35 0.69 0.46 0.47 0.35 0.0 0.75 1.27 0.58 0.21 0.59 0.83 0.29 0.25 0.0 0.63 0.63 2.56 0.28
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.27 0.0
0.24 0.13 0.0 0.28 0.3 0.0 0.0 0.0 0.2 0.21 0.27 0.37 0.33 0.06 0.04 0.15 0.04 0.1 0.14 0.0 0.34 0.28 1.1 0.43 2.7 0.08
0.0 0.0 0.04 0.39 0.58 0.1 0.16 0.42 0.23 0.63 0.28 0.14 0.0 0.04 0.04 0.05 0.14 0.25 0.16 0.07 0.02 0.36 0.12 0.3 1.63 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.09 0.09 0.18 0.27 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.16 0.72 0.13 0.04 0.57 0.07 0.81 3.33 0.25
2.35 2.07 1.38 0.94 0.59 0.78 1.03 1.1 0.67 0.62 0.58 0.91 1.64 0.51 0.68 1.03 0.73 1.55 1.46 0.42 1.13 1.01 2.74 1.3 4.13 0.56
1.18 0.35 0.43 0.42 0.36 0.29 0.49 0.53 0.42 0.27 0.45 0.54 1.16 0.26 0.22 0.8 0.48 0.65 0.9 0.57 1.47 0.41 1.33 1.0 3.06 1.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.05 0.05 0.04 0.0 0.05 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21 0.12 0.0 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.24 0.26 0.22 0.13 0.23 0.1 0.02 0.16 0.12 0.29 0.28 0.24 0.09 0.04 0.0 0.07 0.13 0.06 0.1 0.04 0.18 0.02 0.19 1.23 0.03
0.11 0.2 0.23 0.05 0.34 1.03 0.06 0.49 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.11 0.23 0.43 0.45 0.22 0.03 0.0 0.1 0.0 0.06 3.39 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.16 0.02 0.02 0.03 0.34 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.13 0.02 0.1 0.08 0.09 0.05 0.04 0.04 0.0 0.0 0.18 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.46 0.08 0.26 0.23 0.41 0.17 0.46 0.58 0.27 0.47 0.69 0.19 0.43 0.02 0.04 0.02 0.16 0.06 0.14 0.17 0.03 1.02 0.18 0.2 1.85 0.83
0.06 0.14 0.24 0.38 0.02 0.05 0.4 0.13 0.05 0.0 0.02 0.09 0.24 0.21 0.13 0.0 0.08 0.06 0.16 0.13 0.15 0.15 0.08 0.31 1.56 0.35
0.07 0.27 0.4 0.24 0.3 0.08 0.08 0.78 0.07 0.44 0.53 0.07 0.19 0.28 0.13 0.11 0.25 0.08 0.21 0.02 0.1 0.09 0.2 0.11 1.45 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.18 0.05 0.06 0.31 0.45 0.03
0.12 0.05 0.26 0.25 0.51 0.39 0.27 0.26 0.18 0.04 0.23 0.7 0.47 0.06 0.29 0.39 0.04 0.6 0.31 0.5 0.0 0.03 0.0 0.0 2.33 0.23
0.89 0.34 0.34 0.33 0.54 0.4 0.34 1.16 1.23 0.74 0.83 0.49 0.17 0.33 0.24 0.13 0.21 0.39 0.78 0.21 0.0 0.31 0.64 0.82 3.41 0.18
0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.06
0.09 0.06 0.12 0.09 0.12 0.04 0.06 0.02 0.05 0.1 0.0 0.12 0.03 0.08 0.08 0.04 0.05 0.04 0.2 0.11 0.07 0.29 0.12 0.07 1.44 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0
0.0 0.05 0.22 0.23 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0
0.12 0.02 0.03 0.11 0.07 0.0 0.02 0.06 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.34 0.1
0.09 0.22 0.5 0.21 0.67 0.25 0.35 0.33 0.15 0.25 0.15 0.23 0.17 0.37 0.35 0.24 0.03 0.25 0.28 0.07 0.34 0.09 0.4 0.16 1.5 0.1
0.22 0.12 0.13 0.22 0.16 0.05 0.05 0.29 0.2 0.16 0.34 0.19 0.12 0.0 0.08 0.0 0.03 0.12 0.02 0.02 0.0 0.02 0.05 0.09 0.58 0.04
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.66 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.04 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.17 0.0 0.01 0.05 0.42 0.08
0.41 0.6 0.32 0.37 0.52 0.57 0.16 0.22 1.11 0.38 0.63 0.79 0.15 0.61 0.0 0.3 0.14 0.5 0.05 0.05 0.33 0.73 1.15 0.14 3.5 0.51
0.16 0.07 0.05 0.11 0.04 0.0 0.03 0.1 0.11 0.02 0.04 0.02 0.14 0.24 0.12 0.13 0.09 0.11 0.11 0.13 0.01 0.02 0.24 0.21 0.74 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.79 0.12
0.02 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.51 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.02 0.04 0.18 0.26 0.24 0.22 0.11 0.0 0.04 0.05 0.18 0.49 0.1 0.36 0.07 0.26 0.1 0.02 0.04 0.15 0.01 0.0 0.62 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.28 0.12 0.05 0.09 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.58 0.0
0.1 0.02 0.03 0.07 0.09 0.05 0.0 0.16 0.2 0.14 0.26 0.16 0.05 0.0 0.06 0.02 0.0 0.04 0.0 0.03 0.15 0.1 0.66 0.03 1.29 0.16
0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.26 0.48 0.1 0.9 0.1
0.07 0.0 0.0 0.14 0.22 0.06 0.28 0.12 0.35 0.0 0.19 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.21 0.34 0.4 0.43 3.52 0.18
0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.15 0.03
1.14 0.63 0.19 0.62 0.17 1.01 0.4 0.6 0.98 0.41 0.43 0.56 0.08 0.42 0.56 0.25 0.27 0.35 0.17 0.07 0.18 0.82 0.49 0.08 2.72 0.13
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.81 0.15
0.17 0.55 0.33 0.16 0.47 0.78 0.41 0.29 0.33 0.45 0.28 0.38 0.16 0.43 0.45 0.58 0.29 0.34 0.58 0.42 0.04 0.03 0.08 0.35 1.6 0.42
0.2 0.1 0.23 0.13 0.36 0.13 0.04 0.09 0.04 0.1 0.04 0.05 0.23 0.12 0.18 0.0 0.04 0.03 0.09 0.0 0.03 0.08 0.04 0.07 1.2 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.04 0.02 0.05 0.0 0.12 0.04 0.02 0.0 0.04 0.02 0.06 0.21 0.2 0.04 0.17 0.66 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0
0.16 0.18 0.07 0.09 0.1 0.14 0.23 0.13 0.18 0.12 0.22 0.44 0.34 0.03 0.04 0.07 0.03 0.15 0.02 0.03 0.02 0.24 0.1 0.02 0.92 0.23
0.61 0.07 0.09 0.31 0.32 0.05 0.03 0.38 0.32 0.58 0.41 0.44 0.11 0.09 0.08 0.02 0.0 0.1 0.02 0.02 0.06 0.02 0.14 0.3 2.96 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.04 0.02 0.0 0.05 0.03 0.09 0.12 0.14 0.08 0.12 0.17 0.18 0.01 0.0 0.01 0.16 0.25 0.0
0.88 0.28 0.28 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.05 0.21 0.4 0.3 0.88 0.06 0.04 0.04 0.0 0.03 0.03 0.03 0.46 0.02 0.03 0.07 1.41 0.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)