Heatmap: Cluster_39 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
0.17 -2.27 -1.12 1.44 - 0.88 -0.36 -0.56 -0.88 -1.14 -1.31 2.63 -0.79 -1.17 -0.08 0.51 0.69 0.73 0.72 0.6 0.07 -1.05 -0.29 -0.92 -0.54 -1.08 0.75 0.69 -0.04 - -0.85 -0.87 -1.17 -2.35 0.88 0.17 -0.99 -1.11 0.27 0.61 -1.1 -1.65 -0.51 -0.83
AT1G04710 (PKT4)
-0.46 -1.13 -1.59 0.6 - -0.0 0.81 -2.41 -1.53 -1.35 -1.22 -2.53 -3.91 -0.28 -0.0 -0.79 -0.75 -0.04 0.49 0.57 0.27 0.61 0.73 0.06 -0.06 -0.14 0.57 0.31 0.87 -0.65 0.55 -0.99 0.32 0.98 0.91 1.35 -1.69 -1.32 0.45 0.34 0.12 0.44 0.22 -0.51
AT1G05100 (MAPKKK18)
-1.54 -0.15 -0.57 -5.15 2.68 -1.97 -1.7 -3.79 -2.06 -0.31 -1.37 2.63 0.38 -1.65 0.95 -5.11 -4.34 -2.95 -3.37 -3.33 0.55 -0.05 -0.93 1.37 1.48 1.9 -2.19 -2.58 -0.62 -7.42 -2.08 -0.43 -1.88 2.95 -4.37 -0.84 -5.42 -4.43 -2.45 -3.06 -3.71 -4.96 -2.62 -2.71
-1.62 2.34 0.03 -0.74 - -2.09 -1.95 -4.03 -0.65 -0.05 -0.41 -3.06 - 0.02 -0.29 1.07 1.92 1.94 -0.41 -1.32 1.78 -1.5 0.47 -5.16 -4.77 -0.91 1.56 1.79 -1.13 -7.35 -0.2 -2.18 -0.61 -0.36 0.25 -1.57 -0.89 -2.85 0.93 -1.32 -1.92 -3.24 -0.99 -0.48
- -0.1 0.5 2.51 - 0.75 -0.46 -3.05 -1.62 - -2.63 - - - -0.14 -0.42 -0.73 -0.64 0.63 -1.42 0.32 0.05 0.64 -0.17 -0.46 0.51 1.47 1.19 1.13 - -1.82 -0.13 - - 2.36 1.75 1.46 - -0.74 -1.78 - - -1.23 -2.02
-3.71 - -2.7 -3.19 4.62 -1.89 -0.74 -5.46 -5.7 - - -0.31 - -2.08 -3.67 -1.16 -4.35 -2.08 -1.26 0.66 -1.6 0.07 1.03 - - -0.89 -1.62 -1.58 0.59 0.76 -1.36 - -1.11 -3.68 -1.07 -0.46 -1.01 -1.88 -4.5 -0.49 -1.87 0.03 -4.03 0.52
0.74 3.51 0.78 -1.88 - -2.2 -2.47 -2.25 -4.24 -6.28 -6.07 - - 2.72 -2.49 -2.34 -3.98 -4.91 -2.41 -2.16 -2.38 -0.6 -2.15 -0.91 -1.67 0.62 -3.05 -2.83 -1.22 - 2.31 -1.32 2.67 -2.85 -5.54 -0.65 -1.77 -2.25 -3.05 0.35 -1.05 -3.27 -0.43 -0.18
0.64 -0.11 0.5 0.15 2.52 0.08 -1.79 -0.01 -0.13 -0.07 0.14 -2.77 -1.87 -0.13 -0.01 -0.31 -0.29 -0.03 -0.25 -0.57 0.08 -0.02 -0.19 0.34 0.11 -0.79 0.52 0.9 -0.46 -4.33 0.07 -1.47 -0.02 0.04 0.06 0.49 -1.9 -2.14 0.86 -0.29 -1.28 -1.45 -0.33 0.04
0.69 -0.84 -0.33 0.76 - 0.35 -0.56 -3.1 -2.65 -3.08 -3.02 -4.68 -6.81 -0.54 -0.61 0.35 0.71 0.91 0.74 0.08 0.27 0.88 -0.41 -0.67 -0.59 -0.73 1.0 1.25 0.21 - 0.08 -2.87 -0.19 -1.37 1.2 1.99 -2.72 -1.74 1.11 0.09 -1.18 0.69 0.63 -0.49
0.18 -0.68 -0.72 0.75 -4.89 0.25 0.16 -2.22 -1.62 -1.65 -1.53 -5.4 -3.36 -0.53 -0.8 0.15 0.51 0.93 0.75 0.91 0.12 0.21 0.24 -0.28 -0.36 -0.08 0.9 1.32 0.38 -2.36 -0.16 -0.34 -0.47 -1.62 1.23 0.56 -0.52 -0.19 0.9 0.37 -0.45 0.36 0.01 -0.24
-0.4 -2.14 -1.82 0.93 1.44 -0.14 -1.92 -0.81 -0.09 -0.06 -0.31 1.48 -1.81 -0.01 -0.23 0.49 1.1 1.67 0.71 0.36 0.6 0.34 -1.12 -1.26 -2.21 -1.91 0.94 -0.25 -0.89 -6.76 -0.65 -0.7 -1.3 -3.41 1.65 -0.11 0.25 -0.19 -1.13 -0.54 -1.17 -0.64 -0.45 -0.29
AT1G13220 (LINC2)
0.28 -1.3 -1.97 0.66 -1.02 -0.66 -1.1 -1.47 -1.0 -1.37 -1.2 -0.95 -0.44 -0.32 -0.6 -0.6 0.38 0.71 1.06 0.43 0.58 1.22 -0.63 -0.9 -1.71 -1.05 0.8 0.89 -0.05 -4.57 -0.5 -0.78 -0.62 -0.37 0.77 2.41 -2.41 -0.91 0.54 -0.37 -1.35 1.01 0.63 -0.99
0.75 0.16 1.35 0.94 2.18 0.82 -0.8 -2.14 -1.68 -1.64 -1.77 -0.78 -2.36 -0.2 -1.43 0.14 0.09 0.37 0.34 -0.06 -0.05 0.66 -0.53 0.63 0.25 0.19 0.09 0.12 0.29 -0.33 -0.46 -2.06 -0.6 -0.77 -0.03 -0.11 -2.65 -2.7 -0.11 0.32 -0.37 -0.19 -0.9 -0.13
0.57 -0.26 1.08 1.06 -0.09 0.95 0.11 -1.08 -1.03 -0.95 -1.12 -3.97 -4.07 -0.07 -0.33 0.08 0.48 0.59 0.63 0.57 0.18 0.13 0.25 0.19 0.24 -1.39 0.73 0.72 0.4 -4.27 0.02 -2.0 -0.01 -0.62 0.63 -0.95 -2.61 -3.1 0.55 0.27 0.01 0.09 -0.09 0.01
- - - - - - - 2.91 1.23 1.91 2.37 - - - - - 1.87 - - - 0.52 - - - - 0.19 1.04 - - - -3.14 - - - - 0.94 - - - 0.5 - 3.0 - 2.46
AT1G16330 (CYCB3;1)
0.78 -2.93 -1.28 1.94 2.01 1.2 -3.03 -9.58 - - - -1.8 - -0.24 -7.67 1.15 1.49 1.81 1.6 0.44 -0.36 -0.69 -1.95 -5.27 -4.31 0.04 1.15 1.69 -4.5 -0.56 -0.87 -4.32 -2.3 -7.65 1.45 -1.29 -5.97 -3.42 1.12 -1.18 -2.24 -0.47 -0.73 -1.85
AT1G16610 (SR45)
0.25 -1.11 -0.56 1.22 1.39 0.98 -0.3 -0.43 -0.22 -0.28 -0.32 -1.4 -0.63 -0.71 -0.28 0.49 0.76 0.91 0.62 0.09 -0.18 -1.54 -0.78 -0.66 -0.77 -1.13 0.74 1.07 -0.11 -6.58 -0.6 -0.94 -1.02 -0.91 1.43 -0.48 -1.35 -0.8 0.75 0.02 -0.04 -1.67 0.21 -0.41
-0.4 -0.42 0.21 1.53 - 2.68 - - - - 1.27 - - -3.29 -0.02 -5.51 -1.31 -2.14 - - 3.65 - - -1.48 - -3.98 -0.85 - - - -3.89 -0.92 -3.33 2.33 - 0.04 - 0.78 -2.07 0.98 -0.29 - 0.04 0.88
-1.11 0.4 0.21 0.95 -2.65 -0.38 -1.32 1.4 1.11 1.05 0.86 -0.43 -3.47 0.32 0.88 -1.28 -0.42 -0.21 -0.24 -0.32 0.18 0.85 -0.23 0.28 -1.4 -0.73 0.89 -0.09 0.04 -0.43 -0.26 -1.76 -0.44 -1.32 -0.42 0.71 -1.23 -0.46 -0.06 -0.68 -0.6 0.31 -0.87 0.18
-0.59 -1.37 -1.02 -0.04 -0.13 -0.64 -1.5 1.17 0.97 1.06 0.96 -2.44 - -0.78 0.27 -0.72 -1.15 -0.55 -0.23 -0.4 -0.05 0.37 -0.22 -0.74 -0.89 -1.25 0.02 -0.07 -1.39 - -0.59 0.97 -0.84 -0.03 0.6 1.19 2.05 1.16 -0.13 0.01 -1.75 -0.21 -0.23 -0.43
-0.68 -0.05 0.5 0.63 0.55 0.06 -1.04 -0.98 -0.8 -0.88 -0.89 -1.53 -2.98 0.39 0.12 -0.7 -0.35 0.25 0.6 0.47 0.12 0.0 0.26 0.32 -0.33 -0.67 0.92 0.68 0.42 -1.71 0.24 0.26 0.17 0.25 -0.23 0.06 0.65 0.83 0.5 0.2 -1.21 -1.12 -0.27 -0.66
1.47 2.64 1.9 0.31 0.37 0.52 -1.04 -2.53 -3.17 -3.78 -3.93 -2.02 -2.7 -0.31 -1.8 -0.75 -0.34 0.38 0.24 -0.28 0.2 0.21 -0.76 -0.07 -0.47 0.74 0.61 0.47 -0.26 0.75 -0.53 -5.5 -0.64 -2.45 -0.48 -1.43 - -5.61 0.3 0.7 -0.71 -1.26 0.28 -0.31
-1.03 0.52 -0.11 -0.21 2.32 -1.27 -0.65 1.09 0.47 0.53 0.22 0.98 1.32 -0.1 0.42 -1.46 -1.45 -1.4 -0.46 -0.26 0.02 -0.18 -0.61 0.36 -0.8 -1.13 -0.12 -0.41 0.04 -7.99 -0.58 -1.32 -0.41 -1.67 0.66 -0.77 -1.29 -1.21 -1.42 -0.53 -0.03 0.36 0.72 0.02
-0.52 -0.03 -0.53 0.4 -5.01 -0.36 -0.38 -0.58 0.25 0.45 0.6 -2.41 -0.73 -0.92 -0.32 -0.12 -0.28 -0.01 -0.02 -0.21 0.58 1.04 0.17 -0.43 -1.08 0.23 0.31 0.26 0.06 -0.5 -0.13 -0.82 -0.22 1.52 0.52 0.67 -1.21 -2.26 0.15 0.06 -0.66 0.84 0.86 -0.36
AT1G20930 (CDKB2;2)
0.5 -2.09 -1.26 1.69 - 0.67 -2.34 -3.91 -4.5 -3.72 -3.81 -2.91 0.16 0.12 -4.61 1.41 1.66 1.75 1.86 0.86 0.12 0.08 -1.52 -4.16 -2.98 -1.02 1.32 1.61 -3.2 -1.2 -0.16 -5.39 -1.19 -2.5 1.51 0.13 - -6.54 1.14 -1.23 -1.6 -0.04 -0.86 -1.26
3.17 -2.1 -0.32 4.02 - 2.35 - - - - - 1.04 -1.03 -0.09 -1.87 -3.5 -2.5 -2.4 -1.54 -2.75 -2.66 - -5.56 -3.75 -4.05 -2.28 -0.29 -2.24 -4.82 - -3.42 -3.06 -2.43 - 1.43 -2.92 -3.03 - -2.06 0.74 -2.88 - -0.91 -1.06
AT1G24340 (EMB260)
-0.82 0.49 0.19 0.86 -4.47 0.09 0.07 1.48 0.38 0.04 -0.05 -0.86 -0.93 0.17 0.61 -0.76 -0.72 -0.18 -0.08 0.19 -0.1 -0.77 0.2 0.35 -0.25 -1.19 0.56 0.41 0.23 -4.45 -0.23 -0.48 -0.09 0.22 0.35 0.11 -0.57 -0.51 0.04 0.56 -0.41 -0.66 0.58 -0.13
AT1G26810 (GALT1)
0.19 -0.59 0.17 0.14 1.4 -0.21 -0.57 -1.87 -2.97 -4.6 -4.23 -5.66 - 2.04 -0.83 -1.14 -0.39 0.1 0.8 0.4 0.13 0.25 0.05 1.02 -0.0 -2.07 1.28 0.65 0.15 -7.39 1.46 -4.15 1.69 -2.53 0.19 0.23 -6.35 -5.06 0.67 -0.57 -1.34 -0.5 -0.04 -0.56
0.71 2.56 1.63 1.07 - -0.17 -0.94 -0.83 0.34 -0.31 -0.14 -2.37 -2.29 0.1 -0.29 -1.26 -0.4 0.24 0.66 0.18 0.52 -1.25 -0.22 -1.24 -1.44 -2.12 1.41 0.72 -0.06 - -1.15 -2.26 -0.96 -2.61 1.07 -0.85 -1.94 -2.66 0.25 -0.63 -0.24 -1.24 -0.67 0.88
-1.72 -2.38 -2.58 -0.23 -2.53 -1.45 -0.15 -0.27 0.49 0.73 0.6 -0.58 -0.75 -1.31 0.76 -0.11 0.02 0.2 0.32 0.51 0.39 0.81 0.53 -1.09 -1.37 -1.14 0.63 0.08 -0.29 -2.6 -0.92 0.57 -0.51 0.31 0.47 1.16 1.31 0.8 -0.13 -0.02 -1.47 0.65 0.02 -1.08
0.97 -0.91 1.34 1.37 1.25 1.26 -0.6 -0.89 -2.79 -3.59 -3.46 -3.74 - -0.02 -0.95 0.66 0.58 0.51 0.58 0.15 -0.3 0.99 -0.48 0.86 1.08 -1.98 0.43 0.23 0.27 -6.21 -0.09 -4.11 -0.11 -3.44 0.13 0.23 -7.71 -5.1 0.14 0.35 -1.04 0.43 -0.45 -0.43
0.15 -0.05 0.67 0.55 -0.14 0.01 0.13 -0.04 0.19 -0.05 0.0 -0.63 0.36 0.82 0.44 -0.31 0.11 0.71 0.77 0.43 0.02 -0.75 0.21 0.58 -0.96 -1.19 0.82 0.26 -0.82 -3.97 -0.35 -3.38 -0.05 -0.53 0.85 -0.03 -9.62 -5.21 -0.4 0.18 -0.01 -0.37 0.05 0.37
0.27 -2.06 -0.7 1.36 - 0.87 -1.83 -6.35 -4.75 -5.12 -5.31 -0.37 - -1.23 -4.9 0.8 1.05 1.15 0.63 -0.41 -0.22 0.36 -0.91 -1.5 -2.59 0.27 0.78 1.18 -0.7 -3.23 -0.4 -1.26 -1.41 -3.49 1.55 2.41 1.06 -1.37 1.43 0.47 -1.95 -0.11 -1.08 -1.35
AT1G48880 (TBL7)
1.28 -0.67 1.13 0.79 -3.19 0.91 -1.13 -1.31 -0.23 -0.28 -0.72 -4.68 - 0.38 -1.17 0.3 0.4 0.61 0.4 -0.03 -0.29 0.34 -0.05 0.99 0.47 0.79 0.6 0.2 0.25 0.15 -0.1 -1.97 0.01 -1.43 0.47 0.43 -3.6 -2.19 -0.61 0.5 -0.6 -0.58 -0.7 -0.03
AT1G49620 (ICK5)
-0.86 -1.92 -0.07 0.58 2.67 0.65 -0.55 -2.76 -4.08 -4.03 -4.63 -3.86 -3.1 -0.14 -2.09 -0.18 -0.08 -0.53 -0.1 -0.82 -0.89 1.94 -1.15 2.56 -0.79 -0.9 0.55 1.17 0.68 -5.73 -1.61 -0.69 -1.9 -3.73 -0.07 -4.21 -0.49 -1.36 0.29 -0.1 -1.47 1.06 -0.23 -1.14
-1.33 0.45 - - - - - 2.66 1.24 0.18 0.1 0.73 - 3.58 - - -3.89 -1.75 - 1.22 -2.88 - -1.51 - -1.91 - -0.55 - - - -0.68 - -0.15 - -1.27 2.18 -0.31 -2.09 - - 0.7 - 0.32 1.69
AT1G53650 (CID8)
-0.07 0.02 0.14 -0.28 -6.56 0.14 -0.44 -0.71 -0.17 -0.35 -0.32 -5.66 -8.35 0.6 0.61 0.11 0.28 0.45 0.31 0.0 0.39 0.35 0.27 0.17 0.51 -0.1 0.67 0.91 0.53 -6.27 0.57 -2.05 0.27 -0.05 0.11 0.58 -4.09 -3.11 1.07 0.91 -0.61 0.02 -0.4 -0.05
AT1G54140 (TAF9)
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AT1G59510 (CF9)
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AT1G72470 (EXO70D1)
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AT1G78590 (NADK3)
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AT1G79350 (EMB1135)
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AT2G06005 (FIP1)
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AT2G21070 (FIO1)
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AT2G38670 (PECT1)
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AT2G40380 (PRA1.B2)
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AT2G45490 (AUR3)
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AT3G04460 (APM4)
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AT3G18165 (MOS4)
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AT3G26410 (TRM11)
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AT3G53160 (UGT73C7)
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AT5G08335 (ICMTB)
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AT5G44280 (RING1A)
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AT5G48390 (ATZIP4)
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AT5G54640 (RAT5)
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AT5G56930 (emb1789)
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AT5G57420 (IAA33)
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AT5G59180 (NRPB7)
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AT5G59510 (DVL18)
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-0.43 -1.81 -0.77 1.53 - 0.58 -0.53 -2.15 -1.4 -1.93 -2.06 0.42 0.48 -0.51 1.32 0.79 0.33 0.87 1.25 0.82 0.55 0.15 -0.03 -0.61 -0.41 -0.91 1.17 1.16 0.43 - -0.69 -1.78 -0.81 -1.58 0.95 0.13 -3.35 -2.03 0.72 -0.27 -1.4 -0.24 -0.62 -1.14
AT5G65060 (MAF3)
-0.53 0.1 -0.54 -0.39 -4.09 -0.88 -1.32 0.94 1.02 0.98 1.01 -3.96 -2.34 0.12 0.2 -0.52 -1.17 -0.34 0.35 0.22 0.5 0.58 0.32 0.54 -0.45 -0.7 0.63 -0.07 0.11 -1.86 0.09 0.03 0.23 1.14 -1.28 -2.25 0.1 0.36 0.18 0.2 -0.72 0.12 -0.31 -0.09
AT5G66130 (RAD17)
-1.06 -1.01 -1.04 1.51 -0.22 0.06 -1.27 -0.52 -0.0 -0.79 -0.61 -0.41 -6.75 0.08 1.71 -0.28 0.26 0.87 0.4 -0.36 0.02 -0.31 -0.66 -2.03 -2.62 0.36 0.8 0.66 -0.74 - -0.07 -3.87 -0.65 -2.28 1.61 1.95 -3.98 -5.81 0.51 0.58 -0.6 -0.26 0.64 -0.94

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.