Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Crozier	Root
Cba_g00167	0.0	0.0	0.2	0.13	0.23	1.0	0.04
Cba_g00210	0.13	0.14	0.11	0.08	0.07	1.0	0.12
Cba_g00291	0.28	0.26	0.18	0.22	0.26	1.0	0.2
Cba_g00548	0.01	0.01	0.04	0.0	0.01	1.0	0.01
Cba_g00668	0.19	0.23	0.07	0.07	0.04	1.0	0.13
Cba_g01040	0.59	0.53	0.4	0.43	0.43	1.0	0.35
Cba_g01170 (HEC3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g01446	0.42	0.3	0.11	0.2	0.15	1.0	0.2
Cba_g01686	0.35	0.23	0.18	0.22	0.2	1.0	0.12
Cba_g01954 (HEMA1)	0.41	0.2	0.23	0.19	0.19	1.0	0.09
Cba_g02214	0.43	0.3	0.06	0.12	0.17	1.0	0.13
Cba_g02272	0.3	0.1	0.05	0.07	0.06	1.0	0.1
Cba_g02583 (bHLH121)	0.48	0.47	0.38	0.38	0.36	1.0	0.31
Cba_g02585 (EID1)	0.46	0.46	0.42	0.43	0.46	1.0	0.3
Cba_g02651 (COI1)	0.66	0.48	0.31	0.29	0.37	1.0	0.27
Cba_g02867 (WRKY43)	0.02	0.0	0.02	0.0	0.1	1.0	0.02
Cba_g02950	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g03017 (PYL2)	0.27	0.31	0.1	0.12	0.07	1.0	0.04
Cba_g03878	0.32	0.04	0.01	0.03	0.02	1.0	0.0
Cba_g04153	0.0	0.0	0.04	0.03	0.02	1.0	0.0
Cba_g04319	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g04323	0.08	0.04	0.04	0.03	0.04	1.0	0.12
Cba_g04406	0.3	0.34	0.1	0.15	0.17	1.0	0.04
Cba_g04601	0.22	0.11	0.19	0.18	0.2	1.0	0.23
Cba_g04837	0.05	0.0	0.03	0.0	0.06	1.0	0.16
Cba_g04882	0.2	0.18	0.13	0.14	0.33	1.0	0.25
Cba_g05397	0.13	0.13	0.1	0.05	0.02	1.0	0.07
Cba_g05587	0.26	0.32	0.19	0.22	0.14	1.0	0.15
Cba_g06016	0.02	0.03	0.03	0.01	0.0	1.0	0.16
Cba_g06136	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	1.0	0.0
Cba_g06193	0.0	0.02	0.02	0.03	0.04	1.0	0.03
Cba_g06470 (CDF2)	0.29	0.2	0.21	0.17	0.36	1.0	0.15
Cba_g06756	0.33	0.16	0.04	0.04	0.03	1.0	0.11
Cba_g07391	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g07681 (MGP)	0.42	0.36	0.35	0.4	0.58	1.0	0.27
Cba_g07703 (DSO)	0.27	0.18	0.01	0.02	0.0	1.0	0.0
Cba_g07886	0.22	0.1	0.04	0.06	0.0	1.0	0.11
Cba_g07892 (SAG29)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0
Cba_g08088	0.29	0.0	0.0	0.08	0.05	1.0	0.0
Cba_g08294	0.2	0.31	0.02	0.02	0.11	1.0	0.08
Cba_g08324	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02
Cba_g08632	0.03	0.05	0.04	0.05	0.08	1.0	0.19
Cba_g08800	0.23	0.01	0.04	0.06	0.06	1.0	0.21
Cba_g08860	0.17	0.12	0.08	0.07	0.04	1.0	0.05
Cba_g09064	0.07	0.04	0.0	0.13	0.06	1.0	0.12
Cba_g09621	0.01	0.0	0.09	0.01	0.21	1.0	0.04
Cba_g10138 (LOG1)	0.15	0.06	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g10144 (EXP2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g10876	0.39	0.19	0.0	0.07	0.04	1.0	0.12
Cba_g10974	0.04	0.01	0.0	0.08	0.03	1.0	0.0
Cba_g11032 (MGT6)	0.31	0.29	0.24	0.21	0.26	1.0	0.19
Cba_g11060	0.07	0.17	0.0	0.06	0.0	1.0	0.0
Cba_g11274	0.03	0.11	0.02	0.01	0.06	1.0	0.22
Cba_g11535	0.12	0.04	0.0	0.04	0.02	1.0	0.06
Cba_g11573	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g11648	0.14	0.17	0.03	0.09	0.02	1.0	0.04
Cba_g11715 (HAC1)	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	1.0	0.07
Cba_g11887	0.45	0.39	0.27	0.21	0.32	1.0	0.21
Cba_g12626 (ZHD2)	0.2	0.15	0.01	0.03	0.0	1.0	0.0
Cba_g12637	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0
Cba_g12896	0.25	0.17	0.04	0.07	0.0	1.0	0.11
Cba_g13192	0.36	0.44	0.26	0.26	0.24	1.0	0.25
Cba_g13360	0.16	0.21	0.09	0.13	0.05	1.0	0.14
Cba_g13452	0.48	0.39	0.31	0.3	0.32	1.0	0.19
Cba_g14076	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g14268	0.5	0.29	0.06	0.2	0.03	1.0	0.02
Cba_g14336	0.31	0.22	0.04	0.04	0.12	1.0	0.15
Cba_g14359	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	1.0	0.02
Cba_g14682 (XTH5)	0.0	0.0	0.02	0.0	0.19	1.0	0.01
Cba_g15449	0.02	0.13	0.04	0.05	0.04	1.0	0.3
Cba_g15534 (ATNTT2)	0.01	0.0	0.04	0.02	0.05	1.0	0.1
Cba_g15698 (KNAT4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g16448 (ATSIK)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.16
Cba_g16575	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Cba_g16614	0.56	0.55	0.43	0.44	0.45	1.0	0.34
Cba_g17001 (FRO6)	0.34	0.3	0.0	0.01	0.0	1.0	0.08
Cba_g17191	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01
Cba_g17563	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	1.0	0.02
Cba_g19660	0.43	0.35	0.03	0.14	0.1	1.0	0.19
Cba_g21004	0.05	0.03	0.09	0.05	0.16	1.0	0.03
Cba_g22800 (MYB86)	0.31	0.26	0.09	0.15	0.08	1.0	0.1
Cba_g25090 (GAE1)	0.29	0.06	0.05	0.05	0.07	1.0	0.08
Cba_g28922	0.53	0.3	0.25	0.2	0.32	1.0	0.18
Cba_g30216	0.08	0.08	0.13	0.18	0.12	1.0	0.22
Cba_g30308	0.39	0.28	0.13	0.18	0.13	1.0	0.14
Cba_g30643	0.22	0.06	0.17	0.16	0.14	1.0	0.23
Cba_g30735	0.01	0.02	0.0	0.02	0.0	1.0	0.18
Cba_g32674	0.21	0.25	0.28	0.22	0.23	1.0	0.28
Cba_g32724	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.03
Cba_g32978	0.58	0.5	0.36	0.4	0.38	1.0	0.43
Cba_g33238	0.24	0.18	0.11	0.08	0.2	1.0	0.1
Cba_g34280	0.38	0.31	0.35	0.28	0.28	1.0	0.15
Cba_g34595 (STI)	0.43	0.33	0.18	0.18	0.25	1.0	0.41
Cba_g37127	0.28	0.28	0.27	0.22	0.25	1.0	0.19
Cba_g37316	0.39	0.31	0.14	0.18	0.14	1.0	0.18
Cba_g37385	0.02	0.0	0.06	0.03	0.24	1.0	0.03
Cba_g37509 (MRH1)	0.49	0.43	0.38	0.34	0.39	1.0	0.4
Cba_g38715	0.0	0.0	0.09	0.0	0.1	1.0	0.0
Cba_g41340	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02
Cba_g48157 (CRK8)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	1.0	0.06
Cba_g58157	0.3	0.17	0.05	0.08	0.05	1.0	0.04
Cba_g62456	0.36	0.22	0.07	0.12	0.1	1.0	0.07
Cba_g67183	0.3	0.31	0.14	0.12	0.04	1.0	0.08
Cba_g68061	0.22	0.25	0.08	0.09	0.3	1.0	0.14
Cba_g68315	0.25	0.26	0.01	0.03	0.01	1.0	0.06
Cba_g69088 (OSB2)	0.18	0.27	0.36	0.33	0.42	1.0	0.16
Cba_g73370	0.05	0.01	0.07	0.06	0.07	1.0	0.05
Cba_g74781	0.22	0.2	0.18	0.21	0.1	1.0	0.06
Cba_g76044 (UBC22)	0.33	0.35	0.13	0.19	0.14	1.0	0.17
Cba_g76940	0.24	0.25	0.21	0.26	0.27	1.0	0.25
Cba_g77047	0.4	0.05	0.14	0.06	0.12	1.0	0.03
Cba_g77614	0.01	0.02	0.01	0.04	0.0	1.0	0.0
Cba_g77861	0.04	0.0	0.14	0.08	0.25	1.0	0.04
Cba_g78978	0.09	0.0	0.03	0.02	0.08	1.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)