Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Rhizome
Root
Ala_g00896 (DABB1)
11.09 12.34 0.27 0.1 0.14
72.0 79.46 5.98 6.08 4.26
48.86 51.36 4.53 3.0 2.68
Ala_g01875 (NTRC)
60.82 66.49 9.94 8.3 6.93
67.92 84.42 16.69 14.47 10.69
Ala_g02055 (ABC1)
75.81 83.43 25.26 24.41 23.71
Ala_g02087 (MAR1)
16.37 18.3 5.13 6.19 5.59
18.57 18.69 5.34 4.69 3.98
32.29 36.9 6.76 6.07 4.89
Ala_g02310 (ORF02)
24.52 26.82 3.37 3.27 2.47
Ala_g02375 (SCO1)
252.61 256.27 26.41 17.12 15.48
Ala_g02427 (RAP)
9.08 10.3 2.92 2.99 2.45
Ala_g02431 (SIGB)
29.49 31.38 4.57 4.81 4.42
Ala_g02605 (SPD1)
8.76 11.0 1.29 0.98 0.52
Ala_g02610 (GLDP2)
763.26 867.05 41.51 25.03 10.0
Ala_g02656 (PREP1)
81.25 99.33 13.92 9.92 9.93
21.99 25.57 0.1 0.22 0.0
1755.09 1845.0 5.44 0.65 5.93
Ala_g03406 (OSA1)
94.01 107.3 20.11 8.88 6.02
63.69 66.64 18.88 17.87 18.51
17.24 18.13 2.73 1.83 0.51
Ala_g03909 (BMY8)
24.15 27.62 4.76 4.12 5.0
52.7 57.59 10.05 8.43 8.47
11.38 14.13 0.07 0.0 0.04
Ala_g04195 (GCN5)
137.04 157.3 20.0 14.93 14.88
2.14 2.5 0.08 0.26 0.16
30.42 31.21 3.05 2.84 1.19
Ala_g04905 (ANTR2)
42.15 47.99 8.4 5.62 5.2
Ala_g05149 (SPS1)
97.37 104.45 11.55 6.69 4.75
83.54 97.8 2.85 3.79 2.47
101.62 119.59 0.34 0.67 1.63
9.0 12.19 0.0 0.0 0.05
22.15 24.26 3.46 4.26 3.94
35.25 39.06 9.32 7.3 6.72
Ala_g05931 (INV-E)
21.41 24.53 5.42 4.84 4.27
37.76 39.41 12.48 11.72 9.5
155.69 179.88 5.77 2.89 2.43
Ala_g06373 (RNR1)
16.14 18.06 3.26 2.98 2.7
23.96 26.27 4.57 3.82 2.4
74.85 77.22 6.33 0.91 0.85
Ala_g06908 (TT7)
42.64 49.61 0.2 0.11 0.34
62.39 72.16 15.25 7.81 10.7
9.97 12.39 0.0 0.0 0.0
Ala_g07321 (PPDK)
100.67 109.06 13.82 8.36 9.81
55.77 54.23 11.29 11.86 11.98
Ala_g07481 (SFR2)
48.5 54.98 10.88 5.56 6.01
7.63 9.72 0.05 0.52 0.22
69.35 72.42 23.09 14.51 16.59
Ala_g07841 (PTR1)
32.07 36.42 0.23 0.27 0.19
Ala_g08181 (EGY1)
46.55 48.97 6.42 5.67 5.19
14.13 15.83 4.41 4.27 3.45
Ala_g08447 (FTSH11)
41.96 48.89 14.68 12.12 9.8
Ala_g08503 (HCF173)
124.86 134.45 4.57 5.85 4.11
Ala_g08597 (SIG5)
66.48 72.89 9.5 3.9 3.44
66.47 74.97 5.5 5.31 3.95
38.44 39.93 9.9 9.69 8.26
95.86 107.2 6.94 7.97 5.14
Ala_g08859 (NADK2)
21.79 26.71 5.8 3.81 4.04
Ala_g08924 (CHUP1)
42.98 46.09 6.34 3.87 6.79
Ala_g09008 (CRM3)
27.98 33.75 3.18 2.59 1.73
12.55 13.62 0.19 0.04 0.04
32.21 36.29 2.23 2.02 1.27
Ala_g09121 (PHS1)
8.26 8.51 1.7 1.35 1.51
Ala_g09162 (CRY3)
18.19 22.65 1.62 1.51 0.6
114.49 121.09 24.78 16.27 12.99
75.42 78.73 20.5 17.14 16.5
187.27 213.17 13.84 10.32 9.37
272.44 297.54 90.3 77.75 73.7
Ala_g09550 (SVR2)
222.48 256.76 55.17 48.42 45.0
Ala_g09701 (SPA4)
28.45 32.83 5.68 3.69 2.05
Ala_g09707 (PDS)
32.07 36.63 6.99 6.44 5.57
Ala_g09740 (FUG1)
153.71 183.94 22.3 12.19 11.51
Ala_g09744 (CYP94D1)
60.78 61.84 2.38 6.64 2.76
239.12 266.95 25.27 19.68 15.38
22.57 24.25 4.34 3.49 2.47
Ala_g10332 (CcdA)
56.33 62.19 18.81 18.76 16.54
320.62 314.88 63.25 36.31 40.45
625.54 669.63 20.94 24.82 43.78
Ala_g10747 (BRS1)
16.71 18.7 2.78 3.12 2.75
Ala_g10805 (ACHT4)
66.15 71.24 23.38 17.16 13.92
Ala_g11046 (PGP2)
47.45 56.62 0.2 3.78 0.31
Ala_g11691 (DCA1)
118.99 134.63 29.67 26.95 26.82
43.52 45.09 14.26 12.61 10.75
71.3 92.99 6.76 3.77 2.77
17.33 22.35 0.03 0.0 0.07
Ala_g12116 (SIGB)
64.97 68.13 5.39 4.24 3.54
Ala_g12182 (APG6)
98.31 112.74 26.39 17.46 14.57
Ala_g12198 (ZEP)
236.51 248.06 14.39 8.61 8.94
4.69 5.68 0.0 0.05 0.18
Ala_g12537 (CYP76C2)
15.73 15.73 0.17 0.15 0.14
14.9 16.85 4.15 3.43 2.27
8.73 9.42 1.34 1.45 1.04
19.04 20.39 5.52 4.79 4.57
17.78 20.36 5.4 4.72 4.04
Ala_g13265 (EMB86)
39.23 44.24 6.92 5.89 4.26
153.25 160.44 5.0 4.07 3.89
57.82 71.11 2.94 2.59 2.19
Ala_g13466 (CHUP1)
366.52 412.57 15.09 19.81 23.97
Ala_g13477 (RLP21)
14.06 16.03 0.52 0.32 0.23
2.2 2.53 0.07 0.26 0.03
11.57 13.29 4.14 3.56 2.92
14.69 14.81 1.36 1.82 0.43
Ala_g14008 (STN8)
25.6 29.36 6.3 5.99 5.04
Ala_g14174 (FTSH8)
316.67 356.18 30.2 16.01 15.15
82.13 96.53 3.45 2.8 2.16
42.0 47.21 8.7 6.22 6.96
69.24 86.38 0.45 0.44 0.92
Ala_g14803 (RSH3)
18.74 23.15 5.5 4.38 5.1
20.3 25.37 0.22 0.0 0.16
Ala_g14998 (DFR)
69.89 80.6 12.27 12.82 4.94
Ala_g15072 (KEA3)
50.47 57.65 5.43 3.93 3.18
8.69 9.94 0.16 0.0 0.73
Ala_g15299 (ARASP)
44.77 50.1 7.64 7.18 5.94
1998.25 2419.12 33.12 11.48 16.53
Ala_g16036 (MRL1)
37.68 41.45 3.04 0.8 0.45
Ala_g16234 (CRM3)
27.04 30.94 5.58 4.62 3.81
Ala_g17029 (SPPA)
27.75 30.54 11.18 11.23 10.27
27.34 31.58 3.66 2.61 2.37
35.62 41.51 6.52 6.21 3.13
Ala_g17756 (RHS6)
32.1 36.18 0.47 0.73 0.32
36.78 39.98 4.44 4.68 3.64
60.33 63.97 14.69 12.81 12.34
142.55 158.03 13.05 2.67 2.37
Ala_g19265 (SIGB)
14.72 15.03 2.86 1.25 1.52
Ala_g19731 (UNE9)
74.04 87.86 10.67 11.18 7.45
Ala_g20124 (PNP)
15.23 18.04 3.74 3.4 2.68
29.7 36.08 7.61 4.95 5.97
3.97 5.03 0.43 0.06 0.03
9.38 10.98 1.94 1.83 1.18
248.22 257.28 36.88 27.37 28.16
Ala_g20914 (Phox2)
13.35 15.49 3.49 3.23 2.42
19.55 23.59 3.98 2.39 1.27
Ala_g21575 (CYP94D1)
21.05 21.43 4.5 2.72 0.72
28.44 29.82 2.09 1.24 0.84
45.78 52.43 5.41 5.97 5.83
12.35 14.02 2.22 1.88 1.04
Ala_g22353 (emb1138)
419.73 452.38 38.28 21.61 18.97
4.18 5.26 0.55 0.61 0.44
108.84 113.26 0.34 0.09 0.27
28.73 33.0 1.33 1.19 1.32
Ala_g22694 (ISE2)
11.62 13.54 2.78 2.21 2.35
81.95 84.12 7.02 4.73 4.46
41.94 46.02 6.91 3.98 3.01
28.42 33.79 5.76 4.89 3.66
Ala_g25612 (emb1417)
32.74 32.97 16.89 17.0 16.52
32.38 36.74 10.61 9.92 8.52
27.83 28.07 0.46 0.94 0.28
7.46 8.53 1.74 1.33 1.12
Ala_g26497 (ACD31.2)
137.96 136.89 52.83 38.58 32.4
303.94 333.33 2.1 0.46 0.94
Ala_g26881 (EMB2761)
50.92 53.72 9.43 7.65 7.41
Ala_g27153 (UVR3)
34.93 40.2 9.47 7.81 6.89
Ala_g27656 (HCT)
91.47 99.91 11.91 9.5 12.1
51.18 63.78 7.36 6.79 7.22
29.54 30.94 9.1 8.81 7.32
94.9 100.13 7.52 3.62 2.59
34.9 42.16 0.62 1.25 1.71
44.56 49.42 10.55 8.72 6.79
Ala_g31960 (ZIF1)
19.01 20.87 4.15 5.2 4.61
Ala_g32670 (ATB2)
13.43 13.77 7.9 6.22 6.71
23.21 25.32 7.32 7.06 5.5
Ala_g34500 (PGR5-LIKE A)
119.01 128.98 13.54 10.38 8.86
Ala_g35639 (LOP1)
5.99 8.18 0.14 0.39 0.4
513.85 547.05 1.87 1.55 1.32
9.09 10.84 0.03 0.01 0.01
8.32 8.48 0.63 0.6 0.16
7.71 8.83 1.45 1.59 1.39
8.82 11.39 0.25 0.18 0.14
4.92 5.5 0.02 0.02 0.0
Ala_g37854 (SD2-5)
6.06 7.78 0.7 0.37 0.03
Ala_g38724 (NRT1.5)
54.2 65.2 0.37 1.15 0.31
495.04 556.23 1.17 0.19 0.2
Ala_g39083 (SPT)
5.72 5.79 0.73 0.36 0.28
33.87 38.36 2.28 1.94 3.17
Ala_g39313 (SD2-5)
15.89 17.85 2.02 1.6 2.07

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)