Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
0.15 0.44 1.03 1.03 0.61 271.1 1.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.82 0.0
0.75 0.09 0.66 0.34 0.56 28.63 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.71 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.12 0.0
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 2.69 0.47
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 9.88 0.0
Cba_g00886 (CYCD1;1)
0.12 0.1 0.23 0.66 0.25 10.54 2.16
0.23 0.0 0.0 0.4 0.0 19.2 0.12
0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 6.49 0.0
0.29 0.03 0.0 0.01 0.01 9.36 0.02
0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 7.54 0.13
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 6.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 34.27 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.43 0.01
Cba_g02610 (LAC11)
0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 2.99 0.2
Cba_g02660 (HMG1)
0.18 0.7 6.1 4.35 7.19 160.8 20.18
1.01 0.4 0.08 0.35 0.59 13.45 1.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.87 0.14
Cba_g03039 (IBH1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.26 0.0
0.63 0.04 1.84 1.62 0.65 32.89 0.29
0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 3.07 0.1
Cba_g03164 (CHS)
1.98 9.82 4.01 9.6 3.41 263.67 27.85
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 3.66 0.01
Cba_g03520 (GASA3)
0.0 0.11 0.11 0.0 0.58 1503.48 0.42
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 3.7 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.17 0.01
0.01 0.02 0.01 0.03 0.04 3.58 0.0
Cba_g04033 (PAL4)
0.36 2.78 0.91 2.19 0.74 83.86 7.71
1.63 0.09 0.51 0.58 0.44 455.12 5.01
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 16.24 0.0
0.0 0.09 0.49 0.34 0.1 16.43 0.17
0.01 0.01 0.04 0.01 0.02 1.93 0.02
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 3.26 0.0
0.33 0.41 0.08 0.0 0.25 433.6 2.88
Cba_g05609 (AVP1)
0.03 0.27 0.01 0.03 0.03 5.64 1.03
Cba_g05722 (TBL25)
0.34 0.17 0.5 0.36 0.47 11.33 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.9 0.17
Cba_g06394 (FMA)
0.04 0.01 0.01 0.0 0.17 2.48 0.0
0.09 0.0 0.5 0.57 0.14 10.85 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25.8 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.03 0.0
0.0 0.0 0.36 0.18 0.31 6.64 0.24
0.27 0.19 0.17 0.0 0.0 7.5 0.31
0.01 0.0 0.05 0.03 0.0 4.66 0.33
Cba_g07486 (MRP10)
0.13 0.06 0.1 0.12 0.2 11.44 0.08
0.0 0.43 0.13 0.0 0.0 8.26 0.83
0.12 0.12 0.06 0.18 0.0 11.29 0.56
0.97 0.07 2.64 2.06 2.91 70.05 2.02
Cba_g08025 (NUDT20)
0.09 0.12 0.09 0.14 0.03 9.91 0.06
0.07 0.1 0.44 0.24 0.31 27.62 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11 0.0
Cba_g08173 (UGT85A5)
0.0 0.18 0.08 0.1 0.11 22.89 1.0
0.19 0.02 0.18 0.08 0.08 9.78 0.36
0.0 0.0 0.31 0.21 0.31 5.21 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.19 0.0
0.53 0.28 0.62 0.31 2.17 523.27 1.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 38.46 0.0
Cba_g09346 (EXP15)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36 0.0
0.0 0.03 0.08 0.12 0.08 414.73 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.43 0.39
0.0 0.0 0.06 0.18 0.18 7.37 0.0
Cba_g09705 (PCNA1)
0.52 0.53 1.7 1.42 2.06 28.49 1.2
0.27 0.4 0.09 0.17 0.07 58.4 0.19
Cba_g09785 (UCC1)
0.5 0.81 0.78 0.13 0.45 1079.72 31.54
0.25 0.24 0.07 0.05 0.01 5.95 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.91 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 2.29 0.0
0.07 0.01 0.0 0.02 0.03 4.15 0.04
Cba_g10347 (XTH8)
0.04 0.15 0.11 0.29 0.18 733.3 3.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.78 0.0
0.15 0.14 0.0 0.04 0.0 3.72 0.13
0.71 0.66 0.0 0.07 0.27 27.14 0.2
0.13 0.01 0.23 0.14 0.27 12.87 0.03
Cba_g11025 (HCT)
0.02 0.02 0.01 0.04 0.02 270.22 1.0
0.03 0.08 0.02 0.04 0.12 3.44 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19.37 0.05
0.0 0.17 0.0 0.05 0.06 329.72 6.51
Cba_g12271 (PMI1)
0.91 0.63 1.27 1.1 1.27 11.58 1.88
0.14 0.05 0.51 0.45 0.35 10.45 0.35
0.29 0.14 0.62 0.72 0.57 7.37 1.21
0.72 0.44 0.67 0.58 0.22 10.85 1.13
0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 6.21 0.07
0.01 0.02 0.01 0.0 0.06 3.43 0.19
3.93 0.5 1.52 2.06 1.28 115.46 0.69
0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 19.69 0.06
0.07 0.0 0.46 0.46 0.17 7.94 0.64
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 18.37 0.36
Cba_g14242 (TTL1)
0.02 0.03 0.05 0.05 0.04 6.27 0.18
0.18 0.35 0.54 0.43 0.37 7.69 0.33
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 3.95 0.16
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 41.43 4.79
3.93 3.82 2.53 2.45 2.91 30.11 4.9
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 2.55 0.03
Cba_g15086 (VTC1)
1.25 0.39 0.64 0.67 0.91 29.5 4.16
Cba_g15279 (CYP704B1)
0.18 0.09 0.81 0.66 0.69 16.62 0.54
0.27 0.08 0.11 0.08 0.0 9.47 0.0
Cba_g15317 (EXP10)
0.02 0.0 0.0 0.01 0.05 3.83 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 26.78 0.34
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 43.82 0.16
Cba_g15702 (KAB1)
0.33 0.12 0.0 0.03 0.02 67.93 0.4
0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 32.89 0.0
10.7 9.1 28.17 33.57 24.28 2103.97 68.15
Cba_g16113 (XDH1)
0.38 0.7 0.48 0.52 0.63 11.9 0.68
Cba_g16143 (CLA)
0.05 0.01 0.16 0.15 0.17 76.01 0.34
Cba_g16304 (D6PKL1)
0.0 0.01 0.07 0.06 0.03 4.58 0.06
0.25 0.22 0.0 0.04 0.02 4.86 0.0
0.02 0.0 0.23 0.04 0.13 12.61 0.02
0.23 0.27 0.18 0.18 0.22 7.42 0.13
Cba_g16892 (CYCD1;1)
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 3.51 0.15
0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 7.84 0.0
0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 2.63 0.01
0.0 0.0 0.12 0.09 0.3 3.16 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.5 0.09
8.76 21.5 10.3 17.83 8.97 454.46 83.23
Cba_g19236 (P44)
4.55 4.8 0.81 0.52 0.93 30.97 4.03
1.08 1.65 1.65 0.92 2.13 30.02 1.38
6.98 2.44 0.76 1.1 0.68 258.08 1.72
2.45 9.36 4.32 10.99 4.6 350.71 34.18
0.18 0.11 0.07 0.05 0.04 6.0 0.07
0.31 0.12 0.0 0.0 0.0 38.67 0.2
0.21 0.31 0.5 0.99 1.48 54.25 0.11
13.46 2.42 22.71 19.18 24.87 732.22 53.22
0.21 0.25 0.38 0.37 0.57 5.34 0.73
Cba_g30286 (EXL7)
0.0 0.02 0.82 0.35 2.0 68.39 4.22
0.37 0.21 1.36 0.54 0.81 64.37 2.26
0.86 0.38 9.92 5.99 8.92 702.3 4.35
0.0 1.04 1.21 0.68 0.26 136.87 0.16
2.42 2.98 9.12 5.0 10.18 113.85 4.42
1.42 1.63 6.3 6.97 9.13 89.98 3.89
0.69 0.13 0.7 0.43 0.47 106.17 1.34
Cba_g36856 (VH1)
0.04 0.0 0.67 0.29 0.88 10.62 0.21
7.51 9.91 11.7 15.82 11.71 658.87 69.3
Cba_g38812 (EST3)
0.39 0.13 0.45 0.36 0.34 19.75 0.05
Cba_g42068 (AVP1)
0.0 0.28 0.0 0.04 0.0 5.79 0.66
Cba_g47713 (BGLU40)
0.1 0.39 0.18 0.5 0.06 64.19 2.29
0.35 0.59 0.0 0.2 0.1 26.11 0.58
0.0 0.28 0.0 0.08 0.0 41.58 0.68
1.4 0.37 17.29 14.46 15.24 423.3 11.74
3.5 4.24 10.57 10.14 7.42 649.89 24.06
0.3 0.2 0.36 0.27 0.45 9.42 0.29
0.07 0.0 0.09 0.05 0.09 8.17 0.13
0.07 0.13 0.06 0.0 0.0 10.0 0.9
Cba_g62697 (FEI1)
0.59 0.38 0.56 0.43 0.78 12.45 0.79
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 5.27 0.13
14.12 12.76 1.96 2.32 3.51 110.34 14.89
Cba_g68004 (LPR2)
0.15 0.44 0.0 0.0 0.0 28.4 0.51
11.48 9.86 0.2 0.37 0.0 273.62 0.85
5.22 1.53 0.35 0.34 0.6 72.24 1.26
3.62 14.71 6.34 18.85 6.7 552.75 56.95
Cba_g74298 (TT5)
16.71 35.74 18.53 38.06 16.08 776.6 106.76
1.31 5.81 2.58 6.71 3.75 283.07 25.54

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)