Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Vegetative Sporophyte	Adult Sporophyte	Leaf (0 mg/L NH4NO3)	Leaf (30 mg/L NH4NO3)	Leaf (90 mg/L NH4NO3)	Sporophyte; w/o NH4NO3, w/o cyanobacteria	Sporophyte; w/o NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w cyanobacteria	Sporophyte; w NH4NO3, w/o cyanobacteria	Root Tip, D-3 6h mock treated	Root Tip, D-3 6h 0.1 uM IAA treated	Root Tip, D-3 6h 0.5 uM trans-zeatin treated	Microsporocarp
Azfi_s0001.g000192	0.37	0.21	0.31	0.5	0.56	0.35	0.35	0.3	0.35	0.92	0.86	1.0	0.21
Azfi_s0001.g000493	0.72	0.03	0.25	0.27	0.37	0.2	0.19	0.19	0.24	1.0	0.97	0.98	0.15
Azfi_s0001.g000606	0.45	0.27	0.45	0.4	1.0	0.23	0.24	0.28	0.27	0.76	0.64	0.73	0.19
Azfi_s0001.g000807 (EDA9)	0.54	0.12	0.17	0.28	0.38	0.17	0.2	0.17	0.14	1.0	0.92	0.95	0.01
Azfi_s0001.g000915	0.77	0.68	0.59	0.46	0.54	0.64	0.63	0.65	0.66	0.95	0.94	1.0	0.67
Azfi_s0001.g000970	0.2	0.13	0.18	0.18	0.19	0.07	0.08	0.07	0.1	0.88	0.96	1.0	0.61
Azfi_s0001.g001009	0.81	0.83	0.59	0.58	1.0	0.72	0.82	0.87	0.77	0.89	0.99	0.95	0.35
Azfi_s0002.g001246 (GLT1)	0.75	0.26	1.0	0.64	0.68	0.27	0.29	0.32	0.42	0.71	0.6	0.71	0.67
Azfi_s0002.g001384	0.46	0.16	0.16	0.21	0.32	0.27	0.21	0.31	0.25	1.0	0.97	0.89	0.51
Azfi_s0003.g007692	0.69	0.1	0.74	0.71	0.81	0.72	0.66	0.61	0.68	0.85	1.0	0.98	0.33
Azfi_s0003.g007704	0.58	0.06	0.25	0.32	0.59	0.51	0.35	0.28	0.35	0.99	0.93	1.0	0.19
Azfi_s0003.g007809 (ACA4)	0.49	0.04	0.2	0.36	0.39	0.22	0.24	0.23	0.22	0.99	0.89	1.0	0.13
Azfi_s0003.g007842	0.86	0.24	0.77	0.99	0.7	0.45	0.45	0.41	0.44	0.9	0.81	1.0	0.72
Azfi_s0003.g007941 (LSR3)	0.36	0.12	0.0	0.0	0.0	0.27	0.28	0.26	0.39	0.89	0.84	1.0	0.16
Azfi_s0003.g007943 (ATMS1)	0.72	0.07	0.68	0.59	0.92	0.55	0.72	0.83	0.71	0.93	0.98	1.0	0.15
Azfi_s0003.g007963 (MNS1)	0.37	0.14	0.46	0.47	0.73	0.21	0.21	0.22	0.25	1.0	0.97	1.0	0.18
Azfi_s0003.g008012 (UBC19)	0.74	0.13	0.77	0.91	1.0	0.69	0.7	0.65	0.69	0.69	0.69	0.7	0.3
Azfi_s0004.g008611 (ECT8)	0.31	0.22	0.53	0.73	0.8	0.16	0.19	0.2	0.19	0.74	0.85	1.0	0.5
Azfi_s0004.g008852	0.56	0.31	0.08	0.06	0.03	0.18	0.13	0.13	0.16	0.96	0.98	1.0	0.18
Azfi_s0005.g009412	0.65	0.36	0.19	0.09	0.2	0.7	0.41	0.11	1.0	0.97	1.0	1.0	0.21
Azfi_s0006.g009541	0.41	0.07	0.32	0.33	0.44	0.24	0.24	0.21	0.32	0.94	1.0	0.96	0.26
Azfi_s0006.g010033 (SOL1)	0.64	0.72	0.31	0.36	0.49	0.36	0.34	0.4	0.31	0.96	0.81	1.0	0.21
Azfi_s0006.g010090	0.71	0.05	0.68	0.55	0.55	0.8	0.67	0.54	0.75	0.86	0.96	1.0	0.59
Azfi_s0006.g010112	0.76	0.25	0.63	1.0	0.71	0.59	0.63	0.61	0.74	0.76	0.72	0.74	0.16
Azfi_s0006.g010167 (CIPK3)	0.45	0.06	0.34	0.22	0.48	0.32	0.2	0.18	0.19	1.0	0.92	0.88	0.19
Azfi_s0006.g010385	0.98	0.07	0.49	0.56	0.58	0.91	0.82	0.84	0.93	1.0	0.88	0.89	0.71
Azfi_s0006.g010455	0.72	0.48	0.9	1.0	0.99	0.52	0.46	0.43	0.48	0.96	0.94	0.96	0.37
Azfi_s0006.g010477 (D6PK)	0.28	0.19	0.23	0.24	0.26	0.35	0.26	0.25	0.32	0.89	0.95	1.0	0.36
Azfi_s0007.g010743	0.57	0.19	0.95	1.0	0.72	0.88	0.81	0.78	0.93	0.92	0.98	1.0	0.45
Azfi_s0007.g010868 (ASP1)	0.36	0.02	0.08	0.23	0.15	0.14	0.18	0.18	0.11	0.92	1.0	0.91	0.08
Azfi_s0010.g012066 (CID12)	0.47	0.25	0.46	0.57	0.84	0.5	0.38	0.36	0.4	1.0	0.95	0.94	0.37
Azfi_s0010.g012357	0.56	0.09	0.39	0.29	0.62	0.32	0.25	0.26	0.22	1.0	0.92	0.92	0.23
Azfi_s0011.g012737	0.57	0.44	0.63	0.63	0.83	0.69	0.63	0.57	0.71	0.93	1.0	0.99	0.25
Azfi_s0013.g013315 (DESZ)	0.28	0.17	0.32	0.28	0.49	0.26	0.29	0.26	0.33	0.93	0.96	1.0	0.36
Azfi_s0017.g014553 (LSR1)	0.44	0.08	0.3	0.37	0.5	0.38	0.42	0.45	0.48	0.98	1.0	0.94	0.21
Azfi_s0018.g014790 (SRF3)	0.31	0.34	0.5	0.68	1.0	0.19	0.2	0.19	0.18	0.53	0.54	0.6	0.1
Azfi_s0018.g014850 (EME1B)	0.61	0.11	0.6	0.76	0.72	0.64	0.63	0.56	0.91	0.96	0.98	1.0	0.35
Azfi_s0019.g015305 (RAB2A)	0.49	0.03	0.66	0.5	0.62	0.74	0.61	0.53	0.62	0.98	1.0	0.97	0.44
Azfi_s0021.g015701 (RPT3)	0.81	0.33	0.49	0.57	0.69	0.52	0.4	0.39	0.44	1.0	0.99	1.0	0.12
Azfi_s0022.g016044 (RAB2A)	0.63	0.01	0.31	0.33	0.36	0.53	0.45	0.38	0.4	0.9	0.94	1.0	0.94
Azfi_s0022.g016141 (DER1)	0.51	0.21	0.64	0.69	0.86	0.6	0.61	0.58	0.66	1.0	0.95	0.9	0.41
Azfi_s0028.g023822 (PK5)	0.54	0.11	0.0	0.0	0.0	0.2	0.21	0.18	0.18	0.88	0.84	1.0	0.09
Azfi_s0030.g024428	0.44	0.16	0.65	0.84	1.0	0.2	0.18	0.13	0.16	0.63	0.71	0.64	0.26
Azfi_s0034.g025253	0.3	0.06	0.67	0.69	0.82	0.38	0.32	0.23	0.33	0.97	0.97	1.0	0.17
Azfi_s0037.g025959	0.56	0.34	0.79	0.72	1.0	0.45	0.48	0.45	0.57	0.98	0.84	0.97	0.41
Azfi_s0040.g026629	0.76	0.04	0.98	1.0	0.99	0.67	0.51	0.47	0.57	0.52	0.57	0.62	0.44
Azfi_s0043.g027022 (NFU5)	0.52	0.44	0.3	0.34	0.31	0.37	0.42	0.46	0.44	0.92	1.0	0.97	0.37
Azfi_s0043.g027094	0.34	0.12	0.57	0.35	0.4	0.15	0.19	0.18	0.16	1.0	0.89	0.89	0.26
Azfi_s0045.g030056	0.87	0.18	0.37	0.39	0.44	0.83	0.92	0.89	1.0	0.91	0.79	0.89	0.22
Azfi_s0045.g030095 (LRL1)	0.52	0.11	0.26	0.26	0.35	0.18	0.33	0.24	0.14	0.91	0.88	1.0	0.4
Azfi_s0047.g030352 (PAO3)	0.42	0.2	0.55	0.54	0.7	0.15	0.1	0.09	0.11	0.95	1.0	0.98	0.13
Azfi_s0048.g030535	0.21	0.49	0.32	0.36	0.27	0.17	0.18	0.13	0.23	0.81	0.91	1.0	0.3
Azfi_s0049.g030786	0.52	0.36	0.27	0.27	0.43	0.44	0.35	0.35	0.48	0.95	0.9	1.0	0.25
Azfi_s0055.g034005	0.71	0.38	0.38	0.58	0.51	0.47	0.6	0.49	0.42	0.94	0.99	0.99	1.0
Azfi_s0056.g034196 (STT3A)	0.49	0.07	0.27	0.35	0.49	0.16	0.18	0.16	0.18	1.0	0.89	0.96	0.11
Azfi_s0062.g035196	0.81	0.3	0.65	0.68	0.94	0.54	0.47	0.41	0.56	0.92	0.9	1.0	0.17
Azfi_s0063.g035314	0.84	0.76	0.67	0.59	0.8	0.64	0.65	0.65	0.67	1.0	0.95	1.0	0.56
Azfi_s0063.g035384 (BSL3)	0.9	0.14	0.62	0.59	0.96	0.47	0.45	0.43	0.5	1.0	0.96	1.0	0.27
Azfi_s0064.g035418	0.14	0.22	0.28	0.24	1.0	0.05	0.07	0.05	0.05	0.46	0.34	0.31	0.03
Azfi_s0064.g035711 (ACBP4)	0.42	0.13	0.48	0.49	0.69	0.34	0.36	0.35	0.42	0.99	0.94	1.0	0.17
Azfi_s0067.g036176 (HEC1)	0.24	0.31	0.21	0.25	0.24	0.44	0.33	0.23	0.91	0.94	1.0	0.82	0.18
Azfi_s0073.g037275	0.76	0.1	0.74	0.79	0.67	0.48	0.53	0.46	0.51	0.99	0.92	0.86	1.0
Azfi_s0075.g037601	0.62	0.04	0.3	0.58	0.67	0.13	0.15	0.22	0.24	0.84	0.92	1.0	0.55
Azfi_s0078.g038258	0.44	0.34	0.26	0.23	0.36	0.08	0.14	0.09	0.06	0.91	0.71	1.0	0.13
Azfi_s0087.g042354 (SP7)	0.78	0.15	0.75	0.79	0.84	0.76	0.87	0.83	0.99	1.0	0.92	0.96	0.65
Azfi_s0090.g042701	0.43	0.45	0.66	0.45	0.6	0.39	0.35	0.3	0.39	0.93	0.98	1.0	0.46
Azfi_s0094.g043480	0.2	0.02	0.27	0.26	0.36	0.02	0.05	0.04	0.05	0.89	0.87	1.0	0.04
Azfi_s0099.g044033 (CRLK1)	0.59	0.03	0.82	0.79	0.84	0.78	0.57	0.54	0.73	0.98	0.78	1.0	0.54
Azfi_s0101.g044383 (MPK5)	0.15	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.77	1.0	0.83	0.01
Azfi_s0102.g044441	0.49	0.37	0.24	0.25	0.47	0.09	0.1	0.09	0.11	0.96	0.87	1.0	0.12
Azfi_s0104.g044705	0.53	0.23	0.9	0.85	0.58	0.39	0.36	0.27	0.43	1.0	0.98	0.88	0.46
Azfi_s0104.g044735	0.83	0.06	0.33	0.55	0.41	0.52	0.51	0.56	0.47	0.98	0.99	1.0	0.68
Azfi_s0111.g045712	0.39	0.33	0.42	0.54	0.39	0.27	0.24	0.25	0.35	1.0	0.91	0.93	0.61
Azfi_s0113.g046004	0.33	0.09	0.38	0.11	0.23	0.1	0.17	0.18	0.15	1.0	0.84	0.87	0.32
Azfi_s0117.g046457 (RAB2A)	0.43	0.06	0.74	0.47	1.0	0.49	0.36	0.34	0.5	0.98	0.96	0.97	0.18
Azfi_s0117.g046518 (SNP33)	0.57	0.03	0.3	0.41	0.46	0.17	0.21	0.21	0.19	0.98	0.92	1.0	0.29
Azfi_s0121.g046927 (EXO70F1)	0.5	0.04	0.19	0.18	0.19	0.67	0.46	0.44	0.5	0.8	0.92	1.0	0.35
Azfi_s0127.g048713 (NTT)	0.27	0.23	0.05	0.05	0.06	0.05	0.11	0.14	0.12	0.8	1.0	0.81	0.42
Azfi_s0129.g048924 (BLOS2)	0.51	0.03	0.88	0.94	0.84	0.48	0.48	0.41	0.49	0.93	0.98	1.0	0.53
Azfi_s0130.g049084 (E2FB)	0.75	0.33	0.59	1.0	0.94	0.54	0.6	0.58	0.66	0.79	0.77	0.85	0.26
Azfi_s0132.g049189	0.65	0.17	0.69	0.44	0.74	1.0	0.91	0.71	0.79	0.64	0.6	0.63	0.35
Azfi_s0138.g051128 (SIZ1)	0.76	0.09	0.47	0.69	0.63	0.38	0.41	0.48	0.48	0.98	1.0	0.97	0.43
Azfi_s0151.g053335	0.83	0.18	0.81	0.83	0.97	0.18	0.22	0.21	0.19	0.82	1.0	0.92	0.53
Azfi_s0151.g053345 (SNX1)	0.6	0.08	0.59	0.72	0.67	0.46	0.5	0.47	0.5	0.93	0.98	1.0	0.24
Azfi_s0159.g053937 (BPC3)	0.5	0.58	0.64	0.65	0.57	0.68	0.54	0.46	0.57	0.99	0.96	1.0	0.85
Azfi_s0160.g054044 (TAF15)	0.93	0.1	0.61	0.69	0.74	0.73	0.9	1.0	0.88	0.86	0.93	0.98	0.41
Azfi_s0173.g055758	0.66	0.41	0.77	0.66	0.79	0.67	0.61	0.55	0.63	0.95	0.95	1.0	0.63
Azfi_s0197.g057315 (REV1)	0.43	0.34	0.33	0.53	0.56	0.25	0.28	0.3	0.38	0.89	0.9	1.0	0.46
Azfi_s0198.g057389	0.29	0.05	0.17	0.23	0.37	0.2	0.16	0.13	0.17	1.0	0.99	0.97	0.2
Azfi_s0212.g058221	0.21	0.02	0.14	0.25	0.24	0.14	0.03	0.0	0.13	0.85	0.8	1.0	0.0
Azfi_s0241.g059714	0.55	0.23	0.8	1.0	0.98	0.72	0.47	0.5	0.55	0.86	0.85	0.91	0.87
Azfi_s0242.g059830	0.29	0.14	0.29	0.38	0.37	0.22	0.23	0.18	0.21	0.87	0.82	1.0	0.33
Azfi_s0243.g059860 (HGL1)	0.31	0.11	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.12	0.2	0.98	0.82	1.0	0.09
Azfi_s0245.g059948	0.37	0.21	0.47	0.66	0.91	0.27	0.2	0.22	0.31	1.0	0.78	0.9	0.72
Azfi_s0246.g060047 (TTN6)	0.69	0.87	0.63	0.75	0.74	0.35	0.3	0.3	0.41	1.0	0.9	1.0	0.77
Azfi_s0254.g060456 (SSP5)	0.59	0.46	0.61	0.64	0.76	0.5	0.37	0.27	0.42	1.0	1.0	0.97	0.3
Azfi_s0264.g060924	0.4	0.03	0.63	0.84	0.8	0.16	0.17	0.19	0.16	0.93	0.99	1.0	0.11
Azfi_s0270.g061164	0.25	0.0	0.29	0.27	0.49	0.37	0.14	0.02	0.47	0.93	0.93	1.0	0.42
Azfi_s0270.g061171 (VPS45)	0.48	0.17	0.59	0.65	0.84	0.54	0.53	0.52	0.66	1.0	0.87	0.93	0.31
Azfi_s0273.g061336	0.24	0.17	0.35	0.48	0.76	0.36	0.3	0.28	0.36	0.85	1.0	0.91	0.6
Azfi_s0273.g061340 (ROPGEF1)	0.22	0.02	0.1	0.2	0.18	0.05	0.1	0.07	0.05	0.76	1.0	0.75	0.23
Azfi_s0289.g063282	0.5	0.26	0.35	0.3	0.47	0.74	0.55	0.49	0.54	0.94	1.0	0.91	0.24
Azfi_s0290.g063325 (RPT6A)	0.69	0.11	0.63	0.63	0.7	0.29	0.26	0.25	0.3	0.9	1.0	0.94	0.15
Azfi_s0302.g063736	0.26	0.11	0.41	0.34	0.63	0.2	0.21	0.27	0.17	0.99	0.89	1.0	0.08
Azfi_s0317.g064363	0.44	0.01	0.4	0.44	0.46	0.3	0.31	0.3	0.28	0.93	1.0	0.93	0.12
Azfi_s0322.g064523	0.16	0.25	0.1	0.04	0.12	0.07	0.08	0.07	0.09	1.0	0.99	0.95	0.35
Azfi_s0330.g065386 (RAB6)	0.31	0.12	0.24	0.23	0.22	0.28	0.22	0.31	0.35	0.78	0.81	1.0	0.38
Azfi_s0341.g065662	0.31	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.59	1.0	0.45	0.08
Azfi_s0350.g066558	0.34	0.07	0.06	0.05	0.11	0.23	0.12	0.0	0.26	0.94	0.91	1.0	0.25
Azfi_s0373.g067173	0.65	0.2	0.49	0.58	0.68	0.39	0.45	0.38	0.39	0.99	0.98	1.0	0.37
Azfi_s0375.g067237 (KJK)	0.14	0.16	0.32	0.49	0.36	0.08	0.07	0.06	0.11	0.99	1.0	0.92	0.04
Azfi_s0388.g067594 (OBE2)	0.56	0.47	0.41	0.38	0.44	0.51	0.49	0.42	0.5	0.91	0.96	1.0	0.51
Azfi_s0388.g067597	0.27	0.05	0.16	0.4	0.25	0.17	0.19	0.21	0.19	0.91	0.94	1.0	0.31
Azfi_s0399.g068196 (ATG18G)	0.51	0.25	0.38	0.27	0.56	0.37	0.25	0.21	0.36	0.93	0.9	1.0	0.33
Azfi_s0405.g068386	0.22	0.02	0.07	0.09	0.07	0.12	0.13	0.12	0.1	0.84	1.0	0.99	0.25
Azfi_s0466.g072778	0.53	0.28	0.37	0.35	0.44	0.66	0.65	0.71	0.71	1.0	0.97	1.0	0.38
Azfi_s0535.g076102 (RHS8)	0.19	0.15	0.06	0.09	0.35	0.04	0.06	0.07	0.03	1.0	0.96	0.96	0.19
Azfi_s0577.g078247	0.93	0.29	1.0	0.79	0.99	0.9	0.75	0.66	0.83	0.63	0.63	0.7	0.79
Azfi_s0578.g078260 (GUX3)	0.33	0.32	0.15	0.2	0.25	0.16	0.2	0.21	0.14	0.9	1.0	0.87	0.11
Azfi_s0580.g078305	0.86	0.54	0.73	0.79	0.85	0.67	0.71	0.7	0.81	0.91	1.0	0.94	0.37
Azfi_s0596.g078823	0.29	0.11	0.38	0.27	0.4	0.08	0.08	0.07	0.07	0.87	1.0	0.93	0.24
Azfi_s0620.g079580	0.68	0.19	0.87	0.77	0.89	0.75	0.68	0.64	0.65	0.89	0.97	1.0	0.74
Azfi_s0638.g080510	0.28	0.17	0.24	0.29	0.48	0.1	0.09	0.08	0.07	0.97	1.0	0.95	0.09
Azfi_s0704.g082656	0.56	0.22	0.43	0.4	0.65	0.34	0.29	0.25	0.33	1.0	0.93	0.98	0.19
Azfi_s0796.g087282 (LOS1)	1.0	0.09	0.71	0.67	0.8	0.69	0.88	0.91	0.79	0.85	0.83	0.84	0.2
Azfi_s0825.g088225	0.53	0.12	0.23	0.23	0.68	0.3	0.28	0.33	0.1	0.87	0.87	1.0	0.0
Azfi_s0976.g094215	0.37	0.08	0.34	0.3	0.37	0.43	0.45	0.47	0.38	0.91	1.0	0.97	0.11
Azfi_s1042.g095919	0.39	0.45	0.27	0.27	0.52	0.14	0.16	0.17	0.18	0.96	0.89	1.0	0.18
Azfi_s1174.g098812	0.75	0.72	0.59	0.51	0.68	0.27	0.27	0.24	0.26	0.96	0.92	1.0	0.25
Azfi_s1213.g099771	0.27	0.04	0.3	0.36	0.3	0.13	0.2	0.2	0.17	0.8	1.0	0.95	0.6
Azfi_s1498.g103675	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.98	0.95	1.0	0.05
Azfi_s1642.g105184	0.96	0.15	0.76	0.96	0.18	0.6	0.76	0.7	0.55	0.83	1.0	0.97	0.65
Azfi_s1903.g107954	0.13	0.05	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.06	0.91	0.85	1.0	0.09
Azfi_s2277.g110158	0.68	0.29	0.03	0.05	0.03	0.15	0.26	0.27	0.31	1.0	0.87	0.86	0.72
Azfi_s2745.g112880 (D6PK)	0.28	0.19	0.23	0.24	0.26	0.35	0.26	0.25	0.32	0.89	0.95	1.0	0.36
Azfi_s3525.g115997 (SNX2b)	0.37	0.12	0.0	0.0	0.0	0.43	0.45	0.45	0.32	1.0	0.98	0.98	0.18
Azfi_s3621.g116393 (WRKY4)	0.25	0.0	0.48	0.49	0.52	0.64	0.23	0.0	0.56	0.92	1.0	0.99	0.46
Azfi_s4235.g118410 (LWD1)	0.55	0.11	0.8	0.78	0.69	0.44	0.38	0.43	0.47	0.98	0.99	1.0	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)