1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
0.45 1.0 0.38 0.0 0.58 0.09 0.25 0.23 0.19 0.2 0.46 0.43 0.33 0.38 0.36 0.58 0.21 0.22 0.43 0.24 0.16 0.29
AMTR_s00001p00125890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.100)
 0.0 0.95 0.0 0.0 1.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.31 0.01 0.01 0.22 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.25 0.01
AMTR_s00007p00256610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.302)
 0.0 1.0 0.02 0.05 0.54 0.0 0.2 0.17 0.41 0.28 0.51 0.5 0.3 0.28 0.35 0.17 0.6 0.29 0.24 0.15 0.37 0.32
AMTR_s00010p00251210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.358)
 0.0 1.0 0.46 0.1 0.54 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.04 0.06 0.01 0.12 0.01 0.08 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04
0.0 1.0 0.3 0.05 0.63 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.12 0.11 0.08 0.03 0.08 0.05 0.08 0.19 0.29 0.35 0.13 0.42
AMTR_s00017p00195640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.115)
 0.0 1.0 0.0 0.01 0.52 0.0 0.02 0.27 0.04 0.05 0.43 0.91 0.05 0.02 0.12 0.02 0.34 0.05 0.03 0.01 0.03 0.17
0.01 1.0 0.38 0.01 0.77 0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.07 0.33 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05
AMTR_s00020p00195570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.78)
 0.14 1.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.17 0.07 0.11 0.01 0.11 0.04 0.03 0.17 0.03 0.06 0.26 0.02
AMTR_s00021p00216250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.196)
 0.18 1.0 0.41 0.01 0.5 0.34 0.01 0.0 0.02 0.03 0.39 0.54 0.38 0.28 0.19 0.5 0.34 0.28 0.44 0.22 0.32 0.29
AMTR_s00022p00230660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.310)
 0.41 1.0 0.68 0.01 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00023p00228380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.177)
 0.0 0.98 0.0 0.04 0.97 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.06 0.01 0.12 0.0 0.1 0.0 0.14 0.01 1.0 0.03
AMTR_s00023p00230620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.184)
 0.23 1.0 0.65 0.0 0.55 0.0 0.03 0.0 0.09 0.05 0.21 0.11 0.15 0.12 0.12 0.11 0.2 0.07 0.04 0.08 0.02 0.19
AMTR_s00024p00160570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.116)
 0.25 0.84 0.33 0.01 1.0 0.01 0.26 0.0 0.51 0.38 0.69 0.85 0.46 0.44 0.52 0.34 0.99 0.39 0.34 0.48 0.48 0.47
0.29 1.0 0.15 0.3 0.55 0.05 0.29 0.01 0.11 0.14 0.52 0.38 0.49 0.4 0.44 0.31 0.64 0.29 0.32 0.5 0.22 0.43
AMTR_s00025p00247140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.396)
 0.0 1.0 0.0 0.03 0.5 0.02 0.03 0.0 0.04 0.03 0.58 0.78 0.36 0.2 0.28 0.04 0.32 0.08 0.02 0.09 0.02 0.05
AMTR_s00027p00235310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.124)
 0.0 1.0 0.0 0.1 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00029p00110740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.119)
 0.31 1.0 0.25 0.01 0.72 0.03 0.16 0.2 0.22 0.18 0.53 0.66 0.27 0.27 0.34 0.2 0.32 0.26 0.26 0.26 0.13 0.3
AMTR_s00038p00052930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.18)
 0.18 1.0 0.0 0.06 0.47 0.0 0.21 0.0 0.17 0.16 0.37 0.26 0.31 0.32 0.17 0.25 0.41 0.24 0.13 0.26 0.07 0.28
AMTR_s00044p00163450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.178)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.2 0.23 0.25 0.23 0.04 0.06 0.03 0.05 0.05 0.05 0.12
AMTR_s00045p00117730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.114)
 0.37 1.0 0.0 0.0 0.52 0.24 0.03 0.0 0.03 0.02 0.36 0.51 0.37 0.22 0.14 0.2 0.21 0.09 0.17 0.06 0.21 0.3
0.37 0.75 0.4 0.01 1.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.65 0.67 0.24 0.11 0.17 0.18 0.61 0.12 0.13 0.16 0.09 0.26
0.0 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.4 0.03 0.16 0.24 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
AMTR_s00055p00184890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.106)
 0.67 1.0 0.38 0.18 0.82 0.62 0.09 0.0 0.09 0.1 0.61 0.57 0.5 0.38 0.38 0.44 0.46 0.66 0.51 0.62 0.56 0.35
AMTR_s00057p00106670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.83)
 0.0 0.86 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.13 0.0 0.0 0.11 0.99 0.05
AMTR_s00057p00217720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.278)
 0.22 1.0 0.56 0.0 0.86 0.17 0.19 0.13 0.19 0.17 0.57 0.83 0.3 0.2 0.27 0.18 0.52 0.26 0.23 0.14 0.05 0.39
AMTR_s00059p00058530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.36)
 0.65 1.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.32 0.47 0.43 0.33 0.17 0.25 0.13 0.1 0.24 0.36 0.28 0.2
AMTR_s00061p00031230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.4)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.02 0.01 0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.17 0.01
0.34 1.0 0.99 0.0 0.8 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.44 0.92 0.08 0.02 0.16 0.14 0.63 0.1 0.19 0.13 0.03 0.23
AMTR_s00077p00180970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.204)
 0.06 1.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.2 0.04 0.3 0.29 0.6 0.48 0.62 0.26 0.38 0.12 0.61 0.52 0.36 0.4 0.29 0.3
AMTR_s00089p00097770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.53)
 0.49 0.78 0.26 0.06 1.0 0.0 0.52 0.13 0.36 0.44 0.26 0.29 0.1 0.26 0.4 0.01 0.22 0.09 0.21 0.17 0.15 0.02
AMTR_s00090p00159150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.93)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.18 0.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.43 0.0 0.0 0.0 0.06 0.25 0.07
AMTR_s00090p00172940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.105)
 0.03 1.0 0.11 0.0 0.93 0.0 0.35 0.0 0.22 0.2 0.3 0.4 0.25 0.12 0.19 0.14 0.38 0.18 0.25 0.18 0.07 0.13
AMTR_s00098p00075500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.13)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.29 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0
0.42 1.0 0.0 0.27 0.5 0.0 0.17 0.01 0.18 0.18 0.24 0.32 0.21 0.22 0.27 0.21 0.33 0.27 0.22 0.21 0.23 0.27
AMTR_s00109p00069190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.54)
 0.37 0.88 1.0 0.13 0.84 0.09 0.05 0.33 0.12 0.08 0.75 0.59 0.49 0.37 0.27 0.38 0.36 0.65 0.5 0.17 0.43 0.23
AMTR_s00111p00072010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.42)
 0.91 1.0 0.0 0.06 0.49 0.0 0.04 0.17 0.06 0.07 0.65 0.68 0.38 0.44 0.2 0.2 0.18 0.24 0.53 0.34 0.56 0.35
AMTR_s00120p00079170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.36)
 0.22 1.0 0.04 0.01 0.47 0.0 0.07 0.26 0.05 0.07 0.4 0.42 0.33 0.04 0.07 0.41 0.53 0.34 0.25 0.22 0.15 0.29
AMTR_s00143p00105790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00143.27)
 0.89 1.0 0.98 0.15 0.66 0.23 0.16 0.46 0.29 0.25 0.71 0.72 0.7 0.51 0.36 0.41 0.34 0.45 0.42 0.29 0.25 0.41
AMTR_s00152p00017090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00152.1)
 0.18 1.0 0.18 0.0 0.7 0.0 0.03 0.11 0.05 0.01 0.0 0.0 0.18 0.07 0.09 0.67 0.1 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08
AMTR_s00156p00055010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.27)
 0.86 0.99 0.85 0.07 1.0 0.0 0.77 0.03 0.41 0.63 0.21 0.37 0.21 0.21 0.23 0.08 0.1 0.14 0.24 0.08 0.04 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.11 0.0 0.1 0.1 0.22 0.44 0.21 0.13 0.15 0.06 0.22 0.15 0.32 0.26 0.28 0.16
AMTR_s00165p00063860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00165.41)
 0.4 1.0 0.49 0.08 0.65 0.21 0.1 0.08 0.08 0.1 0.38 0.43 0.51 0.39 0.34 0.4 0.21 0.28 0.38 0.35 0.12 0.32
AMTR_s00173p00058300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00173.14)
 0.15 0.59 0.81 0.0 0.96 0.01 0.05 0.24 0.07 0.09 1.0 0.96 0.55 0.48 0.44 0.21 0.38 0.34 0.44 0.15 0.06 0.38
AMTR_s03073p00008220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03073.2)
 0.02 1.0 0.0 0.07 0.32 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.08 0.08 0.08 0.05 0.04 0.0 0.34 0.09 0.03 0.02 0.06 0.04
AMTR_s03576p00008700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03576.1)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.15 0.11 0.04 0.33 0.06 0.03 0.05 0.05 0.02 0.0 0.14
AMTR_s05591p00003960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05591.1)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.84 0.24 0.37 0.51 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)