Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
8.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 0.09 0.19 0.25 0.05 0.09 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.02 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.03 0.1 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.98 5.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.9 0.0 0.0 0.01 0.02 3.27 0.01 0.0 0.0 0.25 0.0 0.1 0.0 0.0 0.27 0.0 4.4 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.88 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G00190 (PME38)
7.78 2.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.21 0.0 0.0 0.01 0.01 0.97 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.31 0.16 0.17 0.0 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.5 0.0 0.0
43.75 7.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.04 0.11 0.0 0.15 0.04 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 2.92 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 4.84 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G12380 (ANNAT8)
26.68 8.79 1.0 0.75 1.48 0.47 0.96 1.06 0.93 0.83 1.62 0.0 0.71 2.19 2.87 0.66 0.25 0.1 0.63 4.43 0.59 0.64 0.57 0.49 0.72 0.76 2.87 1.68 1.09 1.46 4.71 0.35 0.55 0.57 0.72 0.59 2.36 1.18 4.47 1.12 5.41 1.34 0.71 1.19 0.4 0.79 0.05 0.65
1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
53.49 15.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.37 0.0 0.0 0.0 0.03 3.62 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 5.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.92 2.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
53.49 15.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.37 0.0 0.0 0.0 0.03 3.62 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 5.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
67.87 13.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 3.75 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 10.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
34.26 5.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.6 0.0 0.0 0.0 0.01 2.48 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.62 3.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
37.05 5.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 1.66 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
33.88 5.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.43 0.0 0.0 0.0 0.04 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 3.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
29.7 2.36 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
35.29 7.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.94 0.0 0.0 0.0 0.08 3.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 7.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
50.54 6.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
25.11 7.61 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.37 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.87 0.28 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 4.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
38.6 9.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.48 0.0 0.22 0.0 0.0 0.18 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
30.52 9.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 2.86 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23.71 3.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
30.52 9.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 2.86 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
23.71 3.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
36.58 16.12 0.0 0.13 0.0 0.45 0.5 3.41 25.81 0.76 19.61 0.0 0.0 0.08 0.99 0.0 0.0 0.0 2.68 4.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 10.62 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
64.94 10.56 0.0 0.0 0.09 0.1 0.26 0.39 0.23 0.0 0.12 0.0 0.0 0.16 1.05 0.0 0.0 0.0 0.13 5.23 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 8.65 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
5.6 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
49.44 20.79 2.98 0.36 1.62 0.74 0.56 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 1.34 0.0 0.11 0.0 0.49 10.45 0.11 0.0 0.48 0.72 0.0 0.08 0.15 0.32 0.3 0.04 7.04 0.14 0.03 0.12 0.29 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.28
79.08 33.78 0.0 0.37 0.07 0.0 0.0 0.16 0.0 0.17 0.04 5.69 8.15 0.36 1.49 0.0 0.0 0.0 0.06 12.48 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.03 0.0 0.07 2.93 0.0 33.66 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.45 0.2 0.0 0.0 0.15

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)