Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
1.0 0.73 0.17 0.16 0.11 0.2 0.17
1.0 0.55 0.03 0.01 0.14 0.0 0.0
1.0 0.51 0.01 0.03 0.06 0.01 0.02
Aop_g09865 (ALMT9)
1.0 0.43 0.08 0.08 0.07 0.17 0.05
1.0 0.72 0.13 0.0 0.26 0.2 0.12
1.0 0.49 0.26 0.22 0.23 0.4 0.1
1.0 0.3 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
1.0 0.6 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
1.0 0.63 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0
1.0 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.97 0.0 0.0 0.07 0.02 0.02
1.0 0.25 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
1.0 1.0 0.21 0.21 0.03 0.1 0.14
1.0 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.84 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0
1.0 0.31 0.2 0.03 0.0 0.01 0.07
1.0 0.03 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0
1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.29 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0
1.0 0.88 0.04 0.09 0.0 0.04 0.08
1.0 0.9 0.02 0.06 0.0 0.0 0.2
1.0 0.47 0.06 0.09 0.12 0.08 0.03
1.0 0.56 0.0 0.01 0.04 0.01 0.03
1.0 0.45 0.04 0.08 0.0 0.04 0.0
Aop_g16704 (PHT5)
1.0 0.24 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0
Aop_g16761 (ALDH2B)
1.0 0.65 0.21 0.02 0.0 0.0 0.09
Aop_g16793 (ALDH2)
1.0 0.79 0.22 0.03 0.0 0.0 0.02
1.0 0.37 0.09 0.04 0.0 0.07 0.08
1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.12 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01
1.0 0.79 0.35 0.27 0.39 0.34 0.31
1.0 0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.5 0.01 0.03 0.0 0.04 0.0
1.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.24 0.0 0.05 0.0 0.0 0.22
Aop_g17938 (HSP83)
1.0 0.22 0.04 0.02 0.0 0.0 0.09
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.72 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
Aop_g18161 (SD2-5)
1.0 0.71 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.35 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0
Aop_g18283 (FSD2)
1.0 0.29 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.61 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g18496 (AVP1)
1.0 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.27 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.33 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0
1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g18846 (PCNA2)
1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.26 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0
1.0 0.35 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0
1.0 0.54 0.27 0.15 0.04 0.0 0.0
1.0 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02
1.0 0.44 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.64 0.17 0.07 0.0 0.05 0.0
1.0 0.7 0.25 0.13 0.01 0.01 0.01
1.0 0.12 0.06 0.03 0.0 0.0 0.02
1.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g19300 (CR88)
1.0 0.41 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
1.0 0.24 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0
Aop_g19500 (UNE5)
1.0 0.28 0.06 0.09 0.0 0.0 0.03
1.0 0.38 0.1 0.21 0.1 0.27 0.0
1.0 0.14 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.32 0.2 0.0 0.0 0.0 0.05
1.0 0.75 0.08 0.12 0.06 0.29 0.2
1.0 0.33 0.22 0.07 0.0 0.0 0.05
1.0 0.63 0.1 0.17 0.0 0.0 0.03
1.0 0.11 0.09 0.08 0.0 0.0 0.04
1.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g20073 (ORF02)
1.0 1.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01
1.0 0.52 0.18 0.13 0.01 0.0 0.0
1.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.31 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.57 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0
1.0 0.44 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0
1.0 0.31 0.08 0.2 0.0 0.0 0.0
1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g20593 (LHCA1)
1.0 0.24 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.79 0.19 0.14 0.03 0.06 0.02
1.0 0.3 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0
1.0 0.42 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0
Aop_g21115 (CSD1)
1.0 0.63 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.1 0.02 0.0 0.0 0.04
1.0 0.13 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.49 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.28 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.74 0.12 0.09 0.11 0.05 0.05
Aop_g21607 (PDI2)
1.0 0.47 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0
Aop_g21636 (ATAMT1)
1.0 0.55 0.04 0.02 0.07 0.03 0.03
1.0 0.23 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21704 (NFD4)
1.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.35 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.15 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
1.0 0.5 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21862 (NR1)
1.0 0.74 0.23 0.21 0.02 0.11 0.06
1.0 0.22 0.1 0.05 0.05 0.04 0.0
1.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g22105 (SAG24)
1.0 0.36 0.12 0.02 0.0 0.01 0.12
1.0 0.5 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g22193 (CYTC-2)
1.0 0.35 0.06 0.01 0.0 0.0 0.05
1.0 0.28 0.26 0.16 0.0 0.0 0.0
1.0 0.06 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0
Aop_g22251 (HSP70)
1.0 0.47 0.03 0.01 0.0 0.01 0.12
1.0 0.77 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.4 0.1 0.2 0.17 0.21 0.08
1.0 0.07 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0
1.0 0.17 0.06 0.09 0.0 0.0 0.05
1.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.33 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.67 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
1.0 1.0 0.13 0.19 0.06 0.18 0.2
1.0 0.4 0.1 0.22 0.0 0.01 0.14
Aop_g26860 (ATPT2)
1.0 0.95 0.13 0.19 0.01 0.19 0.24
1.0 0.26 0.14 0.06 0.0 0.0 0.01
Aop_g27198 (SD2-5)
1.0 0.74 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
Aop_g27430 (UNE14)
1.0 0.51 0.05 0.04 0.06 0.0 0.0
1.0 0.15 0.24 0.02 0.0 0.0 0.0
Aop_g28406 (RCA)
1.0 0.28 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0
Aop_g28847 (PS3)
1.0 0.52 0.02 0.03 0.02 0.03 0.14
1.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.5 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.11 0.23 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.14 0.19 0.08 0.0 0.0 0.0
1.0 0.99 0.06 0.05 0.0 0.03 0.08
1.0 0.18 0.15 0.08 0.0 0.0 0.02
1.0 0.43 0.11 0.01 0.02 0.0 0.02
1.0 0.69 0.08 0.09 0.01 0.09 0.01
1.0 0.78 0.24 0.2 0.2 0.17 0.2
1.0 0.65 0.02 0.0 0.19 0.03 0.06
1.0 0.32 0.01 0.0 0.0 0.02 0.09
1.0 0.73 0.42 0.26 0.35 0.24 0.24
1.0 0.64 0.01 0.01 0.1 0.02 0.03
1.0 0.92 0.06 0.06 0.0 0.04 0.0
1.0 0.64 0.02 0.02 0.04 0.2 0.05
1.0 0.92 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03
1.0 0.92 0.12 0.13 0.03 0.03 0.06
Aop_g68099 (CYP76C2)
1.0 0.56 0.12 0.15 0.07 0.21 0.11
1.0 0.83 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.42 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
1.0 0.33 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.37 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0
1.0 0.47 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
1.0 0.14 0.13 0.02 0.0 0.0 0.04
1.0 0.44 0.02 0.02 0.14 0.02 0.0
1.0 0.48 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
1.0 0.74 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0
1.0 0.61 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0
1.0 0.41 0.11 0.02 0.07 0.1 0.08
1.0 0.86 0.08 0.13 0.0 0.0 0.0
1.0 0.92 0.22 0.15 0.02 0.09 0.02
1.0 0.59 0.28 0.06 0.09 0.08 0.0
1.0 0.55 0.2 0.08 0.19 0.12 0.09
1.0 0.39 0.04 0.06 0.07 0.04 0.05
1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.47 0.14 0.02 0.0 0.01 0.04
1.0 0.87 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0
0.95 1.0 0.04 0.11 0.01 0.09 0.1
Aop_g71000 (ARA3)
1.0 0.23 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.36 0.06 0.0 0.2 0.0 0.0
1.0 0.47 0.14 0.05 0.02 0.1 0.0
1.0 0.57 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0
1.0 0.56 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)