Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Vegetative Sporophyte
Adult Sporophyte
Leaf (0 mg/L NH4NO3)
Leaf (30 mg/L NH4NO3)
Leaf (90 mg/L NH4NO3)
Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria
Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria
Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria
Root Tip, D-3 6h mock treated
Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated
Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated
Microsporocarp
-0.38 -1.21 -0.64 0.04 0.22 -0.46 -0.49 -0.68 -0.46 0.93 0.83 1.04 -1.2
0.76 -3.93 -0.8 -0.64 -0.21 -1.07 -1.18 -1.17 -0.85 1.22 1.18 1.2 -1.55
-0.01 -0.75 -0.02 -0.19 1.14 -0.97 -0.91 -0.71 -0.74 0.74 0.49 0.68 -1.24
0.47 -1.71 -1.23 -0.48 -0.03 -1.19 -0.94 -1.2 -1.49 1.36 1.25 1.29 -4.71
0.12 -0.05 -0.25 -0.61 -0.4 -0.14 -0.16 -0.13 -0.11 0.43 0.42 0.5 -0.08
-0.85 -1.49 -0.97 -0.99 -0.92 -2.31 -2.19 -2.26 -1.78 1.29 1.42 1.48 0.77
0.05 0.08 -0.4 -0.43 0.35 -0.12 0.06 0.16 -0.02 0.19 0.34 0.29 -1.17
0.41 -1.1 0.83 0.18 0.28 -1.06 -0.95 -0.83 -0.42 0.33 0.1 0.33 0.25
0.05 -1.44 -1.43 -1.06 -0.46 -0.71 -1.04 -0.51 -0.8 1.18 1.14 1.02 0.21
0.01 -2.84 0.12 0.05 0.25 0.08 -0.05 -0.16 -0.01 0.32 0.55 0.53 -1.07
0.23 -3.04 -0.96 -0.64 0.26 0.04 -0.49 -0.81 -0.5 1.01 0.92 1.03 -1.37
0.25 -3.53 -1.03 -0.21 -0.09 -0.93 -0.81 -0.83 -0.93 1.25 1.1 1.27 -1.64
0.35 -1.51 0.19 0.56 0.06 -0.57 -0.57 -0.71 -0.6 0.41 0.28 0.57 0.1
0.05 -1.52 - - - -0.39 -0.31 -0.41 0.14 1.34 1.25 1.51 -1.16
0.09 -3.36 0.0 -0.2 0.44 -0.31 0.08 0.28 0.05 0.45 0.52 0.55 -2.14
-0.39 -1.72 -0.04 -0.02 0.6 -1.19 -1.16 -1.11 -0.92 1.07 1.02 1.07 -1.44
0.16 -2.35 0.2 0.46 0.59 0.04 0.07 -0.03 0.06 0.05 0.05 0.07 -1.16
-0.67 -1.14 0.1 0.56 0.69 -1.61 -1.38 -1.28 -1.37 0.58 0.78 1.01 0.02
0.6 -0.22 -2.26 -2.68 -3.39 -1.04 -1.48 -1.55 -1.18 1.4 1.42 1.45 -1.03
0.29 -0.56 -1.51 -2.48 -1.39 0.4 -0.36 -2.26 0.91 0.88 0.91 0.91 -1.31
-0.11 -2.58 -0.45 -0.42 -0.01 -0.87 -0.88 -1.06 -0.46 1.09 1.18 1.12 -0.79
0.27 0.45 -0.79 -0.55 -0.11 -0.55 -0.65 -0.41 -0.8 0.86 0.6 0.91 -1.36
0.08 -3.64 0.03 -0.28 -0.28 0.25 -0.01 -0.33 0.16 0.36 0.52 0.57 -0.18
0.25 -1.34 -0.01 0.65 0.15 -0.11 -0.03 -0.06 0.21 0.25 0.16 0.22 -1.99
0.11 -2.69 -0.28 -0.9 0.2 -0.38 -1.06 -1.23 -1.17 1.26 1.13 1.07 -1.13
0.41 -3.5 -0.61 -0.41 -0.35 0.29 0.14 0.18 0.33 0.43 0.24 0.26 -0.07
0.02 -0.56 0.34 0.5 0.49 -0.46 -0.62 -0.73 -0.55 0.43 0.41 0.44 -0.95
-0.61 -1.16 -0.89 -0.83 -0.73 -0.29 -0.7 -0.81 -0.43 1.05 1.15 1.22 -0.26
-0.45 -2.08 0.28 0.35 -0.11 0.16 0.04 -0.0 0.24 0.24 0.33 0.35 -0.79
0.12 -4.01 -2.06 -0.54 -1.16 -1.29 -0.87 -0.91 -1.66 1.46 1.58 1.43 -2.08
-0.28 -1.2 -0.33 -0.01 0.54 -0.21 -0.6 -0.69 -0.51 0.8 0.72 0.7 -0.65
0.26 -2.44 -0.25 -0.68 0.42 -0.53 -0.88 -0.87 -1.1 1.1 0.97 0.97 -1.0
-0.27 -0.62 -0.12 -0.12 0.29 0.02 -0.1 -0.26 0.06 0.44 0.55 0.53 -1.45
-0.69 -1.46 -0.54 -0.68 0.11 -0.81 -0.63 -0.79 -0.49 1.03 1.08 1.13 -0.36
-0.21 -2.64 -0.75 -0.45 -0.01 -0.4 -0.26 -0.16 -0.07 0.95 0.99 0.91 -1.25
-0.41 -0.26 0.28 0.72 1.28 -1.15 -1.05 -1.14 -1.19 0.37 0.39 0.53 -1.99
-0.15 -2.61 -0.19 0.17 0.08 -0.08 -0.11 -0.28 0.42 0.49 0.53 0.56 -0.96
-0.37 -4.25 0.07 -0.33 -0.03 0.23 -0.05 -0.24 -0.02 0.63 0.67 0.62 -0.52
0.43 -0.84 -0.29 -0.06 0.21 -0.2 -0.56 -0.6 -0.44 0.74 0.73 0.74 -2.27
0.2 -6.16 -0.84 -0.75 -0.61 -0.06 -0.29 -0.55 -0.46 0.71 0.77 0.85 0.76
-0.38 -1.66 -0.05 0.06 0.38 -0.15 -0.11 -0.19 -0.01 0.59 0.51 0.44 -0.68
0.73 -1.54 - - - -0.67 -0.66 -0.88 -0.88 1.44 1.37 1.62 -1.83
-0.06 -1.52 0.5 0.86 1.11 -1.17 -1.35 -1.88 -1.56 0.44 0.63 0.47 -0.84
-0.82 -3.08 0.34 0.37 0.63 -0.49 -0.75 -1.23 -0.68 0.87 0.87 0.91 -1.67
-0.24 -0.94 0.26 0.14 0.6 -0.55 -0.47 -0.55 -0.21 0.57 0.35 0.56 -0.67
0.28 -3.97 0.65 0.67 0.67 0.09 -0.3 -0.41 -0.14 -0.26 -0.13 -0.01 -0.52
-0.01 -0.25 -0.82 -0.64 -0.75 -0.53 -0.33 -0.2 -0.26 0.8 0.92 0.88 -0.52
-0.29 -1.84 0.42 -0.27 -0.07 -1.45 -1.19 -1.25 -1.44 1.24 1.08 1.08 -0.72
0.37 -1.92 -0.84 -0.77 -0.6 0.32 0.46 0.4 0.58 0.44 0.25 0.41 -1.59
0.27 -1.98 -0.75 -0.7 -0.29 -1.23 -0.38 -0.86 -1.58 1.08 1.03 1.22 -0.08
-0.11 -1.16 0.27 0.25 0.62 -1.57 -2.16 -2.41 -2.05 1.07 1.13 1.1 -1.86
-0.96 0.24 -0.37 -0.22 -0.61 -1.28 -1.2 -1.66 -0.86 0.97 1.14 1.27 -0.47
0.05 -0.47 -0.89 -0.93 -0.24 -0.2 -0.54 -0.54 -0.08 0.91 0.83 0.99 -0.99
0.12 -0.77 -0.77 -0.17 -0.36 -0.47 -0.11 -0.42 -0.65 0.53 0.61 0.61 0.62
0.27 -2.47 -0.61 -0.24 0.27 -1.36 -1.22 -1.34 -1.2 1.29 1.13 1.23 -1.86
0.33 -1.12 0.02 0.08 0.55 -0.24 -0.46 -0.64 -0.19 0.52 0.48 0.64 -1.91
0.16 0.02 -0.17 -0.34 0.1 -0.24 -0.22 -0.22 -0.18 0.41 0.34 0.41 -0.42
0.49 -2.14 -0.04 -0.11 0.59 -0.44 -0.5 -0.56 -0.35 0.65 0.59 0.64 -1.22
-0.87 -0.17 0.19 -0.08 2.0 -2.33 -1.77 -2.32 -2.33 0.88 0.46 0.32 -3.24
-0.3 -2.04 -0.12 -0.08 0.4 -0.62 -0.55 -0.57 -0.32 0.93 0.84 0.94 -1.64
-0.95 -0.61 -1.14 -0.89 -1.0 -0.09 -0.53 -1.01 0.96 1.0 1.09 0.8 -1.36
0.17 -2.81 0.12 0.21 -0.01 -0.5 -0.35 -0.56 -0.4 0.55 0.44 0.35 0.56
0.37 -3.57 -0.69 0.27 0.47 -1.92 -1.69 -1.12 -1.02 0.8 0.94 1.06 0.2
0.27 -0.09 -0.48 -0.68 -0.04 -2.13 -1.35 -1.99 -2.66 1.32 0.95 1.45 -1.51
-0.02 -2.43 -0.08 0.0 0.09 -0.05 0.14 0.06 0.32 0.34 0.22 0.27 -0.28
-0.39 -0.34 0.21 -0.34 0.07 -0.53 -0.69 -0.91 -0.56 0.71 0.78 0.81 -0.3
-0.61 -3.89 -0.19 -0.27 0.19 -4.18 -2.75 -2.85 -2.75 1.51 1.48 1.67 -3.14
-0.23 -4.58 0.25 0.19 0.29 0.17 -0.29 -0.36 0.08 0.51 0.17 0.53 -0.36
-0.64 -1.92 -2.49 -3.66 -4.74 -4.39 -1.77 -2.51 -2.76 1.72 2.09 1.83 -5.27
0.32 -0.11 -0.71 -0.69 0.25 -2.17 -2.04 -2.2 -1.86 1.28 1.13 1.33 -1.69
-0.2 -1.37 0.57 0.49 -0.06 -0.65 -0.76 -1.17 -0.48 0.73 0.7 0.54 -0.38
0.45 -3.36 -0.89 -0.15 -0.55 -0.21 -0.24 -0.11 -0.37 0.69 0.7 0.72 0.16
-0.39 -0.64 -0.27 0.09 -0.38 -0.94 -1.07 -1.05 -0.55 0.97 0.84 0.87 0.26
-0.16 -2.03 0.04 -1.68 -0.67 -1.82 -1.09 -1.01 -1.3 1.44 1.19 1.24 -0.21
-0.42 -3.19 0.37 -0.28 0.8 -0.23 -0.69 -0.78 -0.21 0.76 0.74 0.75 -1.65
0.37 -3.85 -0.58 -0.09 0.07 -1.4 -1.06 -1.1 -1.25 1.15 1.06 1.18 -0.59
0.05 -3.5 -1.33 -1.45 -1.32 0.48 -0.05 -0.14 0.05 0.74 0.94 1.06 -0.46
-0.25 -0.43 -2.69 -2.79 -2.4 -2.8 -1.53 -1.22 -1.35 1.34 1.66 1.37 0.41
-0.37 -4.51 0.43 0.53 0.36 -0.45 -0.44 -0.67 -0.43 0.51 0.58 0.61 -0.29
0.17 -0.99 -0.17 0.58 0.5 -0.3 -0.15 -0.19 -0.02 0.25 0.2 0.35 -1.38
0.03 -1.94 0.1 -0.55 0.22 0.65 0.5 0.15 0.31 -0.0 -0.08 -0.03 -0.87
0.35 -2.81 -0.34 0.2 0.07 -0.64 -0.54 -0.33 -0.32 0.72 0.74 0.7 -0.47
0.49 -1.73 0.46 0.49 0.71 -1.74 -1.41 -1.51 -1.65 0.47 0.76 0.63 -0.14
0.01 -2.87 -0.01 0.27 0.17 -0.36 -0.26 -0.33 -0.26 0.64 0.72 0.75 -1.33
-0.48 -0.25 -0.11 -0.09 -0.29 -0.02 -0.35 -0.59 -0.29 0.51 0.47 0.53 0.31
0.31 -2.9 -0.3 -0.12 -0.02 -0.04 0.26 0.42 0.24 0.19 0.31 0.39 -0.87
-0.11 -0.8 0.1 -0.12 0.15 -0.08 -0.23 -0.38 -0.17 0.4 0.42 0.49 -0.18
-0.24 -0.61 -0.63 0.05 0.12 -1.01 -0.85 -0.77 -0.42 0.8 0.81 0.97 -0.16
-0.4 -2.91 -1.17 -0.7 -0.04 -0.89 -1.24 -1.56 -1.16 1.4 1.39 1.35 -0.93
-0.46 -3.65 -1.12 -0.23 -0.3 -1.07 -3.2 - -1.15 1.54 1.44 1.77 -
-0.37 -1.63 0.17 0.48 0.45 0.01 -0.62 -0.51 -0.37 0.27 0.24 0.35 0.28
-0.49 -1.53 -0.5 -0.13 -0.14 -0.91 -0.83 -1.16 -0.98 1.08 1.0 1.28 -0.3
-0.0 -1.47 -4.47 -5.0 -4.56 -0.86 -1.11 -1.39 -0.61 1.68 1.42 1.71 -1.72
-0.56 -1.39 -0.19 0.29 0.75 -0.98 -1.4 -1.3 -0.79 0.89 0.53 0.73 0.41
0.04 0.37 -0.09 0.16 0.14 -0.93 -1.16 -1.17 -0.69 0.57 0.43 0.58 0.2
-0.04 -0.4 0.0 0.07 0.32 -0.28 -0.72 -1.15 -0.52 0.72 0.72 0.67 -1.0
-0.31 -4.18 0.35 0.77 0.7 -1.64 -1.52 -1.36 -1.6 0.92 1.0 1.02 -2.2
-0.79 -25.63 -0.56 -0.66 0.18 -0.23 -1.61 -4.82 0.14 1.12 1.12 1.22 -0.03
-0.37 -1.84 -0.08 0.07 0.43 -0.19 -0.24 -0.27 0.09 0.68 0.47 0.58 -1.02
-1.11 -1.55 -0.55 -0.1 0.58 -0.5 -0.79 -0.85 -0.5 0.73 0.97 0.83 0.22
-0.39 -3.86 -1.59 -0.54 -0.69 -2.43 -1.54 -1.99 -2.64 1.41 1.8 1.4 -0.33
-0.15 -1.11 -0.7 -0.91 -0.26 0.41 -0.04 -0.19 -0.07 0.75 0.83 0.7 -1.2
0.4 -2.32 0.27 0.26 0.41 -0.86 -1.04 -1.08 -0.81 0.77 0.93 0.83 -1.8
-0.74 -1.94 -0.08 -0.32 0.55 -1.07 -1.0 -0.68 -1.3 1.22 1.05 1.23 -2.44
-0.05 -5.9 -0.2 -0.05 0.02 -0.62 -0.56 -0.58 -0.69 1.04 1.14 1.03 -1.92
-1.02 -0.4 -1.71 -2.96 -1.43 -2.26 -2.07 -2.24 -1.92 1.61 1.59 1.53 0.08
-0.39 -1.76 -0.73 -0.83 -0.86 -0.51 -0.87 -0.4 -0.2 0.94 1.01 1.31 -0.09
0.69 -2.62 - -4.52 - - -3.24 -4.87 - 1.62 2.37 1.22 -1.19
0.02 -2.33 -2.58 -2.77 -1.62 -0.56 -1.44 - -0.36 1.49 1.46 1.59 -0.41
0.17 -1.57 -0.24 0.0 0.22 -0.57 -0.37 -0.62 -0.58 0.77 0.75 0.79 -0.64
-1.35 -1.19 -0.19 0.42 -0.02 -2.27 -2.36 -2.65 -1.76 1.45 1.46 1.34 -3.36
-0.05 -0.3 -0.51 -0.61 -0.4 -0.18 -0.25 -0.46 -0.23 0.65 0.72 0.78 -0.2
-0.53 -3.04 -1.32 0.03 -0.61 -1.2 -1.0 -0.9 -1.0 1.22 1.28 1.37 -0.33
0.08 -0.98 -0.35 -0.85 0.19 -0.4 -0.96 -1.23 -0.43 0.94 0.9 1.04 -0.56
-0.5 -3.88 -2.2 -1.7 -2.07 -1.41 -1.27 -1.42 -1.57 1.44 1.69 1.68 -0.32
-0.22 -1.17 -0.76 -0.81 -0.49 0.08 0.07 0.19 0.2 0.69 0.65 0.69 -0.69
-0.77 -1.09 -2.36 -1.84 0.14 -3.18 -2.46 -2.27 -3.6 1.65 1.59 1.6 -0.71
0.28 -1.38 0.39 0.06 0.37 0.24 -0.01 -0.2 0.12 -0.27 -0.27 -0.12 0.05
-0.18 -0.2 -1.34 -0.9 -0.58 -1.21 -0.92 -0.79 -1.46 1.27 1.43 1.23 -1.81
0.18 -0.5 -0.05 0.06 0.17 -0.19 -0.11 -0.12 0.09 0.26 0.4 0.3 -1.03
-0.34 -1.74 0.03 -0.44 0.12 -2.19 -2.27 -2.31 -2.42 1.24 1.44 1.34 -0.61
-0.14 -1.98 0.22 0.04 0.26 0.01 -0.13 -0.23 -0.21 0.25 0.37 0.42 -0.02
-0.42 -1.11 -0.65 -0.33 0.38 -1.85 -2.08 -2.21 -2.47 1.39 1.43 1.36 -2.01
0.14 -1.23 -0.22 -0.32 0.36 -0.56 -0.81 -1.04 -0.6 0.99 0.89 0.95 -1.45
0.49 -2.97 0.0 -0.09 0.16 -0.05 0.31 0.35 0.14 0.25 0.23 0.24 -1.81
0.3 -1.83 -0.9 -0.92 0.67 -0.49 -0.6 -0.35 -2.04 1.03 1.03 1.23 -
-0.36 -2.51 -0.48 -0.65 -0.35 -0.16 -0.07 -0.03 -0.32 0.93 1.07 1.03 -2.12
-0.16 0.07 -0.68 -0.66 0.28 -1.59 -1.43 -1.36 -1.23 1.16 1.06 1.22 -1.25
0.39 0.33 0.06 -0.17 0.26 -1.08 -1.07 -1.23 -1.14 0.75 0.69 0.81 -1.21
-0.59 -3.46 -0.43 -0.17 -0.45 -1.67 -1.05 -1.02 -1.25 0.96 1.29 1.21 0.56
-0.9 -6.03 - - - -4.85 -3.38 -5.72 -6.72 2.01 1.98 2.05 -2.42
0.45 -2.18 0.13 0.46 -1.96 -0.23 0.12 0.01 -0.35 0.26 0.52 0.48 -0.11
-0.95 -2.33 - - - -2.76 -4.0 -3.97 -2.03 1.91 1.81 2.05 -1.47
0.68 -0.53 -3.92 -3.14 -4.04 -1.48 -0.68 -0.66 -0.47 1.24 1.03 1.02 0.76
-0.61 -1.16 -0.89 -0.83 -0.73 -0.29 -0.7 -0.81 -0.43 1.05 1.15 1.22 -0.26
-0.15 -1.73 - - - 0.07 0.15 0.14 -0.33 1.3 1.27 1.27 -1.17
-1.01 - -0.07 -0.04 0.05 0.35 -1.11 -6.8 0.15 0.87 0.99 0.97 -0.13
-0.12 -2.43 0.42 0.39 0.21 -0.43 -0.64 -0.46 -0.35 0.71 0.72 0.75 -2.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.