Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.0 0.0 0.68 0.45 0.79 3.41 0.13
1.75 1.97 1.51 1.14 0.99 13.69 1.64
2.65 2.46 1.72 2.09 2.42 9.46 1.89
0.05 0.1 0.37 0.0 0.08 8.54 0.1
0.59 0.72 0.23 0.23 0.12 3.14 0.41
13.61 12.19 9.21 10.0 10.08 23.2 8.09
Cba_g01170 (HEC3)
0.02 0.07 0.0 0.02 0.01 34.05 0.03
89.83 63.99 23.86 42.07 32.85 214.24 42.84
5.43 3.56 2.78 3.34 3.05 15.52 1.85
Cba_g01954 (HEMA1)
5.87 2.88 3.25 2.78 2.74 14.24 1.34
2.94 2.04 0.42 0.79 1.15 6.76 0.87
1.21 0.39 0.21 0.26 0.22 4.0 0.4
Cba_g02583 (bHLH121)
3.54 3.47 2.83 2.78 2.68 7.41 2.28
Cba_g02585 (EID1)
5.6 5.54 5.0 5.23 5.57 12.05 3.61
Cba_g02651 (COI1)
12.5 9.07 5.8 5.55 6.89 18.84 5.14
Cba_g02867 (WRKY43)
0.04 0.0 0.04 0.0 0.24 2.53 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.99 0.0
Cba_g03017 (PYL2)
2.49 2.94 0.93 1.11 0.63 9.38 0.34
2.22 0.31 0.05 0.19 0.15 6.99 0.03
0.0 0.0 0.21 0.14 0.09 4.76 0.0
0.53 0.07 0.0 0.0 0.0 62.24 0.22
11.22 6.23 6.22 3.69 5.14 140.57 17.18
2.25 2.51 0.74 1.15 1.3 7.46 0.31
2.65 1.39 2.32 2.18 2.37 12.13 2.82
0.22 0.0 0.11 0.0 0.23 4.14 0.67
0.58 0.5 0.36 0.4 0.93 2.84 0.72
0.36 0.36 0.27 0.13 0.06 2.75 0.2
2.84 3.5 2.06 2.34 1.56 10.81 1.63
0.19 0.28 0.29 0.08 0.0 8.56 1.36
0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 5.41 0.0
0.0 0.11 0.1 0.19 0.26 6.28 0.17
Cba_g06470 (CDF2)
2.0 1.35 1.42 1.18 2.48 6.86 1.0
3.07 1.47 0.39 0.39 0.27 9.2 0.98
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 10.22 0.02
Cba_g07681 (MGP)
2.51 2.14 2.12 2.38 3.47 5.98 1.59
Cba_g07703 (DSO)
1.09 0.71 0.03 0.06 0.02 4.0 0.01
0.46 0.21 0.08 0.12 0.0 2.07 0.23
Cba_g07892 (SAG29)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.1 0.0
0.59 0.0 0.0 0.16 0.09 2.02 0.0
0.74 1.17 0.09 0.07 0.4 3.71 0.31
0.08 0.01 0.0 0.05 0.1 30.2 0.48
1.7 2.78 2.27 2.65 4.42 52.58 9.89
3.53 0.2 0.58 0.91 0.96 15.09 3.2
1.17 0.8 0.51 0.47 0.24 6.74 0.35
0.14 0.07 0.0 0.24 0.12 1.88 0.22
0.22 0.0 2.0 0.34 4.91 23.19 0.86
Cba_g10138 (LOG1)
5.02 2.19 0.0 0.01 0.02 33.79 0.04
Cba_g10144 (EXP2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 27.82 0.0
1.53 0.75 0.0 0.28 0.14 3.91 0.47
0.24 0.08 0.0 0.54 0.18 6.48 0.0
Cba_g11032 (MGT6)
13.25 12.36 10.3 9.16 11.16 42.89 8.09
0.75 1.74 0.0 0.66 0.0 10.23 0.0
0.06 0.2 0.04 0.02 0.11 1.89 0.41
0.24 0.09 0.0 0.07 0.04 2.05 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.87 0.0
2.21 2.57 0.52 1.39 0.34 15.3 0.62
Cba_g11715 (HAC1)
0.1 0.09 0.14 0.23 0.16 4.57 0.3
11.88 10.35 7.16 5.66 8.48 26.4 5.64
Cba_g12626 (ZHD2)
7.82 5.66 0.44 1.33 0.11 38.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 2.41 0.0
0.49 0.33 0.08 0.13 0.0 1.96 0.22
8.57 10.46 6.35 6.19 5.86 24.04 6.0
2.32 3.13 1.36 1.96 0.7 14.62 2.06
40.15 32.44 25.56 24.93 26.78 83.62 15.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.03 0.0
5.65 3.24 0.62 2.31 0.34 11.27 0.19
9.98 6.93 1.14 1.28 3.71 31.81 4.61
0.04 0.11 0.0 0.03 0.06 5.24 0.11
Cba_g14682 (XTH5)
0.03 0.13 0.94 0.06 9.86 50.96 0.28
0.78 5.02 1.38 2.03 1.49 37.74 11.17
Cba_g15534 (ATNTT2)
0.12 0.08 0.57 0.25 0.78 15.47 1.55
Cba_g15698 (KNAT4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.55 0.0
Cba_g16448 (ATSIK)
0.05 0.01 0.05 0.2 0.1 16.22 2.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26.65 0.0
32.64 32.36 25.07 25.67 26.09 58.42 20.06
Cba_g17001 (FRO6)
1.05 0.93 0.0 0.04 0.0 3.11 0.25
0.1 0.08 0.05 0.07 0.05 14.17 0.09
0.16 0.22 0.0 0.0 0.33 23.26 0.42
2.55 2.09 0.18 0.82 0.59 5.96 1.13
0.75 0.41 1.25 0.75 2.23 14.34 0.49
Cba_g22800 (MYB86)
1.48 1.24 0.45 0.71 0.4 4.84 0.47
Cba_g25090 (GAE1)
2.02 0.44 0.33 0.32 0.45 6.85 0.53
7.09 4.05 3.32 2.7 4.32 13.36 2.35
1.76 1.81 2.91 4.06 2.81 22.94 4.94
45.02 31.61 15.0 20.33 15.22 114.89 15.93
2.59 0.67 2.0 1.87 1.58 11.59 2.65
46.27 61.75 11.68 52.09 8.54 3329.91 588.49
37.01 44.46 49.6 38.09 40.15 175.24 49.86
0.18 0.45 0.82 0.23 0.48 82.55 2.68
52.85 44.9 32.97 35.8 34.52 90.61 39.41
0.82 0.62 0.37 0.29 0.69 3.44 0.35
13.69 11.31 12.7 10.12 10.19 35.98 5.42
Cba_g34595 (STI)
5.67 4.4 2.34 2.38 3.24 13.22 5.39
3.33 3.34 3.15 2.61 2.97 11.86 2.23
5.15 4.0 1.89 2.35 1.83 13.1 2.42
0.44 0.05 1.31 0.66 5.14 20.98 0.73
Cba_g37509 (MRH1)
11.0 9.55 8.56 7.72 8.75 22.45 9.02
0.0 0.0 0.23 0.0 0.24 2.47 0.0
0.17 0.13 0.04 0.0 0.51 110.63 2.53
Cba_g48157 (CRK8)
0.03 0.0 0.02 0.08 0.17 5.66 0.32
5.96 3.41 1.06 1.52 0.96 20.17 0.86
17.71 10.72 3.26 5.94 4.77 49.13 3.67
1.6 1.65 0.73 0.65 0.2 5.27 0.44
0.96 1.12 0.34 0.41 1.33 4.47 0.63
0.47 0.48 0.01 0.06 0.02 1.87 0.11
Cba_g69088 (OSB2)
0.79 1.21 1.62 1.49 1.9 4.51 0.74
0.61 0.11 0.81 0.74 0.85 11.74 0.62
8.12 7.48 6.45 7.66 3.86 36.83 2.07
Cba_g76044 (UBC22)
5.82 6.31 2.33 3.41 2.54 17.86 2.96
1.26 1.33 1.09 1.37 1.43 5.27 1.32
4.66 0.59 1.64 0.74 1.44 11.73 0.41
0.08 0.23 0.1 0.42 0.02 9.3 0.0
0.3 0.0 1.04 0.61 1.9 7.61 0.31
0.38 0.0 0.14 0.09 0.32 4.29 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)