Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.03 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.18
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g00886 (CYCD1;1)
0.01 0.01 0.02 0.06 0.02 1.0 0.2
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g02610 (LAC11)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07
Cba_g02660 (HMG1)
0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 1.0 0.13
0.07 0.03 0.01 0.03 0.04 1.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
Cba_g03039 (IBH1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.0 0.06 0.05 0.02 1.0 0.01
0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.03
Cba_g03164 (CHS)
0.01 0.04 0.02 0.04 0.01 1.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g03520 (GASA3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0
Cba_g04033 (PAL4)
0.0 0.03 0.01 0.03 0.01 1.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 1.0 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.01
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
Cba_g05609 (AVP1)
0.01 0.05 0.0 0.01 0.01 1.0 0.18
Cba_g05722 (TBL25)
0.03 0.01 0.04 0.03 0.04 1.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04
Cba_g06394 (FMA)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0
0.01 0.0 0.05 0.05 0.01 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 1.0 0.04
0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 1.0 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.07
Cba_g07486 (MRP10)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.01
0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 1.0 0.1
0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 1.0 0.05
0.01 0.0 0.04 0.03 0.04 1.0 0.03
Cba_g08025 (NUDT20)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.01
0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g08173 (UGT85A5)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04
0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.04
0.0 0.0 0.06 0.04 0.06 1.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g09346 (EXP15)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07
0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0 0.0
Cba_g09705 (PCNA1)
0.02 0.02 0.06 0.05 0.07 1.0 0.04
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g09785 (UCC1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03
0.04 0.04 0.01 0.01 0.0 1.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01
Cba_g10347 (XTH8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.04 0.04 0.0 0.01 0.0 1.0 0.04
0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01
0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.0
Cba_g11025 (HCT)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 1.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
Cba_g12271 (PMI1)
0.08 0.05 0.11 0.09 0.11 1.0 0.16
0.01 0.01 0.05 0.04 0.03 1.0 0.03
0.04 0.02 0.08 0.1 0.08 1.0 0.16
0.07 0.04 0.06 0.05 0.02 1.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 1.0 0.06
0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0
0.01 0.0 0.06 0.06 0.02 1.0 0.08
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
Cba_g14242 (TTL1)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.03
0.02 0.05 0.07 0.06 0.05 1.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12
0.13 0.13 0.08 0.08 0.1 1.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
Cba_g15086 (VTC1)
0.04 0.01 0.02 0.02 0.03 1.0 0.14
Cba_g15279 (CYP704B1)
0.01 0.01 0.05 0.04 0.04 1.0 0.03
0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0
Cba_g15317 (EXP10)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g15702 (KAB1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.03
Cba_g16113 (XDH1)
0.03 0.06 0.04 0.04 0.05 1.0 0.06
Cba_g16143 (CLA)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Cba_g16304 (D6PKL1)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01
0.05 0.04 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.0
0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 1.0 0.02
Cba_g16892 (CYCD1;1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.03 0.09 1.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.02 0.05 0.02 0.04 0.02 1.0 0.18
Cba_g19236 (P44)
0.15 0.16 0.03 0.02 0.03 1.0 0.13
0.04 0.05 0.05 0.03 0.07 1.0 0.05
0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 1.0 0.1
0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 1.0 0.0
0.02 0.0 0.03 0.03 0.03 1.0 0.07
0.04 0.05 0.07 0.07 0.11 1.0 0.14
Cba_g30286 (EXL7)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 1.0 0.06
0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.03 0.08 0.04 0.09 1.0 0.04
0.02 0.02 0.07 0.08 0.1 1.0 0.04
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01
Cba_g36856 (VH1)
0.0 0.0 0.06 0.03 0.08 1.0 0.02
0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 1.0 0.11
Cba_g38812 (EST3)
0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 1.0 0.0
Cba_g42068 (AVP1)
0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 1.0 0.11
Cba_g47713 (BGLU40)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.04
0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 1.0 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 1.0 0.03
0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 1.0 0.04
0.03 0.02 0.04 0.03 0.05 1.0 0.03
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.09
Cba_g62697 (FEI1)
0.05 0.03 0.05 0.03 0.06 1.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
0.13 0.12 0.02 0.02 0.03 1.0 0.13
Cba_g68004 (LPR2)
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02
0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.07 0.02 0.0 0.0 0.01 1.0 0.02
0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 1.0 0.1
Cba_g74298 (TT5)
0.02 0.05 0.02 0.05 0.02 1.0 0.14
0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 1.0 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)