1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.36 0.34 0.34 0.23 0.16 0.38 0.5 0.32 0.5 0.73 0.67 0.87 0.57 0.34 0.22 0.37 0.71 0.53 0.43 0.17 0.21 0.73 0.53 0.84 0.61
0.6 0.92 0.55 0.27 0.07 0.03 0.14 0.32 0.48 0.48 0.82 0.95 0.82 0.12 0.11 0.1 0.2 0.32 0.17 0.22 0.04 0.15 0.81 0.61 1.0 0.47
0.91 1.0 0.66 0.39 0.25 0.28 0.46 0.59 0.61 0.63 0.68 0.69 0.78 0.47 0.39 0.36 0.46 0.41 0.32 0.43 0.25 0.26 0.8 0.56 0.7 0.58
0.45 0.29 0.16 0.32 0.19 0.33 0.31 0.33 0.29 0.25 0.31 0.3 0.25 0.22 0.15 0.26 0.12 0.45 0.42 0.15 0.06 0.28 0.76 0.32 1.0 0.43
1.0 0.87 0.53 0.31 0.17 0.17 0.4 0.59 0.51 0.55 0.67 0.79 0.86 0.3 0.28 0.27 0.42 0.45 0.31 0.39 0.12 0.43 0.55 0.49 1.0 0.55
0.55 0.38 0.36 0.37 0.38 0.4 0.38 0.37 0.39 0.46 0.57 0.56 0.68 0.45 0.39 0.44 0.32 0.5 0.37 0.28 0.03 0.17 0.42 0.62 1.0 0.55
0.93 1.0 0.55 0.3 0.23 0.31 0.52 0.63 0.68 0.71 0.77 0.8 0.77 0.43 0.19 0.26 0.47 0.5 0.31 0.47 0.1 0.43 0.42 0.62 0.58 0.42
0.88 0.99 0.51 0.29 0.22 0.37 0.52 0.59 0.68 0.65 0.7 0.8 0.81 0.42 0.23 0.32 0.47 0.43 0.37 0.42 0.25 0.69 0.56 1.0 0.96 0.6
0.92 0.95 0.58 0.36 0.29 0.46 0.55 0.66 0.79 0.76 0.87 0.95 1.0 0.41 0.23 0.36 0.43 0.38 0.32 0.38 0.27 0.51 0.6 0.75 0.84 0.51
0.64 0.36 0.35 0.41 0.42 0.41 0.49 0.47 0.5 0.71 0.85 0.84 0.62 0.5 0.38 0.44 0.28 0.62 0.44 0.38 0.12 0.49 0.6 0.63 1.0 0.62
0.9 1.0 0.52 0.28 0.22 0.37 0.49 0.52 0.61 0.69 0.72 0.91 0.82 0.51 0.34 0.33 0.64 0.46 0.5 0.58 0.15 0.38 0.56 0.92 0.52 0.6
0.32 0.06 0.07 0.11 0.24 0.31 0.45 0.42 0.51 0.6 0.62 0.57 0.48 0.22 0.22 0.17 0.28 0.41 0.28 0.37 0.09 0.07 0.61 0.78 1.0 0.55
0.47 0.06 0.01 0.0 0.1 0.16 0.42 0.35 0.32 0.23 0.24 0.1 0.34 0.07 0.03 0.0 0.07 0.22 0.1 0.09 0.09 0.04 0.74 0.53 1.0 0.31
0.81 0.83 0.51 0.38 0.23 0.35 0.41 0.56 0.62 0.54 0.65 0.81 0.77 0.15 0.09 0.1 0.16 0.32 0.16 0.2 0.25 0.63 0.85 1.0 0.95 0.46
0.61 0.31 0.2 0.22 0.3 0.3 0.44 0.53 0.47 0.41 0.47 0.4 0.4 0.38 0.27 0.29 0.33 0.5 0.38 0.32 0.07 0.3 0.84 0.6 1.0 0.59
0.59 0.53 0.43 0.34 0.26 0.24 0.53 0.54 0.49 0.58 0.7 0.84 0.88 0.67 0.53 0.56 0.6 0.82 0.72 0.54 0.14 0.52 0.85 0.82 1.0 0.73
0.38 0.21 0.09 0.13 0.13 0.23 0.4 0.45 0.47 0.57 0.51 0.42 0.41 0.13 0.16 0.18 0.15 0.43 0.28 0.2 0.07 0.21 0.68 0.44 1.0 0.56
0.97 1.0 0.62 0.37 0.31 0.43 0.58 0.66 0.74 0.75 0.81 0.85 0.98 0.49 0.26 0.44 0.45 0.43 0.32 0.42 0.21 0.6 0.49 0.54 0.72 0.43
0.39 0.06 0.03 0.1 0.08 0.08 0.25 0.37 0.33 0.32 0.34 0.23 0.27 0.06 0.1 0.08 0.11 0.37 0.14 0.12 0.06 0.16 0.95 0.35 1.0 0.26
0.95 1.0 0.57 0.34 0.28 0.47 0.59 0.67 0.77 0.68 0.73 0.82 0.93 0.5 0.25 0.41 0.44 0.32 0.32 0.39 0.19 0.39 0.74 0.63 0.67 0.47
0.86 0.31 0.22 0.23 0.23 0.36 0.57 0.68 0.61 0.72 0.74 0.66 0.89 0.65 0.43 0.42 0.3 0.66 0.58 0.42 0.17 0.29 1.0 0.81 0.78 0.93
0.72 1.0 0.68 0.43 0.28 0.22 0.29 0.39 0.41 0.44 0.55 0.68 0.54 0.23 0.26 0.12 0.31 0.41 0.31 0.41 0.23 0.36 0.67 0.53 0.48 0.35
0.82 0.98 0.6 0.36 0.16 0.14 0.31 0.5 0.57 0.65 0.84 0.85 0.63 0.32 0.35 0.19 0.3 0.39 0.31 0.34 0.14 0.32 1.0 0.74 0.83 0.53
0.7 1.0 0.78 0.64 0.52 0.34 0.29 0.38 0.47 0.54 0.7 0.83 0.6 0.32 0.29 0.23 0.4 0.37 0.34 0.56 0.33 0.51 0.91 0.97 0.52 0.53
0.28 0.16 0.09 0.13 0.08 0.09 0.27 0.44 0.4 0.46 0.46 0.42 0.43 0.46 0.26 0.35 0.33 0.45 0.39 0.3 0.06 0.2 0.4 0.41 1.0 0.49
0.82 1.0 0.54 0.29 0.2 0.25 0.41 0.47 0.5 0.53 0.53 0.58 0.73 0.32 0.22 0.27 0.46 0.48 0.32 0.43 0.08 0.49 0.27 0.43 0.62 0.38
0.57 0.16 0.08 0.05 0.05 0.08 0.33 0.43 0.37 0.52 0.56 0.51 0.42 0.24 0.16 0.16 0.18 0.5 0.35 0.22 0.24 0.12 0.63 0.83 1.0 0.67
0.7 0.22 0.07 0.06 0.05 0.07 0.42 0.53 0.36 0.6 0.61 0.53 0.55 0.39 0.37 0.3 0.34 0.74 0.63 0.47 0.23 0.25 0.7 1.0 0.58 0.74
0.29 0.26 0.15 0.28 0.22 0.17 0.33 0.47 0.57 0.59 0.66 0.49 0.3 0.34 0.32 0.4 0.3 0.52 0.45 0.3 0.07 0.23 0.76 0.84 1.0 0.53
1.0 0.56 0.31 0.17 0.14 0.25 0.53 0.67 0.53 0.68 0.73 0.71 0.79 0.25 0.07 0.11 0.27 0.47 0.31 0.47 0.16 0.13 0.78 0.69 0.96 0.74
0.76 1.0 0.53 0.3 0.22 0.31 0.41 0.47 0.52 0.44 0.45 0.56 0.7 0.3 0.19 0.3 0.42 0.45 0.38 0.34 0.26 0.58 0.35 0.65 0.88 0.53
0.38 0.45 0.38 0.36 0.37 0.42 0.52 0.5 0.73 0.73 0.73 0.67 0.42 0.38 0.37 0.49 0.38 0.64 0.53 0.44 0.3 0.11 0.65 0.88 1.0 0.72
0.63 0.83 0.54 0.34 0.25 0.22 0.36 0.44 0.49 0.53 0.63 0.73 0.49 0.23 0.28 0.22 0.4 0.42 0.4 0.4 0.25 0.37 1.0 0.66 0.66 0.28
0.4 0.14 0.13 0.17 0.11 0.14 0.43 0.4 0.79 0.71 0.82 0.47 0.35 0.32 0.25 0.14 0.18 0.35 0.19 0.18 0.05 0.04 1.0 0.8 0.97 0.38
0.88 1.0 0.53 0.31 0.27 0.41 0.51 0.58 0.61 0.59 0.62 0.69 0.78 0.48 0.22 0.29 0.48 0.42 0.32 0.37 0.19 0.67 0.66 0.7 0.9 0.5
0.84 0.37 0.19 0.16 0.18 0.19 0.4 0.5 0.46 0.54 0.56 0.68 0.76 0.29 0.17 0.19 0.3 0.38 0.26 0.36 0.15 0.18 0.73 0.49 1.0 0.65
0.89 1.0 0.55 0.3 0.24 0.36 0.53 0.58 0.63 0.62 0.64 0.72 0.79 0.54 0.26 0.36 0.58 0.43 0.41 0.49 0.09 0.34 0.25 0.51 0.62 0.42
0.81 0.59 0.6 0.68 0.78 0.6 0.79 0.8 0.72 0.8 0.85 0.91 1.0 0.68 0.5 0.62 0.41 0.63 0.55 0.51 0.17 0.67 0.72 0.79 0.96 0.97
0.93 0.68 0.63 0.69 0.63 0.4 0.6 0.69 0.58 0.83 0.93 1.0 0.88 0.88 0.38 0.57 0.54 0.76 0.63 0.71 0.31 0.49 0.75 0.58 0.99 0.83
0.84 0.94 0.76 0.58 0.39 0.32 0.34 0.42 0.44 0.5 0.66 0.8 1.0 0.3 0.31 0.33 0.31 0.33 0.32 0.32 0.06 0.18 0.95 0.55 0.83 0.38
1.0 0.97 0.52 0.3 0.19 0.26 0.33 0.38 0.48 0.58 0.72 0.96 0.86 0.4 0.16 0.35 0.43 0.34 0.29 0.37 0.1 0.41 0.35 0.66 0.68 0.52
1.0 0.79 0.45 0.18 0.2 0.43 0.46 0.44 0.33 0.56 0.68 0.63 0.87 0.36 0.15 0.2 0.27 0.24 0.25 0.27 0.05 0.01 0.35 0.3 0.65 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)