Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
35.54 26.08 5.91 5.85 3.93 6.96 6.16
78.45 43.34 2.07 1.07 11.28 0.0 0.28
28.65 14.62 0.3 0.87 1.67 0.35 0.53
Aop_g09865 (ALMT9)
11.3 4.84 0.86 0.89 0.79 1.96 0.6
3.67 2.63 0.46 0.0 0.94 0.72 0.43
7.71 3.78 1.97 1.71 1.76 3.09 0.73
3.0 0.9 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
2.96 0.39 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
19.94 11.92 0.11 0.3 0.29 0.09 0.0
3.71 2.33 0.59 0.48 0.0 0.0 0.0
4.19 0.3 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
2.3 0.39 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
10.42 10.12 0.0 0.0 0.72 0.2 0.16
4.68 1.17 0.11 0.22 0.0 0.0 0.0
5.66 1.3 0.15 0.02 0.0 0.0 0.06
6.82 6.84 1.47 1.43 0.17 0.69 0.99
8.19 1.47 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
33.84 28.53 0.3 0.0 0.16 0.0 0.0
3.89 2.23 0.56 0.13 0.0 0.0 0.0
17.57 5.38 3.59 0.54 0.0 0.11 1.23
4.29 0.11 0.17 0.48 0.0 0.0 0.0
4.3 2.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.54 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.5 0.72 0.25 0.17 0.0 0.0 0.0
8.79 7.75 0.36 0.8 0.02 0.32 0.66
5.54 4.96 0.1 0.35 0.0 0.0 1.09
24.01 11.4 1.5 2.07 2.96 1.93 0.71
26.88 15.17 0.0 0.15 1.0 0.26 0.72
2.36 1.06 0.1 0.18 0.0 0.08 0.0
Aop_g16704 (PHT5)
3.64 0.87 0.22 0.09 0.0 0.0 0.0
Aop_g16761 (ALDH2B)
3.53 2.29 0.74 0.07 0.0 0.0 0.33
Aop_g16793 (ALDH2)
5.2 4.11 1.15 0.17 0.0 0.0 0.11
4.79 1.8 0.41 0.22 0.0 0.33 0.39
3.56 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.3 1.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.49 0.3 0.12 0.03 0.02 0.0 0.03
36.07 28.62 12.79 9.62 14.22 12.16 11.29
2.56 0.38 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
2.96 1.48 0.04 0.08 0.0 0.11 0.0
4.76 3.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.81 2.64 0.0 0.58 0.0 0.0 2.38
Aop_g17938 (HSP83)
5.88 1.28 0.22 0.13 0.0 0.03 0.51
2.78 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.54 2.57 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0
Aop_g18161 (SD2-5)
4.11 2.93 0.2 0.16 0.0 0.01 0.01
3.43 1.21 0.25 0.57 0.0 0.0 0.0
Aop_g18283 (FSD2)
3.42 1.0 0.29 0.06 0.0 0.0 0.0
10.73 6.53 1.83 0.25 0.0 0.0 0.0
4.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g18496 (AVP1)
2.83 0.45 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
2.62 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.53 1.22 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
3.32 1.1 0.45 0.26 0.0 0.0 0.0
3.25 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g18846 (PCNA2)
2.22 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
18.44 4.87 0.0 0.0 1.46 0.53 0.0
24.18 8.56 0.54 0.35 0.71 0.3 0.0
4.14 2.24 1.14 0.61 0.17 0.0 0.0
42.42 8.53 1.04 0.13 0.0 0.0 0.85
2.19 0.97 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
6.88 4.39 1.15 0.45 0.0 0.33 0.0
9.96 6.96 2.54 1.3 0.1 0.08 0.08
8.31 1.0 0.53 0.23 0.0 0.0 0.17
3.54 0.28 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g19300 (CR88)
2.27 0.92 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
3.1 0.75 0.15 0.29 0.0 0.0 0.0
Aop_g19500 (UNE5)
2.88 0.82 0.17 0.27 0.0 0.0 0.07
2.26 0.87 0.23 0.47 0.22 0.61 0.0
3.93 0.54 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0
4.17 1.34 0.85 0.0 0.0 0.0 0.22
50.23 37.9 4.08 5.99 2.79 14.45 10.27
4.23 1.4 0.93 0.29 0.0 0.0 0.21
6.17 3.89 0.59 1.05 0.0 0.0 0.16
3.6 0.38 0.33 0.3 0.0 0.0 0.13
231.03 173.65 0.73 0.14 0.93 0.0 0.0
Aop_g20073 (ORF02)
71.04 70.88 1.07 1.7 2.04 1.84 1.01
2.49 1.3 0.44 0.32 0.03 0.0 0.0
12.08 0.9 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
2.61 0.81 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
2.99 1.69 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0
19.84 8.71 0.32 0.39 0.05 0.3 0.04
3.4 1.05 0.26 0.7 0.0 0.0 0.0
5.85 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g20593 (LHCA1)
3.71 0.89 0.73 0.08 0.0 0.0 0.0
25.82 7.99 0.04 0.0 0.1 0.07 0.18
2.9 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.48 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.38 7.45 1.82 1.35 0.27 0.6 0.15
3.88 1.15 0.21 0.22 0.0 0.0 0.0
9.62 4.01 0.67 0.79 0.0 0.0 0.0
Aop_g21115 (CSD1)
3.55 2.24 0.16 0.09 0.0 0.0 0.0
3.39 0.45 0.35 0.08 0.0 0.0 0.13
2.55 0.33 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
3.09 1.51 0.21 0.24 0.0 0.0 0.0
3.54 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
2.14 0.6 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
6.09 4.5 0.72 0.53 0.65 0.29 0.31
Aop_g21607 (PDI2)
8.05 3.78 0.31 0.11 0.0 0.0 0.0
Aop_g21636 (ATAMT1)
2.95 1.63 0.13 0.06 0.2 0.07 0.09
2.55 0.59 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
2.34 0.23 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21704 (NFD4)
26.01 12.73 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0
7.09 2.48 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0
2.3 0.35 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
2.32 1.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g21862 (NR1)
93.56 69.02 21.24 19.79 1.54 9.85 5.44
2.64 0.57 0.26 0.13 0.13 0.11 0.0
2.22 0.24 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g22105 (SAG24)
8.05 2.88 0.98 0.15 0.0 0.07 0.96
8.45 4.19 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
Aop_g22193 (CYTC-2)
7.47 2.63 0.41 0.08 0.0 0.0 0.38
4.26 1.18 1.11 0.7 0.0 0.0 0.0
4.27 0.24 0.24 0.65 0.0 0.0 0.0
Aop_g22251 (HSP70)
6.01 2.81 0.19 0.09 0.0 0.08 0.7
52.68 40.46 3.74 1.85 0.03 0.02 0.02
3.97 1.57 0.39 0.8 0.69 0.82 0.33
5.27 0.37 0.31 0.45 0.0 0.0 0.0
7.69 1.32 0.43 0.68 0.0 0.0 0.38
4.17 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0
2.41 0.79 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
2.56 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.92 5.95 0.09 0.02 0.05 0.02 0.06
16.45 16.52 2.1 3.14 1.0 3.05 3.29
23.77 9.62 2.4 5.27 0.0 0.24 3.31
Aop_g26860 (ATPT2)
9.43 8.91 1.26 1.76 0.09 1.8 2.29
11.22 2.97 1.62 0.71 0.0 0.02 0.12
Aop_g27198 (SD2-5)
3.11 2.31 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
Aop_g27430 (UNE14)
410.18 208.05 18.8 14.88 23.26 0.55 1.87
4.55 0.67 1.07 0.09 0.0 0.0 0.0
Aop_g28406 (RCA)
20.4 5.62 4.41 0.51 0.0 0.0 0.06
Aop_g28847 (PS3)
12.87 6.67 0.31 0.32 0.25 0.4 1.79
3.59 0.43 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0
5.43 2.73 0.19 0.11 0.0 0.0 0.0
2.14 0.25 0.49 0.08 0.0 0.0 0.0
3.09 0.43 0.59 0.24 0.0 0.0 0.0
24.29 24.0 1.52 1.2 0.0 0.76 2.06
3.51 0.62 0.51 0.29 0.0 0.0 0.06
6.69 2.85 0.72 0.06 0.12 0.0 0.15
18.97 13.04 1.59 1.69 0.2 1.65 0.13
29.39 22.88 7.19 5.98 5.78 5.13 5.86
19.19 12.4 0.45 0.07 3.64 0.65 1.21
43.38 13.94 0.44 0.0 0.0 0.73 3.88
9.01 6.58 3.82 2.38 3.15 2.2 2.13
13.29 8.46 0.17 0.08 1.29 0.27 0.44
5.02 4.6 0.3 0.32 0.0 0.21 0.0
6.36 4.06 0.11 0.13 0.25 1.27 0.29
6.52 5.97 0.17 0.19 0.0 0.0 0.16
8.16 7.52 0.97 1.07 0.25 0.24 0.49
Aop_g68099 (CYP76C2)
3.15 1.78 0.39 0.48 0.21 0.65 0.34
4.76 3.97 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
2.18 0.91 0.31 0.05 0.0 0.0 0.0
3.8 1.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
2.44 0.8 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0
2.33 0.85 0.19 0.12 0.0 0.0 0.0
2.78 1.29 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
5.78 0.8 0.76 0.09 0.0 0.0 0.22
50.02 22.22 0.89 0.78 7.23 1.06 0.0
2.38 1.14 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0
17.66 13.1 0.3 0.25 0.16 0.12 0.06
3.21 1.94 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0
5.06 2.06 0.55 0.09 0.38 0.52 0.39
3.23 2.8 0.27 0.43 0.0 0.0 0.0
48.05 44.15 10.59 7.42 0.96 4.09 1.15
4.88 2.9 1.38 0.3 0.44 0.38 0.0
12.86 7.13 2.54 1.08 2.4 1.49 1.21
17.66 6.92 0.78 1.02 1.27 0.78 0.81
3.66 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
33.32 15.64 4.56 0.8 0.0 0.21 1.34
2.27 1.97 0.35 0.12 0.0 0.0 0.0
4.24 4.45 0.16 0.5 0.05 0.4 0.46
Aop_g71000 (ARA3)
3.82 0.88 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0
5.22 0.54 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
7.66 2.77 0.45 0.0 1.53 0.0 0.0
6.15 2.87 0.89 0.3 0.15 0.61 0.0
2.7 1.55 0.29 0.06 0.0 0.0 0.0
3.19 1.78 0.44 0.31 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)