1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Root
Cba_g08014 (RPL23AB)
 0.62 15.08 5.92 3.88 2.28 0.65 33.52
1.62 31.36 14.3 11.61 5.97 1.87 78.14
Cba_g12955 (RAN1)
 0.16 4.65 2.15 1.21 1.28 0.27 12.65
Cba_g13254 (UBC11)
 0.09 3.72 1.78 1.67 0.85 0.36 11.77
0.15 2.21 1.01 0.4 0.79 0.18 5.27
2.45 9.85 0.43 3.13 1.18 0.0 28.19
0.2 12.29 3.84 3.6 2.05 0.0 28.12
0.83 21.77 9.49 6.26 4.61 1.11 49.87
0.0 10.47 3.27 1.93 2.41 0.94 27.62
Cba_g30253 (UGP2)
 0.03 1.47 0.74 0.44 0.3 0.08 4.02
0.0 1.18 0.37 1.08 0.29 0.07 3.05
0.22 11.55 5.64 4.13 3.03 0.14 39.44
0.07 2.28 0.41 0.39 0.35 0.07 4.61
0.05 1.56 0.57 0.54 0.36 0.07 4.67
0.21 2.72 1.78 1.27 0.62 0.24 7.69
0.07 2.27 0.88 0.91 0.42 0.1 6.34
0.03 1.44 0.89 0.72 0.29 0.01 3.49
0.04 0.9 0.4 0.37 0.26 0.14 3.31
0.0 1.78 0.97 0.52 0.5 0.11 5.49
0.0 2.77 0.94 0.51 0.38 0.08 4.97
0.06 1.55 0.79 0.47 0.48 0.1 5.15
Cba_g32358 (PBA1)
 0.02 1.71 0.7 0.63 0.27 0.08 5.62
0.0 2.61 2.67 0.69 0.53 0.46 8.03
Cba_g33344 (SCN1)
 0.02 1.56 0.9 0.82 0.4 0.07 4.74
0.03 2.56 1.16 1.03 0.3 0.15 8.37
0.0 6.87 5.14 3.39 1.51 0.4 21.04
0.0 2.12 1.05 0.81 0.33 0.0 6.22
0.0 0.99 0.41 0.17 0.09 0.0 3.08
0.03 0.68 0.44 0.28 0.14 0.04 2.16
0.02 1.03 0.71 0.46 0.14 0.11 3.4
Cba_g35269 (PBB1)
 0.0 1.76 0.83 0.67 0.47 0.04 4.72
Cba_g35280 (PYR6)
 0.07 0.9 0.34 0.39 0.07 0.0 2.24
0.02 0.99 0.43 0.33 0.21 0.02 2.84
0.12 1.11 0.37 0.23 0.15 0.13 2.58
0.03 1.45 0.62 0.75 0.13 0.03 3.1
0.07 1.16 0.55 0.19 0.23 0.09 3.1
Cba_g35551 (RPT3)
 0.01 1.31 0.53 0.43 0.16 0.02 3.34
Cba_g35552 (RAB1C)
 0.05 1.19 0.38 0.31 0.25 0.09 3.81
0.0 0.92 0.34 0.33 0.15 0.04 2.25
0.03 1.69 0.91 0.51 0.39 0.17 4.89
0.02 0.97 0.51 0.54 0.17 0.04 2.16
0.0 0.71 0.46 0.17 0.24 0.0 2.52
0.03 0.82 0.54 0.41 0.08 0.21 2.7
Cba_g35711 (RPT5A)
 0.06 0.98 0.5 0.51 0.27 0.06 3.08
Cba_g35714 (RPT1A)
 0.01 1.13 0.61 0.3 0.28 0.05 3.23
Cba_g35724 (PHT3;1)
 0.09 0.98 0.47 0.42 0.21 0.11 2.77
0.0 0.77 0.35 0.28 0.23 0.06 2.33
Cba_g35768 (CYP710A2)
 0.03 1.48 0.59 0.56 0.31 0.08 3.61
0.06 1.14 0.76 0.32 0.28 0.04 3.44
Cba_g35825 (CSD1)
 0.22 5.15 2.19 1.34 2.18 0.18 13.03
Cba_g35828 (CML23)
 0.0 0.93 0.54 0.14 0.49 0.03 2.37
Cba_g35845 (RPL16A)
 0.03 3.15 1.16 0.71 0.91 0.06 10.29
0.0 1.01 0.36 0.17 0.37 0.05 2.96
0.0 1.03 0.61 0.27 0.14 0.02 3.27
0.0 0.93 0.49 0.15 0.0 0.06 2.81
Cba_g35960 (ORP4A)
 0.01 0.63 0.61 0.25 0.29 0.04 2.33
0.0 1.26 0.35 0.47 0.24 0.08 3.42
Cba_g35979 (PIN1AT)
 0.0 1.09 0.31 0.14 0.21 0.11 2.96
0.0 1.86 0.43 0.82 0.0 0.0 4.88
0.05 1.4 0.52 0.45 0.32 0.02 3.99
0.08 2.76 2.08 0.68 0.24 0.04 7.07
Cba_g36103 (GATA20)
 0.01 1.24 0.5 0.53 0.19 0.12 4.47
0.02 1.06 0.45 0.2 0.12 0.0 3.03
0.01 0.69 0.33 0.26 0.12 0.03 2.6
Cba_g36815 (PHB3)
 0.01 0.76 0.48 0.17 0.22 0.01 2.42
0.0 1.33 1.09 0.54 0.0 0.08 3.89
Cba_g36880 (PGL4)
 0.03 1.49 0.49 0.49 0.24 0.09 3.29
Cba_g37120 (HA3)
 0.07 0.67 0.42 0.31 0.17 0.05 2.81
0.16 3.69 1.87 1.13 1.12 0.13 9.31
0.0 1.32 0.49 0.44 0.12 0.0 3.96
Cba_g37650 (SAR1)
 0.1 2.07 0.59 0.65 0.28 0.12 4.7
Cba_g37655 (CBL)
 0.01 0.66 0.4 0.17 0.08 0.05 2.16
0.1 1.51 0.53 0.37 0.19 0.01 3.53
0.57 28.0 14.32 8.44 7.33 0.91 60.78
0.12 2.7 0.8 1.0 0.29 0.06 7.63
0.08 1.22 0.51 0.46 0.21 0.07 2.67
0.02 0.6 0.46 0.27 0.08 0.09 2.44
0.08 1.27 0.69 0.59 0.21 0.06 4.21
Cba_g38647 (CUM1)
 0.08 1.54 0.78 0.34 0.25 0.06 3.91
0.15 1.37 0.89 0.72 0.13 0.0 3.6
0.03 1.68 1.17 0.51 0.26 0.11 5.8
0.05 2.28 0.85 0.88 0.35 0.11 6.31
0.05 1.27 0.66 0.3 0.23 0.09 3.48
0.12 6.73 7.05 4.09 1.72 1.04 33.15
Cba_g38891 (GPX6)
 0.0 2.19 0.87 0.97 0.37 0.13 6.55
0.02 0.92 0.39 0.33 0.18 0.02 2.61
Cba_g38974 (3BETAHSD/D2)
 0.03 1.16 0.32 0.28 0.12 0.07 2.71
0.02 1.04 0.64 0.38 0.21 0.06 3.08
Cba_g39120 (PAO2)
 0.06 1.28 0.7 0.35 0.24 0.06 3.74
0.11 1.53 0.76 0.34 0.38 0.05 3.78
Cba_g39996 (VAMP725)
 0.17 3.65 0.91 0.61 0.2 0.08 9.18
0.03 1.8 0.41 0.46 0.29 0.02 4.37
0.0 0.82 0.31 0.23 0.21 0.08 2.31
Cba_g40413 (PAC1)
 0.02 0.97 0.51 0.36 0.15 0.02 2.59
0.28 2.9 0.95 1.12 0.41 0.05 9.58
Cba_g42321 (MAPR2)
 0.26 3.33 1.93 1.93 0.66 0.14 12.0
0.0 3.53 0.72 0.52 0.26 0.0 7.7
0.0 1.01 0.33 0.41 0.09 0.02 2.55
0.0 1.06 0.78 0.47 0.26 0.13 2.66
Cba_g46152 (GLTP1)
 0.02 1.89 0.56 0.55 0.09 0.15 6.21
0.0 1.14 0.24 0.46 0.15 0.0 2.74
0.0 0.82 0.26 0.31 0.23 0.11 2.44
Cba_g49569 (ARFA1E)
 0.0 0.6 0.31 0.43 0.16 0.14 2.55
0.75 3.88 0.18 0.87 0.12 0.0 9.83
0.04 1.26 0.58 0.34 0.26 0.04 2.95
Cba_g51027 (POP1)
 0.0 0.76 0.29 0.39 0.27 0.05 2.23
0.03 0.99 0.22 0.2 0.24 0.03 2.21
Cba_g53683 (PK6)
 0.06 1.19 0.55 0.4 0.13 0.05 3.1
0.0 0.76 0.28 0.35 0.12 0.03 2.34
0.03 1.34 0.73 0.45 0.2 0.03 3.83
0.0 0.66 0.36 0.17 0.22 0.02 2.13
0.05 0.88 0.34 0.28 0.24 0.01 2.54
0.1 3.97 1.8 1.2 0.59 0.18 7.64
Cba_g63787 (AGD9)
 0.05 0.46 0.28 0.22 0.08 0.02 2.25
Cba_g63997 (CBL)
 0.03 1.56 0.66 0.59 0.23 0.05 4.72
0.01 0.63 0.43 0.31 0.16 0.01 2.3
0.02 1.23 0.2 0.39 0.17 0.05 3.17
Cba_g64905 (PBG1)
 0.07 1.78 0.5 0.61 0.52 0.09 3.85
0.0 1.03 0.35 0.26 0.17 0.0 2.33
Cba_g65129 (IDH1)
 0.04 1.09 0.46 0.33 0.29 0.09 3.91
0.0 0.98 0.36 0.36 0.12 0.0 2.66
Cba_g67980 (APT4)
 0.03 1.15 0.4 0.33 0.26 0.08 2.61
0.31 10.7 5.96 3.1 1.51 0.83 27.7
0.04 1.38 0.29 0.4 0.22 0.03 2.91
Cba_g70198 (PAD1)
 0.13 1.37 0.8 0.45 0.23 0.06 3.85
0.0 2.42 0.73 0.92 0.63 0.02 6.04
0.0 0.95 0.39 0.08 0.11 0.0 2.64
0.16 3.0 1.01 0.94 0.7 0.07 7.66
0.08 2.33 0.93 0.65 0.31 0.08 6.78
Cba_g75526 (HA4)
 0.0 0.98 0.8 0.38 0.04 0.08 2.56
0.0 1.06 0.45 0.3 0.16 0.07 3.5
Cba_g78592 (SBE2.2)
 0.0 0.83 0.49 0.26 0.15 0.05 2.38
0.27 5.96 1.54 1.5 0.85 0.17 12.34

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)