Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Rhizome
Root
Ala_g00896 (DABB1)
0.9 1.0 0.02 0.01 0.01
0.91 1.0 0.08 0.08 0.05
0.95 1.0 0.09 0.06 0.05
Ala_g01875 (NTRC)
0.91 1.0 0.15 0.12 0.1
0.8 1.0 0.2 0.17 0.13
Ala_g02055 (ABC1)
0.91 1.0 0.3 0.29 0.28
Ala_g02087 (MAR1)
0.89 1.0 0.28 0.34 0.31
0.99 1.0 0.29 0.25 0.21
0.88 1.0 0.18 0.16 0.13
Ala_g02310 (ORF02)
0.91 1.0 0.13 0.12 0.09
Ala_g02375 (SCO1)
0.99 1.0 0.1 0.07 0.06
Ala_g02427 (RAP)
0.88 1.0 0.28 0.29 0.24
Ala_g02431 (SIGB)
0.94 1.0 0.15 0.15 0.14
Ala_g02605 (SPD1)
0.8 1.0 0.12 0.09 0.05
Ala_g02610 (GLDP2)
0.88 1.0 0.05 0.03 0.01
Ala_g02656 (PREP1)
0.82 1.0 0.14 0.1 0.1
0.86 1.0 0.0 0.01 0.0
0.95 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g03406 (OSA1)
0.88 1.0 0.19 0.08 0.06
0.96 1.0 0.28 0.27 0.28
0.95 1.0 0.15 0.1 0.03
Ala_g03909 (BMY8)
0.87 1.0 0.17 0.15 0.18
0.92 1.0 0.17 0.15 0.15
0.81 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g04195 (GCN5)
0.87 1.0 0.13 0.09 0.09
0.86 1.0 0.03 0.1 0.06
0.97 1.0 0.1 0.09 0.04
Ala_g04905 (ANTR2)
0.88 1.0 0.18 0.12 0.11
Ala_g05149 (SPS1)
0.93 1.0 0.11 0.06 0.05
0.85 1.0 0.03 0.04 0.03
0.85 1.0 0.0 0.01 0.01
0.74 1.0 0.0 0.0 0.0
0.91 1.0 0.14 0.18 0.16
0.9 1.0 0.24 0.19 0.17
Ala_g05931 (INV-E)
0.87 1.0 0.22 0.2 0.17
0.96 1.0 0.32 0.3 0.24
0.87 1.0 0.03 0.02 0.01
Ala_g06373 (RNR1)
0.89 1.0 0.18 0.17 0.15
0.91 1.0 0.17 0.15 0.09
0.97 1.0 0.08 0.01 0.01
Ala_g06908 (TT7)
0.86 1.0 0.0 0.0 0.01
0.86 1.0 0.21 0.11 0.15
0.81 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g07321 (PPDK)
0.92 1.0 0.13 0.08 0.09
1.0 0.97 0.2 0.21 0.21
Ala_g07481 (SFR2)
0.88 1.0 0.2 0.1 0.11
0.78 1.0 0.0 0.05 0.02
0.96 1.0 0.32 0.2 0.23
Ala_g07841 (PTR1)
0.88 1.0 0.01 0.01 0.01
Ala_g08181 (EGY1)
0.95 1.0 0.13 0.12 0.11
0.89 1.0 0.28 0.27 0.22
Ala_g08447 (FTSH11)
0.86 1.0 0.3 0.25 0.2
Ala_g08503 (HCF173)
0.93 1.0 0.03 0.04 0.03
Ala_g08597 (SIG5)
0.91 1.0 0.13 0.05 0.05
0.89 1.0 0.07 0.07 0.05
0.96 1.0 0.25 0.24 0.21
0.89 1.0 0.06 0.07 0.05
Ala_g08859 (NADK2)
0.82 1.0 0.22 0.14 0.15
Ala_g08924 (CHUP1)
0.93 1.0 0.14 0.08 0.15
Ala_g09008 (CRM3)
0.83 1.0 0.09 0.08 0.05
0.92 1.0 0.01 0.0 0.0
0.89 1.0 0.06 0.06 0.04
Ala_g09121 (PHS1)
0.97 1.0 0.2 0.16 0.18
Ala_g09162 (CRY3)
0.8 1.0 0.07 0.07 0.03
0.95 1.0 0.2 0.13 0.11
0.96 1.0 0.26 0.22 0.21
0.88 1.0 0.06 0.05 0.04
0.92 1.0 0.3 0.26 0.25
Ala_g09550 (SVR2)
0.87 1.0 0.21 0.19 0.18
Ala_g09701 (SPA4)
0.87 1.0 0.17 0.11 0.06
Ala_g09707 (PDS)
0.88 1.0 0.19 0.18 0.15
Ala_g09740 (FUG1)
0.84 1.0 0.12 0.07 0.06
Ala_g09744 (CYP94D1)
0.98 1.0 0.04 0.11 0.04
0.9 1.0 0.09 0.07 0.06
0.93 1.0 0.18 0.14 0.1
Ala_g10332 (CcdA)
0.91 1.0 0.3 0.3 0.27
1.0 0.98 0.2 0.11 0.13
0.93 1.0 0.03 0.04 0.07
Ala_g10747 (BRS1)
0.89 1.0 0.15 0.17 0.15
Ala_g10805 (ACHT4)
0.93 1.0 0.33 0.24 0.2
Ala_g11046 (PGP2)
0.84 1.0 0.0 0.07 0.01
Ala_g11691 (DCA1)
0.88 1.0 0.22 0.2 0.2
0.97 1.0 0.32 0.28 0.24
0.77 1.0 0.07 0.04 0.03
0.78 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g12116 (SIGB)
0.95 1.0 0.08 0.06 0.05
Ala_g12182 (APG6)
0.87 1.0 0.23 0.15 0.13
Ala_g12198 (ZEP)
0.95 1.0 0.06 0.03 0.04
0.82 1.0 0.0 0.01 0.03
Ala_g12537 (CYP76C2)
1.0 1.0 0.01 0.01 0.01
0.88 1.0 0.25 0.2 0.13
0.93 1.0 0.14 0.15 0.11
0.93 1.0 0.27 0.24 0.22
0.87 1.0 0.27 0.23 0.2
Ala_g13265 (EMB86)
0.89 1.0 0.16 0.13 0.1
0.96 1.0 0.03 0.03 0.02
0.81 1.0 0.04 0.04 0.03
Ala_g13466 (CHUP1)
0.89 1.0 0.04 0.05 0.06
Ala_g13477 (RLP21)
0.88 1.0 0.03 0.02 0.01
0.87 1.0 0.03 0.1 0.01
0.87 1.0 0.31 0.27 0.22
0.99 1.0 0.09 0.12 0.03
Ala_g14008 (STN8)
0.87 1.0 0.21 0.2 0.17
Ala_g14174 (FTSH8)
0.89 1.0 0.08 0.04 0.04
0.85 1.0 0.04 0.03 0.02
0.89 1.0 0.18 0.13 0.15
0.8 1.0 0.01 0.01 0.01
Ala_g14803 (RSH3)
0.81 1.0 0.24 0.19 0.22
0.8 1.0 0.01 0.0 0.01
Ala_g14998 (DFR)
0.87 1.0 0.15 0.16 0.06
Ala_g15072 (KEA3)
0.88 1.0 0.09 0.07 0.06
0.88 1.0 0.02 0.0 0.07
Ala_g15299 (ARASP)
0.89 1.0 0.15 0.14 0.12
0.83 1.0 0.01 0.0 0.01
Ala_g16036 (MRL1)
0.91 1.0 0.07 0.02 0.01
Ala_g16234 (CRM3)
0.87 1.0 0.18 0.15 0.12
Ala_g17029 (SPPA)
0.91 1.0 0.37 0.37 0.34
0.87 1.0 0.12 0.08 0.07
0.86 1.0 0.16 0.15 0.08
Ala_g17756 (RHS6)
0.89 1.0 0.01 0.02 0.01
0.92 1.0 0.11 0.12 0.09
0.94 1.0 0.23 0.2 0.19
0.9 1.0 0.08 0.02 0.02
Ala_g19265 (SIGB)
0.98 1.0 0.19 0.08 0.1
Ala_g19731 (UNE9)
0.84 1.0 0.12 0.13 0.08
Ala_g20124 (PNP)
0.84 1.0 0.21 0.19 0.15
0.82 1.0 0.21 0.14 0.17
0.79 1.0 0.09 0.01 0.01
0.85 1.0 0.18 0.17 0.11
0.96 1.0 0.14 0.11 0.11
Ala_g20914 (Phox2)
0.86 1.0 0.23 0.21 0.16
0.83 1.0 0.17 0.1 0.05
Ala_g21575 (CYP94D1)
0.98 1.0 0.21 0.13 0.03
0.95 1.0 0.07 0.04 0.03
0.87 1.0 0.1 0.11 0.11
0.88 1.0 0.16 0.13 0.07
Ala_g22353 (emb1138)
0.93 1.0 0.08 0.05 0.04
0.79 1.0 0.1 0.12 0.08
0.96 1.0 0.0 0.0 0.0
0.87 1.0 0.04 0.04 0.04
Ala_g22694 (ISE2)
0.86 1.0 0.21 0.16 0.17
0.97 1.0 0.08 0.06 0.05
0.91 1.0 0.15 0.09 0.07
0.84 1.0 0.17 0.14 0.11
Ala_g25612 (emb1417)
0.99 1.0 0.51 0.52 0.5
0.88 1.0 0.29 0.27 0.23
0.99 1.0 0.02 0.03 0.01
0.87 1.0 0.2 0.16 0.13
Ala_g26497 (ACD31.2)
1.0 0.99 0.38 0.28 0.23
0.91 1.0 0.01 0.0 0.0
Ala_g26881 (EMB2761)
0.95 1.0 0.18 0.14 0.14
Ala_g27153 (UVR3)
0.87 1.0 0.24 0.19 0.17
Ala_g27656 (HCT)
0.92 1.0 0.12 0.1 0.12
0.8 1.0 0.12 0.11 0.11
0.95 1.0 0.29 0.28 0.24
0.95 1.0 0.08 0.04 0.03
0.83 1.0 0.01 0.03 0.04
0.9 1.0 0.21 0.18 0.14
Ala_g31960 (ZIF1)
0.91 1.0 0.2 0.25 0.22
Ala_g32670 (ATB2)
0.97 1.0 0.57 0.45 0.49
0.92 1.0 0.29 0.28 0.22
Ala_g34500 (PGR5-LIKE A)
0.92 1.0 0.1 0.08 0.07
Ala_g35639 (LOP1)
0.73 1.0 0.02 0.05 0.05
0.94 1.0 0.0 0.0 0.0
0.84 1.0 0.0 0.0 0.0
0.98 1.0 0.07 0.07 0.02
0.87 1.0 0.16 0.18 0.16
0.77 1.0 0.02 0.02 0.01
0.89 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g37854 (SD2-5)
0.78 1.0 0.09 0.05 0.0
Ala_g38724 (NRT1.5)
0.83 1.0 0.01 0.02 0.0
0.89 1.0 0.0 0.0 0.0
Ala_g39083 (SPT)
0.99 1.0 0.13 0.06 0.05
0.88 1.0 0.06 0.05 0.08
Ala_g39313 (SD2-5)
0.89 1.0 0.11 0.09 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)